cover
Contact Name
Hayati Minarsih
Contact Email
menaraperkebunanppbbi@gmail.org
Phone
-
Journal Mail Official
menaraperkebunan@iribb.org
Editorial Address
Jalan Taman Kencana No.1 Bogor 16128, Jawa Barat
Location
Kab. bogor,
Jawa barat
INDONESIA
Menara Perkebunan
ISSN : 01259318     EISSN : 18583768     DOI : -
Core Subject : Agriculture,
Menara Perkebunan as a communication medium for research in estate crops published articles covering original research result on the pre- and post-harvest biotechnology of estate crops. The contents of the articles should be directed for solving the problems of production and/or processing of estate crops of smallholder, private plantations and state-owned estates, based on the three dedications of plantation. Analyses of innovative research methods and techniques in biotechnology, which are important for advancing agricultural research. Critical scientific reviews of research result in agricultural and estate biotechnology.
Arjuna Subject : -
Articles 541 Documents
Enzymatic hydrolysis of oil palm empty fruit bunch to produce reducing sugar and its kinetic Hidrolisis enzimatik tandan kosong kelapa sawit untuk menghasilkan gula pereduksi dan kinetikanya Vera BARLIANTI; Deliana DAHNUM; . MURYANTO; Eka TRIWAHYUNI; Yosi ARISTIAWAN; Yanni SUDIYANI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 83, No 1: Juni 2015
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (176.219 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v83i1.12

Abstract

Abstrak Sebagai salah satu Negara penghasil minyak kelapa sawit mentah (CPO), Indonesia juga menghasilkan tandan kosong kelapa sawit (TKKS) dalam jumlah besar. TKKS terdiri dari-tiga-komponen utama, yaitu selulosa, hemiselulosa, dan lignin. Pengolahan awal TKKS secara alkalindi ikuti dengan hidrolisis TKKS secara enzimatik menggunakan kombinasi enzim selulase dan β-glukosidase akan menghasilkan gula-gula yang mudah difermentasi.  Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh konsentrasi substrat, kon-sentrasi enzim, dan suhu selama proses hidrolisis berlangsung.  Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa konsentrasi gula maksimum (194,78 g/L) dicapai pada konsentrasi TKKS 20% (b/v), konsentrasi campuran enzim yang terdiri dari selulase dan β-1,4 glukosidase sebesar 3,85% (v/v), dan suhu 50oC. Perbandingan antara selulase dan β-1,4 glukosidase adalah 5:1 dengan masing-masing aktivitas enzim sebesar 144.5 FPU/mL dan 63 FPU/mL. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa model kinetika yang sesuai untuk proses hidrolisis TKKS secara enzimatik adalah model kinetika Shen dan Agblevor dengan reakside aktivasi enzim orde satu.  Hasil ini mendukung studi kelayakan ekonomi dalam pemanfaatan TKKS untuk produksi bioetanol.AbstractAs one of the crude palm oil producers, Indonesia also produces empty fruit bunches (EFB)in large quantities. The oil palm EFB consist of cellulose, hemicellulose and lignin. Alkaline pretreatment of EFB, followed by enzymatic hydro-lysis of cellulose using combination of cellulase and β-glucosidase enzymes produce fermentable sugars. This paper reported the effects of substrate loading, enzyme concentration, and temperature of hydrolysis process on reducing sugar production. The  maximum  sugar  concentration (194.78 g/L) was produced at 50oC using 20% (w/v) EFB and 3.85% (v/v) mixed enzymes of cellulase and β-1,4 glucosidase in volume ratio of 5:1 (v/v), with enzyme activity of 144.5 FPU/mL and 63 FPU/mL, respectively. The results also showed that the suitable kinetic model for enzymatic hydrolysis process of oil palm EFB follow Shen and Agblevor model with first order of enzyme deactivation. These results support the economic feasibility study in utilization of EFB of oil palm for bioethanol production.    
Kloning fragmen gen penyandi β-ketoacyl-ACP synthase II dari dua tipe kelapa sawit dengan kandungan asam oleat yang berbeda Cloning of gene fragment encoding β-ketoacyl-ACP synthase II from two types of oil palm with different oleic acid content Asmini BUDIANI1; Abdul Razak PURBA
E-Journal Menara Perkebunan Vol 78, No 1: Juni 2010
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (406.799 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v78i1.73

Abstract

AbstractIn addition to increase productivity, oil palm breeding is also aimed to increase oil quality, one of which is oleic acid content. Conventionally, the increase of oleic acid is carried out by crossing between Elaeis guineensis which is high in oilcontent and Elaeis oleifera which contain high oleic acid. Genetic engineering to increase oleic acid might be done by over expressing gene encoding β-Ketoacyl-ACP Synthase II (KASII) in the mesocarp of oil palm. As a preliminary workof genetic engineering to increase oleic acid content, this research was aimed to clone DNA fragment of gene encoding KASII by using RT-PCR. Total RNA were isolated from the mesocarp of two different types of oil palms, namelySimalungun (E. guineensis) and Hibrida (E. guineensi x E. oleifera), and used for synthesis of first strand cDNA. Amplification of KASII DNA fragments was carried out using first strand cDNA as a template with specific primers. TheRT-PCR product was verified by electrophoresis on agarose gel, isolated and purified from the gel, sequenced and then cloned into E. coli using pGEM-T Easy cloning vector. Analysis of the target DNA in transformed E. coli was done by colony PCR. Recombinant plasmid was isolated from recombinant E. coli followed by DNA sequencing and analysis. DNA sequences were analysed using BLASTn to test the homology with similar genes. The results show that DNAfragment of RT-PCR products from Simalungun and Hibrida types of oil palm have been cloned in E. coli, and the sequences have been confirmed as a fragment of KASII gene. Analysis of the two sequences indicated that there were differences of four nucleotides at position no of 91, 103, 115, and 148. AbstrakSelain meningkatkan produksi, pemuliaan kelapa sawit juga ditujukan untuk meningkatkan kualitas minyak sawit, salah satunya adalah meningkatkan kandungan oleat. Secara konvensional peningkatan kandungan oleat dilakukan melalui penyilangan antara Elaeis guineensis yang tinggi rendemenminyaknya dengan Elaeis oleifera yang tinggi kandungan oleatnya. Rekayasa genetika untuk peningkatan kandungan oleat dapat ditempuh antara lain dengan mening-katkan ekspresi gen penyandi β-Ketoacyl-ACP Synthase II (KASII)pada mesokarp buah sawit. Sebagai bagian dari upaya peningkatan kandungan oleat, penelitian ini bertujuan untuk mengklon fragmen gen penyandi KASII dengan pendekatanRT-PCR. RNA total diisolasi dari mesokarp dua tipe kelapasawit yaitu Simalungun dan Hibrida (E. guineensis x E. oleifera), kemudian digunakan dalam sintesis utas pertama cDNA. Amplifikasi fragmen DNA penyandi KASII dilakukan menggunakan primer spesifik dan templat cDNAutas pertama hasil sintesis. Produk RT-PCR diverifikasi dengan elektroforesis pada gel agarosa, diisolasi dan dimurnikan dari gel, disekuen kemudian diklon dalam E. coli menggunakan vektor kloning pGEM-T Easy. Analisis adanyafragmen DNA target dalam sel E. coli transforman dilakukan dengan PCR koloni. Plasmid rekombinan diisolasi dari sel rekombinan dan diverifikasi pada gel agarose kemudian disekuen kembali untuk mengkonfirmasi bahwa fragmenDNA terklon adalah bagian dari gen penyandi KASII. Sekuen DNA dianalisis menggunakan BLASTn untuk mengetahui homologinya dengan gen yang sama. Hasil penelitian menunjukkan bahwa fragmen DNA produk RTPCR dari kelapa sawit tipe Simalungun dan Hibrida telah terklon dalam E. coli dan sekuen DNAnya dikonfirmasi sebagai fragmen gen penyandi KASII. Hasil analisis sekuen DNA KASII dari tipe Simalungun dengan tipe Hibrida juga mengindikasikan adanya perbedaan pada empat nukleotida yaitu pada posisi ke-91, ke-103, ke-115, dan ke-148.
Potensi fungi pelapuk putih asal lingkungan tropik untuk bioremediasi herbisida The potential white-rot fungi native of tropical environment for herbicides bioremediation Laksmita Prima SANTI; Lisdar Idwan SUDIRMAN; Didiek Hadjar GOENADI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 75, No 1: Juni 2007
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (238.646 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v75i1.153

Abstract

SummaryFungal treatment by using white-rot fungito reduce a wide variety of herbicide com-pounds is a specialized bioremediation pro-cess. A laboratory experiment was conductedto determine the ability of Phanerochaetechrysosporium, Ceriporiopsis subvermispora,and Pleurocybella porrigens and seven white-rot fungi isolated from a native of tropicalenvironment to grow on yeast malt extractglucose (YMG) agar containing highconcentration of (I) 2,4-dichlorophenoxy aceticacid, (R) glyphosate, and (G) paraquat. Thedata indicated that P. chrysosporium couldgrow on YMG media containing 5000 ppm of(I) 2,4-D, whereas BPBPI 02/04 isolate onYMG 250 ppm of (R) glyphosate or (G)paraquat. Relative values of growth inhibitionof these fungi are 81.1; 27.8; and 50.0%respectively. Biodegradation capability ofherbicides by candidate inoculants in soil-sandmedia was also determined in greenhouseexperiment by using peanut, sorghum, corn,and Borreria alata as bio-indicators. Peanutand B. alata were found to be the bestresponsive seedlings as bio-indicator on thepresence of (I) 2,4-D herbicide in soil-sandmedia.RingkasanTeknologi bioremediasi dengan fungipelapuk putih (FPP) digunakan untuk me-reduksi sejumlah senyawa herbisida. Kegiatanpenelitian yang dilakukan di laboratoriumbertujuan untuk mengetahui kemampuan tum-buh Phanerochaete chrysosporium, Ceripo-riopsis subvermispora, dan Pleurocybellaporrigens serta tujuh isolat FPP yang diperolehdari lingkungan tropik secara in vitro padamedium agar yeast malt extract glucose(YMG) yang mengandung (I) 2,4-dikloro-fenoksi asam asetat, (R) glifosat, dan (G)parakuat konsentrasi tinggi. Dari data yangdiperoleh, diketahui bahwa Ph. chrysosporiummemiliki kemampuan tumbuh dalam mediumpadat YMG yang mengandung 5000 ppm (I)2,4-D dan isolat BPBPI 02/04 pada 250 ppm(R) glifosat dan (G) parakuat dengan nilaihambatan pertumbuhan relatif terhadap kontrol(HPR) masing-masing 81,1; 27,8; dan 50,0%.Pengujian isolat terpilih terhadap kemampuanmendegradasi herbisida di dalam mediumtanah dan pasir juga dilakukan di rumah kacadengan menggunakan kacang tanah, sorgum,jagung, dan Boreria alata sebagai bioindikator.Kacang tanah dan B. alata memberikan responterbaik terhadap keberadaan herbisida (I) 2,4-Ddi dalam medium tanah dan pasir .
Penapisan bakteri penghasil bioplastik polihidroksi alkanoat dari tanah tempat pembuangan sampah dan limbah cair pabrik kelapa sawit Screening of bioplastics polyhydroxy alkanoic producing bacteria from landfill and palm oil mill effluents Irma KRESNAWATY; Haryo Tejo PRAKOSO; Deden Dewantara ERIS; Agustin Sri MULYATNI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 82, No 1: Juni 2014
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (302.734 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i1.28

Abstract

AbstractPlastic wastes  have  become a serious problem  of  the world  because of  unbiodegradable  property. There are many  solutions to this problem  and  one of  them is by replacing conventional plastic base  material with  the  biodegradable  materials. Bioplastic material that is quite important for industries and  recently being developed  by  scientists  is Polyhydroxyalcanoate (PHA). It is a natural polyester which  can be produced  by several microorganisms, like bacteria and algae. Bacterial isolations  from landfills waste and  palm oil mill effluents were conducted on this research. Preliminary screenings of PHA-producing-bacteria were examined qualitatively using  0.05%  Nile red dye. The selection results showed  that among 32 bacterial isolates, 10  of  them could  accumulate PHA  which  could be detected qualitatively through  its  fluorescence in  UV  ray  at λ 235 nm. TH-D092 and LC-S05 isolates originated  respectively  from landfill and  palm oil mill effluent had ability to accumulate PHA respectively  6.67 and 9.44% dried cell weight. Identification  of  the microbe concluded  that TH-D092  was Pseudomonas aeroginosa, whilst LC-S05 and LC-D02 isolates was  Bacillus subtilis.AbstrakLimbah plastik menjadi masalah serius yang dihadapi dunia karena sulit didegradasi mikroba. Salah satu solusi masalah adalah dengan mengganti bahan dasar plastik konvensional dengan plastik biodegradable (bioplastik). Bahan bioplastik yang cukup penting bagi indutri  dan saat ini terus dikembangkan oleh peneliti adalah Polihidroksial- kanoat (PHA). PHA merupakan poliester alami yang dapat diproduksi oleh mikroorganisme, seperti bakteri dan alga. Pada penelitian dilakukan isolasi bakteri dari tanah tempat pembuangan sampah (TPS) dan limbah cair pabrik kelapa sawit (LCPKS). Penapisan awal bakteri penghasil PHA dilakukan secara kualitatif menggunakan pewarna Nile red  0.05%. Hasil penapisan menunjukkan diantara ke-32  isolat bakteri diperoleh 10 isolat mampu mengakumulasi PHA secara kualitatif, yaitu isolat yang mampu menimbulkan  pendaran floresen pada sinar UV  pada λ 235 nm. Isolat TH-D092 dari tanah tempat pembuangan  sampah dan isolat LC-S05 dari limbah cair pabrik kelapa sawit memiliki kemampuan mengakumulasi PHA berturut-turut  6,67 dan 9,44% dari berat sel kering. Hasil identifikasi spesies bakteri menunjukkan bahwa isolat TH-DO9 termasuk Pseudomonas aeroginosa, LC-SO5 dan LC-DO2 termasuk Bacillus subtilis.
Perbanyakan in vitro tanaman kina (Cinchona ledgeriana Moens) melalui tunas aksiler dan apikal In vitro propagation of cinchona (Cinchona ledgeriana Moens) from axillary and apical buds Imron RIYADI; J. S. TAHARDI TAHARDI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 77, No 1: Juni 2009
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (331.473 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v77i1.114

Abstract

AbstractThe use of the appropriate source of nodalbud explants in culture can increase theeffectiveness and efficiency of shootmultiplication. An experiment was conducted todetermine and compare the rate of in vitro shootmultiplication from apical and axillary budsin cinchona (Cinchona ledgeriana Moens) andtheir subsequent growth and development. Theplant material used was Cinchona ledgerianaoriginating from the Indonesian Tea andCinchona Research Institute, Gambung, WestJava. Explants were taken from apical andaxillary nodes from in vitro germinated seedlings.The cultures were incubated at 26 0 C and 60%relative humidity under a 14-h photoperiod withlight intensity of 30 µmol photon/m 2 /sec.provided by cool-white fluorescent tubes (TL40 W) for 4 - 8 weeks. The parameters observedwere shoot multiplication rate, shoot growth anddevelopment such as shoot length, leaf numberand rooting frequency. Apical and axillary nodesproduced shoots at different multiplication rateson Murashige-Skoog (MS) standard mediumcontaining 30 g/L sucrose and supplemented with1 – 5 mg/L BA in combination with 0.1 mg/L IBA.Furthermore, shoots or plantlets of cinchonagrew and developed on the same mediacontaining 5 – 10 mg/L IAA combined with0.5 mg/L IBA. The results showed that shootmultiplication rate was higher in axillary than inapical nodes. The highest multiplication rate inaxillary nodes was 24.6 shootlets with 3 mg/LBA treatment, whereas in apical nodes it was17.2 shootlets with 5 mg/L BA treatment for eightweeks. The highest rooting frequency ofcinchona plantlet was 90%, achieved with 5 mg/LIAA in combination with 0.5 mg/L IBA. Theplantlets were successfully acclimatized andtransplanted to the fieldAbstrakSumber eksplan berupa nodus/tunas padakultur in vitro umum digunakan untuk multi-plikasi tunas. Penelitian ini bertujuan untukmembandingkan tingkat multiplikasi antara tunasapikal dengan tunas aksiler tanaman kina Ledgersecara in vitro. Bahan tanaman yang digunakanadalah kina Ledger (Cinchona ledgeriana Moens)yang berasal dari Pusat Penelitian Teh dan Kina,Gambung, Jawa Barat. Eksplan berupa nodus/tunas apikal dan aksiler asal biji yang dikecam-bahkan secara in vitro. Kultur tersebut diinku-basikan dalam ruang terang pada intensitascahaya 30 μmol foton/m 2 /detik dengan periodepenyinaran 14 jam pada suhu 260 C dankelembaban relatif + 60% selama 4 – 8 minggu.Parameter yang diamati adalah perbandinganmultiplikasi tunas dan pertumbuhan tunas yangmeliputi rata-rata tinggi tunas, jumlah daun danfrekuensi pengakaran. Nodus apikal maupunaksiler menghasilkan tunas dengan tingkatMurashige-Skoog (MS) standar yang me-ngandung sukrosa30 g/L dan ditambahkan BA1 – 5 mg/L dikombinasikan IBA 0,1 mg/L.Selanjutnya tunas/planlet kina tersebut berhasiltumbuhdan berkembang pada medium sama yangdiberi IAA 5 – 10 mg/L dikombinasikan denganIBA 0,5 mg/L. Hasil penelitian menunjukkanbahwa tingkat multiplikasi tunas aksiler lebihtinggi dari pada tunas apikal. Multiplikasi tunasaksiler menghasilkan jumlah tunas rata-ratatertinggi sebesar 24,6 tunas per eksplan padaperlakuan BA 3 mg/L sedangkan multiplikasitunas apikal tertinggi sebesar 17,2 tunas pereksplan pada perlakuan BA 5 mg/L pada umurdelapan minggu. Frekuensi pengakaran planletkina tertinggi mencapai 90% pada perlakuan IAA10 mg/L yang dikombinasikan dengan IBA 0,5mg/L. Planlet yang dihasilkan telah berhasildiaklimatisasi dan dipindahkan ke tempatpersemaian lapang.
Produksi dan kualitas jamur tiram (Pleurotus ostreatus) pada beberapa konsentrasi limbah sludge pabrik kertas Production and quality of oyster mushroom (Pleurotus ostreatus) on selected concentration of sludge of paper industry Happy WIDIASTUTI; . TRI-PANJI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 76, No 2: Desember 2008
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (184.788 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v76i2.86

Abstract

Summary An experiment has been conducted to study the effect of sludge concentration,  waste of paper industry using raw material of recycled paper, as media on oyster mushroom production and quality. Twelve treatment tested are combination of two oyster mushroom strains are oyster mushroom of Bogor (JTB) and oyster mushroom of Taiwan (JTT), three media composition (sawdust, sludge, and sawdust+ sludge (50/50, v/v), and two levels of supplement addition (with rice bran+gypsum+ lime and without) with 10 replications. The production of the  mushroom was conducted  in bag log capacity of 1 kg fresh weight (water content 50%). The result showed that sludge can be used as mixture of oyster mushroom production with the composition 50:50 v/v of sawdust and sludge. Since the higher number of contamination, addition of supplement reduce oyster mushroom production as well as biological efficiency, but increased protein content of fruiting body. The content of Cd, and Pb were below the permissible limits, Cu was higher than the limits but still in the range. The Fe content of mushroom fruit body was higher both in sawdust (147.92 – 149.56 ppm) and sawdust+sludge (295.82 – 335.12 ppm) as media. However, the uptake of Fe of JTT was less (49.08-59.64 ppm) compared to that of JTB (147.92-335.12 ppm).Ringkasan Penelitian dilakukan untuk mempelajari pengaruh konsentrasi sludge limbah pabrik kertas berbahan baku karton bekas sebagai medium terhadap produksi dan kualitas jamur tiram. Dua belas perlakuan yang diuji merupakan kombinasi dua galur jamur tiram, yaitu Jamur Tiram Bogor (JTB) dan Jamur Tiram Taiwan (JTT), tiga jenis komposisi medium (serbuk gergaji, sludge, dan sludge+ serbuk gergaji), dan dua tingkat suplemen (dengan dan tanpa) yang diulang 10 kali untuk masing-masing perlakuan. Produksi jamur tiram dilakukan menggunakan bag log  berkapasitas 1 kg basah (kadar air 50%). Hasil percobaan menunjukkan bahwa sludge dapat digunakan sebagai campuran serbuk gergaji dalam produksi jamur tiram dengan per-bandingan 50:50 (v/v). Pemberian suplemen menurunkan produksi jamur tiram demikian pula efisiensi biologi namun meningkatkan kadar protein tubuh buah. Di dalam tubuh buah JTB, kandungan logam Cd, dan Pb berada di bawah batas yang diijinkan, sedangkan kandungan Cu di atas ambang walaupun masih dalam kisaran. Kandungan  Fe dalam tubuh buah jamur relatif tinggi baik yang ditumbuhkan pada serbuk gergaji sebagai medium standar (147,92 - 149,56 ppm) maupun yang ditumbuhkan pada medium campuran sludge+serbuk gergaji (295,82 - 335,12 ppm). Serapan Fe tubuh buah JTT jauh lebih rendah (49,08- 59,64 ppm) dibandingkan dengan serapan Fe JTB (147,92-335,12 ppm).  
Morphological variations during the development of somatic embryos of tea (Camellia sinensis L.) in vitro Keragaman morfologi selama perkembangan embrio somatik teh (Camellia sinensis L.) in vitro . SUMARYONO; Imron RIYADI; J.S. TAHARDI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 69, No 2: Desember 2001
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (240 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v69i2.167

Abstract

SummarySomatic embryo culture of tea (Camelliasinensis L.) on an agar-solidified medium consistsof embryos of different sizes, colors anddevelopmental stages. One gram of mostly globularsomatic embryos were cultured on a solidproliferation medium of WP containing 57.1 µMIAA and 4.4 µM BAP to observe theirmorphological variations with respect to embryosize, color, and developmental stage over oneculture passage of 6 weeks. Fresh weight ofsomatic embryos increased slowly during the first4 weeks and then sharply thereafter. At the fourthweek, the number of embryos increasedconsiderably although their weight did not increase,indicating the formation of secondary embryos.The average size of tea somatic embryos did notchange significantly over the culture period,however, the embryo size was already highly variedat the start and increased as the embryo developed.About one half of the embryos were yellowish and the rest were divided equally between the greenishand reddish embryos. At the initial culture, 60% ofthe embryos were at the globular, 30% at heart and10% at torpedo stage. Generally, globular embryosdeveloped into later-stage embryos as the cultureprogressed, however, on this proliferation mediumalmost 80% of the embryos remained at the globularand heart-shaped stages even after the sixth week.If single globular somatic embryos with a particularcolor were cultured on a solid regeneration mediumof WP with 0.47 µM kinetin, 0.69 µM ABA and0.29 µM GA 3 , some of them especially theyellowish embryos underwent color change. Mostof these single globular embryos developedgradually into the later stages. While the initialcolors of embryos affected the rate ofdevelopmental stage changes, yellowish globularembryos tended to develop more rapidly intocotyledonary or germinant stages than the greenishand reddish embryos.RingkasanBiak embrio somatik tanaman teh (Camelliasinensis L.) pada medium padat terdiri dari embriodalam berbagai ukuran, warna dan stadiaperkembangan. Satu gram embrio somatik yangsebagian besar dalam stadia globuler telahdibiakkan pada medium padat proliferasi (mediumWP dengan IAA 57,1 µM dan BAP 4,4 µM) untukmengamati keragaman morfologi embrio dalam halukuran, warna dan stadia perkembangan dalamsatu periode kultur 6 minggu. Berat basah embriosomatik meningkat perlahan pada 4 minggupertama kemudian meningkat dengan tajam. Padaminggu keempat, jumlah embrio melonjakwalaupun beratnya tidak meningkat, hal inimenunjukkan adanya pembentukan embriosekunder. Ukuran rata-rata embrio somatik tidakberubah secara nyata selama periode kultur, tetapiukuran embrio sudah sangat beragam sejak awalkultur dan terus meningkat sejalan denganberkembangnya embrio. Sekitar setengah dariembrio berwarna kuning dan sisanya terdiri dariembrio berwarna hijau dan merah. Pada awalkultur, 60% embrio berada pada stadia globuler,30% stadia bentuk-hati dan 10% stadia bentuk-torpedo. Pada umumnya embrio globulerberkembang ke stadia lebih lanjut sejalan denganwaktu, tetapi pada medium proliferasi ini hampir80% embrio masih dalam stadia globuler danbentuk-hati pada minggu keenam. Apabila embriosomatik globuler tunggal dengan warna tertentudibiakkan pada medium padat regenerasi(WP dengan kinetin 0,47 µM, ABA 0,69 µM danGA 3 0,29 µM, sebagian embrio terutama embriokuning akan mengalami perubahan warna.Sebagian besar embrio globuler tunggal iniberkembang secara bertahap kestadia per-kembangan lebih lanjut. Warna awal embrioberpengaruh terhadap kecepatan perubahan stadiaperkembangan embrio, dengan embrio globulerawal warna kuning cenderung lebih cepatberkembang kestadia kotiledon dan kecambahdibandingkan dengan embrio hijau dan merah. 
Daya hidup planlet karet asal in vitro microcutting pada berbagai periode penutupan sungkup plastik dan komposisi media tumbuh Survival rate of in vitro microcutting-derived rubber plantlets on various plastic cover closed periods and medium compositions . SUMARYONO; Masna Maya SINTA; . NURHAIMI-HARIS
E-Journal Menara Perkebunan Vol 80, No 1: Juni 2012
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (319.119 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v80i1.46

Abstract

AbstractIn vitro culture through microcutting technology can be used for clonal propagation of rubber (Hevea brasiliensis Muell. Arg.) rootstocks. Acclimatization of in vitro plantlets to ex vitro conditions is a major bottleneck in the micropropagation of many plants.This research was conducted to study the effect of plastic cover closed period and media composition on the survival rate of rubber plantlets. Plantlets derived from microcutting were planted on plastic pots containing a mixture of soil, cocopeat, dung manure, and sand or zeolite. The plantlets were then placed inside a closed transparent plastic cover that opened after 2, 3, 4 and 6 weeks. The cover was placed under tree canopy. The second experiment used the same media composition with or without cocopeat and with sand or zeolite. At 1.5 month after culture, observation was done on the number of survived plantlets, plantlet height and the percentage of rooted plantlets. The results show that the best coverclosed period was six weeks and the best growing medium was a mixture of soil, cocopeat, dung manure, and zeolite (6:2:1:1v/v). On the two combined treatments, the survival rate was 73.3% after 1.5 month of acclimatization. The use of zeolite and a higher soil percentage gave positive influences on rubber plantlet survival rate. The second experiment results confirmed that the use of zeolite was better than sand and the use of cocopeat was definitely needed. It can be concluded that the best of acclimatization of rubber plantlets from microcutting was on a medium mixture of soil, cocopeat, dung manure, and zeolite (6:2:1:1) and placed inside a closed plastic cover for six weeks before the cover was opened gradually. AbstrakKultur in vitro melalui teknologi microcutting dapat digunakan untuk perbanyakan klonal batang bawah tanaman karet (Hevea brasiliensis Muell. Arg.). Aklimatisasi planlet in vitro ke kondisi ex vitro merupakan hambatan utama pada mikropropagasi berbagai jenis tanaman. Penelitian ini dilakukan untuk mempelajari pengaruh lama penutupan sungkup plastik dan komposisi media tumbuh terhadap daya hidup planlet karet. Planlet karet asal microcutting ditanam pada pot plastik berisi media dengan berbagai campuran tanah, cocopeat, pupuk kandang, dan pasir atau zeolit. Planlet selanjutnya diletakkan di dalam sungkup plastik transparan tertutup rapat yang dibuka setelah 2, 3, 4 dan 6 minggu. Sungkup plastik diletakkan di bawah tajuk pepohonan. Percobaan kedua menggunakan komposisi media serupa dengan atau tanpa cocopeat dan dengan pasir atau zeolit. Pada umur 1,5 bulan, pengamatan dilakukan terhadap jumlah planlet yang hidup, tinggi planlet, dan persentase planlet yang berakar. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lama penyungkupan terbaik adalah enam minggu dan media tumbuh terbaik adalah campuran tanah, cocopeat, pupuk kandang, dan zeolit (6:2:1:1 v/v). Pada kombinasi kedua perlakuan tersebut, daya hidup planlet karet mencapai 73,3% setelah 1,5 bulan aklimatisasi. Penggunaan zeolit dan persentase tanah yang lebih tinggi berpengaruh positif terhadap daya hidup planlet karet. Hasil percobaan kedua menegaskan bahwa penggunaan zeolit lebih baik daripada pasir dan penggunaan cocopeat mutlak diperlukan. Dapat disimpulkan bahwa aklimatisasi planlet karet asal microcutting terbaik dilakukan pada media campuran tanah, cocopeat, pupuk kandang, zeolit (6:2:1:1) dan diletakkan di dalam sungkup plastik tertutup selama enam minggu sebelum sungkup dibuka secara bertahap.
Produksi imunoglobulin Y (IgY) untuk pengembangan metode deteksi dini kontaminasi okratoksin (Immunoglobulin Y (IgY) production to develop an early detection method for ochratoxin contamination) Irma KRESNAWATY; . SUHARYANTO; . SISWANTO; Sumi HUDIYONO
E-Journal Menara Perkebunan Vol 86, No 1 (2018): April, 2018
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v1i1.279

Abstract

Indonesian coffee and cocoa commodities are constrained by low product quality problem due to contamination of fungal metabolites which  producing ochratoxin A (OTA). Ochratoxin is neprotoxic, immunogenic, carcinogenic and teratogenic to the human health. Early detection method on site detection should be developed  because of  those negative effects. The aim of this study  was to produce antibody to develop a method for  OTA detection. Antibody was produced by immunization of egg laying hen. Antibody-produced was sepatared and analyzed using ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) and DBIA (dot blot immunoassay),and tested its composition using HPLC and SDS PAGE. The results showed that anti-OTA polyclonal antibodies had been obtained already from chicken eggs in the 4th period (7 weeks after initial immunization). These antibodies showed anti-OTA reactivity by DBIA method and still showed anti-OTA reactivity up to 9th period (12 weeks after initial immunization). The anti-BSA antibodies produced should be removed to increase the sensitivity of antibodies againts ochratoxin A. The separation of BSA antibodies can be conducted by the absorption of the protein.  [Keywords: ochratoxin A; early detection; antibody IgY]. AbstrakKomoditas kopi dan kakao Indonesia terkendala masalah mutu produk yang rendah akibat kontaminasi cendawan penghasil okratoksin A. Okratoksin A (OTA) bersifat neprotoksik, imunogenik, karsinogenik dan teratogenik yang membahayakan kesehatan manusia. Karena efek negatif yang diakibatkan oleh mikotoksin ini, maka perlu dikembangkan deteksi dini kontaminasi okratoksin langsung di lokasi. Penelitian ini bertujuan menghasilkan antibodi imunoglobulin Y (IgY) untuk mengembangkan metode perakitan perangkat deteksi cepat berbasis imunologi untuk deteksi OTA. Antibodi dihasilkan menggunakan uji ayam petelur. Antibodi yang dihasilkan dipisahkan dan dianalisis aktivitasnya dengan ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) dan DBIA (dot blot immunoassay), serta diuji komposisinya dengan HPLC dan SDS PAGE. Hasil penelitian menunjukkan bahwa antibodi poliklonal anti-OTA sudah diperoleh dari telur ayam pada periode ke-4 (7 minggu setelah imunisasi awal). Antibodi ini menunjukkan reaktivitas anti-OTA dengan metode DBIA dan masih menunjukkan reaktivitas anti-OTA sampai periode 9 (12 minggu setelah imunisasi awal). Komposisi asam amino antibodi anti-OTA menunjukkan perbedaan dengan komposisi asam amino IgY di database. Antibodi anti BSA yang dihasilkan harus dihilangkan terlebih dahulu untuk meningkatkan sensitivitas antibodi terhadap okratoksin A dan pemisahan dapat dilakukan dengan penyerapan antibodi BSA.[Kata Kunci:  okratoksin A;  deteksi dini; antibodi IgY].
Isolation and characterization of protein differentially expressed during oil palm mesocarp development Isolasi dan karakteristik protein terekpresi secara diferensial selama perkembangan mesokarp pada kelapa sawit A BUDIANI; D SANTOSO; H ASWINDINNOOR; A SUWANTO; S SUDIATSO
E-Journal Menara Perkebunan Vol 70, No 1: Juni 2002
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (273.136 KB) | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v70i1.130

Abstract

RingkasanPada kelapa sawit, mesokarp merupakan jaringan yang lebih dikhususkan untuk mensintesis minyak. Akumulasi minyak pada jaringan ini terjadi selama perkembangan buah. Beberapa enzim yang terlibat dalam biosintesis minyak tampaknya disintesis hanya pada periode tertentu dari biosintesis minyak. Sedangkan protein regulator diduga ada pada saat minyak mulai disintesis atau beberapa saat sebelumnya. Sebagai bagian dari usaha mengklon gen kunci untuk biosintesis minyak, penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan mengisolasi protein yang terekspresi secara diferensial sesuai perkembangan buah. Sebagai bahan penelitian digunakan jaringan mesokarp dari berbagai umur buah sawit. Untuk setiap fase perkembangan buah dilakukan analisis kandungan minyak dan protein total. Elektroforesis gel poliakrilamid-SDS (SDS – PAGE) dan elektroforesis dua dimensi (2-D) digunakan untuk mempelajari dan mendeteksi adanya pita protein spesifik yang terekspresi secara diferensial sejalan dengan peningkatan kandungan minyaknya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa minyak mulai aktif disintesis pada saat buah berumur 17 minggu setelah antesis. Konsentrasi protein total tidak meningkat sejalan dengan peningkatan kandungan minyaknya. Dari hasil SDS-PAGE terdeteksi dua protein, yaitu protein dengan berat molekul (BM) 31,0 kDa dan 34,3 kDa yang meningkat ekspresinya pada awal dan menjelang periode aktif sintesis minyak. Analisis lebih lanjut dengan elektroforesis 2-D menunjukkan bahwa protein 31,0 kDa terdiri dari dua protein dengan pI 4,64 dan pI 4,95, sedangkan protein 34,3 kDa merupakan protein tunggal dengan pI 4,56. Sikuensing secara parsial kedua protein tersebut menunjukkan adanya dua polipeptida dari protein 31,0 kDa yang mempunyai homologi tinggi dengan subunit biotin karboksilase ht-ACCase, dan empat polipeptida yang mempunyai homologi dengan enoilACP reduktase. Sedangkan protein 34,3 kDa mempunyai homologi dengan gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase. SummaryIn oil palm, mesocarp is tissue specialized for oil synthesis. Accumulation of oil in this tissue occurs during fruit development. It is likely that some enzymes involved in oil biosynthesis are synthesized only in a certain period of oil biosynthesis, while regulatory proteins may present at the beginning or right before the period of active oil synthesis. As a part of research work on cloning of gene encoding key enzymes for oil biosynthesis in palm mesocarp, this research was aimed to identify and isolate proteins differentially expressed during fruit development. Mesocarps from different developmental stage of fruit were used for analysis of oil content and protein concentra-tion. Sodium Dodecyl Sulphate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE) and two dimentional (2-D) electrophoresis were used to study and detect specific protein bands differentially expressed during fruit development. It was shown that oil synthesis was started at 17 weeks after anthesis (WAA). There was no correlation between concentrations of total protein with oil content during mesocarp development. From the SDS-PAGE, two protein of 31.0 kDa and 34.3 kDa were detected that their expression increased at the beginning and just before the period of active oil biosynthesis respectively. Further analysis with 2-D electrophoresis showed that 31.0 kDa-protein consist of two proteins, with pI 4,64 and pI 4,95, while 34.3 kDa protein is a single protein with pI 4,56. Partial amino acid sequencing data of the 31.0 kD protein showed that two polypeptides highly homologous with ht-ACCase biotin carboxylase subunit and four polypeptides homologuus with enoyl-ACP reductase, whereas 34.3 kD protein showed homology with glyceraldehyde-3 phosphate dehydrogenase.

Page 11 of 55 | Total Record : 541


Filter by Year

2000 2025


Filter By Issues
All Issue Vol. 93 No. 1 (2025): 93(1), 2025 Vol. 92 No. 2 (2024): 92(2), 2024 Vol. 92 No. 1 (2024): 92(1), 2024 Vol. 91 No. 2 (2023): 91 (2), 2023 Vol. 91 No. 1 (2023): 91 (1), 2023 Vol. 90 No. 2 (2022): 90 (2), 2022 Vol. 90 No. 1 (2022): 90 (1), 2022 Vol. 90 No. 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 1 (2022): April, 2022 Vol. 89 No. 2 (2021): 89 (2), 2021 Vol. 89 No. 1 (2021): 89 (1), 2021 Vol 89, No 2 (2021): Oktober, 2021 Vol 89, No 1 (2021): April, 2021 Vol. 88 No. 2 (2020): 88 (2), 2020 Vol. 88 No. 1 (2020): 88 (1), 2020 Vol 88, No 2 (2020): Oktober,2020 Vol 88, No 1 (2020): April, 2020 Vol. 87 No. 2 (2019): 87 (2), 2019 Vol. 87 No. 1 (2019): 87 (1), 2019 Vol 87, No 2 (2019): OKTOBER, 2019 Vol 87, No 1 (2019): April, 2019 Vol. 86 No. 2 (2018): 86 (2), 2018 Vol. 86 No. 1 (2018): 86 (1), 2018 Vol 86, No 2 (2018): Oktober 2018 Vol 86, No 1 (2018): April, 2018 Vol. 85 No. 2 (2017): 85 (2), 2017 Vol. 85 No. 1 (2017): 85 (1), 2017 Vol 85, No 2 (2017): Oktober 2017 Vol 85, No 1 (2017): April, 2017 Vol. 84 No. 2 (2016): 84 (2), 2016 Vol. 84 No. 1 (2016): 84 (1), 2016 Vol 84, No 2 (2016): Desember 2016 Vol 84, No 1: Oktober 2016 Vol. 83 No. 2: 83 (2), 2015 Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015 Vol 83, No 2: Desember 2015 Vol 83, No 1: Juni 2015 Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014 Vol. 82 No. 1: 82 (1), 2014 Vol 82, No 2: Desember 2014 Vol 82, No 1: Juni 2014 Vol. 81 No. 2: 81 (2), 2013 Vol. 81 No. 1: 81 (1), 2013 Vol 81, No 2: Desember 2013 Vol 81, No 1: Juni 2013 Vol. 80 No. 2: 80 (2), 2012 Vol. 80 No. 1: 80 (1), 2012 Vol 80, No 2: Desember 2012 Vol 80, No 1: Juni 2012 Vol. 79 No. 2: 79 (2), 2011 Vol. 79 No. 1: 79 (1), 2011 Vol 79, No 2: Desember 2011 Vol 79, No 1: Juni 2011 Vol. 78 No. 2: 78 (2), 2010 Vol. 78 No. 1: 78 (1), 2010 Vol 78, No 2: Desember 2010 Vol 78, No 1: Juni 2010 Vol. 77 No. 2: 77 (2), 2009 Vol. 77 No. 1: 77 (1), 2009 Vol 77, No 2: Desember 2009 Vol 77, No 1: Juni 2009 Vol. 76 No. 2: 76 (2), 2008 Vol. 76 No. 1: 76 (1), 2008 Vol 76, No 2: Desember 2008 Vol 76, No 1: Juni 2008 Vol. 75 No. 2: 75 (2), 2007 Vol. 75 No. 1: 75 (1), 2007 Vol 75, No 2: Desember 2007 Vol 75, No 1: Juni 2007 Vol. 74 No. 2: 74 (2), 2006 Vol. 74 No. 1: 74 (1), 2006 Vol 74, No 2: Desember 2006 Vol 74, No 1: Juni 2006 Vol. 73 No. 2: 73 (2), 2005 Vol. 73 No. 1: 73 (1), 2005 Vol 73, No 2: Desember 2005 Vol 73, No 1: Juni 2005 Vol. 72 No. 2: 72 (2), 2004 Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004 Vol 72, No 2: Desember 2004 Vol 72, No 1: Juni 2004 Vol. 71 No. 2: 71 (2), 2003 Vol. 71 No. 1: 71 (1), 2003 Vol 71, No 2: Desember 2003 Vol 71, No 1: Juni 2003 Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002 Vol. 70 No. 1: 70 (1), 2002 Vol 70, No 2: Desember 2002 Vol 70, No 1: Juni 2002 Vol. 69 No. 2: 69 (2), 2001 Vol. 69 No. 1: 69 (1), 2001 Vol 69, No 2: Desember 2001 Vol 69, No 1: Juni 2001 Vol. 68 No. 2: 68 (2), 2000 Vol. 68 No. 1: 68(1), 2000 Vol 68, No 2: Desember 2000 Vol 68, No 1: Juni 2000 More Issue