Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Jurnal Biosense

OPTIMASI SUHU ANNEALING MARKA MOLEKULER SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR) UNTUK STUDI KERAGAMAN GENETIK Aglaonema pictum (Roxb.) Kunth Maharani, Fira Shabrina Bintang; Hariri, Muhammad Rifqi; Turhadi, Turhadi
JURNAL BIOSENSE Vol 8 No 4 (2025): Edisi Oktober 2025
Publisher : Program Studi Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas PGRI Banyuwangi, Jalan Ikan Tongkol No 01, Telp (0333) 421593, 428592 Banyuwangi 68416

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36526/biosense.v8i4.5695

Abstract

Aglaonema pictum (Roxb.) Kunth merupakan tanaman hias populer di dunia karena memiliki variasi corak warna daun. Studi tentang keragaman genetik A. pictum masih jarang dilakukan, sehingga upaya ini perlu dilakukan. Salah satu penanda molekuler yang dapat digunakan untuk mengetahui keragaman genetik yaitu Simple Sequence Repeats (SSR). Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi kondisi optimum pada primer SSR untuk studi keragaman genetik A. pictum. Metode yang digunakan adalah pengumpulan sampel, ekstraksi DNA menggunakan cetyltrimethylammonium bromide (CTAB), amplifikasi DNA menggunakan primer SSR (OSR13, RM10, RM6470, OSR14, MRG2172_RT2172, MRG2153_RGP2153, RM249, RM100, MRG2881_RT2881, dan RM7240) dengan menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) pada kisaran suhu 52-54℃, 55-59℃, 47.2-50.9℃, dan 47.6-50.4℃, elektroforesis dan dokumentasi gel agarosa, serta analisis data. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dua dari sembilan primer SSR (RM249 dan RM7240) dapat diamplifikasi dengan baik pada suhu 49,3 ˚C dan 52,6 ˚C. Kedua suhu tersebut mengindikasikan suhu optimum yang dapat mengamplifikasi DNA sampel A. pictum. Sementara itu, primer OSR13, RM10, RM6470, OSR14, MRG2172_RT2172, MRG2153_RGP2153, RM100, MRG2881_RT2881 tidak berhasil teramplifikasi dengan baik dan spesifik pada rentang suhu annealing yang digunakan dalam penelitian ini.
Co-Authors . Hamim . Miftahudin . PRIYONO Abdullah Abdullah Aliarani Rosyidiana Putri Amalia Danti Safa Audia Annisa Aulya Aksa Asmini Budiani Bedjo Bedjo Briliyan Natalina Sudarjayanti Cristina Mega Meyfiani Kekung Dawama Nur Fadlilah Deden Sukmadjaya Dian Siswanto Dini Astika Sari Eko Suyanto Else Vilia Setiawan Elvina Rashida Khairi Estri Laras Arumingtyas Ezra, Achmad fatchiyah . Fatchiyah Fatchiyah Fatchiyah Fatchiyah Fatchiyah Fatchiyah Fathiyah Nurul Izzah Fatma Yona, Hafidza Fauziatul Fitriyah Fifi Mar’atun Solihah Fifi Mar’atun Solihah Firda Nuri Asyhari Galuh Arkana Giral Baines Mora Grace Christy Haikal Ageng Maulana Hamim Hamim Hamim Hamim Hayati Minarsih Hayati Minarsih Hayati Minarsih Hose, Victor Alvianoes Guterez Husaini, Iin Pertiwi A Iin Pertiwi A Husaini Imron RIYADI Imron Riyadi Karuniasari, Nadaa Kekung, Cristina Mega Meyfiani Khairunnisa Hidaya, Amira Luchman Hakim Maharani, Fira Shabrina Bintang Masna Maya Sinta Mentari Putri Pratami Miftahuddin Miftahuddin Miftahuddin Miftahudin . Mufidah Afiyanti Muhammad Rifqi Hariri Muhammad Rifqi Hariri Muhammad Wisam Wira Sakti Munif Ghulamahdi Muwaffiq Faza, Ahmad Nabila Shafa Yumna Salsabila Nandagesta Aurelia Shafa Wagmi Nashafi, Azizuddin Muhammad Nuraini Rosyadah Padmana, I Made Dhena Radya Pratama, Ardo Cahya Rahmadini, Agnia Fadillah Rahmi Izzati Raissa Kendra Ainiyah Rayhan Yugo Nurul Maulana Riza Arief Putranto Rizka Tamania Saptari Rodiyati Azrianingsih Rodiyati Azrianingsih Salma Wahid Marseti Septhyanti Aprilia Kavitarna Serafinah Indriyani Serafinah Indriyani Setiyanto, Afif Eka Rahma Shafala Safa, Muhammad Solihah, Fifi Mar’atun Suharjono Suharjono Sustiprajitno Sustiprajitno Talitha Pangestu, Twistka Yohanna Sisilia Grace Sirait Yuli Setiawati