Garuda - Garba Rujukan Digital

Transformasi Gen Antisens ACC Oksidase pada Pepaya dengan Teknik Penembakan Partikel Diani Damayanti; Sudarsono Sudarsono; Ika Mariska; Muhamad Herman
Jurnal AgroBiogen Vol 5, No 1 (2009): April
Publisher : Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jbio.v5n1.2009.p32-38

Papaya (Carica papaya L.) is a climacteric fruit that exhibit avery fast ripening rate. Ethylene controls the ripening eventin the papaya fruit. 1-aminocyclopropane-1-carbocxylic acid(ACC) oxidase gene encodes a specific enzyme for ethylenebiosynthesis. The gene had become a target for manipulationto make a gene construct of an antisense ACC oxidaseto regenerate transgenic papaya that has a characteristic ofdelayed ripening. The objective of the experiment is to engineer transgenic papaya that has a delayed ripening characteristic by transforming papaya with the antisense ACC oxidase gene through particle bombardment technique. The immature embryos of papaya variety Burungwere used for the explants. Antisense ACC oxidase and reporter (gus) genes were co-transformed to papaya calli. Four hundreds eighteen calli were bombarded by the antisense ACC oxidase gene. The transformation experiment resulted 25 putatives transgenic plants out of fifty plantsacclimatized in a greenhouse. Gus gene expression assay observed at 9 days after bombardment showed that the papaya explants bombarded twice at 9 cm shoot distance had 53.3% transformation rate of gus positive and 5.25 blue spots number in average. The results of PCR analysis showed that four out of 25 transgenic putative papaya plants (TR6, TR9, TR20, dan TR24), indicated a positive PCR of the antisense ACC oxidase gene with the amplified fragment DNA size of 800 base pair.

PENGGUNAAN ASAM FUSARAT DALAM SELEKSI IN VITRO UNTUK RESISTENSI ABAKA TERHADAP Fusarium oxysporum f.sp. cubense RULLY DYAH PURWATI; UNTUNG SETYO BUDI; SUDARSONO SUDARSONO
Jurnal Penelitian Tanaman Industri Vol 13, No 2 (2007): JUNI 2007
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perkebunan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jlittri.v13n2.2007.64-72

ABSTRAKPenyakit layu Fusarium yang disebabkan oleh cendawan Fusariumoxysporum Schlecht f.sp. cubense (E.F. Smith) Snyd & Hans (Foc)merupakan penyakit yang banyak menyerang tanaman Musa sp. (termasukabaka) dan dapat menurunkan produktivitas serat antara 20-65%. Salahsatu cara untuk mengatasi masalah tersebut adalah penggunaan klon abakayang resisten. Seleksi in vitro dengan menggunakan agens penyeleksiasam fusarat (AF) merupakan metode yang efektif untuk memperoleh klonabaka resisten terhadap infeksi Foc. Pengkulturan kalus embriogen dantunas abaka pada medium tunas (MT) yang mengandung berbagaikonsentrasi AF digunakan untuk mengetahui pengaruh daya hambat AF.Konsentrasi sub-letal ditentukan sebagai konsentrasi yang paling tinggimenghambat proliferasi kalus embriogen dan tunas abaka. Seleksi in vitrountuk mengidentifikasi embrio somatik yang insensitif AF dilakukandengan konsentrasi sub-letal. Setelah regenerasi dan aklimatisasi plantlet,klon abaka hasil regenerasi ditanam di rumah kaca untuk pengujianketahanan terhadap Foc menggunakan metode detached leaf dual culture.Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengevaluasi daya hambat pertumbuhankalus embriogen abaka, (2) mengetahui konsentrasi sub-letal AF, (3)mengidentifikasi varian embrio somatik abaka yang insensitif AF melaluiseleksi in vitro yang dilanjutkan dengan regenerasi plantlet, dan (4)mengevaluasi resistensi plantlet hasil regenerasi terhadap infeksi Foc.Hasil penelitian menunjukkan bahwa AF menghambat pertumbuhan kalusembriogen dan tunas abaka, sedangkan konsentrasi sub-letal AF adalah 50mg/l. Dari seleksi in vitro dihasilkan 85 plantlet klon Tangongon dan 28plantlet klon Sangihe-1 yang diregenerasikan dari embrio somatik yanginsensitif AF. Genotipe asli Tangongon termasuk dalam kelompok sangatrentan terhadap infeksi Foc, sedangkan dua dari tiga varian dari klonTangongon yang diuji menunjukkan resisten dan satu agak rentan. Padapenelitian ini, pengujian resistensi terhadap infeksi Foc varian yangberasal dari klon Sangihe-1 belum dapat dilakukan karena plantlet masihterlalu kecil sehingga belum dapat diaklimatisasi.Kata kunci: Abaka, Musa textilis Nee., penyakit, Fusarium, keragamansomaklonal, toksin cendawan, Jawa TimurABSTRACTThe usage of fusaric acid (FA) in vitro selection of abacaresistant to Fusarium Oxysporum f. sp. cubenseWilt Fusarium disease caused by Fusarium oxysporum Schlechtf.sp. cubense (E.F. Smith) Snyd & Hans (Foc) is one of the major diseasesof Musa sp. including abaca, and it could decrease 20-65% fiberproductivity. One of the method to solve this problem is utilization ofabaca resistant clones. In vitro selection using fusaric acid (FA) asselective agents is an effective method to produce abaca resistant clones toFoc infection. Culturing abaca embriogenic calli (EC) and shoots on MTmedium containing various FA concentrations was used to determine FAinhibition effects. Sub-lethal concentration was defined as one inhibiting >90% proliferation of abaca EC and shoots. In vitro selection to identify FAinsensitive SE was conducted using FA sub-lethal concentration.Following plantlet regeneration and acclimatization, the regenerated abacalines were grown in the glasshouse for testing against Foc using detachedleaf dual culture test. The objectives of this study were to (1) evaluategrowth inhibition of abaca EC and shoots by FA, (2) determine sub-lethalconcentration of FA, (3) identify FA insensitive variants of abaca somaticembryos (SE) through in vitro selection followed by plantlet regeneration,and (4) evaluate resistance of regenerated plantlets against Foc infection.Results of the experiment showed FA inhibited abaca EC and shootsgrowth while sub-lethal concentration of FA was 50 mg/l. Following invitro selection, 85 plantlets of Tangongon and 28 of Sangihe-1 wereregenerated from FA insensitive SE. The original Tangongon genotypewas very susceptible against Foc infection. Meanwhile, among three Foctested lines derived from Tangongon, two lines were considered resistantand one was slightly susceptible. However, resistance against Foc ofvariants derived from Sangihe-1 have not been evaluated in thisexperiment due to the plantlets were not strong enough to be acclimatized.Key words : Manila hemp, Musa textilis Nee., pest, Fusarium,somaclonal variation, fungal toxin, East Jav

ANALISIS KERAGAMAN GENETIK PLASMA NUTFAH KAKAO (Theobroma cacaoL.) BERDASARKANMARKA SSR / Analysis of Genetic Variability Germplasm of Cacao (Theobroma cacaoL.)Basedon SSR Marker Surti Kurniasih; Rubiyo Rubiyo; Asep Setiawan; Agus Purwantara; Sudarsono Sudarsono
Jurnal Penelitian Tanaman Industri Vol 17, No 4 (2011): Desember 2011
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perkebunan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jlittri.v17n4.2011.156-162

Microsatellite or simple sequence repeat (SSR) markers have proven to be an excellent tool for cultivar identification, pedigree analysis, and genetic distance evaluations among organisms. The objectives of this research were to characterize cacao collection of Indonesian Coffee and Cacao Research Institute (ICCRI) and to analyze their genetic diversity using SSR markers. In this research, 39 SSR primer pairs were used to amplify genomic DNA of 29 cacao clones. Amplified SSR fragments for each primer pair were scored as individual band and used to determine genetic distance among evaluated cacao clones. Results of the experiment indicated that all SSR primer pairs evaluated were able to produce SSR markers for 29 cacao clones. The results also indicated that 34 out of 39 microsatellite loci evaluated were polymorphic, while 5 others were monomorphic. The total number of observed alleles among 29 clones was 132. Number of alleles per locus ranged from 4-8, with an average of 5.5 alelles per locus. Results of data analysis indicated that the PIC value was 0.665, the observed heterozigosity (Ho) was 0.651, and the gene diversity (He) was 0.720. The PIC, Ho, and He values were considered high. Genetic distances were evaluated using NTSys version 2.1 and dendrogram was constructed. Results of analysis indicated that 12 cacao clones evaluated were clustered in the first group with diversity coefficient of < 3.75. Nine cacao clones were in the second group but with the same value of diversity coefficient (<7.50). The rest of the cacao clones were in the third group with diversity coefficient of>7.50. Based on those finding, all SSR primer pairs evaluated could be used to analyze cacao genome and be useful for genetic diversity analysis of cacao germplasm. The SSR marker analysis in ICCRI cacao collections resulted in high PIC, high observed heterozygosity, and high genetic diversity.Key words: Theobroma cacao L, microsatelite, molecular marker, genetic diversity, heterozygosity AbstrakMarka mikrosatelit atau sekuens sederhana berulang (simple sequence repeat = SSR) terbukti merupakan alat yang bagus untuk identifikasi kultivar, analisis pedigree, dan evaluasi jarak genetik berbagai organisme. Penelitian ini bertujuan untuk:1) karakterisasi kakao koleksi Pusat penelitian Kopi dan Kakao Indonesia menggunakan marka SSR dan 2) analisis keragaman genetik klon-klon kakao koleksi dengan menggunakan marka SSR. Dalam penelitian ini, 39 pasangan primer SSR telah digunakan untuk amplifikasi DNA genomik dari 29 klon kakao. Skoring pita SSR hasil amplifikasi menggunakan masing-masing pasangan primer dilakukan secara terpisah dan digunakan untuk menentukan jarak genetik di antara klon kakao yang dievaluasi. Hasil percobaan menunjukkan bahwa semua pasangan primer SSR yang digunakan mampu menghasilkan pita DNA hasil amplifikasi (marka SSR) untuk 29 klon kakao yang diuji. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa 34 dari 39 lokus SSR yang dianalisis bersifat polimorfik sedangkan lima primer yang lain bersifat monomorfik. Dari 29 klon kakao yang dievaluasi, telah berhasil diamplifikasi sebanyak 132 alel, dengan kisaran antara 4-8 alel/lokus. Rataan jumlah alel per lokus sebanyak 5,50. Hasil analisis data yang dilakukan juga menunjukkan nilai PIC untuk marka SSR yang digunakan sebesar 0,665. Untuk populasi klon kakao yang dievaluasi, diperoleh nilai rataan heterosigositas pengamatan (Ho) sebesar 0,651 dan rataan diversitas gen (He) sebesar 0,720. Nilai PIC Ho dan He yang didapat tergolong tinggi. Berdasarkan analisis keragaman dengan menggunakan program NTSys, diperoleh hasil 12 klon kakao berada dalam grup pertama (koefisien keragaman<3,75) dan9 klon berada dalam grup kedua, dengan koefisien keragaman < 7,50. Sedangkan klon-klon lainnya mempunyai koefisien keragaman > 7,50. Berdasarkan hasil penelitian dan analisis data disimpulkan bahwa marka SSR dapat digunakan untuk menganalisis keragaman genetik plasma nutfah kakao. Tingkat polimorfisme yang dihasilkan marka SSR relatif tinggi. Tingkat heterosigositas plasma nutfah kakao koleksi Puslit Kopi dan Kakao Indonesiarelatif tinggi, dan keragaman genetiknyacukup tinggi.Kata kunci : Theobroma cacao L, mikrosatelit, marka molekuler, keragaman genetik, heterosigositas

Induksi Kalus Embriogenik dan Daya Regenerasi Kopi Arabika Menggunakan 2,4- Dichlorophenoxyacetic Acid dan 6-Benzyladenine Meynarti Sari Dewi Ibrahim; Rr Sri Hartati; Rubiyo Rubiyo; Agus Purwito; Sudarsono Sudarsono
Jurnal Tanaman Industri dan Penyegar Vol 4, No 2 (2013): Buletin Riset Tanaman Rempah dan Aneka Tanaman Industri
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perkebunan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jtidp.v4n2.2013.p91-98

Embriogenesis somatik kopi Arabika (Coffea arabica L.) masih mengalami kendala dalam meregenerasikan planlet dari eksplan yang dikulturkan. Kemampuan eksplan daun membentuk embrio dalam proses embriogenesis somatik kopi sangat dipengaruhi oleh komposisi media dan zat pengatur tumbuh. Penelitian bertujuan untuk melihat pengaruh pemberian 2,4-Dichlorophenoxyacetic Acid dan 6-Benzyladenine dalam proses pembentukan kalus embriogenik dan daya regenerasi kopi Arabika. Penelitian dilakukan di Unit Pengembangan Benih Unggul Pertanian, Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian pada bulan Juli 2011 sampai Desember 2012. Bahan tanaman yang digunakan adalah daun kopi Arabika varietas S795 koleksi Balai Penelitian Tanaman Industri dan Penyegar. Rancangan perlakuan menggunakan rancangan acak lengkap dengan 6 ulangan, masing-masing ulangan terdiri dari 5 eksplan. Induksi kalus menggunakan 5 kombinasi perlakuan 2,4-D 1 mg/l + BA 0 mg/l; 2,4-D 1 mg/l + BA 1 mg/l; 2,4-D 1 mg/l + BA 2 mg/l; 2,4-D 2 mg/l + BA 1 mg/l; dan kontrol (tanpa penambahan 2,4-D dan BA). Peubah yang diamati meliputi jumlah kalus, persentasi kalus embriogenik, berat basah kalus, dan jumlah proembrio. Hasil penelitian menunjukkan perlakuan 2,4-D 1 mg/l + BA 0 mg/l; 2,4-D 1 mg/l + BA 1 mg/l; 2,4-D 1 mg/l + BA 2 mg/l; dan 2,4-D 2 mg/l + BA 1 mg/l dapat membentuk kalus kecuali perlakuan kontrol. Berat kalus, persentasi kalus embriogenik, dan jumlah proembrio tertinggi diperoleh pada media kombinasi 2,4-D 2 mg/l dan BA 1 mg/l. Kalus yang mampu beregenerasi berasal dari media kombinasi 2,4-D 1 mg/l dan BA 2 mg/l dengan persentasi 16,67% dengan 6 kecambah per 0,2 gram kalus.Kata Kunci: Coffea arabica, 2,4-Dichlorophenoxyacetic Acid, 6-Benzyladenine, embriogenesis somatikRegeneration of planlets from cultured explants has been an obstacle in somatic embryogenesis of arabica coffee (Coffea arabica L.). The ability of leaf explants to generate embryos in somatic embryogenesis process of coffee was affected by composition of media and plant growth regulators. The objectives of the research was to examine the effect of 2,4-Dichlorophenoxyacetic Acid dan 6-Benzyladenine in the process of embryogenic callus and regeneration potential of arabica coffee. The study was conducted at Agricultural Superior Seed Development Unit, Indonesian Agency for Agricultural Research and Development (IAARD) from July 2011 to December 2012. Plant material used was leaves of S795 variety which is collected by Indonesian Industrial and Beverage Crops Research Institute. The research was arranged in completely randomized design with 6 replications, each replication consist of 5 explants. Callus induction used 5 treatments, i.e. 2,4-D 1 mg/l + BA 0 mg/l; 2,4-D 1 mg/l + BA 1 mg/l; 2,4-D 1 mg/l + BA 2 mg/l; 2,4-D 2 mg/l + BA 1 mg/l; and control (without 2,4-D and BA). Variables observed were number of callus, percentage of embryogenic callus, callus fresh weight and number of proembryo. Result showed that all treatments can produce the callus except control. Combination of 2,4-D 2 mg/l and BA 1 mg/l gave the highest of fresh weight of callus, percentage of embryogenic callus, and number of proembryo. Regenerating callus of 16.67% with the number of sprouts of 6 per 0.2 gram only derived from combination of 2,4-D 1 mg/l BA and 2 mg/l.

IDENTIFIKASI KETAHANAN PLASMA NUTFAH KARET IRRDB 1981 TERPILIH TERHADAP PENYAKIT GUGUR DAUN CORYNESPORA BERDASARKAN AKTIVITAS TOKSIN CASSICOLIN Fetrina Oktavia; Sudarsono Sudarsono; Kuswanhadi Kuswanhadi; Dini Dinarty; Widodo Widodo
Jurnal Penelitian Karet JPK : Volume 34, Nomor 1, Tahun 2016
Publisher : Pusat Penelitian Karet - PT. Riset Perkebunan Nusantara

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/ppk.jpk.v34i1.225

Salah satu penyakit pada tanaman karet adalah penyakit gugur daun Corynespora (PGDC) yang disebabkan oleh jamur Corynespora cassiicola. Patogen tersebut dapat menyerang semua tahap pertumbuhan tanaman karet yang menyebabkan terjadinya penurunan hasil lateks yang cukup signifikan dan bahkan dapat menyebabkan kematian tanaman. Penggunaan klon-klon tahan sebagai bahan tanam merupakan cara yang paling efektif dan ekonomis untuk mencegah terjadinya serangan PGDC. Karena itu identifikasi klon-klon resisten merupakan strategi utama dalam manajemen PGDC. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi tingkat ketahanan 50 genotipe terpilih plasma nutfah IRRDB 1981 (PN’81) terhadap PGDC. Enam klon karet yang berasal dari populasi Wickham digunakan sebagai pembanding (BPM 24, BPM 1, GT 1, RRIC 600, PB 260 dan RRIM 600). Empat isolat C. cassiicola (CC-01, CC-20, CC-22, dan CC-23) diinokulasikan masing-masing pada daun muda tahap pertumbuhan B2C, dan intensitas kelayuan daun dihitung berdasarkan estimasi kehilangan air akibat aktifitas patogenisitas toksin. Hasil penelitian menunjukkan bahwa 12 genotipe tergolong sangat tahan, 13 genotipe tergolong tahan, 23 genotipe tergolong rentan dan 8 genotipe tergolong sangat rentan. Genotipe PN 451, PN 494 dan PN 604 menunjukkan tingkat ketahanan yang lebih baik terhadap PGDC dibandingkan dengan populasi Wickham sehingga ketiga genotipe tersebut berpotensi digunakan sebagai sumber gen ketahanan dalam program pemuliaan tanaman karet. Diterima : 13 Maret 2016 / Direvisi : 29 Juli 2016 / Disetujui : 2 Agustus 2016 How to Cite : Oktavia, F., Sudarsono, S., Kuswanhadi, K., Dinarty, D., & Widodo, W. (2016). Identifikasi ketahanan plasma nutfah karet IRRDB 1981 terpilih terhadap penyakit gugur daun Corynespora berdasarkan aktivitas toksin Cassicolin. Jurnal Penelitian Karet, 34(1), 35-48. Retrieved from http://ejournal.puslitkaret.co.id/index.php/jpk/article/view/225

ANALISIS KERAGAMAN GENETIK PLASMA NUTFAH KAKAO (Theobroma cacaoL.) BERDASARKANMARKA SSR / Analysis of Genetic Variability Germplasm of Cacao (Theobroma cacaoL.)Basedon SSR Marker Surti Kurniasih; Rubiyo Rubiyo; Asep Setiawan; Agus Purwantara; Sudarsono Sudarsono
Jurnal Penelitian Tanaman Industri Vol 17, No 4 (2011): Desember 2011
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perkebunan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jlittri.v17n4.2011.156-162

Microsatellite or simple sequence repeat (SSR) markers have proven to be an excellent tool for cultivar identification, pedigree analysis, and genetic distance evaluations among organisms. The objectives of this research were to characterize cacao collection of Indonesian Coffee and Cacao Research Institute (ICCRI) and to analyze their genetic diversity using SSR markers. In this research, 39 SSR primer pairs were used to amplify genomic DNA of 29 cacao clones. Amplified SSR fragments for each primer pair were scored as individual band and used to determine genetic distance among evaluated cacao clones. Results of the experiment indicated that all SSR primer pairs evaluated were able to produce SSR markers for 29 cacao clones. The results also indicated that 34 out of 39 microsatellite loci evaluated were polymorphic, while 5 others were monomorphic. The total number of observed alleles among 29 clones was 132. Number of alleles per locus ranged from 4-8, with an average of 5.5 alelles per locus. Results of data analysis indicated that the PIC value was 0.665, the observed heterozigosity (Ho) was 0.651, and the gene diversity (He) was 0.720. The PIC, Ho, and He values were considered high. Genetic distances were evaluated using NTSys version 2.1 and dendrogram was constructed. Results of analysis indicated that 12 cacao clones evaluated were clustered in the first group with diversity coefficient of < 3.75. Nine cacao clones were in the second group but with the same value of diversity coefficient (<7.50). The rest of the cacao clones were in the third group with diversity coefficient of>7.50. Based on those finding, all SSR primer pairs evaluated could be used to analyze cacao genome and be useful for genetic diversity analysis of cacao germplasm. The SSR marker analysis in ICCRI cacao collections resulted in high PIC, high observed heterozygosity, and high genetic diversity.Key words: Theobroma cacao L, microsatelite, molecular marker, genetic diversity, heterozygosity AbstrakMarka mikrosatelit atau sekuens sederhana berulang (simple sequence repeat = SSR) terbukti merupakan alat yang bagus untuk identifikasi kultivar, analisis pedigree, dan evaluasi jarak genetik berbagai organisme. Penelitian ini bertujuan untuk:1) karakterisasi kakao koleksi Pusat penelitian Kopi dan Kakao Indonesia menggunakan marka SSR dan 2) analisis keragaman genetik klon-klon kakao koleksi dengan menggunakan marka SSR. Dalam penelitian ini, 39 pasangan primer SSR telah digunakan untuk amplifikasi DNA genomik dari 29 klon kakao. Skoring pita SSR hasil amplifikasi menggunakan masing-masing pasangan primer dilakukan secara terpisah dan digunakan untuk menentukan jarak genetik di antara klon kakao yang dievaluasi. Hasil percobaan menunjukkan bahwa semua pasangan primer SSR yang digunakan mampu menghasilkan pita DNA hasil amplifikasi (marka SSR) untuk 29 klon kakao yang diuji. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa 34 dari 39 lokus SSR yang dianalisis bersifat polimorfik sedangkan lima primer yang lain bersifat monomorfik. Dari 29 klon kakao yang dievaluasi, telah berhasil diamplifikasi sebanyak 132 alel, dengan kisaran antara 4-8 alel/lokus. Rataan jumlah alel per lokus sebanyak 5,50. Hasil analisis data yang dilakukan juga menunjukkan nilai PIC untuk marka SSR yang digunakan sebesar 0,665. Untuk populasi klon kakao yang dievaluasi, diperoleh nilai rataan heterosigositas pengamatan (Ho) sebesar 0,651 dan rataan diversitas gen (He) sebesar 0,720. Nilai PIC Ho dan He yang didapat tergolong tinggi. Berdasarkan analisis keragaman dengan menggunakan program NTSys, diperoleh hasil 12 klon kakao berada dalam grup pertama (koefisien keragaman<3,75) dan9 klon berada dalam grup kedua, dengan koefisien keragaman < 7,50. Sedangkan klon-klon lainnya mempunyai koefisien keragaman > 7,50. Berdasarkan hasil penelitian dan analisis data disimpulkan bahwa marka SSR dapat digunakan untuk menganalisis keragaman genetik plasma nutfah kakao. Tingkat polimorfisme yang dihasilkan marka SSR relatif tinggi. Tingkat heterosigositas plasma nutfah kakao koleksi Puslit Kopi dan Kakao Indonesiarelatif tinggi, dan keragaman genetiknyacukup tinggi.Kata kunci : Theobroma cacao L, mikrosatelit, marka molekuler, keragaman genetik, heterosigositas

PENGGUNAAN ASAM FUSARAT DALAM SELEKSI IN VITRO UNTUK RESISTENSI ABAKA TERHADAP Fusarium oxysporum f.sp. cubense RULLY DYAH PURWATI; UNTUNG SETYO BUDI; SUDARSONO SUDARSONO
Jurnal Penelitian Tanaman Industri Vol 13, No 2 (2007): JUNI 2007
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perkebunan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jlittri.v13n2.2007.64-72

ABSTRAKPenyakit layu Fusarium yang disebabkan oleh cendawan Fusariumoxysporum Schlecht f.sp. cubense (E.F. Smith) Snyd & Hans (Foc)merupakan penyakit yang banyak menyerang tanaman Musa sp. (termasukabaka) dan dapat menurunkan produktivitas serat antara 20-65%. Salahsatu cara untuk mengatasi masalah tersebut adalah penggunaan klon abakayang resisten. Seleksi in vitro dengan menggunakan agens penyeleksiasam fusarat (AF) merupakan metode yang efektif untuk memperoleh klonabaka resisten terhadap infeksi Foc. Pengkulturan kalus embriogen dantunas abaka pada medium tunas (MT) yang mengandung berbagaikonsentrasi AF digunakan untuk mengetahui pengaruh daya hambat AF.Konsentrasi sub-letal ditentukan sebagai konsentrasi yang paling tinggimenghambat proliferasi kalus embriogen dan tunas abaka. Seleksi in vitrountuk mengidentifikasi embrio somatik yang insensitif AF dilakukandengan konsentrasi sub-letal. Setelah regenerasi dan aklimatisasi plantlet,klon abaka hasil regenerasi ditanam di rumah kaca untuk pengujianketahanan terhadap Foc menggunakan metode detached leaf dual culture.Penelitian ini bertujuan untuk (1) mengevaluasi daya hambat pertumbuhankalus embriogen abaka, (2) mengetahui konsentrasi sub-letal AF, (3)mengidentifikasi varian embrio somatik abaka yang insensitif AF melaluiseleksi in vitro yang dilanjutkan dengan regenerasi plantlet, dan (4)mengevaluasi resistensi plantlet hasil regenerasi terhadap infeksi Foc.Hasil penelitian menunjukkan bahwa AF menghambat pertumbuhan kalusembriogen dan tunas abaka, sedangkan konsentrasi sub-letal AF adalah 50mg/l. Dari seleksi in vitro dihasilkan 85 plantlet klon Tangongon dan 28plantlet klon Sangihe-1 yang diregenerasikan dari embrio somatik yanginsensitif AF. Genotipe asli Tangongon termasuk dalam kelompok sangatrentan terhadap infeksi Foc, sedangkan dua dari tiga varian dari klonTangongon yang diuji menunjukkan resisten dan satu agak rentan. Padapenelitian ini, pengujian resistensi terhadap infeksi Foc varian yangberasal dari klon Sangihe-1 belum dapat dilakukan karena plantlet masihterlalu kecil sehingga belum dapat diaklimatisasi.Kata kunci: Abaka, Musa textilis Nee., penyakit, Fusarium, keragamansomaklonal, toksin cendawan, Jawa TimurABSTRACTThe usage of fusaric acid (FA) in vitro selection of abacaresistant to Fusarium Oxysporum f. sp. cubenseWilt Fusarium disease caused by Fusarium oxysporum Schlechtf.sp. cubense (E.F. Smith) Snyd & Hans (Foc) is one of the major diseasesof Musa sp. including abaca, and it could decrease 20-65% fiberproductivity. One of the method to solve this problem is utilization ofabaca resistant clones. In vitro selection using fusaric acid (FA) asselective agents is an effective method to produce abaca resistant clones toFoc infection. Culturing abaca embriogenic calli (EC) and shoots on MTmedium containing various FA concentrations was used to determine FAinhibition effects. Sub-lethal concentration was defined as one inhibiting >90% proliferation of abaca EC and shoots. In vitro selection to identify FAinsensitive SE was conducted using FA sub-lethal concentration.Following plantlet regeneration and acclimatization, the regenerated abacalines were grown in the glasshouse for testing against Foc using detachedleaf dual culture test. The objectives of this study were to (1) evaluategrowth inhibition of abaca EC and shoots by FA, (2) determine sub-lethalconcentration of FA, (3) identify FA insensitive variants of abaca somaticembryos (SE) through in vitro selection followed by plantlet regeneration,and (4) evaluate resistance of regenerated plantlets against Foc infection.Results of the experiment showed FA inhibited abaca EC and shootsgrowth while sub-lethal concentration of FA was 50 mg/l. Following invitro selection, 85 plantlets of Tangongon and 28 of Sangihe-1 wereregenerated from FA insensitive SE. The original Tangongon genotypewas very susceptible against Foc infection. Meanwhile, among three Foctested lines derived from Tangongon, two lines were considered resistantand one was slightly susceptible. However, resistance against Foc ofvariants derived from Sangihe-1 have not been evaluated in thisexperiment due to the plantlets were not strong enough to be acclimatized.Key words : Manila hemp, Musa textilis Nee., pest, Fusarium,somaclonal variation, fungal toxin, East Jav

POLIETILENA GLIKOL (PEG) DALAM MEDIA IN VITRO MENYEBABKAN KONDISI CEKAMAN YANG MENGHAMBAT TUNAS KACANG TANAH (Arachis hypogaea L.) Enni Suwarsi Rahayu; Edi Guhardja; Satriyas Ilyas; Sudarsono
JURNAL PENELITIAN BIOLOGI BERKALA PENELITIAN HAYATI Vol 11 No 1 (2005): December 2005
Publisher : The East Java Biological Society

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.23869/457

The objectives of this experiment were to determine response of epycotyl of nine peanut cultivars against polyethylene glycol (PEG 6000) induced stress under in vitro conditions, effective concentration of PEG to inhibit growth and development of epycotyl, evaluate tolerance of the cultivars against PEG stress, and evaluate changes in total proline content due to PEG stress. Growing epycotyls from peanut seeds (TDK) or from embryo axis (TTK) were planted on liquid MS-0 medium containing PEG 6000 (0%, 5%, 10%, 15%, and 20%). Growth, development, and the tissue damage score of the epycotyl were observed after six weeks. Total content of proline were analyzed for stressed and non stressed epycotyl to determine effect of PEG stress on proline accumulation. Results of the experiment indicated that addition of PEG 6000 in to MS-0 medium inhibited growth and development of peanut epycotyls and increased its total proline content. Addition of PEG 6000 might be used to simulate drought stress under in vitro condition. PEG at 15% concentration was effective for inhibiting growth and development of epycotyl explant. The response of peanut epycotyls against medium containing 15% PEG 6000 might be used as alternative methods for screening peanut tolerance against drought stress. The TDK and TTK might be used as explant, while increased in shoot length (TTK), in leaf number (TDK and TTK), in milted leaf number (TDK and TTK), in root number (TDK) and score of tissue damage (TDK) might be used as criteria for drought tolerance.

Title

Found 8 Documents
Search

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Title Search

Found 8 Documents Search

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Title

Found 8 Documents
Search