cover
Article Per Year (5 Year)
All
Home Page
OAI Link
Editorial Team
Contact
Reviewer
Google Scholar
Contact Name
ARI HAYATI
Contact Email
ari.hayati@unisma.ac.id
Phone
+62341- 551932
Journal Mail Official
biosaintropis@unisma.ac.id
Editorial Address
Tata Usaha FMIPA Unisma Gedung Usman bin Affan Kompleks Unisma Jl. MT Haryono 193 Malang 65144
Location
Kota malang,
Jawa timur
INDONESIA
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience-Tropic)
Published by Universitas Islam Malang
ISSN : 23382805     EISSN : 24609455     DOI : https://doi.org/10.33474/e-jbst.v7i2.305
Core Subject : Agriculture, Social,
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Environmental Science
Jurnal ini mengkaji fenomena dan temuan penelitian di bidang biologi dan ilmu-ilmu dasar (sains) lainnya serta bidang studi di wilayah tropis. Jurnal ini ditujukan untuk menemukan solusi alternatif dalam perkembangan ilmu biologi demi kesejahteraan masyarakat Indonesia dan Dunia.
Arjuna Subject : Biokimia, Genetika dan Biologi Molekuler - Bioteknologi
Articles 8 Documents
 1 
Search results for , issue "Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro" : 8 Documents clear
PENGARUH PEMBERIAN BERBAGAI KONSENTRASI KOLKISIN DENGAN LAMA PERENDAMAN TERHADAP RESPON FENOTIPIK ZAITUN (Olea europaea) Sirojuddin M. Rochmat; Tintrim Rahayu; Saimul Laili
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (211.95 KB)

Abstract

Olive plant is a plant that lives in the Middle East region, but also in Indonesia olive plant can grow. Olive trees can be propagated by using various ways such as using ovule (spheroplast) or stem cuttings. One effort that can be applied to improve plant genetic olive namely through the use of colchicine. Colchicine can induce chromosomal polyploidy, or doubling the olive set chromosome. The method of administration of colchicine can be done on the part of the plant that are actively dividing such as the root end. It can resulting in the appearance of plants that grow large. This study aimed to determine the effect of colchicine at various concentrations and soaking time of the olive plant phenotypic response. The method used in this study is an experimental method with a randomized block design. Treatment given soaking time is 1 and 2 hours and colchicine concentrations of 0% (control), 0:25% 0:50%, 0.75% and 1%. Units were divided into three groups and each group consisted of three replications. Analyses were performed using ANOVA two way analysis at α = 0.95.The analysis showed that the treatment of colchicine concentration and soaking time and no significantly effect on plant height and number of leaves on the olive, but significant effect on the increase of stem diameter at the treatment of 0.25% with a soaking time of 1 hour.Keywords: phenotypic response, olive, colchicine concentration, soaking timeABSTRAKTanaman zaitun merupakan tanaman yang hidup di wilayah Timur Tengah, tetapi di Indonesia tanaman zaitun dapat tumbuh. Pohon zaitun dapat diperbanyak dengan menggunakan berbagai cara seperti menggunakan bakal biji (spheroplast) atau pun stek batang. Salah satu upaya yang dapat diterapkan untuk memperbaiki genetik tanaman zaitun yaitu melalui penggunaan kolkisin. Kolkisin dapat menginduksi poliploidi atau penggandaan kromosom pada tanaman zaitun. Metode pemberian kolkisin dapat dilakukan pada bagian tanaman yang sedang aktif membelah seperti pada ujung akar sehingga mengakibatkan kenampakan tanaman yang bertambah besar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pemberian kolkisin pada berbagai konsentrasi dan lama perendaman terhadap respon fenotipik tanaman zaitun. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode eksperimental dengan rancangan acak kelompok (RAK). Perlakuan lama perendaman yang diberikan adalah 1 dan 2 jam serta konsentrasi kolkisin yaitu 0% (kontrol), 0.25%, 0.50%, 0.75% dan 1%. Unit percobaan dibagi ke dalam tiga kelompok dan tiap kelompok terdiri dari tiga ulangan. Analisis dilakukan dengan menggunakan ANOVA dua arah pada P=0.05. Hasil analisis menunjukkan bahwa perlakuan konsentrasi kolkisin dan lama perendaman tidak pengaruh nyata terhadap tinggi tanaman dan jumlah daun pada tanaman zaitun, akan tetapi memberikan pengaruh nyata terhadap pertambahan diameter batang pada perlakuan 0,25% dengan lama perendaman 1 jam.Kata Kunci: Respon fenotipik, zaitun, konsentrasi kolkisin, lama perendaman
PENGARUH PEMBERIAN SUBKRONIK EKSTRAK METANOLIK Scurrula atropurpurea (Bl) Dans TERHADAP KADAR KREATININ TIKUS WISTAR Nurhidayah Indah Prastika; Nuor Athiroh; Hari Santoso
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (241.189 KB)

Abstract

Levels of creatinine in the blood is one indicator of the diagnosis of kidney function. The higher the levels mean a higher likelihood of kidney dysfunction, because it shows that the ability of the kidneys to excrete these substances has begun to diminish. One of the causes of high creatinine levels is the presence of free radicals. Thus it is necessary for the prevention of free radical substance using active antioxidants of quercetin derived from the leaves of tea parasite that work to stabilize free radicals. The purpose of this research was to determine the of Extract of methanolic of tea parasite Scurrula atropurpurea Bl. Dans (EMSA) effect to creatinine levels in test animals Wistar rats (Rattus norvegicus). This study uses True Experimental Design completely randomized design (CRD) with four treatments were given as much as five times a week for 28 days, control, EMSA dose of 250 mg/Kg BW, 500 mg/Kg BW, 1000 mg / Kg BW. Based on the results of this study on all treatments, after giving EMSA has no effect on blood creatinine levels in rats Rattus norvegicus Wistar during 28 days (Sub-Chronic), it is suspected that EMSA not toxic so it does not cause damage to kidney function.Keywords : Extract, Kreatinin, Sub-ChronicABSTRAKKadar kreatinin dalam darah merupakan salah satu indikator mendiagnosis fungsi ginjal. Makin tinggi kadarnya berarti makin besar kemungkinan terjadinya disfungsi ginjal, karena menunjukan bahwa kemampuan ginjal mengeluarkan zat tersebut sudah mulai berkurang. Salah satu penyebab tingginya kadar kreatinin adalah adanya radikal bebas. Maka dari itu perlu dilakukan pencegahan terhadap redikal bebas dengan menggunakan zat aktif kuersetin yaitu antioksidan yang berasal dari daun benalu teh yang bekerja menstabilkan radikal bebas. Tujuan pada penelitian ini adalah untuk mengetahui efek pemberian ekstrak metanolik benalu teh  Scurrula atropurpurea Bl. Dans (EMSA) terhadap kadar kreatinin pada hewan uji tikus wistar (Rattus norvegicus). Penelitian ini menggunakan metode True Experimental Design Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan empat perlakuan yang diberikan sebanyak 5 kali dalam satu minggu selama 28 hari yaitu kontrol, EMSA dosis 250 mg/Kg BB, 500 mg/Kg BB, 1000 mg/Kg BB. Berdasarkan Hasil penelitian ini pada semua perlakuan, pemberian EMSA tidak berpengaruh terhadap kadar kreatinin darah pada tikus wistar Rattus norvegicus selama 28 hari (subkronik), hal ini diduga bahwa EMSA tidak bersifat toksik sehingga tidak menyebabkan kerusakan pada fungsi ginjal.Kata kunci : Ekstrak, Kreatinin, Subkronik.
KAJIAN SUBKRONIK EKSTRAK METANOLIK Scurrula atropurpurea (BI) Dans TERHADAP KADAR GLUTAMIC OXALOACETIC TRANSAMINASE TIKUS BETINA Uyunul Hikmah; Nour Athiroh; Hari Santoso
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (204.82 KB)

Abstract

Liver is an organ that susceptible to the ravages of drugs or toxic chemicals substance because liver is central’s organ occurrence of body’s metabolism. Liver damage can be known with increasing levels of Serum Glutamic Oxaloacetic Transaminase (SGOT) in the blood. This study aimed to know levels of SGOT on female wistar rats after administering Metanolic extract of Scurrula atropurpurea for 28 days (Sub-Chronic exposure).  This re-search used a True Experimental Design with Complete randomized design. Twenty female wistar rats, weight 100-200 gr are divided into 4 groups, 1 group as control and 3 groups is the treatment, treatment groups were given different doses with EMSA i.e. 250 , 500, and 1000 mg/Kg BW. Rats were fasted for 14-18 hours before it had given treatment. EMSA awarded at least 5 times a week for 28 days.  After 28 days, rats were sacrificed and done the examination levels of SGOT, serum levels of SGOT treatment group compared the control. The results showed that levels of SGOT in serum of mice have an increased dose of 250, 500, and 1000 mgKg BW compared with controls, but having tested the ANOVA showed that the treatment group of mice did not differ markedly compared the control, this means that Metanolic extract of Scurrula atropurpurea has no effect against a female rat serum levels of SGOT and no toxic effects so securely test sub-chronic.Keywords: Liver, Loranthus tea, SGOT, Sub-ChronicABSTRAKHati merupakan organ yang sangat rentan terhadap kerusakan akibat obat atau bahan kimia beracun karena hati merupakan organ pusat terjadinya metabolisme dalam tubuh. Kerusakan hati dapat diketahui dengan indikator meningkatnya kadar Serum Glutamic Oxaloacetic Transaminase (SGOT) dalam darah. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kadar SGOT pada tikus wistar betina setelah pemberian Ekstrak Metanolik Scurrula atropurpurea (EMSA) selama 28 hari (paparan subkronik). Jenis penelitian ini merupakan True Experimental Design dengan Rancangan Acak Lengkap. Jumlah tikus yang digunakan 20 ekor tikus wistar betina dengan berat badan 100-200 gr yang dibagi menjadi 4 kelompok, 1 kelompok sebagai kontrol dan 3 kelompok adalah perlakuan, kelompok perlakuan diberi EMSA dengan dosis berbeda yaitu 250 mg/Kg BB, 500 mg/Kg BB, dan 1000 mg/Kg BB, tikus dipuasakan selama 14-18 jam sebelum disonde. EMSA diberikan minimal 5 kali dalam seminggu selama 28 hari. Setelah 28 hari, tikus dikorbankan dan dilakukan pemeriksaan kadar SGOT dari serum, hasil kadar SGOT kelompok perlakuan dibandingkan dengan kontrol. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kadar SGOT pada serum tikus mengalami peningkatan dari dosis 250, 500, dan 1000 mgKgBB dibandingkan dengan kontrol, namun setelah diuji ANOVA menunjukkan bahwa tikus kelompok perlakuan tidak berbeda nyata dibandingkan dengan tikus kontrol, hal ini berarti bahwa EMSA tidak berpengaruh terhadap kadar SGOT serum tikus betina dan tidak ada efek toksik yang dituimbulkan sehingga EMSA aman secara uji subkronis.Kata kunci: Hati, SGOT, Benalu Teh, Subkronik
PENGARUH PEMBERIAN KOLKISIN TERHADAP KARAKTER STOMATA DAUN ZAITUN (Olea europeae L.) Ainur Rohmah; Tintrim Rahayu; Ari Hayati
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (329.485 KB)

Abstract

The olive plant (Olea europaea L.) is a plant in the area with a hot climate to a temperate climate. Polyploids can be ocur naturally or unnaturally in plants. Artificially polyploids can be done with chemical substances, one of them is Colchicine. Induction of polyploids in colchicine with a high concentration because the size of stomata became larger and the number of stomata will be decline. The plants that are polyploids in anatomy can be marked with the size of his cell becomes larger. This research is attempted to know the influence of various concentrations of colchicine against the shape, size, and density of stomata, olive leaf (Olea europaea L.). This research use the method of complete Random design experiments that is consist of 5 treatment with the soaking and drops. Research parameters include form/type stomata density, stomata and the size of the length and width of the stomata. The results showed that the present of colchicine can affect the size of stomata, olive leaf (Olea europaea L.). 0.75% concentration is the better results than other concentrations. However, the present of colchicine has not effect to the change of shape and density of stomata, olive leaf (Olea europaea L.). Key words: Colchicine, Polyploidy, Stomata, olive (Olea europaea L.).ABSTRAKTanaman zaitun  (Olea europaea L.) merupakan tanaman yang banyak terdapat di daerah dengan iklim panas sampai iklim sedang. poliploid ini dapat terjadi secara alami maupun buatan pada tanaman. Poliploid  secara buatan dapat dilakukan dengan zat kimia, salah satunya dengan kolkisin. Induksi poliploid pada kolkisin dengan konsentrasi yang tinggi dapat menyebabkan ukuran stomata menjadi lebih besar dan jumlah stomata akan mengalami penurunan. Tanaman yang bersifat poliploid secara anatomi dapat ditandai dengan ukuran selnya menjadi lebih besar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh berbagai konsentrasi kolkisin terhadap bentuk, ukuran, dan kerapatan stomata daun zaitun (Olea europaea L.). Penelitian ini menggunakan  metode eksperimen dengan Rancangan Acak lengkap (RAL) yang terdiri atas 5 perlakuan dengan perendaman dan tetes. Parameter penelitian meliputi bentuk/ tipe stomata, kerapatan stomata dan ukuran panjang dan lebar stomata. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pemberian kolkisin dapat berpengaruh terhadap ukuran stomata daun zaitun (Olea europaea L.). Konsentrasi 0,75% merupakan hasil yang paling baik daripada konsentrasi yang lain. Akan tetapi pemberian kolkisin tidak berpengaruh terhadap perubahan bentuk dan kerapatan stomata daun zaitun (Olea europaea L.).Kata Kunci: Kolkisin, Poliploidi, Stomata, Zaitun (Olea europaea L.).
PENENTUAN KUANTITAS SEL Saccharomyces cerevisiae DENGAN TURBIDIMETRI Ahmad Syauqi
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (245.535 KB)

Abstract

The purpose of this research is first, study turbidity levels that consistent of fungal cell suspensions form of Saccharomyces cerevisiae with turbidimeter instrument. Second, to obtain the S cerevisiae cells quantity using visible spectrophotometer instrument at a wavelength of 600 nm. Third, to obtain a significant linear between the number of S cerevisiae cells and the absorption of that spectrum result of spectrophotometer instruments and quantity of cells with turbidity. Research using randomized block design experiment. The variables in the study consisted of: independent variable of amount suspended cells that have different types and levels of concentration are shown turbidity (NTU) and the criteria on the interval readings% T 20-80 wavelength spectrum of 600 nm as the fulfilment of the law of Lambert-Beer; dependent variable is the number of cells per volume. Using a statistical analysis of covariance to test the consistency of the group replicates, each of which has a regression relationship. The experiments were performed with the replication of the type of granule cells 2 x 10 times and totalling 40 units. Turbidity caused by Saccharomyces cerevisiae cells have a consistent characters such as the use of its interaction with a wavelength of 600 nm spectrum that meets the Lambert-Beer law. Four replications follow the covariance analysis showed every value of slopes is not different. Linear equation between the quantity of cells and light of turbidimeter by light scattering in this study did not result yet in the value of accuracy that expected.Keywords: Saccharomyces cerevisiae cell, a wavelength of 600 nm, turbidityABSTRAKTujuan penelitian adalah pertama, mempelajari tingkat kekeruhan yang konsisten bentuk suspensi sel jamur Saccharomyces cerevisiae dengan instrumen Turbidimeter. Kedua, mendapatkan kuantitas sel S cerevisiae menggunakan instrumen spektrofotometer sinar tampak pada panjang gelombang 600 nm. Ketiga, mendapatkan sifat linier yang nyata antara jumlah sel S cerevisiae dan serapan spektrum tersebut hasil kerja instrumen spektrofotometer dan kuantitas sel dengan kekeruhan pada turbidimeter.Penelitian menggunakan metode eksperimen rancangan acak kelompok. Variabel dalam penelitian terdiri atas: Variabel bebas jumlah padatan tersuspensi yang mempunyai jenis dan tingkat konsentrasi berbeda ditunjukkan kekeruhan (NTU) dan memiliki kriteria pada selang pembacaan %T 20 – 80 spektrum panjang gelombang 600 nm sebagai pemenuhan hukum Lambert-Beer; variabel tergantung yaitu jumlah sel tiap volume.Menggunakan analisis statistik kovariansi untuk menguji konsistensi kelompok ulangan yang masing-masing memiliki hubungan regresi. Percobaan dilakukan dengan replikasi jenis granul sel 2 x 10 kali dan keseluruhan berjumlah 40 unit.Kekeruhan yang ditimbulkan oleh sel Saccharomyces cerevisiae mempunyai karakter konsisten seperti penggunaan interaksinya dengan spektrum panjang gelombang 600 nm yang memenuhi hukum Lambert-Beer. Setiap ulangan yang dilakukan menghasilkan slope yang sama. Persamaan linier antara kuantitas sel dan cahaya lampu turbidimeter dengan hamburan cahaya dalam penelitian ini belum menghasilkan nilai ketepatan yang diharapkan.Kata kunci: Sel Saccharomyces cerevisiae, panjang gelombang 600 nm, kekeruhan
KAJIAN PEMBERIAN KOLKISIN DENGAN METODE TETES TERHADAP PROFIL POLIPLOIDI TANAMAN ZAITUN (Olea europaea) Dewi Rahayu Saraswati; Tintrim Rahayu; Ari Hayati
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (298.949 KB)

Abstract

The olive (Olea europaea) included in the family Oleaceae. Olive (Olea europaea) has 2n = 46 chromosomes. Accelerated evolution in higher plants can be characterized by an increase in the number of chromosomes as a result of polyploidy. Polyploidy can be done by duplicating the number of chromosomes and this can be caused by several antimitotic agent and the most common of which is colchicine. Colchicine many successfully used to obtain polyploidy in Olive plants for increasing secondary metabolite ingredients. This study aims to determine chromosome profiles olive plants after administration concentration of colchicine 0 %, 0.25 %, 0.50 %, 0.75 % and 1 % using drip method. The method used in this research is descriptive qualitative method. The results showed that administration of colchicine with a drip method can affect the olive plant chromosome profile. Observations at a concentration of 1 % indicate that chromosomes in the concentrations seen more. It can be used as an indication of polyploidy in Olive plants. Keywords: Polyploidy, Olives, Colchicine.ABSTRAKPohon zaitun (Olea europaea) termasuk ke dalam famili Oleaceae. Zaitun (Olea europaea) memiliki kromosom 2n = 46. Evolusi yang dipercepat pada tanaman tingkat tinggi dapat ditandai oleh bertambahnya jumlah kromosom sebagai hasil poliploidi. Kromosom dapat diduplikasi melalui mutasi sehingga memunculkan peristiwa poliploidi. Poliploidi dapat dilakukan dengan menggunakan kolkisin sebagai agen antimitosis. Kolkisin telah banyak digunakan untuk memperoleh poliploidi pada tanaman zaitun untuk meningkatkan kandungan metabolit sekundernya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil kromosom tanaman zaitun setelah pemberian konsentrasi kolkisin 0%, 0,25%, 0,50%, 0,75% dan 1% dengan menggunakan metode tetes. Metode penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode deskriptif kualitatif. Hasil pengamatan menunjukkan bahwa pemberian kolkisin dengan metode tetes dapat mempengaruhi profil kromosom tanaman zaitun. Hasil pengamatan pada konsentrasi 1% menunjukkan bahwa kromosom pada konsentrasi tersebut cenderung lebih banyak. Hal ini dapat digunakan sebagai indikasi adanya poliploidi pada tanaman zaitun. Kata Kunci: Poliploidi, zaitun, kolkisin
PEMBERIAN EKSTRAK METANOLIK Scurrula atropurpurea (BI) Dans SECARA SUBKRONIK TERHADAP PROTEIN TOTAL DAN ALBUMIN TIKUS BETINA Fatimah Abdul Sammad; Nour Athiroh AS; Hari Santoso
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (210.367 KB)

Abstract

Parasites species of Scurrula atropurpurea (Bl) Dans is plants parasitic on tea tree (Thea sinensis L). Extract of parasites species containing sixteen of bioactive substances. Attention preparation security test need to undergone a toxicity sub-chronic to see the biochemical reactions (protein total and albumin). Using clinical biochemistry parameter as an indicator of the damaged hepar. Research aim is to understand the provision influence of Scurrula atropurpurea (Bl) Dan metanolic extract toward levels of a total protein and albumin serum in female mice for 28 days. A method use true experiment with complete random design. EMSA were presented in mice for 28 days (sub-chronic). The number of mice is 20 and divided into 4 groups; one group as control and three groups have different doses of EMSA. Level of a protein total and albumin in serum of mice examined. The group directly compared to the control then done data analysis of ANOVA in SPSS 17. The analysis shows the treatment is not significant difference (P>0.05) with control. Provision of doses 250 mg/kg body weight (BW), 500 mg/kg BW and 1000 mg/kg BW are not influence toward levels of a total protein and albumin in serum of mice.Keywords: sub-chronic, total proteins and albuminABSTRAKEkstrak tanaman benalu Scurulla atropurpurea Bl. Dans memiliki enam belas bahan bioaktif dan tumbuh pada pohon teh (Thea sinensis L). Protein Total dan Albumin digunakan untuk melihat reaksi biokimia yaitu perhatian kepada keamanan sediaan uji dan perlu dilakukan uji toksisitas subkronik. Penggunaan parameter biokimia klinis adalah indikator adanya kerusakan hepar. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pemberian ekstrak metanolik Scurrulla atropurpurea (Bl) Dans terhadap kadar Protein Total dan albumin serum tikus betina selama 28 hari. Jenis penelitian ini adalah True Experimental Design dengan rancangan Acak Lengkap. EMSA dipaparkan pada tikus selama 28 hari (subkronis) dengan jumlah tikus sebanyak 20 ekor dan dibagi menjadi empat kelompok; satu kelompok sebagai kontrol dan tiga kelompok mempunyai dosis EMSA yang berbeda. Serum tikus diperiksa tingkat kadar Protein Total dan Albumin. Kelompok perlakuan langsung dibandingkan dengan kontrol kemudian analisis data menggunakan ANOVA pada SPSS 17. Analisis ANOVA pada perlakuan tidak berbeda nyata (p>0,05) dengan kontrol, hal ini menunjukkan bahwa pada pemberian dosis 250 mg/kg berat badan (BB), 500 mg/kg BB dan 1000 mg/kg BB tidak berpengaruh terhadap kadar Protein Total dan Albumin serum tikus.Kata Kunci : Subkronik, Protein Total dan Albumin
KARAKTERISASI PROFIL ZONA PELUSIDA MANUSIA (Homo sapiens) MENGGUNAKAN ANALISIS IN SILICO Nurul Jadid Mubarakati; Saimul Laili
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (329.248 KB)

Abstract

Most important in mammlian fertilization were egg binding sperm, whose fusion generates a zygote that will develop into a new individual. In mammals, zona pellucida (ZP) is a specialized extracellular matrix of the egg. The matrix is important for this process by directly mediating species-restricted recognition between gametes. The aims of this study was to analyze the profile of human (Homo sapiens) zonna pellucida (hZP) using in silico method, position of O-linked and N-linked glycosilation units on human ZP amino acid sequence and to predict interaction between ZP and ADAM 2. The method of research was using in silico analysis. ZP protein profile was using data mining in UNIPROT database. Profile exploration searched primery funtion of protein, location, expression place, protein structure and ZP-interaction protein. The Primer data was compared each other. Determining O-linked and N-linkedglycosilation units in hZP amino acid sequence was analyzed using O and N-Glycosylation sites prediction. The results showed that in silico analysis conducted that profile of ZP3 identified as a primary receptor sites for spermatozoa and induced acrosome reaction. Amino acid sequence in ZP have potential site in N-Linked and O-linked glycosilation units, but have quantity different. Keywords : human zonna pellucida, N- Glycosylation, O- Glycosylation, in silico.ABSTRAKTahapan awal yang paling penting dalam fertilisasi mamalia adalah ikatan antara sel telur dan sperm yang dilanjutkan terbentuknya zigot dan terjadi perkembangan individu baru. Pada mamalia, zona pelusida merupakan lapisan ekstraseluler sel telur. Lapisan ini sangat penting dalam proses pengenalan secara langsung yang dimediasi oleh interaksi gamet. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui profil zona pelusida manusia secara in silico, untuk mengetahui posisi O-linked dan N-linked pada sekuen ZP manusia (Homo sapiens) serta memprediksi interaksi antara ZP dengan ADAM 2. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah menggunakan analisis in silico.Profil Protein Zona pelusida dilakukan dengan cara data mining di database UNIPROT. Eksplorasi profil dilakukan pada pencarian fungsi utama protein, lokasi protein, tempat ekspresi, struktur protein,dan juga protein yang berinteraksi dengan zona pelusida. Informasi dasar tersebut kemudian dikomparasi agar diketahui peranan protein yang paling krusial. Penentuan sisi potensial O-linked dan N-linked pada sekuen ZP manusia dianalisis menggunakan O dan N-Glycosylationsites prediction. Interaksi ZP dengan ADAM 2 menggunakan moleculer docking. Hasil penelitian menunjukkan bahwa profil zona pelusida (ZP) secara in silico diperoleh bahwa ZP3 berperan sebagai reseptor primer yang berperan dalam ikatan dengan spermatozoa pada oosit dan menginduksi reaksi akrosom. ZP memiliki sisi potensial pada N-glikosilasi maupun O-glikosilasi, namun memiliki jumlah yang berbeda.Kata kunci: Zona Pelusida manusia, N-glikosilasi, O-glikosilasi, in silico

Page 1 of 1 | Total Record : 8

 1 

Filter by Year

2017 2017


Reset
Filter By Issues
All Issue Vol 11 No 1 (2025): Agustus 2025 Vol 10 No 2 (2025): Januari 2025 Vol 10 No 1 (2024): Agustus 2024 Vol 9 No 2 (2024): January 2024 Vol 9 No 1 (2023): Agustus 2023 Vol 8 No 2 (2023): Januari 2023 Vol 8 No 1 (2022): Agustus 2022 Vol 7 No 2 (2022): Januari 2022 Vol 7 No 1 (2021): Agustus 2021 Vol 6 No 2 (2021): Memperjelas Fenomena Vol 6: Edisi Khusus Tafsir I tentang Masyarakat-Lingkungan-Hayati Vol 6 No 1 (2020): Kondisi Habitat Vol 5 No 2 (2020): Fase Pembentukan Tubuh dan Sebaran Makhluk Vol 5 No 1 (2019): Keragaman Populasi Makhluk Vol 4 No 2 (2019): Ekstrak dan Nutrisi Vol 4 (2019): Edisi Khusus: Pertalian Manusia - Makhluk Hidup Vol 4 No 1 (2018): Sehat Lingkungan Vol 3 No 3 (2018): Lingkungan Hidup dan Konsep di Masyarakat Manusia Vol 3 No 1 (2017): Lingkungan dalam dan luar tubuh makhluk hidup Vol 2 No 2 (2017): Dunia Makhluk Hidup Mikro dan Makro Vol 3 (2017): Edisi Khusus: Manfaat Metabolit dan Aktivitas Interaksi Makhluk Hidup Vol 2 No 1 (2016): Sumberdaya Lingkungan Vol 2, No 1 (2016): Sumberdaya Lingkungan Vol 1 No 1 (2015): Kearifan Lokal dan Biologi pada Usaha Perbaikan Kualitas Habitat Vol 1, No 1 (2015): Kearifan Lokal dan Biologi pada Usaha Perbaikan Kualitas Habitat More Issue