Claim Missing Document
Check
Articles

Found 8 Documents
Search

Construction and Expression of Single Recombinant Peptide Surfactant for EOR Application CUT NANDA SARI; USMAN USMAN; RIESA KW ROHMAT; LENI HERLINA; KEN SAWITRI SULIANDRI; ONIE KRISTIAWAN; DWIYANTARI DWIYANTARI; TATI KRISTIANTI; SONY SUHANDONO
Microbiology Indonesia Vol. 11 No. 1 (2017): March 2017
Publisher : Indonesian Society for microbiology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (1420.163 KB) | DOI: 10.5454/mi.11.1.5

Abstract

Surfactant is generally synthetic chemical, which is effective and reliable. However, the chemicals usually did not degraded easily in the environment and could cause damage to the environment. The other possible alternative to produce surfactant is using genetic engineering in order to produce peptide based surfactant. In this research, peptide surfactant was produced using a gene construct which was created using overlapped polymerase chain reaction method (OE-PCR). PAGE analysis shows that single surfactant peptide construction can be expressed by induction of IPTG 1 mM and after at least twice sonication. This research proves that both two constructions have been successfully expressed by producing peptide in expected size (approximately 15 kDa).
BIOREMEDIATION Cut Nanda Sari; Tyas Putri Sativa; Setyo Sarwanto Moersidik
Scientific Contributions Oil and Gas Vol. 39 No. 1 (2016): SCOG
Publisher : Testing Center for Oil and Gas LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29017/scog.39.1.251

Abstract

Oil
IN SILICO POTENTIAL ANALYSIS OF X6D MODEL OF PEPTIDE SURFACTANT FOR ENHANCED OIL RECOVERY Cut Nanda Sari; Usman; Rukman Hertadi; Tegar Nurwahyu Wijaya; Leni Herlina; Ken Sawitri Suliandari; Syafrizal; Onie Kristiawan
Scientific Contributions Oil and Gas Vol. 39 No. 2 (2016): SCOG
Publisher : Testing Center for Oil and Gas LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29017/scog.39.2.267

Abstract

Peptides and their derivatives can be applied in enhanced oil recovery (EOR) due to their ability to form an emulsion with hydrophobic molecules. However, peptide research for EOR application, either theoretical or computational studies, is still limited. The purpose of this research is to analyse the potency of the X6D model of surfactant peptide for EOR by molecular dynamics simulations in oil-water interface. Molecular dynamics simulation using GROMACS Software with Martini force field can assess a peptides ability for self-assembly and emulsification on a microscopic scale. Molecular dynamics simulations combined with coarse grained models will give information about the dynamics of peptide molecules in oil-water interface and the calculation of interfacial tension value. Four designs of X6D model: F6D, L6D, V6D, and I6D are simulated on the oil-water interface. The value of interfacial tension from simulation show the trend of F6D L6D > I6D > V6D. The results indicate that V6D has the greatest reduction in interfacial tension and has the stability until 90C with the salinity of at least 1M NaCl.
CONSTRUCTION AND EXPRESSION?OF QUARTET RECOMBINANT PEPTIDE SURFACTANT FOR EOR APPLICATION Cut Nanda Sari; Usman; Refiana Lestary; Riesa Khairunnisa W.R.; Leni Herlina; Syafrizal; Tati Kristianti; Sony Suhandono
Scientific Contributions Oil and Gas Vol. 39 No. 3 (2016): SCOG
Publisher : Testing Center for Oil and Gas LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29017/scog.39.3.271

Abstract

The main drawback of the SUPEL peptide surfactant product which has been developed for EOR application is it isunstable at a high temperature. This research is aimed at generating the prototype of peptide surfactant construction in recombinant by stringing up 4 SUPEL linier sequences. Quartet recombinant technology can produce the peptide surfactant characterized as reversible biosurfactant, which is active at high temperature but inactive at low temperature. Multiple SUPEL Construction (MSC) that was developed in this research is using synthetic DNA and producing SUPEL in 4 sequences that can flip at normal temperature and can open when heated. SDS PAGE analysis results show that MSC construction can be expressed by inducting IPTG and cell harvested at 90C. This research proves that construction and expression of the SUPEL quartet has been achieved by producing the peptide at an ideal size.
BIOREMEDIATION OF PETROLEUM HYDROCARBON IN CONTAMINATED SOILS: COMPARISON OF COMPOST AND WWTP SLUDGE RESIDUAL ADDITION (BIOREMEDIASI TANAH TERCEMAR PETROLEUM HYDROCARBON: PERBANDINGAN PENAMBAHAN KOMPOS DAN LUMPUR IPAL) Cut Nanda Sari; Lina Lubnah
Scientific Contributions Oil and Gas Vol. 40 No. 1 (2017): SCOG
Publisher : Testing Center for Oil and Gas LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29017/scog.40.1.280

Abstract

Crude oils processing into energy continue to increase, hence treatment for its environmental impact is needed. The objectives of the study is to determine the differences in bacteria growth rate and removal efficiency of Total Petroleum Hydrocarbon (TPH) between compost and WWTP (Waste Water Treatment Plant) sludge addition at 5% and 10% concentration levels. Those effects were acknowledged through experiments in laboratory scale using soil contaminated by 5,5% TPH within 5 weeks until it reach less than 1% as the requirement. The soil comes from Marunda Beach, compost from UPS Merdeka, WWTP sludge from Jababeka, and bacteria isolated from soil contaminated in the area surrounding refining. The treatment used in this experiment was landfarming with nutrition addition and the main variable analyzed was TPH and the microorganism population. Results of this study show that the bacteria growth rate in compost and WWTP sludge at 5% and 10% concentration each are 0,7567/weeks and 1,154/week for compost and also 0,8783/week and 1,1109/week for WWTP sludge. The TPH removal efficiency obtained was 95,32% and 96,85% for the addition of compsot as well as 91,15% and 91,02% for the addition of WWTP sludge at 5% and 10% concentrations. Base on a t-Test, the differences between all the variation of concentrations are not significant. The correlation test between TPH degradation to bacteria growth showed that there is a weak downward (negative) linear relationship. Kegiatan pengelolaan minyak bumi terus meningkat, maka dari itu dibutuhkan tindakan penanganan pemulihan kondisi lingkungan yang disebabkan oleh kegiatan tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbedaan laju pertumbuhan bakteri dan efi siensi penyisihan Total Petroleum Hydrocarbon (TPH) dengan variasi perlakuan pemberian kompos dan lumpur residu pengelolaan air limbah. Penelitian dilakukan dalam skala laboratorium dengan konsentrasi awal TPH sebesar 5,5% selama 5 minggu atau sampai TPH mencapai konsentrasi kurang dari 1% sesuai dengan baku mutu. Tanah yang digunakan berasal dari Pantai Marunda, Bekasi. Kompos berasal dari UPS (Unit Pengolah Sampah) Merdeka, Depok. Lumpur Instalasi Pengelolaan Air Limbah (IPAL) berasal dari Jababeka. Isolat bakteri yang digunakan berasal dari tanah tercemar TPH disekitar ,kilang minyak. Hasil dari penelitian menunjukkan laju pertumbuhan bakteri pada perlakuan penambahan kompos dan lumpur IPAL pada konsentrasi 5% dan 10% masing-masing adalah 0,7567/minggu dan 1,154/minggu untuk kompos, serta 0,8783/minggu dan1,1109/minggu untuk residu lumpur IPAL. Efisiensi penyisihan TPH yang diperoleh adalah 95,32% and 96,85% untuk penambahan kompos dan 91,15% dan 91,02% untuk penambahan residu lumpur IPAL pada konsentrasi 5% dan 10%. Berdasarkan hasil uji-t, perbedaan untuk masing-masing perlakuan tidaklah signifikan. Uji korelasi antara perubahan konsentrasi TPH dengan pertumbuhan bakteri menunjukkan hubungan lemah berbanding terbalik.
VARIATION OF CARBON SOURCES IN PRODUCTING RHAMNOLIPID BY Pseudomonas aeruginosa FOR MICROBIAL ENHANCED OIL RECOVERS APPLICATION (VARIASI SUMBER KARBON PADA PRODUKSI RHAMNOLIPID OLEH Pseudomonas aeruginosa DALAM APLIKASI MICROBIAL ENHANCED OIL RECOVERY (ME Nafian Awaludin; Cut Nanda Sari
Scientific Contributions Oil and Gas Vol. 40 No. 1 (2017): SCOG
Publisher : Testing Center for Oil and Gas LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29017/scog.40.1.281

Abstract

The decrease in oil production is caused by the ageing of oil production wells. The enhanced oil recovery (EOR) technology is proven to increase oil reserves and production in mature oil fields. One EOR technology that has proven to be efficient in increasing oil production is microbial EOR by using biosurfactant. The most effective biosurfactant is rhamnolipid produced by Pseudomonas aeruginosa, the bacteria of which can lower the interfacial tension between the petroleum and water. In biosurfactants production thanks to these bacteria, the substrate as the source of carbon in the fermentation process is needed. The sources of carbon used in this study are glucose, glycerol, molasses, banana peels, and waste from Pseudomonas aeruginosa by using Busnell Hass medium as a liquid medium of bacterial growth. Biosurfactants production results are; 74mg/L from glucose; 63mg/L from banana peels; 66mg / L from glycerol; 85mg/L from waste cooking oil; and 64mg/L of molasses with the following decreasing surface tension: 33.55 mN/m from glucose; 32.51 mN/m from banana peels; 27.55 mN/m from glycerol; 22.46 mN/m from waste cooking oil; and 31.49 mN/m from molasses. In addition, the decrease of interface tension of glucose; banana peels; glycerol; waste cooking oil; and molasses are as follows : 15.2 mN/m; 13.78 mN/m; 8:15 mN/m; 0.14 mN/m; and 11.2 mN/m respectively. Menurunnya produksi minyak bumi disebabkan karena sumur produksi yang sudah tua. Teknologi enhanced oil recovery (EOR) terbukti mampu meningkatkan cadangan dan produksi lapangan minyak mature. Salah satu teknologi EOR yang dikenal efi sien dalam meningkatkan perolehan minyak adalah microbial enhanced oil recovery menggunakan biosurfaktan. Biosurfaktan yang paling efektif adalah rhamnolipid yang dihasilkan oleh bakteri Pseudomonas aeruginosa yang dapat menurunkan tegangan antarmuka antara minyak bumi dengan air. Dalam produksi biosurfaktan oleh bakteri ini, diperlukan substrat sebagai sumber karbon dalam proses fermentasi. Sumber karbon yang digunakan pada penelitian ini adalah glukosa, gliserol, molase, kulit pisang, dan minyak jelantah. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sumber karbon yang paling optimum dalam menghasilkan biosurfaktan dari Pseudomonas aeruginosa dengan menggunakan busnell hass medium sebagai media cair pertumbuhan bakteri. Produksi biosurfaktan yang dihasilkan adalah 74mg/L dari glukosa; 63mg/L dari kulit pisang; 66mg/L dari gliserol; 85mg/L dari minyak jelantah; dan 64mg/L dari molase dengan penurunan tegangan permukaan berturutturut: 33,55 mN/m dari glukosa; 32,51 mN/m dari kulit pisang; 27,55 mN/m dari gliserol; 22,46 mN/m dari minyak jelantah; dan 31,49 mN/m serta memiliki penurunan tegangan antarmuka dari glukosa; kulit pisang; glisero; minyak jelantah; dan molase berturut-turut adalah 15,2 mN/m; 13,78 mN/m; 8,15 mN/m; 0,14 mN/m; dan 11,2 mN/m.
PENGAMATAN MEOR MENGGUNAKAN FORMULA NUTRISI RENDAH GLUKOSA DENGAN METODA IMBIBISI Sugihardjo; Zulkifliani; Onie Kristiawan; Cut Nanda Sari; Syafrizal
Lembaran Publikasi Minyak dan Gas Bumi Vol. 53 No. 1 (2019): LPMGB
Publisher : BBPMGB LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kegiatan skala laboratorium telah dilakukan untuk merancang formula nutrisi MEOR (Microbial Enhanced Oil Recovery) dengan bahan dasar rendah-glukosa. Bahan yang dipakai meliputi: limbah cair tahu, air kelapa, limbah cair ikan, limbah pengolahan pati, ekstrak teh, pupuk cair, ekstrak daging sapi, dan pepton. Bahan-bahan tersebut diracik untuk menjadi beberapa formula yang dapat merangsang pertumbuhan mikroba yang terkandung pada percontoh fluida dari sumuran SMR-01, SMR-02, dan SMR-03 sehingga menghasilkan bioproduk yang diperlukan untuk MEOR Pada seleksi kajian awal ada 48 formula nutrisi, kemudian diseleksi dan diperoleh yang potensial dalam pertumbuhan mikroba sebanyak 8 formula, yaitu 2 macam formula untuk SMR-01, 3 untuk SMR-02, dan 3 juga untuk SMR-03. 8 formula tersebut diinkubasi selama 7 hari dan diamati bioproduknya yang meliputi: pertumbuhan mikroba, pH, IFT, densitas, dan viskositas minyak. Pada tiap formula juga ditambahkan konsorsium mikroba exogenous untuk memperkaya jenis mikroba. Uji imbibisi dilakukan terhadap 8 formula tersebut serta ditambah 8 formula lagi dengan menambahkan konsorsium mikroba exogenous selama 71 hari. Hasil yang terbaik ternyata ada pada formula Ef1 dengan penambahan ekstrak teh dan pepton dan Ez1 dengan tambahan ekstrak teh dan ekstrak beef pada fluida SMR-02. Dengan nilai masing masing nilai RF (recovery factor) 56,91 untuk Ef1 dan 55,86% untuk Ez1. Oleh karena itu kedua formula tersebut dapat dijadikan acuan untuk implementasi lapangan. Secara ekonomis mungkin Ez1 akan lebih murah karena prosentase kandungan extract beef hanya 10%.
KONSTRUKSI DAN EKSPRESI REKOMBINAN TUNGGAL PEPTIDA SURFAKTAN (SINGLE SUPEL CONSTRUCTION) UNTUK APLIKASI EOR Cut Nanda Sari; Usman P; Riesa K. W. Rohmat; Leni Herlina; Ken Sawitri Suliandari; Onie Kristiawan; Dwiyantari; Tati Kristianti; Sony Suhandono
Lembaran Publikasi Minyak dan Gas Bumi Vol. 50 No. 3 (2016): LPMGB
Publisher : BBPMGB LEMIGAS

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Surfaktan yang digunakan pada aplikasi peningkatan perolehan minyak tahap lanjut pada umumnya merupakan hasil sintesis kimia. Hasil sintesis ini bersifat cepat dan efektif namun secara kuantitas sangat kecil, sehingga bila dibutuhkan dalam jumlah banyak akan membutuhkan banyak biaya untuk memproduksinya. Alternatif lain yang bisa digunakan untuk menghasilkan surfaktan adalah dengan rekayasa genetika melalui produksi rekombinan dalam mikroorganisme seperti bakteri untuk menghasilkan surfaktan berbasis peptida. Teknologi ini relatif murah dan simpel untuk dilakukan yaitu dengan manipulasi ekspresi sel inang agar menghasilkan peptida surfaktan yang dikonstruk kedalam vektor ekspresi berbasis bakteri. Pada penelitian ini dilakukan konstruksi peptida surfaktan dengan menggunakan metode overlaped reaksi berantai polimerase untuk menghasilkan surfaktan peptida sebagai peptida tunggal. Hasil analisis SDS PAGE (Sodium Dodecyl Sulphate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis) menunjukkan konstruksi peptida surfaktan tunggal dapat diekspresikan dengan cara diinduksi IPTG 1 mM dan dilakukan pemecahan sel untuk mendapatkan protein yang diproduksi diperiplasma. Penelitian ini membuktikan bahwa kedua konstruk berhasil diekspresikan dengan menghasilkan peptida pada ukuran yang sesuai.