cover
Article Per Year (5 Year)
All
Home Page
OAI Link
Editorial Team
Contact
Reviewer
Google Scholar
Contact Name
Hayati Minarsih
Contact Email
menaraperkebunanppbbi@gmail.org
Phone
-
Journal Mail Official
menaraperkebunan@iribb.org
Editorial Address
Jalan Taman Kencana No.1 Bogor 16128, Jawa Barat
Location
Kab. bogor,
Jawa barat
INDONESIA
Menara Perkebunan
Published by Pusat Penelitian Kelapa Sawit
ISSN : 01259318     EISSN : 18583768     DOI : -
Core Subject : Agriculture,
Agriculture, Biological Sciences & Forestry
Menara Perkebunan as a communication medium for research in estate crops published articles covering original research result on the pre- and post-harvest biotechnology of estate crops. The contents of the articles should be directed for solving the problems of production and/or processing of estate crops of smallholder, private plantations and state-owned estates, based on the three dedications of plantation. Analyses of innovative research methods and techniques in biotechnology, which are important for advancing agricultural research. Critical scientific reviews of research result in agricultural and estate biotechnology.
Arjuna Subject : -
Articles 541 Documents
 36   37   38   39   40 
Ekspresi β -1,3 glukanase dan kitinase pada tanaman kopi arabika (Coffea arabica L.) tahan dan rentan karat daun Expression of β-1,3 glucanase and chitinase of arabica coffee (Coffea arabica L.) resistant and susceptible against leaf rust disease Asmini BUDIANI; I SUSANTI; Surip MAWARDI; D A SANTOSO; . SISWANTO
Menara Perkebunan Vol. 72 No. 2: 72 (2), 2004
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v72i2.122

Abstract

Summary Leaf rust disease caused by Hemileia vastatrix is considered to be one of the most important diseases on arabica coffee plantation. In order to understand the mechanism underlying resistance of arabica coffee against leaf rust disease, this research was aimed to study expression of β-1,3 glucanase (GLU) and chitinase (CHI) genes in the arabica coffee S1934 and  BLP10 that have been reported respectively as a resistant and susceptible varieties to H. vastatrix. The two varieties were essayed against H. vastatrix, and an RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction) using total RNAs  from the S1934 and BLP10, both inoculated with H. vastatrix and uninnoculated was carried out for studying the expression of GLU and CHI. Two primer pairs were designed to amplify the conserved region of GLU and CHI. Amplification products were sequenced and the nucleotide sequences were subjected to BlastX analysis. The result of bioassay confirmed that arabica coffee S1934 was resistant to H. vastatrix, while BLP10 was susceptible.   β-1,3 glucanase was expressed in all of the four samples, the inoculated and uninnoculated S1934, and BLP10 in different degree. S1934 expressed higher GLU compared to BLP10. In the inoculated S1934 the expression of this gene was higher compared to that of the uninoculated one. Expression of CHI was detected only in the S1934, both inoculated and uninoculated. Sequence analysis confirmed that the RT-PCR products were exon regions of genes encoding β-1,3 glucanase dan chitinase respectively. Both of the cDNA fragment have been cloned in E.coli.  Ringkasan Karat daun yang disebabkan oleh jamur Hemileia vastatrix merupakan salah satu penyakit penting pada perkebunan kopi arabika. Untuk memahami mekanisme ketahanan kopi arabika terhadap karat daun, penelitian ini bertujuan untuk mempelajari ekspresi gen β-1,3 glukanase dan kitinase pada varietas kopi arabika S1934 yang dilaporkan tahan karat daun dan varietas BLP10 yang termasuk rentan karat daun. Untuk itu kedua varietas diuji kembali ketahanannya terhadap H. vastatrix melalui bioesai dan dilakukan RT-PCR menggunakan RNA total dari S1934 dan BLP10, baik yang diinokulasi dengan H. vastatrix maupun yang tidak diinokulasi, untuk mempelajari ekspresi gen GLU dan CHI. Dua pasang primer spesifik dirancang untuk mengamplifikasi daerah konservatif kedua gen  tersebut. Hasil amplifikasi disekuen dan dianalisis menggunakan program BlastX. Hasil bioesai mengkonfirmasi bahwa S1934 tahan terhadap H. vastatrix, sedangkan  BLP10 rentan.  β-1,3 glukanase diekspresikan pada kedua varietas, baik yang diinokulasi maupun yang tidak diinokulasi, namun dengan tingkat ekspresi yang sedikit berbeda. Varietas S1934 mengekspresikan β-1,3 glukanase lebih tinggi dibandingkan dengan BLP10. Ekspresi gen tersebut pada S1934 yang diinokulasi lebih tinggi dibandingkan dengan yang tidak diinokulasi. Sedangkan kitinase hanya diekspresikan pada varietas S1934. Hasil sekuensing dan analisis DNA mengkonfirmasi bahwa sekuen hasil RT-PCR merupakan bagian ekson dari gen penyandi β-1,3 glukanase dan kitinase. Kedua fragmen tersebut telah diklon pada E. coli.
Kultur akar rambut Cinchona ledgeriana dan C. succirubra dalam kultur in vitro Hairy root culture of Cinchona ledgeriana and C. succirubra by in vitro culture Nurita TORUAN-MATHIUS; . REFLINI; . NURHAIMI-HARIS; . JOKO-SANTOSO; A PRIANGANI-ROSWIEM
Menara Perkebunan Vol. 72 No. 2: 72 (2), 2004
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v72i2.123

Abstract

Summary Problems encountered in hairy root culture  of  C. ledgeriana and C. succirubra are low percentage of transformation of explants by Agrobacterium rhizogenes and slow growth of hairy root. The objective of this research was to evaluate the potential of several A. rhizogenes strains for initiation  hairy roots of  C. succirubra and C. ledgeriana, and to obtain the best medium for hairy root culture of Cinchona spesies. Axenic shoot and leaves explants of eight-month-old of C. ledgeriana and  C. succirubra seedlings were inoculated with A. rhizogenes strain ATCC-15834, ATCC-8196,    R-20001, 07-20001, A4, R-MAFFA, TISTR509, TISTR510 and LBA9457. Inoculated explants were cultured in solid MS medium with the addition of 100 mg/L amphicylin. Subculture of the hairy root was performed by transferred of root pieces into fresh liquid basal medium MS, B5, White and Heller. Hairy roots from the best of basal medium were subcultured on the same medium with the addition of 50  and 100 mg/L   L-tryptophane, three or five times concentration of MS vitamins. The integration of T-DNA of   A. rhizogenes in hairy root was confirmed with specific primer for TL and TR-DNA of plasmid by Polymerase Chain Reaction analysis. The results showed that only A. rhizogenes strain  LBA 9457 were effective for  transformation of explants from both Cinchona species. The fastest hairy roots growth were found  in MS medium, while growth in others medium was poor. Hairy roots of  C. ledgeriana has vigor and growth better than hairy roots of C. succirubra. MS with the addition of 50 mg/L  L-tryptophane and  three times the concen-trations of vitamin  is the best medium for hairy root growth and vigor. Hairy roots of  C. succirubra and C. ledgeriana used in this studies were confirmed that hairy roots  contained TL and TR-DNA region of Ri plasmid with molecular weight 780 and 1600 bp.  The results showed that strain of A. rhizogenes, plant species, source of explant and composition of medium affect the initiation, growth, development  and vigor of hairy roots.Ringkasan Masalah dalam kultur akar rambut  C. ledgeriana dan C. succirubra adalah rendahnya tingkat keberhasilan transformasi eksplan dengan Agrobacterium rhizogenesdan pertumbuhannya yang lambat. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi  potensi dari beberapa galur A. Rhizogenes untuk inisiasi, mendapatkan komposisi medium terbaik untuk pertumbuhan akar rambut C. ledgeriana dan C. succirubra, serta konfirmasi terintegrasinya TR dan TL-DNA Ri plasmid ke dalam jaringan eksplan.  Eksplan batang  dan  daun  berasal  dari kecambah aksenik C. ledgeriana dan C. succirubra berumur delapan bulan diinokulasi dengan A. rhizogenes galur 15834, 8196, R-20001, 07-20001, A4, R.MAFFA,TISTR 509, TISTR 510 dan LBA 9457. Eksplan yang sudah diinokulasi dikulturkan dalam medium MS padat. Subkultur dilakukan dengan cara mentransfer potongan ujung akar rambut ke dalam medium cair MS, B5, White dan Heller. Akar rambut dari medium kultur yang terbaik kemudian disubkultur ke dalam medium yang sama dengan penambahan 50 dan 100 mg/L L-triptofan dengan konsentrasi vitamin sebanyak tiga kali dan lima kali dari konsentrasi normal MS. Integrasi T-DNA dalam akar rambut dikonfirmasi meng-gunakan Polymerase Chain Reaction  dengan primer spesifik untuk TL dan TR-DNA plasmid. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa hanya A.rhizogenes galur LB9457 yang efektif menginfeksi eksplan baik batang maupun daun dari kedua spesies kina. Induksi, pertumbuhan dan vigor akar rambut yang terbaik diperoleh dari medium MS dengan penambahan 50 mg/L L-triptofan dan tiga kali konsentrasi vitamin. Hasil konfirmasi akar rambut baik dari batang maupun daun menggunakan PCR, menunjukkan bahwa TL dan TR-DNA dari Ri plasmid  A. rhizogenes mampu menghasilkan pita-pita DNA dengan BM780 dan 1600 pb. Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa galur  A. rhizogenes, spesies tanaman, sumber eksplan dan komposisi medium berpengaruh terhadap inisiasi, pertumbuhan,  perkembangan dan vigor akar rambut.
Deteksi dan analisis sekuen gen inhibitor proteinase pada beberapa klon kakao harapan tahan penggerek buah kakao dari Sulawesi Selatan Detection and sequence analysis of proteinase inhibitor gene in cacao clones putatively cacao pod borer-tolerant from South Sulawesi Abdul Mollah S. JAYA; Hajrial ASWIDINNOOR; Djoko SANTOSO
Menara Perkebunan Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v72i1.124

Abstract

Summary Cacao is socially and economically an important commodity for Indonesia, in which the cacao plantations have been challenged with a threatening pest, cacao pod borer (CPB). This research aimed to identify and clone PIN (proteinase inhibitor), a gene carrying resistance of plant to some chewing pests like CPB. The methodology included several experiments. Detection of PIN in cacao was done by PCR using PIN-specific heterologous primers and cacao genomic DNA as templates. Cloning vector pGEM-T was utilized to clone the PCR products. Sequence analysis was conducted with BlastX and Blast Special programs from NCBI. Alignment analysis to determine genetic similarity was performed with ClustalW from EBI. Thirteen of the 18 clones tested were detected to have PIN homologs. Two DNA fragments from cacao clones putatively tolerant to CPB, MJ-1 and LW-1, were sequenced. One of them, MJ-1 was cloned. Sequence analyses of the fragments of both cacao clones, indicated that they have PIN homologs and a very closed genetic relation with 96% level of similarity. Ringkasan Kakao adalah komoditas yang secara sosial maupun ekonomi penting bagi Indonesia, dimana perkebunan kakao menghadapi masalah serius hamapenggerek buah kakao (PBK). Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan mengklon PIN (inhibitor proteinase), gen yang membawa sifat ketahanan tanaman terhadap hama ulat seperti PBK. Metodologinya terdiri dari beberapa percobaan. Deteksi PIN di dalam kakao dikerjakan dengan PCR menggunakan primer heterologous yang spesifik terhadap PIN dan DNA genomik kakao sebagai templetnya. Vektor kloning pGEM-T digunakan untuk mengklon produk PCR. Analisis sekuen dilakukan dengan program BlastX dan Blast spesial dari NCBI. Analisis penjajaran (alignment) untuk menentukan kemiripan genetik menggunakan program ClustalW dari EBI. Tiga belas dari 18 klon kakao yang diuji  menunjukkan adanya  homolog  PIN. Dua DNA fragmen dari klon harapan tahan, MJ-1 dan LW-1, telah ditentukan sekuen nukleotidanya. Satu diantara-nya, MJ-1 berhasil diklon. Analisis sekuen  kedua klon tersebut menunjukkan identitas sebagai homolog PIN dan keduanya memiliki kemiripan genetik yang tinggi.
Perbanyakan tanaman kina Cinchona ledgeriana Moens. dan C. succirubra Pavon melalui penggandaan tunas aksiler Propagation of cinchona plant Cinchona ledgeriana Moens. and C. succirubra Pavon through axillary buds multiplication . JOKO-SANTOSO; Nurita TORUAN-MATHIUS; U SASTRAPRAWIRA; G SURYATMANA; D SAODAH
Menara Perkebunan Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v72i1.125

Abstract

SummaryCinchona ledgeriana (Ledger) and C. succirubra (Succi) were industrial commodities which their barks of the trunk  contain alkaloid   used as raw materials in pharmaceutical, food, drug and beverages and chemical industries. The problem  faced in conventional plant propagation are. incompatibilities, high numbers of death caused by transportation, limited numbers and time consume in  plant materials  production. These problems may be  overcome by axillary buds multiplication.  The aim of the experiment were to find out propagation technology of Ledger and Succi by  tissue culture technique.  Experiments were conducted in three consecutive steps, viz the effect of (i) BAP on multiplication and growth of axillary’s bud of Ledger and Succi in vitro culture, (ii) IBA on root initiation and growth, (iii)  growth medium on the growth of plantlets in  acclimatization.The design of the experiments were Complete Randomized Design with 15 (i & ii) and four (iii) replications. The treatments were (i) 0,1,2,3,4, dan 5 mg/L BAP, (ii) 0.0; 0.5; 1.0; 1.5; 2.0; dan 2.5 mg/L IBA, and (iii) mixture of soil and rice husk charcoal (1:1), mixture of soil and compost (1:1),  mixture of soil, rice husk charcoal, and  compost  (1:1:1).  Parameters measured in the experiments were (i) the initiation of buds multiplication rate twice at axillary buds at subculture.  (ii) initiation  and  roots vigor. (iii) numbers of survived  plants and plants vigor. The explant source used derived from two-month old axillary buds cultured in Murashige and Skoog (MS) medium without growth regulator. Results of the experiment showed  that the best shoot multiplication of Ledger  and Succi  was obtained from the application of 3 mg/L BAP, with buds multipli-cation rate 7 buds/explant/month for Ledger, and 3-4 buds/explants/month for succi. The best root initation and root growth were found from the application of 2 mg/L IBA. The highest percentage of survived plantlets (100%) in acclimatization was obtained from mixture of soil and rice husk charcoal (1:1) medium.  Therefore it is  concluded that tissue culture technique could be used for planlet  mass propagation    of  elite C. Ledgeriana and C. Succirubra through axillary bud multiplication.Ringkasan Tanaman kina Cinchona ledgeriana (Ledger) dan C. succirubra (Succi)  merupakan tanaman industri yang mengandung alkaloid di dalam kulit batangnya dan berguna dalam bidang industri farmasi, makanan, minuman dan kimia. Kendala yang dihadapi dalam perbanyakan tanaman kina secara konvensional dengan sistem sambung  adalah inkompatibilitas,    kematian akibat pengangkutan cukup tinggi, jumlah bahan tanam yang diproduksi sangat terbatas dan waktu penyediaan yang cukup lama. Masalah tersebut dapat diatasi dengan menggunakan teknik kultur jaringan. Penelitian ini bertujuan untuk men-dapatkan teknologi perbanyakan tanaman kina Ledger dan Succi dengan teknik kultur jaringan. Penelitian terdiri atas (i) pengaruh BAP terhadap inisiasi dan penggandaan  tunas aksilar, (ii) pengaruh IBA terhadap inisiasi serta pertum-buhan akar planlet,   dan (iii) pengaruh beberapa medium terhadap pertumbuhan planlet dalam aklimatisasi. Percobaan menggunakan Rancangan Acak Lengkap, masing-masing diulang 15 (i & ii)  dan (iii) empat kali. Peubah yang diukur untuk percobaan (i) adalah waktu inisiasi tunas dan laju penggandaan tunas aksiler pada dua  kali  subkulur. (ii)  Waktu  inisiasi  dan vigor akar. (iii) Jumlah tanaman yang bertahan hidup setelah aklimatisasi, serta vigor tanaman. Sumber eksplan yang digunakan adalah tunas aksilar dari kecambah terpilih berumur dua bulan yang dikulturkan dalam medium Murashige dan Skoog tanpa zat pengatur tumbuh. Perlakuan untuk percobaan (i) adalah 0,0; 1,0; 2,0; 3,0; 4,0 dan  5,0 mg/L BAP, (ii) adalah 0,0; 0,5; 1,0; 1,5; 2,0; dan 2,5 mg/L IBA, sedang (iii) adalah medium tanam tanah, tanah : arang sekam (1:1),  tanah : kompos (1:1), tanah : arang sekam : kompos (1:1:1). Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa konsentrasi BAP terbaik untuk inisiasi dan penggandaan tunas tanaman kina Ledger dan Succi adalah 3 mg/L BAP, dengan laju penggandaan tujuh tunas/eksplan/bulan untuk Ledger dan 3-4 tunas/eksplan/bulan untuk Succi. Sedang untuk perakaran diperoleh dari medium MS dengan penambahan 2 mg/L IBA. Persentase tertinggi planlet (100%) yang mampu bertahan hidup pada aklimatisasi diperoleh dari medium campuran tanah : arang sekam (1:1). Berdasarkan hasil tersebut di atas dapat disimpulkan bahwa perbanyakan tanaman kina secara in vitro untuk menghasilkan bibit bermutu dapat dilakukan melalui teknik penggandaan tunas aksiler
Kloning parsial gen penyandi enoil-ACP reduktase dari mesokarp buah kelapa sawit (Elaeis guineensis Jacq.) Partial cloning of gene encoding enoyl-ACP reductase from mesocarp of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) Asmini BUDIANI; Djoko SANTOSO; Hajrial ASWIDINNOOR; Antonius SUWANTO
Menara Perkebunan Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v72i1.126

Abstract

Summary Enoyl-ACP reductase (ENR) is a component of fatty acid synthase (FAS) that is considered to play an important role in fatty acid elongation and oil accumulation of several plants. One of the proteins expressed coinciding with fruit development and oil accumulation in oil palm has been detected from the previous study and had homology with ENR. Therefore, as a part of genetic engineering program to improve oil content and quality in oil palm mesocarp, this research was aimed to clone cDNA conserved region of gene encoding enoyl-ACP reductase from oil palm mesocarp. Based on the amino acid sequence of the polypeptide that was homologous with ENR and combined with information of conserved region sequences of the same gene from other plant sources, primers were designed for amplifying conserved region of the ENR gene. Amplifi-cation was carried out by RT-PCR using total RNA as template, at several annealing temperatures and MgCl2 concentrations. Amplification product was cloned using pCR 2.1-TOPO, and the sequence was subjected into BlastN analysis. The results confirmed that the cloned cDNA fragment with 698 bp in size was the conserved region of the ENR gene.  This sequence was highly homologous with the same gene from other plants such as Oryza sativa, Olea europaea, Brassica napus, Triticum aestivum and Arabidopsis thaliana with E-value 1e-96, 7e-77, 2e-64, 5e-41 and 3e-36, respectively. Based on this result, primers have been made and used to amplify the 5’- and 3’ ends of the ENR -cDNA  of oil palm mesocarp. Ringkasan Enoil-ACP reduktase (ENR) merupakan salah satu komponen asam lemak sintase (FAS) yang berperan penting dalam pemanjangan asam lemak dan akumulasi minyak pada berbagai tanaman. Salah satu protein yang ter-ekspresi sejalan dengan tahapan perkembangan buah sawit dan akumulasi minyak pada penelitian sebelumnya diketahui mempunyai homologi dengan ENR. Oleh karena itu, sebagai salah satu bagian dari usaha rekayasa metabolisme minyak pada mesokarp buah sawit, penelitian ini bertujuan untuk mengklon cDNA daerah konservatif gen penyandi ENR dari mesokarp buah sawit. Berdasarkan  sekuen asam amino polipeptida yang mempunyai homologi dengan ENR dan dikombinasikan dengan hasil penjajaran daerah konservatif gen tersebut dari berbagai anaman lain, dirancang primer  untuk  amplifikasi daerah konservatif ENR. Amplifikasi dilakukan dengan RT-PCR menggunakan templat RNA total pada berbagai suhu   penempelan   dan   konsentrasi    MgCl2. Hasil amplifikasi dimurnikan dari gel dan diklon menggunakan vektor kloning pCR2.1-TOPO serta dianalisis nya menggunakan BlastN. Hasilnya mengkonfirmasi fragmen cDNA terklon berukuran 698 pb sebagai daerah konservatif ENR tersebut mempunyai homologi tinggi dengan gen yang sama dari    O. sativa,  O. europaea, B. napus, T. aestivum dan  A. thaliana masing-masing dengan E-value 1e-96, 7e-77, 2e-64, 5e-41 dan 3e-36. Berdasarkan hasil tersebut telah dibuat primer spesifik untuk amplifikasi cDNA daerah ujung 5’- dan 3’- gen  ENR dari mesokarp kelapa 
Keragaman genetik klon-klon karet (Hevea brasiliensis Muell. Arg) yang resisten dan rentan terhadap Corynespora casiicola berdasarkan penanda RAPD dan AFLP Genetic variation of rubber ( Hevea brasiliensis Muell. Arg) clones resistance and susceptible to Corynespora cassiicola using RAPD and AFLP markers Nurita TORUAN-MATHIUS; Z LALU; . SOEDARSONO; Hajrial ASWIDINNOOR
Menara Perkebunan Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v70i2.127

Abstract

SummaryCorynespora leaf fall disease (CFLD) caused by the fungus Corynespora casiicola is one of the most important diseases of Hevea brasiliensis.CFLD was reported to cause serious damage on rubber productivity, and the disease has became more apparent in the recent years. The objectives of this study were (i) to analyze genetic similarities among several rubber clones resistance and susceptible to CFLD based on RAPD and AFLP markers, (ii) to compare the effectiveness of RAPD and AFLP markers. DNA genomic was extracted from young leaves of RRIM600, GT1, PB260, RRIC100, BPM1 (belongs to resistance group), PPN2058, PPN2444, and PPN2447 (belongs to susceptible group). Data were analyzed with NTSYS-pc program version 2.10, and a dendogram was created by cluster analysis using the unweighted pair group method on the basis of arithmetic averages (UPGMA). The results show that marker index AFLP (3.57) is higher than RAPD (1.02), it means that AFLP is more effective compared to RAPD. The average of genetic similarity AFLP (0.63) lower than RAPD (0.67) it means that AFLP is more discriminative than RAPD. Dendogram based on AFLP and RAPD were the best with at 0.65 level of genetic similarity cluster divided into two cluster A and B. Cluster A with a sub group A1 consisted of RRIC100, PPN2058 and PPN244 are belongs to resistance group), and sub group A2 consisted of (RRIM600, GT1, BPM1 and PB 260 are belongs to susceptible group), while cluster B only PPN2447 is belong to susceptible group. AFLP analysis show that one AFLP band of 110 bp resulting from PCR amplification using E-ACA/M-CAG (E-ACA/M-CAG110) primer pairs present in resistance clones, but absent in the susceptible clones. Meanwhile, application of 50 random primers decamer in RAPD analysis did not showed the specific band for either one of the group. It is concluded that AFLP marker analysis using EACA/M-CAG primer pair have a potential to differentiate resistance and the susceptible rubber clones to Corynespora. For the confirmation of the results more resistance and susceptible clones are needed for further test. RingkasanPenyakit gugur daun Corynespora (PDGC) yang disebabkan oleh patogen Corynespora asiicola, merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman karet (Hevea brasiliensis). PGDC menyebabkan penurunan yang cukup serius terhadap produktivitas tanaman karet. Tujuan penelitian ini adalah untuk (i) mengidentifikasi kesamaan genetik antar beberapa klon yang tergolong tahan dan rentan dengan marka RAPD dan AFLP, dan (ii) mempelajari efektivitas kedua marka tersebut. DNA genomik diekstraksi dari daun muda klon RRIM600, GT1, PB260, BPM1, RRIC100 (tergolong resisten), PPN2058, PPN2444, dan PPN2447 (tergolong rentan ). Data dianalisis dengan NTSYS-pc program versi 2.10. Dendogram dibuat dengan analisis pengelompokan menurut metode Unweighted Pair Group berbasis Arithmetic Avarages (UPGMA). Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa marka indeks AFLP (3,57) lebih tinggi daripada RAPD (1,02), sehingga AFLP lebih efektif dibandingkan dengan RAPD. Rata-rata perkiraan kesamaan genetik AFLP (0,63) sedikit lebih rendah dari RAPD (0,67) sehingga AFLP relatif lebih diskriminatif daripada RAPD. Dendogram berdasarkan integrasi AFLP dan RAPD adalah yang paling baik, dimana pada rata-rata perkiraan kesamaan genetik (0,65) terbentuk dua kelompok yaitu A dan B. Kelompok A terdiri atas sub sub kelompok A1 yang beranggotakan (RRIC100, PPN2058 dan PPN244 yang tergolong resisten), dan sub group A2 yang beranggotakan (RRIM600, GT1, BPM1 dan PB 260 yang tergolong rentan) Sedang kelompok B beranggotakan hanya PN2447 yang tergolong rentan. Analisis AFLP menghasilkan satu pita AFLP dengan menggunakan pasangan primer EACA/M-CG (E-ACA/M-CAG110 ) secara konsisten diperoleh dari klon karet yang resisten, namun tidak ditemukan pada klon yang rentan. Sementara itu, aplikasi 50 primer acak dekamer dalam analisis RAPD tidak menghasilkan pita spesifik untuk kedua kelompok yang diuji. Disimpulkan bahwa analisis AFLP menggunakan pasangan primer EACA/M-CAG berpotensi untuk membedakan klon karet yang resisten dan rentan terhadap Corynespora. Untuk mengkorfirmasi hasil yang diperoleh, perlu dilakukan pengujian terhadap klon-klon yang resisten dalam jumlah yang lebih banyak
Optimasi simbiosis cendawan mikoriza arbuskula Acaulospora tuberculata dan Gigaspora margarita pada bibit kelapa sawit di tanah masam Optimizing arbuscular mycorrhizal fungi symbiosis Acaulospora tuberculata and Gigaspora margarita with oil palm seedling in acid soil) Happy WIDIASTUTI; Edi GUHARDJA; Nampiah SOEKARNO; L K DARUSMAN; Didiek Hadjar GOENADI; Sally SMITH
Menara Perkebunan Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v70i2.128

Abstract

SummaryAM fungal symbiosis increase the uptake of P in oil palm seedlings. However the optimum condition of symbiosis has to be determined to get higher benefit of AM fungal symbiosis. Optimization of the symbiosis Acaulospora tuberculata and Gigaspora margarita with oil palm seedling in acid soil was determined. An experiment was conducted in polybag sized 40 x 60 cm contained sterilized Cikopomayak soil. Three factors studied were AM fungal species (A. tuberculata, G. margarita), inoculant dose (0.0; 12.5; 25.0; and 37.5% w/w), and fertilizer rate (0; 25; 50; and 100% recommended dose) and each treatment replicated three times. The result showed that optimum growth reached on the inoculant addition of 36% (w/w) in the form of infected roots, hypha, and spores and fertilizer dose of 25% for A. tuberculata, while for G. margarita was 40% (w/w) inoculant and 26% fertilizer. Efectivity of fertilizer and P uptake of oil palm seedling were significantly increased with AM fungi inoculation. P uptake of oil palm seedling inoculated with A. tuberculata increase. RingkasanSimbiosis cendawan mikoriza arbuskula (CMA) dapat meningkatkan serapan P pada pembibitan kelapa sawit. Namun, untuk mendapatkan keuntungan simbiosis yang tinggi perlu diketahui kondisi optimum simbiosis. Simbiosis CMA dengan tanaman sangat dipengaruhi tingkat hara dan dosis inokulum. Percobaan dilakukan dalam polibag berukuran 40 x 60 cm berisi tanah Cikopomayak steril. Tiga faktor yang diuji ialah spesies CMA (A. tuberculata, G. margarita), dosis inokulum campuran (0,0; 12,5; 25,0; dan 37,5% b/b), dosis pupuk (0; 25; 50; dan 100% dosis rekomendasi) dan masing masing perlakuan diulang tiga kali. Hasil percobaan menunjukkan bahwa pertumbuhan optimum dicapai pada pemberian inokulum berupa akar terinfeksi, hifa, dan spora 36% (b/b) dan pupuk 25% untuk A. tuberculata, sedangkan untuk G. margarita ialah 40% (b/b) inokulum dan pupuk 26%. Keefektifan pupuk dan serapan P meningkat secara nyata dengan inokulasi CMA
Produksi dan stabilisasi desaturase dari Absidia corymbifera Production and stabilization of desaturases from Absidia corymbifera . TRI-PANJI; . SUHARYANTO; A W PAULUS; K SYAMSU; A M FAUZI
Menara Perkebunan Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v70i2.129

Abstract

SummaryDesaturases are enzymes which catalyze desaturation process on carbon chain of fatty acids into unsaturated fatty acids useful for healthy oil. Desaturases could be produced from Absidia corymbifera and applied for increasing unsaturation level and crude palm oil (CPO) quality. Desaturases have been known as very unstable enzymes. The objective this research was to determine carbon sources and culture time for optimum desaturase production, fatty acid composition resulted from desaturase bioconversion, and methods for stabilization of desaturase from A. corymbifera. Results showed that desaturases from A. corymbifera are intracellular enzymes that reached the highest activity in Serrano-Careon medium with C sources of a mixture of sucrose and paraffin (0.14 U/mL) and C sources of molasses (0.11 U/mL) incubated for 76 and 120 hours respectively. Activity of ∆6 and ∆12 desaturases have been detected in culture filtrate of A. corymbifera. Activiy of ∆12 desaturase was confirmed by increasing of linoleic acid in CPO incubated with culture filtrate and biomass extract, while activity of ∆6 was detected by its conversion as much as 66.48 % linoleic acid into gamma linolenic acid (GLA) that having high economic value. Precipitation of culture filtrate and lipid extraction of biomass were unable to stabilize desaturases. Desaturase degradation rate could be inhibited by isolation and washing of microsome fraction using high salt buffer. This method could stabilize desaturases 70-80% from initial activity at storage temperature 25o C and 50 o C for 6 hours. RingkasanDesaturase merupakan enzim yang berperan dalam proses desaturasi rantai karbon asam lemak menjadi asam lemak tak jenuh yang banyak manfaatnya bagi kesehatan. Desaturase dapat dihasilkan dari Absidia corymbifera dan diamplifikasikan untuk peningkatan ketidakjenuhan dan kualitas minyak sawit mentah (CPO). Enzim desaturase dikenal sangat tidak stabil. Penelitian bertujuan menetapkan sumber karbon dan waktu kultur yang memberikan aktivitas desaturase tertinggi, komposisi asam lemak hasil konversi desaturase dan cara menstabilkan desaturase dari A. corymbifera. Hasil penelitian menunjukkan bahwa desaturase dari A. corymbifera merupakan enzim intraselular yang mencapai aktivitas tertinggi pada medium Serrano-Careon dengan sumber karbon campuran sukrosa dan parafin (0,14 U/mL) dan sumber karbon molases (0,11 U/mL) masingmasing pada inkubasi selama 76 dan 120 jam. Aktivitas ∆6 dan ∆12 desaturase terdeteksi pada cairan fermentasi A. corymbifera. Aktivitas ∆12 desaturase terdeteksi dari peningkatan persentase asam linoleat pada CPO yang telah diinkubasi dengan cairan fermentasi atau ekstrak biomassa, sedangkan aktivitas ∆6 desaturase terdeteksi dari dikonversinya sebesar 66,48% asam linoleat menjadi asam gamma linolenat (GLA) yang memiliki potensi nilai ekonomis lebih tinggi. Pengendapan filtrat kultur fermentasi dan ekstraksi lipida biomassa tidak mampu menstabilkan desaturase. Laju degradasi desaturase dapat dihambat dengan cara isolasi dan pencucian fraksi mikrosom dengan bufer garam. Cara tersebut dapat mempertahankan aktivitas desaturase 70–80% pada penyimpanan suhu 25o C dan 50o C selama enam jam.
Isolation and characterization of protein differentially expressed during oil palm mesocarp development Isolasi dan karakteristik protein terekpresi secara diferensial selama perkembangan mesokarp pada kelapa sawit A BUDIANI; D SANTOSO; H ASWINDINNOOR; A SUWANTO; S SUDIATSO
Menara Perkebunan Vol. 70 No. 1: 70 (1), 2002
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v70i1.130

Abstract

RingkasanPada kelapa sawit, mesokarp merupakan jaringan yang lebih dikhususkan untuk mensintesis minyak. Akumulasi minyak pada jaringan ini terjadi selama perkembangan buah. Beberapa enzim yang terlibat dalam biosintesis minyak tampaknya disintesis hanya pada periode tertentu dari biosintesis minyak. Sedangkan protein regulator diduga ada pada saat minyak mulai disintesis atau beberapa saat sebelumnya. Sebagai bagian dari usaha mengklon gen kunci untuk biosintesis minyak, penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan mengisolasi protein yang terekspresi secara diferensial sesuai perkembangan buah. Sebagai bahan penelitian digunakan jaringan mesokarp dari berbagai umur buah sawit. Untuk setiap fase perkembangan buah dilakukan analisis kandungan minyak dan protein total. Elektroforesis gel poliakrilamid-SDS (SDS – PAGE) dan elektroforesis dua dimensi (2-D) digunakan untuk mempelajari dan mendeteksi adanya pita protein spesifik yang terekspresi secara diferensial sejalan dengan peningkatan kandungan minyaknya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa minyak mulai aktif disintesis pada saat buah berumur 17 minggu setelah antesis. Konsentrasi protein total tidak meningkat sejalan dengan peningkatan kandungan minyaknya. Dari hasil SDS-PAGE terdeteksi dua protein, yaitu protein dengan berat molekul (BM) 31,0 kDa dan 34,3 kDa yang meningkat ekspresinya pada awal dan menjelang periode aktif sintesis minyak. Analisis lebih lanjut dengan elektroforesis 2-D menunjukkan bahwa protein 31,0 kDa terdiri dari dua protein dengan pI 4,64 dan pI 4,95, sedangkan protein 34,3 kDa merupakan protein tunggal dengan pI 4,56. Sikuensing secara parsial kedua protein tersebut menunjukkan adanya dua polipeptida dari protein 31,0 kDa yang mempunyai homologi tinggi dengan subunit biotin karboksilase ht-ACCase, dan empat polipeptida yang mempunyai homologi dengan enoilACP reduktase. Sedangkan protein 34,3 kDa mempunyai homologi dengan gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase. SummaryIn oil palm, mesocarp is tissue specialized for oil synthesis. Accumulation of oil in this tissue occurs during fruit development. It is likely that some enzymes involved in oil biosynthesis are synthesized only in a certain period of oil biosynthesis, while regulatory proteins may present at the beginning or right before the period of active oil synthesis. As a part of research work on cloning of gene encoding key enzymes for oil biosynthesis in palm mesocarp, this research was aimed to identify and isolate proteins differentially expressed during fruit development. Mesocarps from different developmental stage of fruit were used for analysis of oil content and protein concentra-tion. Sodium Dodecyl Sulphate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE) and two dimentional (2-D) electrophoresis were used to study and detect specific protein bands differentially expressed during fruit development. It was shown that oil synthesis was started at 17 weeks after anthesis (WAA). There was no correlation between concentrations of total protein with oil content during mesocarp development. From the SDS-PAGE, two protein of 31.0 kDa and 34.3 kDa were detected that their expression increased at the beginning and just before the period of active oil biosynthesis respectively. Further analysis with 2-D electrophoresis showed that 31.0 kDa-protein consist of two proteins, with pI 4,64 and pI 4,95, while 34.3 kDa protein is a single protein with pI 4,56. Partial amino acid sequencing data of the 31.0 kD protein showed that two polypeptides highly homologous with ht-ACCase biotin carboxylase subunit and four polypeptides homologuus with enoyl-ACP reductase, whereas 34.3 kD protein showed homology with glyceraldehyde-3 phosphate dehydrogenase.
Teknik aplikasi dan efektivitas formula VGR untuk penurunan tingkat layu pentil kakao Application techniques and effectivity of VGR formulas to reduce cherelle wilt in cacao D SANTOSO; A RAHMAWAN
Menara Perkebunan Vol. 70 No. 1: 70 (1), 2002
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v70i1.131

Abstract

SummaryIndonesia cacao plantations have relatively low productivity, which actually can be improved by reducing cherelle wilt using vegetative growth retardant (VGR) formula with proper composition. This paper describes research progress aimed to formulate molecular inducer capable of reducing cherelle wilt in cacao plantation. The main constituent of the formula was VGR of chloro choline type with additional component of a acidic buffer. Chemical environment was adjusted for better effectiveness of the formula. The application to examine the affectivity was conducted by several ways with the aqueous solution at 25 to 200 ppm. The observation was recorded twice a week. Examination in experimentation showed that foliar spray at upper side was the best among 6 methods tested. Experiments done in a commercial plantation demonstrated that VGR was able to reduce cherelle wilt in cacao. Addition of acidic buffer improved the performance of VGR formula. At 3 and 4 weeks after the treatments with the VGR formulas, cherelle wilt were decreased to become 18.8% and 39.9%. These numbers were significantly lower than the percentages of cherelle wilt on the trees sprayed only with water, which reached to 48.8% dan 64.6% at 3 and 4 weeks after treatments respectively. RingkasanProduktivitas perkebunan kakao Indonesia relatif rendah. Usaha peningkatan produktivitasnya dapat ditempuh melalui pengurangan jumlah layu pentil kakao, dengan cara mengaplikasikan formula zat pengatur tumbuh dari jenis penghambat pertumbuhan vegetatif (VGR) berkomposisi sesuai. Makalah ini membahas hasil penelitian tentang pengembangan suatu teknologi praktis untuk menurunkan tingkat layu pentil kakao. Sebagai komponen utama adalah VGR jenis kloro kolin dengan suplemen bufer asam. Kondisi kimiawi tertentu formula tersebut merupakan pertimbangan tambahan dalam mendapatkan keefektifan yang lebih baik. Aplikasinya dilakukan dengan berbagai cara pada tanaman yang sedang berbuah kecil (pentil) dengan konsentrasi VGR bervariasi antara 25 hingga 200 ppm. Pengamatan dilakukan secara periodik dua kali dalam satu minggu. Dari enam cara aplikasi yang diuji, penyemprotan lapis atas daun merupakan cara yang terefektif. Percobaan pada tanaman kakao di kebun percobaan maupun kebun komersial menunjukkan bahwa VGR mampu menekan layu pentil kakao. Formula VGR yang mengandung bufer asam memiliki daya pengurangan layu pentil lebih baik daripada yang tanpa bufer. Pada pengamatan 3 dan 4 minggu setelah aplikasi formula VGR, tingkat layu pentil pada pohon kakao yang disemprot dengan formula VGR berbufer hanya sekitar 18,8% dan 39,9%. Sementara itu pada pohonpohon yang hanya disemprot dengan air, layu pentil pada waktu pengamatan tersebut mencapai 48,8% dan 64,6%.

Page 38 of 55 | Total Record : 541

 36   37   38   39   40 

Filter by Year

2000 2025


Reset
Filter By Issues
All Issue Vol. 93 No. 1 (2025): 93(1), 2025 Vol. 92 No. 2 (2024): 92(2), 2024 Vol. 92 No. 1 (2024): 92(1), 2024 Vol. 91 No. 2 (2023): 91 (2), 2023 Vol. 91 No. 1 (2023): 91 (1), 2023 Vol. 90 No. 2 (2022): 90 (2), 2022 Vol. 90 No. 1 (2022): 90 (1), 2022 Vol. 90 No. 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 1 (2022): April, 2022 Vol. 89 No. 2 (2021): 89 (2), 2021 Vol. 89 No. 1 (2021): 89 (1), 2021 Vol 89, No 2 (2021): Oktober, 2021 Vol 89, No 1 (2021): April, 2021 Vol. 88 No. 2 (2020): 88 (2), 2020 Vol. 88 No. 1 (2020): 88 (1), 2020 Vol 88, No 2 (2020): Oktober,2020 Vol 88, No 1 (2020): April, 2020 Vol. 87 No. 2 (2019): 87 (2), 2019 Vol. 87 No. 1 (2019): 87 (1), 2019 Vol 87, No 2 (2019): OKTOBER, 2019 Vol 87, No 1 (2019): April, 2019 Vol. 86 No. 2 (2018): 86 (2), 2018 Vol. 86 No. 1 (2018): 86 (1), 2018 Vol 86, No 2 (2018): Oktober 2018 Vol 86, No 1 (2018): April, 2018 Vol. 85 No. 2 (2017): 85 (2), 2017 Vol. 85 No. 1 (2017): 85 (1), 2017 Vol 85, No 2 (2017): Oktober 2017 Vol 85, No 1 (2017): April, 2017 Vol. 84 No. 2 (2016): 84 (2), 2016 Vol. 84 No. 1 (2016): 84 (1), 2016 Vol 84, No 2 (2016): Desember 2016 Vol 84, No 1: Oktober 2016 Vol. 83 No. 2: 83 (2), 2015 Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015 Vol 83, No 2: Desember 2015 Vol 83, No 1: Juni 2015 Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014 Vol. 82 No. 1: 82 (1), 2014 Vol 82, No 2: Desember 2014 Vol 82, No 1: Juni 2014 Vol. 81 No. 2: 81 (2), 2013 Vol. 81 No. 1: 81 (1), 2013 Vol 81, No 2: Desember 2013 Vol 81, No 1: Juni 2013 Vol. 80 No. 2: 80 (2), 2012 Vol. 80 No. 1: 80 (1), 2012 Vol 80, No 2: Desember 2012 Vol 80, No 1: Juni 2012 Vol. 79 No. 2: 79 (2), 2011 Vol. 79 No. 1: 79 (1), 2011 Vol 79, No 2: Desember 2011 Vol 79, No 1: Juni 2011 Vol. 78 No. 2: 78 (2), 2010 Vol. 78 No. 1: 78 (1), 2010 Vol 78, No 2: Desember 2010 Vol 78, No 1: Juni 2010 Vol. 77 No. 2: 77 (2), 2009 Vol. 77 No. 1: 77 (1), 2009 Vol 77, No 2: Desember 2009 Vol 77, No 1: Juni 2009 Vol. 76 No. 2: 76 (2), 2008 Vol. 76 No. 1: 76 (1), 2008 Vol 76, No 2: Desember 2008 Vol 76, No 1: Juni 2008 Vol. 75 No. 2: 75 (2), 2007 Vol. 75 No. 1: 75 (1), 2007 Vol 75, No 2: Desember 2007 Vol 75, No 1: Juni 2007 Vol. 74 No. 2: 74 (2), 2006 Vol. 74 No. 1: 74 (1), 2006 Vol 74, No 2: Desember 2006 Vol 74, No 1: Juni 2006 Vol. 73 No. 2: 73 (2), 2005 Vol. 73 No. 1: 73 (1), 2005 Vol 73, No 2: Desember 2005 Vol 73, No 1: Juni 2005 Vol. 72 No. 2: 72 (2), 2004 Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004 Vol 72, No 2: Desember 2004 Vol 72, No 1: Juni 2004 Vol. 71 No. 2: 71 (2), 2003 Vol. 71 No. 1: 71 (1), 2003 Vol 71, No 2: Desember 2003 Vol 71, No 1: Juni 2003 Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002 Vol. 70 No. 1: 70 (1), 2002 Vol 70, No 2: Desember 2002 Vol 70, No 1: Juni 2002 Vol. 69 No. 2: 69 (2), 2001 Vol. 69 No. 1: 69 (1), 2001 Vol 69, No 2: Desember 2001 Vol 69, No 1: Juni 2001 Vol. 68 No. 2: 68 (2), 2000 Vol. 68 No. 1: 68(1), 2000 Vol 68, No 2: Desember 2000 Vol 68, No 1: Juni 2000 More Issue