Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0.408
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Makara Journal of Science
Musie, Royna Rahma
Unknown Affiliation
Chemistry

Published : 2 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

 1 
Deteksi Vibrio parahaemolyticus Menggunakan Primer Gen toxR2 dengan Gradient Polymerase Chain Reaction Nurjayadi, Muktiningsih; Krisdawati, Ismaya; Declan, Jefferson Lynford; Putri, Gladys Indira; Juliansyah, Dandy Akbar; Rahmawati, Atikah Nur; Fitriyanti, Anisa; Musie, Royna Rahma; Kurniadewi, Fera; Sukmawati, Dalia; Saamia, Vira; Wiranatha, I Made; Abomoelak, Bassam; Elenshasy, Hesham Ali
Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Vol. 11 No. 1 (2025): Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan, Volume 11 Nomor 1, Juni 2025
Publisher : Program Studi Kimia Universitas Negeri Jakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21009/JRSKT.111.03

Abstract

Makanan adalah kebutuhan vital, dengan kriteria utama adalah keamanan, kualitas, dan nilai gizi. Untuk memastikan keamanan makanan, diperlukan metode deteksi yang cepat dan akurat, terutama untuk mendeteksi bakteri patogen penyebab keracunan makanan. Vibrio parahaemolyticus merupakan bakteri patogen yang banyak ditemukan pada makanan laut. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan metode deteksi cepat V. parahaemolyticus dengan menargetkan gen toxR2 menggunakan Gradient Polymerase Chain Reaction. Gen toxR dipilih karena fungsinya sebagai pengatur penting gen virulensi. Tahapan yang dilakukan meliputi desain primer, penyiapan sampel bakteri dari biakan murni, dan uji amplifikasi menggunakan PCR Gradien. Hasil uji amplifikasi menunjukan bahwa pasangan primer toxR2 berhasil mengamplifikasi pada suhu 58-62°C dengan dihasilkan pita berukuran 137 bp. Berdasarkan hasil tersebut, dapat disimpulkan bahwa PCR Gradien dengan primer toxR2 dapat diaplikasikan untuk mengembangkan alat deteksi V. parahaemolyticus dengan dilakukan uji lanjutan seperti uji konfirmasi, uji spesifisitas, uji sensitivitas, dan uji pada pangan menggunakan Real-Time Polymerase Chain Reaction.
Detection Method for Escherichia coli Using Real-Time Polymerase Chain Reaction Targeting the yhaV Gene Nurjayadi, Muktiningsih; Fitriyanti, Anisa; Musie, Royna Rahma; Putri, Gusti Angieta; Azizah, Puan Aqila; Angelina, Helzi; Grace, Grace; Sihombing, Ananda Indah Putri; Setiawan, Agus; Declan, Jefferson Lynford; Putri, Gladys Indira; Juliansyah, Dandy Akbar; Fatimah, Siti; Berkahingrum, Ayu; Kartika, Irma Ratna; Kurniadewi, Fera; Saamia, Vira; Chen, Shyi-Tien; Aboemolak, Bassam; Enshasy, Hesham Ali El
Makara Journal of Science
Publisher : UI Scholars Hub

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Escherichia coli is a foodborne pathogenic bacterium that can cause diarrhea, while yhaV is a virulence-associated gene linked to the toxin–antitoxin system in E. coli. This study was aimed at evaluating the confirmation, specificity, and sensitivity of a yhaV gene primer using real-time polymerase chain reaction. The yhaV-targeting PCR successfully amplified a DNA fragment with an amplicon length of 207 bp (base pairs) under an annealing temperature optimized to a range of 54 °C to 62 °C via gradient PCR. The PCR using the primer pair produced a consistent Ct (cycle threshold) of 14.14 ± 0.05 and showed a single peak in the melting curve at a Tm (melting temperature) of 83.67 °C ± 0.02. The specificity test indicated that the yhaV primer effectively distinguished E. coli from nontarget bacteria on the basis of differences in Ct and Tm values. The sensitivity analysis showed that the PCR directed toward the primer pair successfully detected E. coli at a minimum concentration of 2.24 pg/µL, with a Ct value of 29.93 and a detection limit of 31.5 × 102 CFU. These results suggest that yhaV-based real-time PCR quickly and accurately identifies E. coli. Primer designs that target yhaV have the potential to be developed as components of a rapid, specific, and sensitive kit for detecting E. coli in food samples.
Co-Authors Aboemolak, Bassam Abomoelak, Bassam Agus Setiawan Angelina, Helzi Azizah, Puan Aqila Berkahingrum, Ayu Chen, Shyi-Tien Dalia Sukmawati Elenshasy, Hesham Ali Enshasy, Hesham Ali El Fitriyanti, Anisa Grace, Grace Jefferson Lynford Declan Juliansyah, Dandy Akbar Kartika, Irma Ratna Krisdawati, Ismaya Kurniadewi, Fera Muktiningsih Nurjayadi Putri, Gladys Indira Putri, Gusti Angieta Rahmawati, Atikah Nur Saamia, Vira Sihombing, Ananda Indah Putri Siti Fatimah Wiranatha, I Made