Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search

Optimasi dan Evaluasi Whole Genome Sequencing SARS CoV-2 Di Balai Laboratorium Kesehatan dan Pengujian Alat Kesehatan Provinsi Jawa Tengah Hediningsih, Yekti; Nurhafid, Mohammad; Wahyuni, Endah; Hapsari, Dyah Ayu Kunti; Purnomo, Purnomo; Marwiyah, Marwiyah; Sulistiyanto, Hendrik; Farhati, Ismi; Handayani, Sekti; Peni, Wiwik
Health Information : Jurnal Penelitian Vol 15 No 1 (2023): Januari-April
Publisher : Poltekkes Kemenkes Kendari

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36990/hijp.v15i1.706

Abstract

SARS CoV-2 merupakan virus yang menyebar hampir keseluruh Negara di dunia termasuk Indonesia. Whole genome sequencing merupakan metode yang paling tepat digunakan untuk mendeteksi beberapa varian dan mutasi gen dari SARS CoV-2. Tujuan dari penelitian ini yaitu mengetahui dan evaluasi pengerjaan whole genome SARS CoV-2 berdasarkan nilai keberhasilan dan indikator sekuensing di Balai Laboratorium Kesehatan dan Pengujian Alat Kesehatan Provinsi Jawa Tengah. Metode survei digunakan dalam penelitian ini di mana sampel diambil dari beberapa daerah yaitu Jawa tengah, Jawa Barat, Banten dan Jakarta. Analisis keberhasilan didasarkan pada hasil fasta dari analisis Dragen COVID Lineage. Hasil penelitian menunjukan bahwa persentase keberhasilan dari empat batch pengerjaan menunjukkan bahwa dua batch terakhir mendapatkan persentase lebih tinggi dibandingkan dengan dua batch pertama. Primer pool artic yang digunakan yaitu versi V3 dan V4 diduga kuat sebagai faktor yang mempengaruhi keberhasilan tersebut di mana versi V4 menunjukkan performa yang lebih baik dan cocok digunakan dalam pengerjaan whole genome sequencing SARS CoV-2 di Balai Laboratorium Kesehatan dan Pengujian Alat Kesehatan Provinsi Jawa Tengah. Beberapa indikator digunakan sebagai penilaian standar evaluasi yaitu cluster density, passing filter dan Q30 yang disesuaikan dengan instrument yang digunakan.
Study of the Characteristics of Bacteria Isolated from the Pelus River, Banyumas Regency Nurhafid, Mohammad; Indyaswari, Marthyana; Husen, Fajar; Riady, Reza Muhammad
Journal Of Artha Biological Engineering Vol. 1 No. 1 (2023)
Publisher : PT. Artha GenetikaLab Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.62521/6wsyrt43

Abstract

Community activities around the Pelus River cause pollution which affects the bacterial community found in the river. The aim of this research was to determine the characteristics of bacteria isolated from the Pelus river environment in Banyumas Regency. The method used in this research is an exploratory method where bacterial sampling is carried out at 3 different stations. The samples taken were then isolated, observed colony morphology, as well as biochemical and physiological characterization of the bacteria. The research results obtained 10 different isolates. A total of 10 isolates were obtained based on morphological differences. The characteristics of most of the Pelus River bacteria show variations ranging from enzymatic to environmental resistance which describes the waters of the Pelus River. Bacteria isolated from the water have characteristics that identify them as bacteria capable of degrading compounds
Rapid Detection of the Aeromonas sp. group using Conventional PCR at the Aquaculture Technology Development Center, Cangkringan, Sleman, Special Region of Yogyakarta Nurhafid, Mohammad; Astuti; Riady, Reza Muhammad; Ufianah; Pardiyanto, Eko; Ruanda, Faldo Ody
Journal Of Artha Biological Engineering Vol. 1 No. 1 (2023)
Publisher : PT. Artha GenetikaLab Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.62521/c8cxaf15

Abstract

The catfish is a freshwater cultivated fish that can be found all over Indonesia. However, the problems that occur in general are usually attacks by pathogens from the Aeromonas sp group. This research aims to optimize the rapid detection of the Aeromonas sp group using PCR at the Aquaculture Technology Development Center, Cangkringan, Sleman, special region of Yogyakarta. The research was conducted by survey with purposive sampling. Isolation was carried out using two growth media, namely Tryptone Soy Agar (TSA) and Glutamate Starch Phenile (GSP). Colonies that had characteristics of the Aeromonas sp group were subjected to PCR amplification using specific primers for the Aeromonas sp group. The results of the amplification resulted in DNA that matched the target, namely 953bp, which showed that the sample belonged to the Aeromonas sp group. Based on this technique, the level of accuracy in detecting pathogens is higher than conventional methods.
Penerapan Teknologi Zero Waste Concept pada Pengolahan Ikan Tuna (Thunnus) di UKM Mino Sari Desa Adisara, Kecamatan Jatilawang, Kabupaten Banyumas fitriadi, ren; Hary Tjahja Soedibya, Petrus; Palupi, Mustika; Riviani; sutanto; Muhammad Riady, reza; Nurhafid, Mohammad
Artha Imperium: Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat Vol. 1 No. 1 (2023): 2023
Publisher : PT. Artha Genetikalab Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.62521/mkhvkh74

Abstract

Salah satu kawasan sentra pengolahan ikan yang ada di Kabupaten Banyumas, Jawa Tengah adalah Desa Adisara Kecamatan Jatilawang. Kawasan ini merupakan kawasan pengolahan ikan yang sudah ada dari tahun 1930-an. Permasalahan yang paling banyak dialami oleh UKM Mino Sari termasuk semua kelompok pengolahan di Desa Adisara adalah limbah yang mencemari lingkungan sekitar sehingga menjadi permasalahan yang belum teratasi, mengingat produksi olahan pindang tuna yang dihasilkan sekitar 12.360 kg/bulan dengan total limbah padat yang dihasilkan sebesar 4,944 kg/bulan. Tujuan kegiatan ini adalah peningkatan kompetensi pembuatan tepung dan minyak ikan dari pengolahan limbah ikan sehingga dapat menjadi produk yang bermanfaat. Target kegiatan ini adalah Kelompok Pengolahan UKM Mino Sari. Metode kegiatan pendekatan yang dilakukan dalam kegiatan ini adalah pendekatan partisipatif (PRA/Participatory Rural Appraisal) dengan cara sosialisasi dan penyuluhan. Hasil kegiatan pengabdian bahwa khalayak mitra dapat memahami rangkaian kegiatan pelatihan dan pendampingan pengelolaan limbah ikan menjadi tepung ikan. Khalayak juga dapat mentransfer pengertahuan kepada kelompok lainnya dalam rangka pernyebaran pengetahuan pembuatan tepung limbah ikan.