cover
Contact Name
Dinia R Dwijayanti,
Contact Email
biotropika@gmail.com
Phone
+62341-575841
Journal Mail Official
biotropika@gmail.com
Editorial Address
Departemen Biologi FMIPA UB, Jalan Veteran, 65145, Malang, Jawa Timur
Location
Kota malang,
Jawa timur
INDONESIA
Biotropika
Published by Universitas Brawijaya
ISSN : 23027282     EISSN : 25498703     DOI : 10.21776/ub.biotropika.
Biotropika: Journal of Tropical Biology invites research articles, short communication, and reviews describing new findings/phenomena of biological sciences in tropical regions, specifically in the following subjects, but not limited to biotechnology, biodiversity, microbiology, botany, zoology, biosystematics, ecology, and environmental sciences.
Arjuna Subject : -
Articles 544 Documents
Peran Alpha-S2 kasein Susu Kambing PE Terhadap Perbaikan Morfologi dan Histologi Membran Synovial Tikus Rheumatoid Arthritis Bia, Rivqi Rifa; Fatchiyah, Fatchiyah; Soewondo, Aris
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 2, No 5 (2014)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (94.516 KB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk menganalisa efek pemberian alpha-S2 kasein  susu kambing PE terhadap perubahan morfologi dan histologi membran sinovial tikus Rheumatoid Arthritis (RA). Tahapan penelitian meliputi pembuatan RA menggunakan multidosis CFA (Complete Freud Adjuvant. Kelompok perlakuan dibagi menjadi (C: Kontrol; CM: Kontrol + alpha-S2 kasein; RA: Rheumatois Arthritis; RAM: Rheumatois Arthritis + alpha-S2 kasein). Treatment RA dilakukan  selama 2 bulan dengan dosis 2mg/kg. Analisa morfologi dilakukan dengan skoring perubahan bentuk kaki dan histologi menggunakan metode HE yang divisualisasi menggunakan mikroskop BX53. Hasil penelitian menunjukkan adanya perbaikan morfologi yang ditandai dengan penurunan hasil skor klinis (C = 0; RA = 4; CM = 0; RAM = 1.3). Perbaikan histologi terletak pada penurunan jumlah hiperplasia pada kelompok RA + alpha-S2 kasein menuju kondisi normal dimana penurunan level tersebut mengidikasikan alpha-S2 kasein dapat digunakan sebagai alternatif penyembuhan RA.
Identifikasi Synaptula (Echinodermata : Holothuroidea) Raja Ampat Berdasarkan Gen COI Kurniasari, Robitoh Desi; Soewondo, Aris
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 2, No 5 (2014)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (86.451 KB)

Abstract

Identification of species Raja Ampat required in order to obtain marine biodiversity in Raja Ampat. Synaptula is one of the organism that inhabit in Raja Ampat and belonging to sea cucumber. Sea cucumber is an organism that difficult to distinguish through morphological characteristic.. This study aimed to identify Synaptula from Raja Ampat based on mitochondrial gene, cytochrome c oxidase subunit 1 (COI). The results of the study that Synaptula of Raja Ampat (UNP 101) is Plakobranchus ocellatus, the result is different with identification through morphological. Synaptula of Raja Ampat (UNP 101) has a high similarity with Plakobranchus ocellatus species from Sulawesi and the Philippines. Genetic distance Synaptula of Raja Ampat (UNP 101) with Synaptula reciprocans is 76.8%, while similarity values is 23.6%. The difference in the results of species  identification may be caused by contamination DNA Plakobranchus UNP 67A to DNA Synaptula UNP 101, contamination is likely to occur during the identification process which simultaneity. Keywords: COI gene, identification, Synaptula.  
Uji Daya Tumbuh Porang (Amorphophallus muelleri Blume) dari Berbagai Variasi Potongan Biji Turhadi, Turhadi; Indriyani, Serafinah
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (101.025 KB)

Abstract

Budidaya porang dapat dilakukan dengan metode perkecambahan poliembrioni yaitu pada satu biji dilakukan pembelahan untuk memisahkan bagian embrio yang ada di dalamnya. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui perbedaan jumlah tunas, persentase tumbuh bagian biji bertunas, biji yang bertunas secara monoembrio dan poliembrio, serta bagian biji yang non-viable dari berbagai variasi potongan biji porang. Biji dengan berat 0,17±0,017 gram dipotong dengan berbagai variasi potongan yaitu biji dipotong tiga (P1) dan dua (P2) membujur, dipotong tiga (P3) dan dua (P4) melintang, dan biji utuh (P5), kemudian dikecambahkan selama tujuh minggu. Biji bertunas difiksasi dalam larutan alkohol 70 %untuk pengamatan lebih lanjut. Rancangan percobaan yang digunakan adalah Rancangan Acak Lengkap dan tiap perlakuan diulang sebanyak empat kali. Analisis data menggunakan ANOVA dan dilanjutkan uji Tukey (α = 0,05) menggunakan program SPSS 16.0. Berdasarkan hasil penelitian diketahui bahwa jumlah tunas paling banyak terdapat pada perlakuan biji yang dibelah tiga melintang. Tunas yang muncul semuanya berasal dari bagian proksimal biji. Persentase tumbuh bagian biji bertunas paling tinggi terdapat pada perlakuan biji utuh (70,00±21,60 %). Biji porang yang bertunas secara poliembrio paling tinggi terdapat pada perlakuan biji porang utuh (35,00±10,00 %). Perlakuan pembelahan biji secara statistik tidak berpengaruh nyata dalam menghasilkan bibit porang poliembrio. Kata kunci: biji, poliembrio, porang, potongan, tunas
STUDY BIRDS ARE TRADE IN SPLENDID BIRD MARKET, MALANG Prakosa, Bayu Hendra; Kurniawan, Nia
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (138.388 KB)

Abstract

Splendid Bird Market was established in 1955 and located central city of Malang. The purpose of this study was to determine number of species birds are trade in Splendid Bird Market and knowing conservation status of bird traded in Splendid Bird Market, this studi started in January 1st until March 31th 2014 located at Splendid Bird Market. Tools and materials that used for collecting data are field guide bird identification of greater Sunda region and Wallacea region, camera, pocket book, handphone, and stationery. The method of collecting data consist of field observation, interview, collecting primary and secondary data. Data were analyzed using qualitative descriptive analysis. The results were found 10 ordes, 38 family, and 148  spesies of birds. Birds that were traded in Splendid bird market mostly come from Sumatera, Java, Bali, and Borneo and the percentage of that birds is 92%. Birds like Long-tailed Shrike (Lanius schach Linnaeus 1758), Oriental-magpie Robin (Copsychus saularis, Linnaeus 1758), White-rhumped Shama (Copsychus malabaricus, Scopoli 1786), Greater Leafbird (Chloropsis sonnerati, Jardine & Selby 1827), Orange-headed Thrush (Zoothera citrina, Latham 1790), Straw-headed Bulbul (Pycnonotus zeylanicus, Gmelin 1789), and Bali Starling (Leucopsar rothschildi Stresemann 1912) were most wanted by people. Several birds were migrant birds from East Asia, based on IUCN, 90% birds were traded in Splendid Bird Market have conservation status is least concern, and singing birds are most wanted by people. Keyword : Bird, Bird market, Bird trading.
Efectivity Test of Bitter Melon (Momordica charantia) and Bitter (Andrographis paniculata) Extract to T Lymphocytes Profile in Balb/C Mice Vilansari, Novembya
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (588.005 KB)

Abstract

Type 2 diabetes mellitus (T2D) is a disease caused by the ineffectiveness of the body in using insulin. Intake of hypoglycemic drugs currently available only to control and normalize blood sugar levels but not to heal. The aim of this research was to confirm the effects of bitter melon (Momordica charantia) and bitter (Andrographis paniculata) extract on quantitative changes of CD4+TNF-α+ T cells. This research used 20 female mice as a probandus which were divided into 5 treatment groups: negative control, positive control, dose 1, dose 2 and dose 3. T2D was induced by STZ (streptozotocin) injection. T2D induced mice were treated with poly-herbal medicine extracts. After 14 days, spleen and liver cells were isolated for flow cytometry analysis. The analysis showed that ethanol extract of bitter melon (Momordica charantia) and bitter (Andrographis paniculata) can ameliorate type 2 diabetes mellitus mice model. This is proved by the decreasing of  CD4+TNF-α+ after administration of the poly-herbal medicine. The poly-herbal medicine also lowers blood sugar levels in mice experiencing hyperglycemia.   Keywords: Bitter, Bitter Melon, Diabetes Mellitus, STZ
Activity Test of VipAlbumin® against Blood Glucose Levels and Lymfhocytes Profiles in Balbc mice as Type 2 Diabetes Mellitus model Silvana, Ganys Tri
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (237.707 KB)

Abstract

Activity Test of VipAlbumin® against Blood Glucose Levels and Lymfhocytes Profiles in Balb/c mice as Type 2 Diabetes Mellitus model   Ganys Tri Silvana1), Muhaimin Rifa’i2) 1) Biology Department, Faculty of Science, Brawijaya University, Malang, Indonesia   Abstract Diabetes mellitus (DM) has a prevalence that is increase from year to year, so we need an effective and economical drugs to cope. VipAlbumin® have high antioxidant content, so it can be used as an effective diabetes therapy. The purpose of this study was to determine the effect VipAlbumin® derived from Fish Cork (Channa striata) in decreasing blood glucose levels and assessing relative number of T cells. Mice models of  diabetes mellitus (DM) were created by injecting treptozotocin in  mice at the age of 5 days (streptozotocin in 1 ml of citrate buffer solution, a dose of 100 mg / kg BW). Mice were divided into 5 groups (Normal mice, DM, DM-D1, DM-D2 and DM-D3). After 3 weeks, the levels of blood glucose was examined and then oral therapy with VipAlbumin® was performed for 15 days. Profiles of CD4+, CD8+, and CD4+CD62L+ T cells were analyzed by flow cytometry by isolating splenic cells. One-way ANOVA was used to analyze the data. The differences between groups were considered significant at P<0.05. All results were presented as the mean of ± SD values of 5 mice in each group. In this experiment we showed that VipAlbumin® have a capability to prevent T cells activation by increasing naïve type status of both CD4 and CD8 population in mice model of DM. The number of CD4+ and CD8+ T cells decreased significantly in a dose of D3. Effective dose to decrease blood sugar in mice with type 2 diabetes is on the D3.   Keyword : Diabetes Melitus, Flowcytometry, Lympocytes, Streptozotocin, VipAlbumin®.
STRUKTUR KOMUNITAS MAKROINVERTEBRATA BENTOS DI SALURAN MATA AIR NYOLO DESA NGENEP KECAMATAN KARANGPLOSO KABUPATEN MALANG Rahmawati, Noviana Nur; Retnaningdyah, Catur
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (146.737 KB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil struktur komunitas makroinvertebrata bentos untuk evaluasi kualitas air di mata air Nyolo dan salurannya yang terletak di Desa Ngenep Kecamatan Karangploso Kabupaten Malang. Pengambilan sampel makroinvertebrata bentos dilakukan pada enam stasiun meliputi sekitar mata air Nyolo (stasiun satu dan dua), Curah Glogo (stasiun tiga dan empat), dan Curah Lang-lang (stasiun lima dan enam). Sampel diambil sebanyak ±100 individu/stasiun menggunakan Jaring Surber dan handnet. Pengumpulan data tiap stasiun meliputi komposisi dan kerapatan tiap spesies selanjutnya digunakan untuk menghitung kekayaan taksa, INP (Indeks Nilai Penting), dan indeks diversitas (H’). Hasil penelitian menunjukkan bahwa kekayaan taksa makroinvertebrata bentos yang ditemukan sebanyak 28 taksa dan bervariasi pada tiap stasiun. Baetidae, Caenidae, Melanoides tuberculata, Odonata dari famili Euphaeidae, Planaria dan Hydropsychidae jenis Cheumatopsyche sp. ditemukan di semua stasiun. Pada setiap stasiun didominasi oleh jenis yang berbeda, di stasiun satu terdapat  kodominasi Chironomidae dan Cheumatopsyche sp., stasiun dua didominasi oleh Melanoides tuberculata, stasiun tiga terdapat kodominasi Lymnaea rubiginosa, Thiara scabra, dan Dugesia trigina, stasiun empat terdapat kodominasi Cheumatopsyche sp. dan Simuliidae, dan di stasiun lima dan enam didominasi oleh Baetidae. Tingkat pencemaran bahan organik semakin menurun pada saluran yang semakin jauh dari mata air berdasarkan taksa makroinvertebrata bentos dominan yang ditemukan, namun demikian tingkat pencemaran bahan toksik  berdasarkan indeks diversitas Shannon-Wiener semakin tinggi. Kata kunci: makroinvertebrata bentos, mata air Nyolo dan salurannya, struktur komunitas
STUDI KELAYAKAN KUALITAS AIR MINUM DELAPAN MATA AIR DI KECAMATAN KARANGPLOSO KABUPATEN MALANG Rahmawati, Rani; Retnaningdyah, Catur
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (286.074 KB)

Abstract

Tujuan penelitian ini untuk melakukan evaluasi terhadap kualitas delapan mata air berdasarkan sifat fisik dan kimia air. Penelitian dilakukan di mata air Ngenep, PraNyolo, Umbulan, Langgar, Balittas, Lowoksari, Leses dan Soko yang terletak di Kecamatan Karangploso Kabupaten Malang. Pada  masing–masing  mata air  tersebut  dilakukan  pengambilan sampel air  pada dua titik sebagai ulangan. Parameter  yang diukur meliputi suhu, pH, DO, konduktivitas, turbiditas, BOD, nitrat, ortofosfat, alkalinitas, TDS, TSS, TOM dan debit. Perbedaan kualitas fisikokimia air antar mata air ditentukan dengan uji Anova yang dilanjutkan dengan Duncan Multiple Range test, analisis cluster dan PCA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa delapan mata air yang dipantau sudah tidak layak digunakan sebagai bahan baku air minum. Parameter yang sudah tidak memenuhi  baku mutu  berdasarkan  PP No 82 tahun 2001 tentang  Pengelolaan  Kualitas  Air dan  Pengendalian Pencemaran Air adalah nilai DO (semua mata air), BOD (mata air  PraNyolo), Nitrat (mata air  Langgar, Balittas, Lowoksari, Leses, Soko).   Kata kunci: Indeks Kualitas air Prati’s, Karangploso, kualitas air,  mata air
Regenerasi Tanaman dari Eksplan Kalus Bawang Putih (Allium sativum L.) secara In Vitro Fauziah, Arbaul; Widoretno, Wahyu
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (141.87 KB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh zat pengatur tumbuh auksin dan sitokinin terhadap induksi kalus dan regenerasi tanaman bawang putih (Allium sativum L.) secara in vitro. Medium Murashige and Skoog (MS) dengan penambahan kombinasi 2,4-D dan kinetin digunakan untuk induksi kalus dari eksplan meristem basal,  sedangkan NAA dan BAP digunakan untuk regenerasi planlet dari eksplan kalus. Pertumbuhan kalus pada medium kultur yang mengandung 2,4-D dan kinetin pada konsentrasi rendah lebih baik daripada konsentrasi tinggi. Kalus yang dikulturkan pada medium kultur yang mengandung NAA 0.1 ppm dikombinasikan dengan BAP 0.5-2 ppm mampu membentuk tunas. Jumlah tunas meningkat seiring dengan peningkatan konsentrai BAP. Di antara berbagai macam konsentrasi NAA dan BAP, jumlah tunas terbanyak diperoleh pada medium kultur yang mengandung NAA 0.1 ppm dan BAP 2 ppm. Tunas-tunas dipindahkan ke medium kultur dengan penambahan BAP 10 ppm untuk menginduksi pemanjangan tunas. Planlet bawang putih dihasilkan dari tunas yang dikulturkan pada medium kultur dengan penambahan IBA 2 ppm. Kata kunci: bawang putih, kalus, meristem basal, regenerasi in vitro
Konstruksi Protein Transcription Activator-Like Effector (TALE) 1 dan 2 dengan Target Sekuen DNA strain HPV Tipe 16 dan 18 Puspitasari, Agatha Mia; Widodo, Nashi
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : Biotropika: Journal of Tropical Biology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (89.385 KB)

Abstract

Kanker serviks dapat disebabkan oleh infeksi virus HPV tipe 16 dan 18 namun dapat dihindari dengan melakukan deteksi awal atau screening pada wanita. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain protein Transcription Activator-Like Effector (TALE) sebagai detektor dari HPV 16 dan 18 dengan cara mencari sekuen target DNA HPV 16 dan 18 beserta konstruksi protein TALE tersebut. Metode yang dilakukan adalah analisa sekuen target HPV 16 dan 18 dengan software MEGA, konstruksi protein TALE pada plasmid pSB1C3, PCR, Golden Gate Cloning, dan elektroforesis. TALE yang dikonstruksi adalah 2 macam protein TALE, yaitu TALE 1 dan TALE 2, yang memiliki susunan basa DNA yang berbeda. Konstruksi TALE dilakukan dengan Golden Gate Cloning menggunakan GATE Assembly Kit. Sekuen target DNA diperoleh dari hasil alignment software MEGA yang terdiri dari 14 bp pada masing-masing TALE dengan Timin (T) pada ujung-ujung sekuen. Kemudian konstruksi TALE diperoleh dari tim Freiburg yang memiliki 6 bagian yang dapat mengkode protein TALE. Hasil yang didapatkan dari konstruksi adalah pita DNA sebesar 3kbp pada gel agarosa melalui elektroforesis.   Kata kunci: HPV 16,  HPV 18,  kloning, TALE 1, TALE 2