Garuda - Garba Rujukan Digital

Article Per Year (5 Year)

p-Index From 2020 - 2025

P-Index

This Author published in this journals

All Journal Jurnal Akuakultur Indonesia

K. Sumantadinata

Bogor Agricultural University, Department of Aquaculture

Author-ID : 391811

Agriculture, Biological Sciences & Forestry

Published : 13 Documents Claim Missing Document

Claim Missing Document

Articles

1 2

Relation between broodstock number and spawning frequency and egg production of humpback grouper (Cromileptes altivelis) Syaifudin, M.; Aliah, R.S.; Muslim, .; Sumantadinata, K.
Jurnal Akuakultur Indonesia Vol. 6 No. 2 (2007): Jurnal Akuakultur Indonesia
Publisher : Indonesian Society of Scientific Aquaculture (ISSA)

This study was performed to determine spawning frequency, number of ovulated egg and spawning time of humpback grouper (Cromileptes altivelis) broodstock in hatchery. Broodstock of 20-83 fish in weight of 1.5-2.0 kg were reared in circular concrete tank 225 m3. The results showed that increasing in number of broodstock increases spawning frequency (R2= 0.694), and ovulated eggs number was also increased (R2= 0.828). Spawning of humpback grouper can occur in the third to fourth week in every month. Keywords: reproductive biology, spawning, Cromileptes altivelis ABSTRAK Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui frekuensi pemijahan, jumlah telur dan waktu pemijahan populasi induk ikan kerapu tikus (Cromileptes altivelis) di hatchery. Jumlah induk yang bervariasi antara 20-83 ekor dengan ukuran 1,5-2 kg ditempatkan dalam bak beton bulat, kapasitas 225 m3. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa dengan bertambahnya jumlah induk, maka frekuensi pemijahan yang diperoleh juga semakin meningkat (R2=0,694), dan produksi telur juga semakin meningkat (R2=0,828). Pemijahan kerapu tikus dapat berlangsung setiap bulan, di mana waktu pemijahan terjadi pada kuarter keempat hingga kuarter ketiga. Kata kunci: Biologi reproduksi, Pemijahan, Cromileptes altivelis

Characterization of β-Actin Promoter from Nile Tilapia (Oreochromis niloticus) Alimuddin, .; Octavera, A.; Arifin, O.Z.; Sumantadinata, K.
Jurnal Akuakultur Indonesia Vol. 7 No. 2 (2008): Jurnal Akuakultur Indonesia
Publisher : Indonesian Society of Scientific Aquaculture (ISSA)

Promoter is one of the factors determining the successful of transgenesis. In this study we isolated and characterized β-actin promoter from Nile tilapia (tiBP) towards production of autotransgenic tilapia. β-actin promoter has high activity in muscle. Sequence of tiBP promoter was isolated by using PCR method. Sequencing was performed using ABI PRISM 3100 machine. Analysis of sequences was conducted using GENETYX version 7 and TFBind softwares. DNA fragment of PCR amplification product digested from the vector cloning was then ligated with pEGFP-N1 to generate ptiBP-EGFP construct. The construct was microinjected into one-cell stage of zebrafish (Danio rerio) embryos to test the tiBP promoter activity. EGFP gene expression was observed by fluorescence microscope. The result of sequence analysis showed that the length of DNA fragment obtained is about 1.5 kb and containing the evolutionary conserved sequences of transcription factor for β-actin promoter including CCAAT, CArG and TATA boxes. Furthermore, tiBP sequence in ptiBP-EGFP construct could regulated GFP expression in muscle of zebrafish embryos injected with the construct. The results suggested that PCR amplification product is the regulator sequence of tilapia β-actin gene. Autotransgenic tilapia can be then produced by changing GFP gene fragment of ptiBP-EGFP construct with genes from tilapia encoding important traits in aquaculture. Keywords: cloning, β-actin promoter, autotransgenic, EGFP, Oreochromis niloticus, Danio rerio ABSTRAK Promoter merupakan salah satu faktor penentu keberhasilan transgenesis. Pada penelitian ini kami mengisolasi dan mengkarakterisasi promoter β-actin dari ikan nila (tiBP) dalam rangka pembuatan ikan nila autotransgenik. Promoter β-actin memiliki aktivitas tinggi pada jaringan otot. Sekuens promoter tiBP diisolasi menggunakan metode PCR. Sekuensing dilakukan menggunakan mesin ABI PRISM 3100. Analisa sekuens menggunakan software GENETYX versi 7 dan TFBind. Fragment DNA hasil amplifikasi PCR yang didigesti dari vektor kloning selanjutnya diligasi dengan pEGFP-N1 untuk membuat konstruksi ptiBP-EGFP. Konstruksi ptiBP-EGFP dimikroinjeksi ke embrio ikan zebra (Danio rerio) fase 1 sel untuk menguji aktivitas promoter tiBP. Ekspresi gen EGFP diamati menggunakan mikroskop fluoresens. Analisa sekuens menunjukkan bahwa panjang fragmen DNA hasil amplifikasi PCR sekitar 1,5 kb dan memiliki faktor transkripsi yang konserf untuk promoter β-actin, yaitu CCAAT, boks CArG dan TATA. Selanjutnya, sekuens tiBP dalam konstruksi ptiBP-EGFP mampu mengendalikan ekspresi gen EGFP pada jaringan otot embrio ikan zebra yang dimikroinjeksi dengan konstruksi tersebut. Dengan demikian dapat disimpulkan bahwa fragmen DNA hasil amplifikasi PCR tersebut merupakan sekuens promoter β-actin ikan nila. Pembuatan ikan nila autotransgenik selanjutnya dapat dilakukan dengan mengganti gen EGFP pada pktBA-EGFP dengan gen-gen asal ikan nila yang mengkodekan karakter penting dalam budidaya ikan. Kata kunci: kloning, promoter β-actin, autotransgenik, EGFP, Oreochromis niloticus, Danio rerio

Hematology of common carp following DNA vaccination and koi herpesvirus challenge test Nuryati, Sri; Maswan, N.A.; Alimuddin, .; Sukenda, .; Sumantadinata, K.; Pasaribu, F.H.; Soejoedono, R.D.; Santika, A.
Jurnal Akuakultur Indonesia Vol. 9 No. 1 (2010): Jurnal Akuakultur Indonesia
Publisher : Indonesian Society of Scientific Aquaculture (ISSA)

The study was aimed to determine the effectiveness of DNA vaccine doses on hematological aspect which represent immune response and its influence on common carp survival rate. DNA vaccines encoding the viral glycoprotein of koi herpesvirus (KHV) have been proved to highly protect the fish under laboratory condition. A dose of 12.5 µg/100 µl vaccine had resulted in a survival rate of 96.67 % during 30 days after challenge test with a lethal dose of KHV. Fish vaccinated using lower doses, i.e. 2.5 and 7.5 µg/100µl showed 100% mortality after 15 and 19 days challenge test respectively, whereas non vaccinated fish as a control showed 100% mortality after 17 days challenge test. Total leucocytes of the vaccinated fish were higher than control until 42 days post vaccination, but declined afterward. Phagocytic index of the vaccinated fish using 12.5 µg/100 µl was declined after 49 days post vaccination or 7 days post challenge test. Key words: DNA vaccine, Koi herpesvirus (KHV), leucocyte, phagocytic index, Cyprinus carpio ABSTRAK Penelitian ini bertujuan untuk menguji pengaruh vaksinasi menggunakan vaksin DNA dengan dosis berbeda terhadap gambaran darah ikan sebagai respresentasi tanggap kebal ikan mas serta pengaruhnya terhadap tingkat kelangsungan hidup ikan mas. Vaksin DNA penyandi glikoprotein koi herpesvirus (KHV) dapat memberikan proteksi yang tinggi pada percobaan skala laboratorium. Vaksinasi dengan dosis 12,5 µg/100µl dapat mempertahankan kelangsungan hidup sebesar 96,67% selama satu bulan setelah uji tantang dengan virus KHV menggunakan dosis letal. Ikan yang divaksin dengan dosis yang lebih rendah yaitu 2,5 dan 7,5 µg/100µl mengalami kematian total berturut-turut setelah 15 dan 19 hari uji tantang, sedangkan ikan kontrol yang tidak divaksin mengalami kematian total setelah 17 hari uji tantang. Jumlah leukosit total ikan yang divaksinasi lebih tinggi dibanding dengan kontrol sampai hari ke-42, setelah itu mengalami penurunan. Indeks fagositosis ikan yang divaksin dengan dosis 12,5 µg/100µl mengalami penurunan setelah hari ke-49 atau 7 hari setelah uji tantang. Kata kunci: Vaksin DNA, Koi herpesvirus (KHV), leukosit, indeks fagositosis, Cyprinus carpio

Co-Authors , Alimuddin . Muslim . Wahidah A. Octavera A. Santika Adharto Utiah Alimuddin B.R. Parlinggoman D. Irawan D. Shafruddin Estu Nugroho F.H. Pasaribu G. Yoshizaki Harton Arfah I. Mokoginta Julie Ekasari L. Okmawati Anwar M. Syaifudin M. Zairin Junior N.A. Maswan O. Carman O.Z. Arifin Odang Carman R. Affandi R.D. Soejoedono R.S. Aliah Ratu Siti Aliah Sri Nuryati Sukenda . Y. Hadiroseyani

Title

Found 13 Documents
Search

Abstract

Abstract

Abstract

Title Search

Found 13 Documents Search

Abstract

Abstract

Abstract

Title

Found 13 Documents
Search