Claim Missing Document
Check
Articles

Found 26 Documents
Search

Studi In Silico: Prediksi Potensi 6-shogaol dalam Zingiber officinale sebagai Inhibitor JNK Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng Tiring; Yohanes Bare; Andri Maulidi; Mansur S; Fitra Arya Dwi Nugraha
Al-Kimia Vol 7 No 2 (2019): DECEMBER
Publisher : Study Program of Chemistry - Alauddin State Islamic University of Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (549.97 KB) | DOI: 10.24252/al-kimia.v7i2.10638

Abstract

Type 2 Diabetes Mellitus (T2DM) is a metabolic disease characterized by hyperglycemia and insulin resistance. T2DM therapy against c-Jun N-terminal kinase (JNK) is one of the recovery solutions using bioactive compounds from ginger. 6-shogaol is bioactive compounds of ginger that has antioxidant properties. The purpose of this study is to analyze the potential of 6-shogaol as a JNK inhibitor. JNK protein (ID: 464Y) was obtained from Protein Data Bank (PDB) through 6-shogaol ligand (CID: 5281794) obtained from the PubChem database. Protein docking protein and ligand use Hex 8.0.0 software while visualization and analysis using Discovery Studio client 4.0. The results showed that 6-shogaol was predicted to have potential as a JNK inhibitor. Proving this by finding five amino acid residues (TRY223, LEU210, THR103 ALA214, ARG107) with an energy of -236.29cal/mol. We found the type of hydrogen bonds and the van der waals forces formed. The interaction of ligand and protein successfully inactivates JNK and stops pancreatic β cell dysfunction. 6-shogaol has pharmacological properties as a JNK,T2DM. 
The Potential Role of 6-gingerol and 6-shogaol as ACE Inhibitors in Silico Study Yohanes Bare; Maria Helvina; Gabriella Chandrakirana Krisnamurti; Mansur S
Biogenesis: Jurnal Ilmiah Biologi Vol 8 No 2 (2020)
Publisher : Department of Biology, Faculty of Sci and Tech, Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/bio.v8i2.15704

Abstract

Hypertension has become the third highest cause of death in Indonesia. The condition is correlated with angiotensin-converting enzyme (ACE), and possibly managed with the use of drugs. In addition, some natural compounds, including 6-shogaol and 6-gingerol from ginger, are used to decrease blood pressure. However, the mechanism and binding site of these compounds to ACE protein is currently unclear. This study, therefore, aims to investigate the potential role of these compounds as an angiotensin-converting enzyme inhibitor. The ACE protein was downloaded from Protein Data Bank (PDB) database with the ID: 3bkk, while the 6-shogaol (CID: 5281794) and 6-gingerol (CID: 44559528) ligands were obtained from the PubChem database. Meanwhile, molecular docking was established using HEX 8.0.0 software. The analysis examined the amino acid residues and the bonds formed from these interactions. According to the results, 14 amino acid residues were formed by the interaction between 6-shogaol and ACE, while the interaction between 6-gingerol and ACE formed eight amino acids. Also, 13 amino acid residues in the novelty binding site of ACE were discovered to be blocked by the ligands from ginger. Therefore, the compounds have potential roles as inhibitors, and this possibly helps to prevent regulation of the renin-angiotensin system. These interactions also formed hydrogen bonds, as well as electrostatic, unfavorable, and hydrophobic sites, making the binding stronger than others. 
Virtual Screening: Prediksi potensi 8-shogaol terhadap c-Jun N-Terminal Kinase (JNK) Yohanes Bare; Mansur S; Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng Tiring; Dewi Ratih Tirto Sari; Andri Maulidi
Jurnal Penelitian dan Pengkajian Ilmu Pendidikan: e-Saintika Vol. 4 No. 1: March 2020
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pemberdayaan Masyarakat (LITPAM)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36312/e-saintika.v4i1.157

Abstract

JNK adalah gen yang berperan dalam metabolisme DMT2. Dalam pengobatan T2DM digunakan JNK sebagai potensi terapi dengan menggunakan bahan alam. 8-shogaol adalah komponen kimia yang terkandung dalam jahe yang memiliki aktivitas antioksidan. Tujuan dari penelitina ini adalah menginversitagasi dan menganalisis peran 8-shogaol terhadap JNK. Protein JNK (ID: 464Y) diperoleh dari Protein Data Bank dan ligan 8-shogaol (CID:6442560 ) didapat dari pubchem. Ligan dan protein didocking menggunakan Hex 8.0.0. File dalam bentuk pdb divisualtisasi dan analisis menggunakan Discovery Studio Client 4.1 software. Interaksi ligan-protein menunjukan ikatan hidrogen pada residu asam amino LYS93 dan van der Waals pada 18 residu asam amino dengan energi ikatan-289.68cal/mol. Interkasi ini berpotensi sebagai penghambat kerja JNK dan dapat digunakan dalam terapi DMT2.Virtual screening: potential prediction of 8-shogaol againts c-Jun N-Terminal Kinase (JNK)AbstractJNK is one of gene that has a role in T2DM condition. To curve T2DM use JNK as potential healing using natural compounds. Eight-shogaol which found in ginger has function as a antioxidant.. The aim of the research is to investigate and analyze role 8-shogaol againts JNK. Protein JNK (ID: 464Y) was taken from Protein Data Bank and ligand 8-shogaol (CID:6442560 ) acquired from pubchem. Ligand and protein model were docked using Hex 8.0.0 software. Visualization and analysis molecular interactions by the Discovery Studio Client 4.1 software. Interaction ligand-protein showed one hydrogen bond in amino acid residue LYS93 and formed van der Waals in eighteen amino acid residues which energy binding -289.68cal/mol. This interaction has a potential to inhibit JNK role and lead to therapy T2DM.
KEARIFAN LOKAL KEMALIK SUKU SASAK UNTUK MENJAGA KELESTARIAN LINGKUNGAN HIDUP DUSUN SADE Mansur S
Gema Wiralodra Vol. 9 No. 2 (2018): Gema Wiralodra
Publisher : Universitas Wiralodra

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.31943/gemawiralodra.v9i2.26

Abstract

Penelitian ini bertujuan mendeskripsikan kearifan lokal kemalik di masyarakat Suku Sasak Dusun Sade, Desa Rembitan, Kecamatan Pujut, Kabupaten Lombok Tengah Nusa Tenggara Barat dalam menjaga kelestarian lingkungan. Metode penelitian menggunakan penelitian kualitatif. Data deskriptif berasal dari hasil observasi dan wawancara peneliti kepada masyarakat Suku Sasak Dusun Sade. Hasil penelitian Kearifan Lokal kemalik merupakan larangan memasuki hutan adat gunung Kiyangan secara sembarangan, yang bila dilanggar akan mendapat musibah atau gangguan dikemudian hari. Apabila hutan dirusak serta kayunya ditebang, maka perusak tersebut diwajibkan membayar denda adat yang harus dipenuhi seperti satu ekor kerbau, beras satu kwintal ( 100 kg) , uang bolong (kepeng susuk) 244 biji, gula merah, beras satu rombong (baskom). Sanksi yang lebih berat, jika sanksi di atas tidak dipatuhi bagi si pelanggar maka, tidak diberikan penghulu (pengurus adat), kyai adat dalam pelaksanaan syukuran atau selamatan, misalnya pada acara selamatan rumah dan lain-lain, serta dikucilkan atau diasingkan dan tidak diakui sebagai masyarakat adat.
Kearifan Lokal ; Sesaji; Dusun Sade Mansur S
Jurnal Dinamika Sosial Budaya Vol 24, No 1 (2022): Juni (2022)
Publisher : Universitas Semarang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.26623/jdsb.v24i1.3506

Abstract

Penelitian ini bertujuan mendeskripsikan kearifan lokal sesaji di masyarakat Suku Sasak Dusun Sade, Desa Rembitan, Kecamatan Pujut, Kabupaten Lombok Tengah Nusa Tenggara Barat dalam menjaga kelestarian lingkungan. Metode penelitian menggunakan penelitian kualitatif, untuk mengembangkan teori yang dibangun melalui data yang diperoleh di lapangan. Untuk memastikan kebenaran data digunakan teknik pengumpulan data. Metode kualitatif digunakan untuk memperoleh data bersifat deskriptif. Data deskriptif berasal dari hasil observasi dan wawancara peneliti kepada masyarakat Suku Sasak Dusun Sade. Hasil penelitian tentang kearifan lokal sesaji yaitu, memberikan persembahan dalam bentuk makanan kepada arwah leluhur. Sesaji ini dibuat dengan menggunakan bahan yang terdapat di sekitar dusun sade seperti, Pare bulu dan daun pisang tanduk sebagai bahan pembuatan sesaji, yang dibuat tidak boleh menggunakan bumbu atau mencampur dengan bahan-bahan yang lain, karena menurut kepercayaan masyarakat di Dusun Sade ketika sesaji itu dimakan akan menyebabkan pengendalian emosi pada saat marah atau pada saat emosi. Pada masyarakat Suku Sasak Dusun Sade, tradisi  yang menggunakan sesaji seperti, ziarah hutan adat gunung Kiyangan, ziarah makam deside wali nyatoq, dan adat istiadat lainnya
In-silico Approach for The Prediction of Chlorogenic Acid as PPAR-γ Activator Yohanes Bare; Mansur S; Sukarman Hadi Jaya Putra; Margaretha Rika W G L; Dewi Ratih Tirto Sari
Biota Vol 13 No 1 (2020)
Publisher : Universitas Islam Negeri Mataram

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20414/jb.v13i1.197

Abstract

Coffee is one of the essential crops commonly cultivated in Indonesia. Coffee contains diverse bioactive compounds, which are associated with human health benefits. One of the compounds is Chlorogenic acid, which able to decrease the risk of type 2 diabetes mellitus (T2DM). However, the mechanism of chlorogenic acid toward anti-diabetes still unclear. This study aimed to analyze and investigate the potential role of chlorogenic acid as anti-diabetes through their interaction with Peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPAR-γ) as an enzyme to phosphorylate and regulate the mechanism of T2DM. The physicochemical properties of chlorogenic acid also performed in this study. The PPAR-γ was downloaded from the PDB database, and the chlorogenic acid was retrieved from the PubChem database. The protein and ligand were prepared using the PyRx program and were docked using Hex 8.0.0 software. Discovery Studio client 4.1 software was used to analyze the interaction between chlorogenic acid and PPAR-γ protein. Based on the physicochemical properties, chlorogenic acid is highly permeable to the cell and easily absorbed. Thirteen amino acid residues of PPAR-γ (GLN410, SER394, ASP396, GLY395, GLU407, LEUA401, LEU400, VAL403, LYS373, LYS438, LEU377, LYS434, and GLY437) were identified on the chlorogenic acid-PPAR-γ interaction. Interestingly, the kind of interactions, including hydrophobic interaction, hydrogen bond, and van der Waals, which are supported by the tight interaction. Our study indicated that chlorogenic acid might have anti-diabetes activity through PPAR-γ interaction.
Persepsi Guru dan Siswa terhadap Pemanfaatan Media Pembelajaran Google Classroom pada Mata Pelajaran Biologi SMA Yohanes Bare; Mansur S; Mira Kurniawati
Journal on Teacher Education Vol. 3 No. 2 (2022): Journal On Teacher Education
Publisher : Universitas Pahlawan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (536.086 KB) | DOI: 10.31004/jote.v3i2.4060

Abstract

Google Classroom merupakan salah satu media pembelajaran jarak jauh yang dapat diakses hanya dengan menggunakan  internet. Persepsi guru dan siswa  terhadap media pembelajaran Google Classroom ini dapat memberikan dampak yang positif bagi siswa maupun guru. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis pemanfaatan media pembelajaran Google Classroom, persepsi guru dan siswa pada pembelajaran Biologi di SMA Negeri 2 Maumere. Jenis penelitian yang digunakan adalah deskriptif kualitatif. Kualitatif merupakan penelitian yang temuan-temuannya tidak melalui statistik. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa media pembelajaran Google Classroom di SMAN 2 Maumere sangat membantu dalam pengecekan kehadiran dan keaktifan siswa, membantu siswa dalam melihat materi dan tugas yang sudah dikirimkan oleh guru dan dapat mengerjakan semua tugas yang diberikan selama pembelajaran daring. Pemahaman guru dan siswa terhadap media pembelajaran Google Classroom terdapat sedikit perbedaan, sebagian siswa dan guru memahami aplikasi Google Classroom dapat digunakan kapan saja dan dimana saja, tanpa ada kendala apapun.
Pengembangan Lembar Kerja Siswa Berbasis Inkuiri Terbimbing Untuk Siswa SMP Negeri Nuba Arat Pada Materi Kelompok Tumbuhan Cornelia Dua Kotin; Yohanes Nong Bunga; Mansur S
SPIZAETUS: JURNAL BIOLOGI DAN PENDIDIKAN BIOLOGI Vol 1, No 2 (2020): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (222.365 KB) | DOI: 10.55241/spibio.v1i2.8

Abstract

Penelitian ini dilatari oleh kemampuan siswa dalam memecahkan masalah masih tergolong lemah, kurangnya keaktifan siswa saat pembelajaran berlangsung dan minimnya literatur cetak yang menyebabkan kemampuan literasi siswa sangat lemah. Penelitian bertujuan untuk mengembangkan Lembar Kerja Siswa (LKS) berbasis inkuiri terbimbing pada materi tumbuhan bagi siswa SMP Negeri Nuba Arat. Penelitian ini merupakan penelitian pengembangan atau Recearch and Development (R&D) dengan menggunakan model 4D (Define, Design, Develope, and Dessiminate). Dalan penelitian ini, peneliti melakukan beberapa tahap yaitu, analisis awal, analisis tugas, analisis konsep, spesifikasi tujuan, penyusunan tes, pemilihan media dan pemilihan model LKS. Selanjutnya peneliti melakukan validasi produk, perbaikan produk, ujicoba kelas kecil dan menginformasikan kepada siswa serta guru IPA di SMP Negeri Nuba Arat terkait LKS yang sudah dikembangkan. Hasil validasi ahli terhadap produk yang dikembangkan memiliki skor 2,80 untuk ahli materi dan 3,25 untuk ahli media. Validator atau ahli juga memberikan saran terhadap LKS yang dikembangkan berupa perbaikan penempatan gambar, layout dan kesalahan penulisan. Selain itu skor tanggapan siswa dan guru pada saat uji coba kelas kecil yakni 84,71 untuk tanggapan siswa dan 90,07 untuk tanggapan guru. Berdasarkan hasil validasi ahli, perbaikan saran dan skor tanggapan subjek penelitian, maka LKS berbasis inkuiri terbimbing pada materi tumbuhan dinyatakan layak dan dapat digunakan dalam pembelajaran IPA di SMP Negeri Nuba Arat. Kata Kunci: 4D, Inkuiri Terbimbing; Lembar Kerja Siswa, Validasi
Studi In silico Potensi aktivitas 10-shogaol dalam Jahe (Zingiber officinale) terhadap gen ACE Mansur S; Yohanes Bare; Maria Helvina; Aprianus Pani Pili; Gabriella Chandrakirana Krisnamurti
SPIZAETUS: JURNAL BIOLOGI DAN PENDIDIKAN BIOLOGI Vol 1, No 3 (2020): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v1i3.23

Abstract

Peningkatan tekanan darah tinggi (hipertensi) mengakibatkan terpicunya berbagai macam penyakit kronis serta komplikasinya. Salah satu activator dalam kondisi tekanan darah tinggi adalah aktivitas Angiotensin converting enzyme (ACE). ACE berperan dalam mengatur sistem renin-angiotensin. Penurunan hipertensi perlu untuk menekan aktivitas ACE. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis potensi 10-shogaol terhadap ACE. Metode yang digunakan adalah studi in silico. Protein model ACE (ID: 3bkk) didapatkan dari database Protein data Bank (PDB) sedangkan 10-shogaol (CID: 6442612) didapat dari database PubChem. Docking menggunakan Hex 8.0.0 sedangkan visualisasi dan analisis menggunakan Discovery Studio. Hasil Penelitian menunjukan bahwa bahwa senyawa 10-shogaol memiliki potensi sebagai inhibitor gen ACE dibuktikan 2 residu asam amino yang berikatan dengan ligan. Ikatan tersebut berupa ikatan hidropobik yang meningkatkan kekuatan tersebut dengan besar energi -291.3cal/mol.
Identifikasi Jenis Tumbuhan Obat di Kecamatan Doreng Kabupaten Sikka Anastasia Nona Lelo; Mansur S
SPIZAETUS: JURNAL BIOLOGI DAN PENDIDIKAN BIOLOGI Vol 1, No 2 (2020): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (157.862 KB) | DOI: 10.55241/spibio.v1i2.9

Abstract

Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui jenis-jenis tumbuhan obat tradisonal yang ditemukan di Kecamatan Doreng Kabupaten Sikka. Pendekatan penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah pendekatan kualitatif. Terdapat 21 jenis tumbuhan obat tradisional yang digunakan oleh hattra dalam menyembuhkan berbagai jenis penyakit. Dari 21 jenis tumbuhan tersebut ada 3 jenis tumbuhan obat yakni keru, padu api dan nitaruntarun yang tidak dapat dideskripsikan karena tumbuhan obat ini sangat langka. Jenis-jenis tumbuhan obat yang ditemukan di Kecamatan Doreng Kabupaten Sikka yaitu patikan kebo, jambu biji, jombang, tembeleken, susuruhan, tempuyung, awar-awar, prasman, rumput mutiara, bluntas, jambu, antana geude, daun jintan, leng-lengan, kumis kucing, tomat, daun sirih dan jarak merah. Kata kunci: Identifikasi, Sikka, Tumbuhan Obat