cover
Contact Name
-
Contact Email
-
Phone
-
Journal Mail Official
-
Editorial Address
-
Location
Kota semarang,
Jawa tengah
INDONESIA
Berkala Bioteknologi
Published by Universitas Diponegoro
ISSN : -     EISSN : -     DOI : -
Core Subject : Science,
Arjuna Subject : -
Articles 68 Documents
Isolasi Khamir Fermentatif dari Batang Tanaman Tebu (Saccharum officinarum. L) dan Hasil Identifikasinya Berdasarkan Sekuens Internal Transcribed Spacer Anggraini, Ika Anggraini; Ferniah, Rejeki Siti; Kusdiyantini, Endang
Berkala Bioteknologi Vol. 2 No. 2 November 2019
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (336.023 KB)

Abstract

Yeast is a single-celled fungus that acts as epiphytes, endophytes or parasites. Yeast is divided into fermentative yeast and oxidative yeast. Fermentative yeast can produce primary and secondary metabolites. The role of fermentative yeast is widely used in the food industry, health and energy, so necessary to be explore fermentative yeast from sugarcane stems. The purpose of this study was to isolate fermentative yeast from sugarcane stems and identify molecular yeast based on the Internal Transcribed Spacer sequences (ITS). Isolation of epiphytic and endophytic yeast was carried out by spread plate of water soak sugarcane and sugar cane juice. Yeast isolation using 2 media, PDA and YGP with chloramphenicol. Morphological characterization was carried out by observing macroscopic and microscopic characteristics. Biochemical characterization was carried out by carbohydrate fermentation test and 50% glucose media growth test. Selected isolates were molecularly identified using Internal Transcribed Spacer (ITS) sequences. Primers used are ITS 1 and ITS 4. Phylogenetic analysis using Neighbor Joining from MEGA-6 program. The results of isolation obtained 7 yeast isolates characterized morphologically and biochemically. The based result of morphology and biochemical characterization were found 1 selected isolate with name Ed 1B. Selected yeast isolate have characteristics are round colonies, creamy white, shiny surface, raised elevation, wavy edges, ovoid cell shape, cell diameter 4,74µm, budding, glucose fermentation and sucrose fermentation, but not for lactose and grow well of 50% glucose media. The results of the Basic Alignment Search Tools (BLAST) are Ed 1B isolates had 99% homology with Kodamaea ohmeri species. Key Words :  Sugarcane (Saccharum officinarum. L.), Yeast, Molecular Identification
Isolasi dan Karakterisasi secara Morfologi dan Biokimia Khamir dari Limbah Kulit Nanas Madu (Ananas comosus L.) untuk Produksi Bioetanol Akbar, Galih Pertiwi; Kusdiyantini, Endang .; Wijanarka, W .
Berkala Bioteknologi Vol. 2 No. 2 November 2019
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (413.58 KB)

Abstract

Yeast is a group of microorganisms that are easily found in fermented products, soil, water, plant tissues, leaves, flowers and fruits. Bioethanol is one of the alternative energy produced by yeast through fermentation. This study aims to isolate and characterize yeast morphologically and biochemically yeast from honey pineapple skin waste for bioethanol production. Isolation was carried out using PDAY + chloramphenicol media. Morphological characterization were carried out by observing colony morphology, cell and yeast asexual reproduction. Biochemical characterization included carbon and nitrogen assimilation, urea hydrolysis test, protein hydrolysis test, glucose acid production test, high glucose tolerance test, ethanol tolerance test and production and analysis of fermented bioethanol levels by yeast isolates. From the isolation process found 6 yeast isolates, where isolates Ep-1 and Ep-2 are similar to Wickerhamia sp., Ep-3 and Ed-3 similar to Zygosaccharomyces sp. and isolates Ed-1 and Ed-2 are similar to Saccharomyces sp.Characteristics possessed by yeast isolates showed the ability to assimilate several sources of carbon and ammonium sulfate; able to hydrolyze proteins; some are able to produce acid; cannot hydrolyze urea; tolerant to glucose concentrations of 40%, 50% and 60%; tolerant to ethanol 5%, 10% and 15%; and able to produce bioethanol.Ep-1 isolates are known to have the most potential for ethanol production because they are tolerant to 60% glucose concentration and 15% ethanol and the level of bioethanol produced is 12.00%. Key words : yeast, honey pineapple skin waste,  characterization, bioethanol
Evaluasi Keragaman Mutan Generasi MV3 Aster Cina (Callistephus chinensis L.) Hasil Mutasi Induksi Sinar Gamma Chelsea, Fiorentina; Anwar, Syaiful; Sudarman, Adriani Darmawati; Kusmiyati, Florentina
Berkala Bioteknologi Vol. 3 No. 2 November 2020
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRAK Aster cina (CallistephuschinensisL.) merupakansalahsatujenistanamanhias yang sering digunakan dalam industry bunga potong. Penelitian bertujuan untuk mengkaji keragaman genetik dan heritabilitas pada tanaman mutan aster cina MV3hasil mutasi radiasi sinar gamma. Iradiasi sinar gamma telah diaplikasikan pada anakan aster cina MV0dengan variasi dosis iradiasi Y0= 0 Gy, Y1= 5 Gy, Y2= 10 Gy, Y3= 15 Gydan Y4= 20 Gy. Bahan tanam MV3diambil dari generasi MV2 yang memiliki karakter berbunga cepat (46 anakan), jumlah bunga terbanyak (56 anakan) dan tangkai bunga terpanjang (59 anakan). Rancangan percobaan yang digunakan yaitu Rancangan Acak Kelompok non faktorial dengan 9 genotipe uji dan 1 genotipe kontrol sebagai pembanding. Hasil analisis ragam menunjukkan bahwa karakter umur muncul bakal bunga dan umur binga mekar sempurna tidak berbeda nyata terhadap pengaruh genotipe maupun pengaruh lingkungan. Karakter jumlah daun, jumlah anakan dan jumlah tangkai bunga memiliki heritabilitas sedang serta karakter jumlah bunga memiliki heritabilitas yang tinggi. Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa terdapat keragaman antara tanaman control dengan genotipe, sehingga dapat dilakukan evaluasi keragaman untuk generasi selanjutnya. Kata kunci:Callistephus chinensis L., genetik, keragaman, MV3,sinar gamma
Isolasi Bakteri Endofit Tanaman Pepaya (Carica Papaya L.) Dan Uji Aktivitas Enzim Amilase Ginting, Ledy; Wijanarka, Wijanarka; Kusdiyantini, Endang
Berkala Bioteknologi Vol. 3 No. 2 November 2020
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRACTEndophytic bacteria are beneficial microorganisms that interact with plants without causing disturbance or damage to them. Research shows that certain endophytic bacterial isolates can produce secondary metabolites that have health effects, especially endophytic bacteria isolated from the Papaya plant (Carica Papaya. L). Amylolytic bacteria is one of the bacteria that has the potential to produce amylase enzymes which play an important role in industry. Endophytic bacteria were isolated using Nutrient Agar media 1% starch (soluble starch) and amylolytic index measurements were carried out using Lugol's reagent. Isolation of endophytic bacteria was carried out by streak method on Nutrient Agar media. The cultures were incubated at 37ºC for 48 hours. The morphological characteristics of the growing colonies were observed and Gram stained was carried out. Amylase activity was measured using the Dinitrosalisilic acid (DNS) method. The results of this study found 19 isolates of endophytic bacteria were isolated. There were 5 isolates that had the highest clear zone, namely isolates AE4, BE2, DE6, TD2, and TD5. The highest amylase enzyme activity of 0.225 U / mL was produced in TD5 isolates.Keyword : Isolation, Endophytic Bacteria, Enzyme Amylase, Papaya Plants
Isolasi DNA Daun Jeruk Bali Merah (Citrus maxima Merr.) dengan Modifikasi Metode Doyle and Doyle Rizko, Nurmalisa; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti; Ferniah, Rejeki Siti; Pujiyanto, Sri; Erfianti, Tia; Mawarni, Shelina Nurunnisa; Tri Rahayu, Hesti; Khairunnisa, Dinda
Berkala Bioteknologi Vol. 3 No. 2 November 2020
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRAK Jeruk bali merah (Citrus maximaMerr) merupakan tanaman lokal yang tersebar di wilayah Indonesia. Keunggulan tanaman tersebut adalah nutrisi yang tinggi yang terdiri dari vitamin C996,773 mg/L, riboflavin, natrium (Na), kalsium (Ca), serta senyawa metabolit lainnya yang merupakan sumber antioksidan yang baik. Dalam masa pandemi ini, kebutuhan vitamikhusunya dalam menghadapi Pandemi Covid19.Pengembangan potensivarietas unggul dari jeruk bali perlu dilakukan salah satunya dengan analisis genetik. Tahap awal analisis genetik suatu tanaman adalah isolasi DNA tanaman tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi DNA pada daun jeruk bali dengan metode Doyle & Doyle yang dimodifikasi dengan penambahan CTAB untuk mengatasi kadungan polisakarida dan senyawa polifenol yang tinggi dalam tanaman jeruk bali. Sampel DNA jeruk bali yang telah diisolasi di analisis menggunakan NanoDrop dengan absorbansi (A260/A280). Hasil pada penelitian ini, sampel DNA yang dianalisis menggunakan NanoDrop memiliki konsentrasi 220,8ng/µlserta kemurnian sebesar 1,93.Kata kunci : Jeruk bali (Citrus maxima), isolasi DNA, CTAB
Analisis Cemaran Kapang dan Khamir pada Jamu Serbuk Instan Jahe Merah dan Temulawak Dion, Romario; Purwantisari, Susiana
Berkala Bioteknologi Vol. 3 No. 2 November 2020
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRACTInstant herbal medicine is a powder or granule form of herbal medicine that is usually made from sugar and spices which are combined with or without the addition of other food ingredients and food additives. Powdered herbal medicine has the advantage that it is practical and fast in serving, and has a relatively long shelf life. However, poor processing of herbal powder can lead to microbial contamination such as mold and yeast. This study aims to determine the presence of mold and yeast contamination contained in the red ginger and ginger powder herbs. The steps taken in this study were sampling, preparation of tools and materials, homogenization and sample dilution, and testing for mold and yeast levels. This research was conducted for 2 months from August to September 2020 at the Biotechnology Laboratory, Department of Biology, Faculty of Science and Mathematics, Diponegoro University. The results showed that the mold and yeast levels found in the red ginger powder herbal sample were 1 x 101 colonies / g, while the mold and yeast levels found in the ginger powder herbal medicine were 21 x 101 colonies / g. of the two samples have met the standards of BPOM RI Regulation Number 32 of 2019 so that it can be concluded that the red ginger and ginger powder herbs are still safe for consumption.Keyword :  Herbal powder, Contaminants, Molds and Yeasts
Analisis Efektivitas Probiotik di Dalam Produk Kecantikan sebagai Antibakteri terhadap Bakteri Staphylococcus epidermidis Aviany, Hanna Berliana; Pujiyanto, Sri
Berkala Bioteknologi Vol. 3 No. 2 November 2020
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRAK                 Probiotik merupakan suplemen makanan berupa mikrobia hidup yang memiliki efek menguntungkan bagi inang yang mengkonsumsi melalui keseimbangan mikrobia intestin. Probiotik mempunyai potensi sebagai antiinflamasi dan yang biasa digunakan dalam produk kecantikan adalah probiotik topical memiliki efek  positif  untuk  terapi  dan  pencegahan  masalah  yang  timbul  pada  kulit, seperti penuaan, jerawat, rosasea, infeksi bakteri dan jamur, psoriasis, dan dermatitis. Penelitian bertujuan untuk mengetahui aktivitas antibakteri pada probiotik terhadap Staphylococcus epidermidis. Penelitian dilakukan melalui beberapa   proses   dan   tahapan   hingga   didapatkan   hasil   positif   dengan ditandainya zona bening pada cawan petri. Tahapan dan metode yang dilaksanakan  antara  lain  preparasi,  pembuatan  isolat,  pembuatan  larutan standar mcfarland dan uji aktivitas antibakteri. Hasil penelitian yang didapatkan adalah zona bening sebesar 5 mm pada kertas cakram di cawan petri I dan sebesar 3 mm dan 2 mm pada kertas cakram di cawan petri II. Namun zona bening yang diperoleh belum menunjukkan efektivitas probiotik sebagai antibakteria terhadap Stapyhlococcus epidermidis.   Kata Kunci: Probiotik, Uji Aktivitas Antibakteri, dan Staphylococcus epidermidis
Isolasi Dan Karakterisasi Bakteri Asam Laktat Pada Pangan Fermentasi Mandai Siregar, Mangasa Tua Pandapotan; Kusdiyantini, Endang; Rukmi, Isworo
Berkala Bioteknologi Vol. 3, No. 1, April 2020
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kalimantan Timur memiliki banyak produk olahan makanan tradisonal, salah satunya adalah mandai yang merupakan makanan fermentasi berbahan dasar kulit buah cempedak (Arthocarphus champeden). Bakteri asam laktat yang terlibat dalam fermentasi mandai sangat berpengaruh pada mutu produk akhir. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan isolasi dan karakterisasi bakteri asam laktat pada proses fermentasi mandai. Medium MRS Agar digunakan dalam proses isolasi bakteri selama 14 hari. Isolasi bakteri yang didapatkan selama proses fermentasi mandai adalah 17 isolat, dengan sembilan isolat bakteri Gram negatif dan delapan isolat bakteri Gram positif. Delapan isolat bakteri gram positif menunjukkan hasil positif terhadap beberapa karakterisasi morfologi dan biokimia. Karakterisasi biokimia meliputi, pembentukan asam dan produksi gas dari glukosa, uji motilitas, uji katalase, pertumbuhan di 160C dan 480C, hidrolisis pati, hidrolisis lemak, dan hidrolisis kasein serta uji pembentukan asam. Delapan isolat bakteri membuat mandai menjadi produk olahan pangan yang memiliki cita rasa asam.
Deteksi Gen DXS dan Penentuan Jalur Biosintesis Karotenoid pada Chlorella pyrenoidosa Monalita, Ramadhebi; Kusumaningrum, Hermin; Budiharjo, Anto
Berkala Bioteknologi Vol. 2 No. 2 November 2019
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Sintesis karotenoid alami belum pernah melebihi produk sintetik pada skala komersial. Kurangnya pemahaman mengenai aspek mikrobiologis dan ekofisiologis isolat penghasil karotenoid menyebabkan terjadinya kesalahan penamaan spesies. Satu isolat lokal alga hijau yang digunakan sebagai pakan alami sumber karotenoid dalam industri makanan yaitu Chlorella pyrenoidosa. Akumulasi karotenoid jalur non- MVA pada alga hijau ditentukan oleh enzim D-1-deoksixilulosa 5-fosfat sintase, yang disandi oleh gen D- 1-deoksixilulosa 5-fosfat sintase (DXS). Tujuan utama penelitian ini adalah untuk mendeteksi gen DXS sebagai penyandi enzim kunci biosintesis karotenoid pada C. pyrenoidosa apakah juga mengikuti jalur non- MVA untuk biosintesis karotenoidnya atau tidak. Metode karakterisasi morfologis dan ekofisiologis dilakukan berdasarkan pengamatan secara berkala dan deteksi gen DXS menggunakan panduan Kuzuyama (2000). Hasil analisis keserupaan gen DXS C. pyrenoidosa pada daerah lestari memperlihatkan dapat mendeteksi parsial gen DXS dari Chlamydomonas reinhardtii. Tidak adanya hambatan pertumbuhan pada C. pyrenoidosa dengan lovastatin menunjukkan jalur non-MVA adalah jalur yang digunakan dalam biosintesis karotenoidnya.
Karakteristik Morfologi, Biokimia, Dan Molekuler Isolat Khamir IK-2 Hasil Isolasi dari Jus Buah Sirsak (Annona muricata L.) Suryaningsih, Vivi; Ferniah, Rejeki Siti; Kusdiyantini, Endang
Berkala Bioteknologi Vol. 1, No. 2, November 2018
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Khamir seringkali ditemukan pada makanan yang banyak mengandung gula seperti pad a buah-buahan. Khamir memanfaatkan gula sederhana pada makanan untuk mendapatkan energi. Khamir memiliki peran dalam fermentasi buah secara alami yang mengakibatkan terjadinya pembusukan, perubahan warna, dan menyebabkan buah menjadi tidak tahan lama. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengisolasi khamir dari buah sirsak dan mengidentifikasi khamir secara morfologi, uji biokimia, dan molekuler berdasarkan daerah Internal Transcribed Spacer (ITS). Isolasi khamir dilakukan dengan menumbuhkan pada medium PDA dan kloramfenikol. Identifikasi dilakukan melalui uji biokimia dan Identifikasi molekuler menggunakan daerah Internal Transcribed Spacer (ITS). Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat khamir IK-2 yang diisolasi dari jus buah sirsak memiliki bentuk oval, elevasi menonjol, berwarna putih agak krem, pembentukan tunas, mampu memfermentasi glukosa dan sukrosa, tetapi tidak pada laktosa, serta mampu tumbuh pada media dengan kadar glukosa 50%. Analisis molekuler daerah ITS menggunakan primer ITS1 dan ITS4, dan analisis filogenetik menggunakan Neighbor Joining. Hasil Basic Local Alignment Tools (BLAST) menunjukkan homologi 95% dengan Candida tropicalis.