Claim Missing Document
Check
Articles

Found 36 Documents
Search

KARAKTERISASI PARSIAL FAKTOR IMUNOMODULATOR KELENJAR SALIVA Aedes aegypti (DIPTERA: CULICIDAE) SEBAGAI KANDIDAT Transmission Blocking Vaccine (TBV) DEMAM BERDARAH DENGUE Wathon, Syubbanul; Senjarini, Kartika; Widajati, Sri Mumpuni Wahyu; Oktarianti, Rike
BERKALA SAINSTEK Vol 2, No 1 (2014)
Publisher : My Home

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Penyakit Demam Berdarah Dengue (DBD) disebabkan oleh infeksi virus dengue yang dibawa Aedes aegypti (Ae. aegypti) sebagai vektor primernya. Pengendalian vektor pada penyakit DBD masih belum maksimal. Selain itu vaksin yang belisensi untuk penyakit DBD masih belum dilaporkan. Melalui pengembangan TBV salah satunya dengan memanfaatkan komponen saliva vektor. aliva vektor memiliki potensi dalam meningkatkan transmisi patogen ke tubuh inang, maka perlu adanya karakterisasi molekul dalam saliva nyamuk termasuk faktor imunomodulator. Karakterisasi faktor imunomodulator saliva Ae. aegypti dilakukan melalui uji reaksi silang antara protein kelenjar saliva Ae. aegypti dengan beberapa plasma darah manusia. Hasil penelitian menunjukkan adanya protein spesifik yang dikenali antibodi dalam plasma darah orang endemik dengan berat molekul ~ 37 kDa. Hal ini megindikasikan bahwa di dalam tubuh penduduk endemik telah mengembangkan antibodi anti-saliva Ae. aegypti yang diduga berperan penting dalam resistensi terhadap infeksi virus dengue. Kata Kunci: Ae. aegypti, DBD, faktor imunomodulator, kelenjar saliva, TBV
PURIFIKASI PROTEIN IMUNOGENIK 31 DAN 56 kDa DARI KELENJAR SALIVA Aedes aegypti Wathon, Syubbanul; Mutiah, Fitria; Oktarianti, Rike; Senjarini, Kartika
Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI) Vol. 7 No. 1 (2020): June 2020
Publisher : Balai Bioteknologi, Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (9682.432 KB) | DOI: 10.29122/jbbi.v7i1.3931

Abstract

Purification of 31 and 56 kDa Immunogenic Proteins from the Salivary Glands of Aedes aegyptiThe salivary gland of arthropod vector contains various bioactive compounds and plays a role in the transmission of pathogens to the host. The host develops anti-salivary antibodies against vector saliva exposure. Our previous research has identified two immunogenic proteins with molecular weights of 31 and 56 kDa from the Aedes aegypti salivary gland protein extract. However, the role of the 31 and 56 kDa immunogenic proteins from saliva Ae. aegypti is not fully known, so it is necessary to purify two immunogenic protein fractions to better specify the target of developing a dengue vaccine. This study aimed to purify the 31 and 56 kDa immunogenic protein fractions by electroelution and dialysis methods. The purification of the two protein fractions has been successful which were confirmed by the SDS-PAGE by the existence of single-band parallel to the positive control. These results were further supported by the dot blot analysis which showed a positive reaction in the form of dark spots in the two protein fractions which were reacted with dengue patients' serum, endemic healthy people, and neonates. These results indicated that the purified 31 and 56 kDa immunogenic protein fraction can be identified by specific antibodies.Keywords: dialysis, electroelution, immunogenic, purification, saliva  ABSTRAKKelenjar saliva vektor arthropoda mengandung berbagai senyawa bioaktif dan berperan dalam transmisi patogen ke tubuh inang. Tubuh inang mengembangkan antibodi anti-saliva terhadap paparan saliva vektor. Penelitian kami sebelumnya telah mengidentifikasi dua protein imunogenik dengan berat molekul 31 dan 56 kDa dari ekstrak protein kelenjar saliva Aedes aegypti. Namun demikian, peranan protein imunogenik 31 dan 56 kDa dari saliva Ae. aegypti belum diketahui sepenuhnya sehingga perlu dilakukan purifikasi dua fraksi protein imunogenik untuk lebih menspesifikkan target pengembangan vaksin dengue. Tujuan penelitian ini untuk melakukan purifikasi fraksi protein imunogenik 31 dan 56 kDa melalui metode elektroelusi dan dialisis. Keberhasilan purifikasi dua fraksi protein 31 dan 56 kDa terbukti dari hasil konfirmasi SDS-PAGE dengan terbentuknya pita tunggal sejajar dengan kontrol positif. Hasil tersebut diperkuat dengan analisis dot blot yang menunjukkan reaksi positif dengan munculnya noktah gelap pada dua fraksi protein tersebut ketika direaksikan dengan serum pasien DBD, penduduk sehat endemik dan neonatus. Hasil ini mengindikasikan bahwa fraksi protein imunogenik 31 dan 56 kDa hasil purifikasi dapat dikenali oleh antibodi spesifik.
FREKUENSI ALEL GOLONGAN DARAH SISTEM A-B-O PADA POPULASI SUKU OSING DESA KEMIREN KABUPATEN BANYUWANGI Amania, Novita; Wiyono, Hidayat Teguh; Oktarianti, Rike
BIOMA Vol 5, No 1 (2020): BIOMA : JURNAL BIOLOGI DAN PEMBELAJARAN BIOLOGI
Publisher : Universitas Muhammadiyah Jember

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.32528/bioma.v5i1.3680

Abstract

Suku Osing di desa Kemiren, Banyuwangi memiliki tradisi perkawinan upek-upekkan, yaitu perkawinan antar kerabat. Perkawinan ini termasuk dalam perkawinan endogami yang menyebabkan menurunnya variasi genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui proporsi fenotip, frekuensi alel, dan kesetimbangan genetic Hardy-Weinberg golongan darah ABO pada populasi suku Osing di Desa Kemiren. Pengambilan sampel dilakukan secara acak. Identifikasi golongan darah dilakukan dengan metode slide test. Analisis penelitian menggunakan uji Chi-square. Hasil penelitian menunjukkan golongan darah pada populasi suku Osing di Desa Kemiren sebagai berikut: golongan darah O (45,95%), A (23,99%), B (21,97%), dan AB (8,09%). Frekuensi alel masing-masing adalah alel IA (0,16), frekuensi alel IB (0,16), dan frekuensi alel i (0,68). Hasil pengujian kesetimbangan genetik Hardy-Weinberg dengan uji Chi-square menunjukkan tidak ada penyimpangan yang signifikan.
Detection of immunogenic protein from salivary gland of Aedes albopictus Oktarianti, Rike; Khasanah, Rochmatul Nuryu; Wathon, Syubbanul; Senjarini, Kartika
Universa Medicina Vol. 40 No. 3 (2021)
Publisher : Faculty of Medicine, Universitas Trisakti

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.18051/UnivMed.2021.v40.234-242

Abstract

BackgroundDengue virus is transmitted by several species of Aedes mosquitoes, with Aedes albopictus as secondary vector. During blood feeding, these vectors inject saliva into the vertebrate hosts. The saliva contains anticoagulant, anti-inflammatory and immunogenic factors. The objective of this research was to detect immunogenic proteins from Ae.albopictus salivary glands reacting with sera of people living in dengue endemic areas. MethodsThe identification of immunogenic proteins of Ae. albopictus salivary gland used one-dimensional gel electrophoresis (sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis), and western blot analysis, respectively. To determine the immunogenic nature of the candidate proteins, the antigens from the salivary gland of Ae. albopictus were reacted with sera from healthy persons, dengue hemorrhagic fever (DHF) patients, and neonates, each of the groups comprising 10 samples. ResultsThe protein profiles of Ae. albopictus salivary glands showed 13 bands with molecular weights from 16 kDa up to 97 kDa, i.e. 16, 17, 26, 28, 31, 32, 45, 55, 60, 67, 73, 76, and 97 kDa. According to western blot analysis result, the 31 kDa proteins were recognized in all endemic population sera, both in DHF patients and healthy persons. In contrast, protein bands of 47 and 67 kDa were only recognized by the sera of DHF patients. ConclusionThree immunogenic proteins of 31, 47 and 67 kDa were detected from Ae. albopictus salivary glands. These immunogenic proteins may be developed as candidate biomarkers for bite exposure to Ae. albopictus and as vector-based DHF vaccines.
Identifikasi dan Analisis Bionomik Vektor Malaria Anopheles sp. di Desa Bangsring Kecamatan Wongsorejo, Banyuwangi Renam Putra Arifianto; Dewi Masruroh; Maulana Jauharil Habib; Mochtar Gunawan Wibisono; Syubhanul Wathon; Rike Oktarianti; Kartika Senjarini
Acta VETERINARIA Indonesiana Vol. 6 No. 1 (2018): Januari 2018
Publisher : IPB University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (697.425 KB) | DOI: 10.29244/avi.6.1.44-50

Abstract

Kabupaten Banyuwangi merupakan salah satu daerah endemis malaria, khususnya Desa Bangsring Kecamatan Wongsorejo. Berdasarkan laporan survei entomologi, di desa tersebut terdapat lagun yang digunakan sebagai tempat perindukan Anopheles. Penelitian ini bertujuan untuk mengamati beberapa karakteristik bionomik yang penting yaitu identifikasi spesies serta perilaku dan preferensi menghisap darah. Sampling dilakukan pada bulan Mei sampai bulan November2015, pada minggu ke 2 setiap bulannya. Penangkapan nyamuk dilakukan pada Manusia Dalam Rumah dan Manusia Luar Rumah di dua rumah berbeda. Masing-masing penangkapan setiap 40 menit, dimulai pukul 18.00 sampai 06.00. Penangkapan nyamuk yang Istirahat Dalam Rumah (IDR) dan Istirahat di Sekitar Kandang Ternak (ISKT) setiap 10 menit pada waktu yang sama. Hasil identifikasi menunjukkan spesies Anopheles yang dominan di lokasi penelitian adalah An. sundaicus. Beberapa spesies lainnya yang ditemukan diantaranya adalah An. vagus, An. subpictus, An. barbirostris dan An. indefinitus. Aktivitas mengigit Anopheles mengalami puncak kepadatan antara pukul 21.00 – 22.00. Sementara itu preferensi mengigitnya lebih bersifat eksofagik dan zoofilik. Hal ini dapat merupakan penyebab menurunnya kasus malaria di daerah tersebut selama 3 tahun terakhir semenjak terjadinya kejadian luar biasa malaria pada tahun 2011 dengan jumlah kasus sebanyak 107 kasus malaria.
PURIFIKASI PROTEIN IMUNOGENIK 31 DAN 56 kDa DARI KELENJAR SALIVA Aedes aegypti Syubbanul Wathon; Fitria Mutiah; Rike Oktarianti; Kartika Senjarini
Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI) Vol. 7 No. 1 (2020): June 2020
Publisher : Balai Bioteknologi, Badan Pengkajian dan Penerapan Teknologi (BPPT)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29122/jbbi.v7i1.3931

Abstract

Purification of 31 and 56 kDa Immunogenic Proteins from the Salivary Glands of Aedes aegyptiThe salivary gland of arthropod vector contains various bioactive compounds and plays a role in the transmission of pathogens to the host. The host develops anti-salivary antibodies against vector saliva exposure. Our previous research has identified two immunogenic proteins with molecular weights of 31 and 56 kDa from the Aedes aegypti salivary gland protein extract. However, the role of the 31 and 56 kDa immunogenic proteins from saliva Ae. aegypti is not fully known, so it is necessary to purify two immunogenic protein fractions to better specify the target of developing a dengue vaccine. This study aimed to purify the 31 and 56 kDa immunogenic protein fractions by electroelution and dialysis methods. The purification of the two protein fractions has been successful which were confirmed by the SDS-PAGE by the existence of single-band parallel to the positive control. These results were further supported by the dot blot analysis which showed a positive reaction in the form of dark spots in the two protein fractions which were reacted with dengue patients' serum, endemic healthy people, and neonates. These results indicated that the purified 31 and 56 kDa immunogenic protein fraction can be identified by specific antibodies.Keywords: dialysis, electroelution, immunogenic, purification, saliva  ABSTRAKKelenjar saliva vektor arthropoda mengandung berbagai senyawa bioaktif dan berperan dalam transmisi patogen ke tubuh inang. Tubuh inang mengembangkan antibodi anti-saliva terhadap paparan saliva vektor. Penelitian kami sebelumnya telah mengidentifikasi dua protein imunogenik dengan berat molekul 31 dan 56 kDa dari ekstrak protein kelenjar saliva Aedes aegypti. Namun demikian, peranan protein imunogenik 31 dan 56 kDa dari saliva Ae. aegypti belum diketahui sepenuhnya sehingga perlu dilakukan purifikasi dua fraksi protein imunogenik untuk lebih menspesifikkan target pengembangan vaksin dengue. Tujuan penelitian ini untuk melakukan purifikasi fraksi protein imunogenik 31 dan 56 kDa melalui metode elektroelusi dan dialisis. Keberhasilan purifikasi dua fraksi protein 31 dan 56 kDa terbukti dari hasil konfirmasi SDS-PAGE dengan terbentuknya pita tunggal sejajar dengan kontrol positif. Hasil tersebut diperkuat dengan analisis dot blot yang menunjukkan reaksi positif dengan munculnya noktah gelap pada dua fraksi protein tersebut ketika direaksikan dengan serum pasien DBD, penduduk sehat endemik dan neonatus. Hasil ini mengindikasikan bahwa fraksi protein imunogenik 31 dan 56 kDa hasil purifikasi dapat dikenali oleh antibodi spesifik.
Analisis Hasil Elektroforesis DNA dengan Image Processing Menggunakan Metode Gaussian Filter Khairul Anam; Widya Cahyadi; Ihsanul Azmi; Kartika Senjarini; Rike Oktarianti
IJEIS (Indonesian Journal of Electronics and Instrumentation Systems) Vol 11, No 1 (2021): April
Publisher : IndoCEISS in colaboration with Universitas Gadjah Mada, Indonesia.

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22146/ijeis.58268

Abstract

DNA gel electrophoresis plays an important role in the development of science. However, the process of manually analyzing DNA size is still relatively difficult, time-consuming, and often results an error. This study proposed electrophoresis process using image processing with Gaussian Filter method. Gaussian Filter is used to improve the quality of the image which makes the image clearer. The method was applied using python programming and then embedded into Raspberry pi 3 module. This modul processed images taken by Raspberry pi V1 camera. To realize these taken images, tracking mouse was used. All the images which had been processed were displayed on LCD touchscreen 5 inch. The result shows that the study using Gaussian Filter indicates good performance. This is proved by the lowest error percentage of 0,20% . In addition, compared to previous studies, the largest error percentage is still relatively smaller at 12.41%.
GENETIC VARIATION OF AEDES AEGYPTI (DIPTERA : CULICIDAE) BASED ON DNA POLYMORPHISM Rike Oktarianti; Sri Mumpuni
UNEJ e-Proceeding 2016: Proceeding The 1st International Basic Science Conference
Publisher : UPT Penerbitan Universitas Jember

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Dengue hemorrhagic fever (DHF) is a health problem in Indonesia, particularly in Jember. Dengue is a disease caused by Dengue virus (DENV). Ae. aegypti is the main vector for transmission of Dengue viruses into human. The spread of Dengue virus caused by the vector density. The objective of this research is to study the genetic variation of Aedes aegypti based on DNA polymorphism by Random Amplified Polymorphic (RAPD) PCR analysis. The mosquitoes were collected from Arjasa, Mumbulsari and Mayang in Jember district. The primer were used to RAPD analysis are OPE 16, OPE 17, OPE 19, OPF 2, OPF 4 and OPF 6. The result showed, the genetic variation of Aedes aegypti from Arjasa, Mumbulsari and Mayang based on DNA polymorphism were 22.58%, 23.53% and 21.21% respectively.
Distribusi dan Frekuensi Alel Golongan Darah Sistem ABO dan Rhesus pada Penduduk Pulau Gili Ketapang Probolinggo Kirana Eka Rezki; Rike Oktarianti; Hidayat Teguh Wiyono; Purwatiningsih Purwatiningsih
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 7 No 1 (2021): Agustus 2021
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (461.049 KB)

Abstract

Sistem penggolongan darah pada manusia yang banyak dikenal adalah sistem ABO dan rhesus. Tujuan penelitian ini adalah Mengetahui distribusi golongan darah sistem ABO dan rhesus serta frekuensi alel pada populasi penduduk pulau Gili Ketapang, kabupaten Probolinggo. Pengambilan sampel dilakukan secara acak dengan cara dilakukan pengundian jumlah sampel yang diambil sebanyak 384 jiwa. Identifikasi golongan darah sistem ABO pada penelitian ini dilakukan dengan metode slide dengan prinsip antigen (aglutinogen) yang direaksikan dengan antibodi (aglutinin). Hasil penelitian menunjukkan distribusi golongan darah sistem ABO dan Rhesus O+ (46,61%), B+ (24,22%), A+ (23,18%), dan AB+ (5,99%). Frekuensi alel IA(0,16), frekuensi alel IB (0,16), frekuensi alel i (0,68), dan frekuensi alel rhesus positif (Rh+) adalah 1
Prevalensi Buta Warna pada Siswa Sekolah Dasar di Pulau Gili Ketapang Kabupaten Probolinggo Nailatur Rifdah; Rike Oktarianti; Hidayat Teguh Wiyono; Asmoro Lelono; Husnatun Nihayah
Jurnal Ilmiah Biosaintropis (Bioscience -Tropic) Vol 7 No 2 (2022): Januari 2022
Publisher : Fakultas Matematika & Ilmu Pengetahuan Alam - Universitas Islam Malang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (765.482 KB) | DOI: 10.33474/e-jbst.v7i2.453

Abstract

Buta warna merupakan salah satu kendala dalam proses pembelajaan setiap siswa tingkat dasar yang harus diketahui sejak dini. Buta warna utamanya disebabkan oleh faktor genetik. Buta warna merupakan kelainan genetik sex linkage pada kromosom X. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui prevalensi penderita buta warna, frekuensi alel buta warna dan normal, dan mengetahui diagram silsilah keluarga penderita buta warna. Pengujian buta warna menggunakan metode Ishihara. Siswa yang diambil sebagai sampel yaitu 255 siswa yang telah dipilih secara acak, dengan rentang usia 8-12 tahun. Pengambilan sampel sesuai dengan prosedur pada Ethical clearance nomor 1224/UN25.8/KEPK/DL/2021. Hasil penelitian menunjukkan bahwa prevalensi penderita buta warna sebesar 3.14% dan prevalensi rang normal sebesar 96.86%. Frekuensi alel buta warna dan alel normal berturut-turut adalah 0,023 dan 0,977. Diagram silsilah pada keluarga penderita buta warna menunjukkan bahwa pola pewarisan buta warna adalah pola pewarisan bersilang (criss cross inheritance).