Garuda - Garba Rujukan Digital

Article Per Year (5 Year)

All

Menara Perkebunan

mpjurnal
Website

Published by Pusat Penelitian Kelapa Sawit

ISSN : 01259318 EISSN : 18583768 DOI : -

Core Subject : Agriculture,

Agriculture, Biological Sciences & Forestry

Menara Perkebunan as a communication medium for research in estate crops published articles covering original research result on the pre- and post-harvest biotechnology of estate crops. The contents of the articles should be directed for solving the problems of production and/or processing of estate crops of smallholder, private plantations and state-owned estates, based on the three dedications of plantation. Analyses of innovative research methods and techniques in biotechnology, which are important for advancing agricultural research. Critical scientific reviews of research result in agricultural and estate biotechnology.

Arjuna Subject : -

Articles 541 Documents

12 13 14 15 16

Keragaman morfologi selama perkembangan embrio somatik sagu (Metroxylon sagu Rottb.) Morphological variations during the development of somatic embryos of sago (Metroxylon sagu Rottb.) Pauline Destinugrainy KASI; . SUMARYONO
E-Journal Menara Perkebunan Vol 74, No 1: Juni 2006
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Summary In vitro culture of sago (Metroxylon sagu Rottb.) on an agar-solidified medium consists of somatic embryos of different sizes, colors, and developmental stages. One gram of mostly globular somatic embryos were cultured on a solid medium to observe their morphological variations with respect to embryo size, color, and developmental stage over one passage of six weeks culture. The medium was a modified-MS medium with half-strength of macronutrients containing 0.01 mg/L ABA and 2 mg/L kinetin. At the end of culture passage, fresh weight of embryo increased by 2.3 folds. The embryo numbers increased by more than two times indicating the formation of secondary embryos. The average size of sago somatic embryos did not change significantly over the culture period; however, the embryo size was already highly varied at the start and increased gradually as the embryo developed. At the initial of culture, 33.7 % of the embryos were yellowish, 64.1 % were greenish, and 2.2% were reddish. By the end of the culture the composition of yellowish embryos increased to 51.2 %, greenish embryo decreased to 42.5 % and red embryos increased to 6.3 %. At the initial culture, 61 % of the embryos were at the globular, 9 % at heart-shape and 30 % at torpedo stage. Generally globular embryos developed into later-stage embryos as the culture progressed, although almost 56% of the embryos remained at the globular stage after the sixth week.Ringkasan Kultur in vitro sagu (Metroxylon sagu Rottb.) pada medium padat terdiri dari embrio somatik dalam berbagai ukuran, warna, dan fase perkembangan. Satu gram embrio somatik yang sebagian besar dalam fase globuler dikulturkan pada medium padat untuk mengamati keragaman morfologi embrio dalam hal ukuran, warna dan fase perkembangan dalam satu periode kultur enam minggu. Medium kultur adalah MS modifikasi dengan setengah hara makro serta penambahan zat pengatur tumbuh ABA 0,01 mg/L dan kinetin 2 mg/L. Pada akhir masa kultur bobot embrio segar meningkat 2,3 kali dibandingkan awal masa kultur. Jumlah embrio juga mengalami peningkatan sebesar lebih dari dua kali yang menunjukkan adanya pembentukan embrio somatik sekunder. Ukuran rata-rata embrio tidak berubah secara signifikan selama masa kultur akan tetapi ukuran embrio telah sangat beragam pada awal kultur dan terus meningkat hingga akhir kultur. Warna embrio mengalami perubahan selama periode kultur. Pada awal kultur dijumpai 33,7 % embrio berwarna kuning, 64,1 % embrio hijau, dan 2,2 % embrio merah. Pada akhir kultur presentase embrio kuning meningkat menjadi 51,2 %, embrio hijau menjadi 42,5 %, dan embrio merah 6,3 %. Pada awal kultur, dijumpai 61 % embrio pada fase globuler, 9 % fase bentuk-hati dan 30 % fase torpedo. Umumnya embrio globuler berkembang menjadi embrio fase lanjut selama kultur berlangsung, namun 56 % embrio masih tetap dalam fase globuler pada minggu keenam.

Pengaruh bahan pra-sterilan, tutup tabung kultur, dan musim terhadap tingkat kontaminasi eksplan pada kultur microcutting karet Effect of pre-sterilization agent, culture tube closure, and season on the contamination level of rubber microcutting culture . NURHAIMI-HARIS; . SUMARYONO; M.P. CARRON CARRON
E-Journal Menara Perkebunan Vol 77, No 2: Desember 2009
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractMicrobial contamination is a major obstaclein clonal propagation of hevea (Heveabrasiliensis) through microcutting technology;therefore the ability to reduce contamination willdetermine the success of the application of thistechnology. The aim of experiments was toincrease healthy and survived plantlets by testingpre-sterilization agents for cleaning explantsduring pre-sterilization step, culture tubeclosures suitable for explants growth and anappropriate time for introducing explants at theprimary culture phase. The pre-sterilizationagents tested were aganol, alcohol anddesogerme, the culture tube closures used wereparafilm and cotton, and the time for culturingexplants were determined by using rubbergenotypes introduced during the year of 2006 and2007. The results show that desogermedecreased significantly the level of explantcontamination compared to aganol and alcohol,meanwhile the type of culture tube closure didnot affect the level of explant contamination. Thetype of culture tube closure influencedsignificantly the survival of explants where thenumber of survived explants in culture tubescovered with cotton was higher than that of withparafilm. Season also affected the contaminationfrequency of the explants. Higher number ofhealthy plantlets were obtained whenintroduction of the explants were conducted fromJune to October considered as dry season inBogor compared to introduction of the explantsduring rainy season from January to May.Different genotypes of rubber introduced at theprimary culture phase did not affect thepercentage of explant contamination.AbstrakKontaminasi oleh mikroba merupakanmasalah utama pada perbanyakan klonal tanamankaret (Hevea brasiliensis) melalui teknologimicrocutting sehingga kemampuan mengurangikontaminasi menentukan keberhasilan aplikasiteknologi tersebut. Penelitian ini bertujuanmempelajari pengaruh jenis bahan pra-sterilanyang efektif untuk pencucian eksplan tahap pra-sterilisasi, mempelajari pengaruh tutup tabungterhadap perkembangan eksplan serta meng-identifikasi waktu yang tepat untuk melaksanakanintroduksi eksplan pada tahap kultur primer(kultur awal) sehingga jumlah eksplan sehat dantumbuh dapat ditingkatkan. Bahan pra- sterilanyang diuji adalah aganol, alkohol dan desogerme,tutup tabung yang digunakan adalah parafilm dankapas, sedangkan identifikasi waktu kulturdilakukan melalui introduksi eksplan sepanjang tahun 2006 dan 2007 terhadap berbagai genotipetanaman karet yang tersedia. Hasil penelitianmenunjukkan bahwa desogerme menurunkansecara nyata tingkat kontaminasi eksplandibandingkan dengan aganol dan alkohol,sedangkan jenis tutup tabung tidak berpengaruhterhadap persentase kontaminasi. Jenis tutuptabung berpengaruh sangat nyata terhadappersentase eksplan yang hidup dan membentuktunas, di mana persentase eksplan membentuktunas pada tabung dengan tutup kapas lebih tinggidibandingkan dengan tutup parafilm. Musim jugasangat mempengaruhi tingkat kontaminasieksplan. Eksplan sehat jauh lebih banyakdiperoleh apabila penanaman eksplan dilakukanpada bulan Juni sampai Oktober, yang merupakanmusim kemarau di Bogor dibandingkan denganintroduksi eksplan pada bulan Januari sampaiMei, yang merupakan musim hujan. Jenisgenotipe yang ditanam pada tahap kultur primertidak berpengaruh terhadap persentasekontaminasi.

Kloning gen LEAFY kakao dari jaringan bantalan bunga aktif Cloning of cacao LEAFY gene from the active flower cushions Tetty CHAIDAMSARI; Rita HAYATI; Auzar SYARIEF; Aswaldi ANWAR; Djoko SANTOSO
E-Journal Menara Perkebunan Vol 77, No 2: Desember 2009
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

SummaryAttempts to improve productivity of cacaoplantations lead us to study the molecularmechanism of flowering. In the model speciesArabidopsis thaliana as well as some otherspecies, LEAFY is a central regulatory gene forthe transition of shoot apical meristems toflowering meristems. Different from that ofArabidopsis, cacao inflorescence is acauliflorous type, by which flowers can developrepeatedly from the same flower cushion on thetrunk. In this research, a LEAFY homolog wasisolated from active flower cushion with RT-PCRusing a pair of DNA primer specifically designedto isolate its complete cds. Gel electrophoresisexamination indicated the presence of a 1.2 kbamplicon. Purified from the gel, this DNAfragment was cloned into competent cells ofE. coli XL1 Blue using pGEM-T Easy cloningvector at an orientation according to the T7promoter of the plasmid. Sequence analysis usingBLASTX, showed that the amplicon was LEAFY(LFY) homolog. Alignment analysis using ClustalW indicated that the cTcLFY highly homologousto those from other perennial crops such ascitrus, grape, apple and poplar. The highesthomology (conserved region) was found in the Cterminal of the encoded proteins.RingkasanUsaha untuk meningkatkan produktivitasperkebunan kakao telah mendorong penelitianmolekuler tentang mekanisme pembungaankakao. Pada tanaman model Arabidopsis thalianadan lainnya, LEAFY merupakan gen kunci dalamtransisi meristem tunas jadi meristem bunga.Berbeda dengan sistem pada Arabidopsis,pembungaan kakao termasuk tipe cauliflorous,bunga dapat muncul dari bantalan bunga yangsama sepanjang tahun. Dalam penelitian inihomolog LFY diisolasi dari bantalan bunga aktifmenggunakan RT-PCR dengan sepasang primerspesifik yang dirancang berdasarkan sekuenDNA di kedua ujung gen tersebut. Pemeriksaangel elektroforesis menunjukkan adanya amplikontunggal berukuran 1,2 kb. Setelah dimurnikandari gel, amplikon dapat diklon ke dalam selkompeten E. coli galur XL1 Blue menggunakanvektor pGEM-T Easy dengan orientasi yangsesuai dengan promoter T7 dari vektor. AnalisisBLASTX sekuen DNA membuktikan bahwaamplikon tersebut adalah homolog dari genLEAFY. Analisis penjajaran dengan mengguna-kan ClustalW menunjukkan bahwa gen cTcLFYtersebut memiliki homologi yang tinggi dengangen sejenis dari tanaman keras lainnya sepertitanaman jeruk, anggur, apel dan poplar.Homologi tertinggi (daerah terkonservasi)terdapat pada ujung (terminal) C dari proteinyang disandinya.

Optimasi sterilisasi permukaan eksplan stek mikro tanaman karet Optimization of surface sterilization on rubber microcutting explan Irfan MARTIANSYAH; Deden Dewantara ERIS; . NURHAIMI-HARIS; Darmono TANIWIRYONO
E-Journal Menara Perkebunan Vol 81, No 1: Juni 2013
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractAn increasing number of explants is necessary toobtain plantlets in large quantities, for mass propagationof rubber plants. However, high level of contamination atthe primary culture stage is still a major constraint in invitro microcutting of rubber. The aim of this study was tooptimize surface sterilization procedures to reduce micro-bial contamination at the primary culture. Sterilizationexperiment was conducted in two step., The first step wasto determine the effect of washing the explants withrunning water prior to sterilization and then using Deso-germe, ethanol or H 2 O 2 , while the second step was toidentify the suitable sterilization process on reducing thelevel of contamination. The results showed that the surfacesterilization with only one type of sterilization agent couldnot reduce contamination level caused either by bacteriaor fungi, while sterilization with three types of sterilizingagents increased the number of dead explants. The besttreatment for surface sterilization was the directsterilization of explants using 70% ethanol for one minuteand 17.6% H 2 O 2 for 20 minutes without washing with tapwater (A-CD treatment). The percentage of viable andaseptic explantsof this treatment was 76.7%, which wassignificantly higher than those of other treatments. Thistreatment reduced contamination level to 21.7%.AbstrakPeningkatan jumlah eksplan sangat diperlukan untukmemperoleh planlet dalam jumlah besar pada perbanyakanmassal tanaman karet secara in vitro. Namun, tingginyatingkat kontaminasi pada tahap kultur primer masih me-rupakan kendala utama dalam kultur stek mikro tanamankaret. Tujuan penelitian adalah mengoptimasi prosedursterilisasi permukaan eksplan untuk mengurangi jumlaheksplan yang terkontaminasi mikroba pada tahap kulturprimer. Percobaan sterilisasi dilaksanakan dalam duatahap, tahap pertama untuk mengetahui pengaruh pen-cucian eksplan dengan air mengalir pada awal sterilisasiserta penggunaan Desogerme, etanol dan H 2 O 2 , sedang-kan tahap kedua untuk mendapatkan proses sterilisasi yangpaling sesuai dalam menurunkan tingkat kontaminasi.Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan sterilisasipermukaan yang menggunakan satu jenis bahan sterilantidak dapat mengurangi kontaminasi, baik oleh bakterimaupun cendawan. Perlakuan sterilisasi eksplan dengantiga jenis bahan sterilan meningkatkan kematian eksplan.Perlakuan sterilisasi permukaan terbaik adalah sterilisasilangsung eksplan menggunakan etanol 70% selama satu menit dan H 2 O 2 17,6% selama 20 menit, tanpa pencuciandengan air mengalir (perlakuan A-CD). Persentase eksplansteril yang hidup sebesar 76,7%, berbeda nyata dibanding-kan dengan perlakuan lainnya. Perlakuan tersebut dapatmengurangi kontaminasi menjadi sebesar 21,7%.

Peningkatan vigor kelapa sawit melalui pengayaan kecambah dengan Trichoderma asperellum, Cendawan Mikoriza Arbuskular dan Enterobacter sacchari Increasing of oil palm seedling vigor through seed enrichment with Trichoderma asperellum, Arbuscular Mycorrhizal Fungi, and Enterobacter sacchari) Esty Puri UTAMI; Eny WIDAJATI; Endah Retno PALUPI; Nurita TORUAN-MATHIUS
E-Journal Menara Perkebunan Vol 86, No 2 (2018): Oktober 2018
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Oil palm is a leading commodity of the plantation sector in Indonesia. Improving the quality of oil palm still be carried out to increase production. Seed technology can be used as an effort to improve the quality of oil palm seeds. The aim of this experiment was to determine the effect of seed enrichment with consortium of three microbes to increase vigor of oil palm seedling in pre nursery stage. The experiment design of this reseach was using completely randomize block design consisted of two factors. The first was seed coating consist of two factors, ie: coated seed and uncoated seed. Second was seed enrichment consist of eight factors, ie: control, enrichment with E. sacchari, abruscular mycorrhizal fungi (AMF), T. asperellum, E. sacchari+ AMF, E. sacchari+ T. asperellum, AMF + T. asperellum, E. sacchari+ AMF + T. asperellum. The result showed that enrichment with consortium of three microbes could increase vigor of oil palm seedling based on seedling germination, rate of germination, palm height, and numbers of survival seedling.[Keywords:biological agent, compatibility, diazotroph] Abstrak *) Penulis korespondensi: eny.widajati61@gmail.com Kelapa sawit adalah komoditas unggulan sektor perkebunan di Indonesia. Peningkatan mutu kelapa sawit terus dilakukan agar mening-katkan produksinya. Teknologi benih dapat digu-nakan sebagai salah satu upaya peningkatan mutu benih kelapa sawit. Penelitian ini bertujuan untuk menetapkan pengaruh pengayaan konsorsium tiga mikroba, E. sacchari,T. asperellumdan cendawan mikoriza arbuskular (CMA) dan pelapisan kecambah terhadap peningkatan vigor bibit kelapa sawit di pre nursery. Percobaan dirancang dengan rancangan acak kelompok dengan dua faktor, yaitu pelapisan dan pengayaan. Pelapisan terdiri dari dua taraf, yaitu dengan pelapisan dan tanpa pelapisan. Pengayaan terdiri dari 8 taraf, yaitu kontrol, pengayaan dengan E. sacchari, CMA, T. asperellum, E. sacchari+ CMA, E. sacchari + T. asperellum,CMA + T.asperellum,E. sacchari+ CMA + T. asperellum. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pengayaan dengan konsor-sium tiga mikroba dapat meningkatkan vigor bibit kelapa sawit berdasarkan parameter daya tumbuh, kecepatan tumbuh, tinggi bibit, dan jumlah bibit yang hidup. [Kata kunci: agen hayati, diazotrop, kompa-tibilitas]

Continuously increasing of unsaturation level of crude palm oil using fermentation broth of Absidia corymbifera Peningkatan ketidakjenuhan minyak sawit kasar secara kontinyu menggunakan cairan fermentasi Absidia corymbifera . TRI-PANJI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 68, No 1: Juni 2000
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Ringkasan Absidia corymbifera merupakan fungi penghasil asam lemak takjenuh majemuk yaitu asam linoleat dan asam y-linolenat. Produksi asam lemak jenis ini berkaitan dengan aktivitas enzim desaturase yang terdapat balk di dalam sel maupun di dalam cairan fermentasi (di luar sel). Enzim ini berpotensi untuk dimanfaatkan dalam biokonversi enzimatik guna meningkatkan ketidakjenuhan minyak sawit kasar (CPO). Penelitian ini bertujuan meningkatkan ketidakjenuhan minyak sawit kasar melalui biokonversi enzimatis secara kontinyu menggunakan cairan fermentasi Absidia corymbifera Pertama, fungi ini dikulturkan dalam media cair mengandung CPO dengan suplemen garam tertentu menggunakan bioreaktor film permukaan. Setelah inkubasi, biomassa fungi disaring dan sisa CPO dipisahkan. Cairan fermentasi diisikan ke dalam kolom gelas dan CPO dipompakan dari bagian bawah kolom menggunakan pompa peristaltik Analisis komposisi asam lemak dilakukan terhadap CPO sebelum dan setelah biokonversi serta terhadap lipid biomassa. Karakterisasi lipid dilakukan terhadap CPO sebelum dan setelah biokonversi, meliputi angka asam, angka iod, dan angka penyabunan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa cairan fermentasi A. corymbifera mampu meningkatkan ketidakjenuhan CPO dan kandungan asam lemak talfenuh majemuk Peningkatan ketidakjenuhan berkurang selama proses biokonversi kontinyu yang diduga disebabkan menurunnya aktivitas enzim desaturase. Angka asam dan angka penyabunan tidak meningkat secara nyata yang menunjukkan bahwa pada proses tersebut tidak terjadi pemecahan gliserida dari CPO.Summary Absidia corymbifera is a fungus producing polyunsaturated fatty acids (PUFA), namely linoleic and y-linolenic acids. Production of these kind of fatty acids is related to the acitivity of desaturase enzyme existing both inside and outside cell (in fermentation broth). This enzyme is potential to be used in enzymatic bioconversion for increasing unsaturation level of crude palm oil (CPO). The objective of this research was to increase unsaturation level of CPO through continuous enzymatic bioconversion using fermentation broth of A. corymbifera. This fungus was firstly cultured on a media containing CPO supplemented with certain salts using surface film bioreactor. After incubation, fungal biomass was filtered and residual CPO was then separated. Fermentation broth was filled to a glass column and CPO was pumped from the bottom side of the column using a peristaltic pump. Analysis of fatty acid composition was carried out on CPO before and after bioconversion as well as to lipid biomass. Lipid characterization was carried out for CPO before and after bioconversion, including acid, iodine and saponification numbers. The results showed that fermentation broth of A. corymbifera was capable of increasing unsaturation level CPO and the content of polyunsaturated fatty acids. Desaturation process decreased during bioconversion which was possibly caused by the decrease of activity of desaturase enzyme. Acid and saponification numbers did not increase significantly, indicated that hydrolysis glyceride of CPO did not occur.

Peranan rizobakteri dan fungi mikoriza arbuskular dalam proses fotosintesis dan produksi gula sorgum manis (Sorghum bicolor L. Moench) Role of rhizobacteria and arbuscular mycorrhizal fungi in increasing photosynthesis process and sugar production of sweet sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) Bedah RUPAEDAH; Iswandi ANAS; Dwi Andreas SANTOSA; Wahono SUMARYONO; Sri Wilarso BUDI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 83, No 1: Juni 2015
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractDual inoculation effects of rhizobacteria andAMF as well as the addition of chemical fertilizerson photosynthesis were studied by analyzingprocess of CO2 gas exchange, chlorophyll content,nutrient uptake, sugar content and growth of sweetsorghum. AMF inoculation as a single cultureincreased carbon assimilation, stomatal conductance,intercellular CO2 concentration, phosphoruscontent, chlorophyll content, sugar content, plantheight, shoot weight and mycorrhizal colonization.Interaction of AMF and rhizobacteria increasedsugar content of sweet sorghum stems andpotassium content of sweet sorghum leaves,whereas its interaction with chemical fertilizerssignificantly increased chlorophyll content, sugarcontent and mycorrhizal colonization of sorghumplant roots. Interaction of AMF, rhizobacteria andchemical fertilizers increased sugar content, rootweight and mycorrhizal colonization. The use ofAMF solely or its interaction with rhizobacteriaand chemical fertilizers had a great potential inimproving photosynthesis process of sweetsorghum. The process is associated with increasingcrop productivity, such as sugar content ofsorghum which is potential as a source ofrenewable energy.AbstrakPengaruh inokulasi ganda rizobakteri danFMA dengan penambahan pupuk kimia dipelajaridengan cara menganalisis proses pertukaran gas CO2, kandungan klorofil, kandungan hara dan gula,pertumbuhan dan produktivitas sorgum manis.Inokulasi FMA sebagai kultur tunggal dapatmeningkatkan asimilasi karbon, konduktansistomata, konsentrasi CO2 interselular, kandunganfosfor, kandungan klorofil, kandungan gula, tinggitanaman, berat batang dan derajat kolonisasimikoriza. Interaksi antara rizobakteri dan FMAdapat meningkatkan kandungan gula batang dankalium daun sorgum manis, sedangkan interaksinyadengan pupuk kimia dapat meningkatkan kandunganklorofil dan gula serta derajat kolonisasimikoriza pada perakaran sorgum manis. Sementaraitu, interaksi FMA, rizobakteri dan pupuk kimiadapat meningkatkan kandungan gula batang, beratakar dan derajat kolonisasi mikoriza pada perakaransorgum manis. Penggunaan FMA baik sendirimaupun interaksinya dengan rizobakteri dan pupukkimia memiliki potensi besar dalam meningkatkanproses fotosintesis sorgum manis. Proses tersebutberkaitan dengan peningkatan produktivitas sorgummanis dalam hal ini kandungan gula sorgum manisyang berpotensi sebagai sumber energi terbarukan.

Pengaruh pemberian inokulan Burkholderia cenocepacia dan bahan organik terhadap sifat fisik tanah berpasir Effect of the inoculation of Burkholderia cenocepacia and organic materials on physical properties of a sandy soil Laksmita Prima SANTI; . SUDARSONO; Didiek Hadjar GOENADI; Kukuh MURTILAKSONO; Dwi Andreas SANTOSA
E-Journal Menara Perkebunan Vol 78, No 1: Juni 2010
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractSoil aggregation is a dynamic and very important factor for the development of agricultural soil functions. Unstable soil aggregation in a sandy soil type is a limiting factor for plant growth. The aim of this study was to investigate theinfluence of a exopolysaccharide-producing bacterium and organic material on some physical properties of a sandy soil. A highly potential bacterium for exopolysaccharides production, i.e Burkholderia cenocepacia, was isolated froma sandy soil located at Kotawaringin Barat, Central Kalimantan. The isolated bacterium is capable on improving aggregate’s stability of a soil with about 60% sand fraction [medium sand fraction (MSF)]. Interaction between available water and electric conductivity with aggregate stability index has significant correlation in medium sand fraction inoculated by 109 CFU of B. cenocepacia suspension, i.e. r = 0.806* and r=0.966**, respectively. Organic materials and its combination with the addition of 108 CFU B. cenocepacia suspension treatments could increase the aggregate stability index but have no effects on bulk density and total pore space values in an artificial condition of medium sand fraction. AbstrakAgregasi tanah bersifat dinamis dan merupakan faktor penting untuk pengembangan fungsi tanah pertanian. Ketidakstabilan agregat tanah pada jenis tanah berpasir merupakan faktor pembatas untuk pertumbuhan tanaman.Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh eksopolisakarida bakteri dan bahan organik terhadap beberapa sifat fisik bahan tanah berpasir. Satu bakteri potensial penghasil eksopolisakarida yaitu Burkholderia cenocepacia telah berhasil diisolasi dari bahan tanah berpasir asal Kotawaringin Barat, Kalimantan Tengah. Bakteri ini dapat meningkatkan kemantapan agregat bahan tanah dengan kandungan fraksi pasir sekitar 60% [fraksi pasir sedang (FPS)]. Hubungan antara air tersedia dan konduktivitas elektrik terhadap indeks kemantapan agregat sangat nyata pada bahan tanah FPS yang diinokulasi dengan 109 CFU suspensi B. cenocepacia masing-masing r = 0,806* dan = 0,966**. Perlakuan bahan organik dan kombinasinya dengan penambahan 109CFU suspensi B. cenocepacia dapat meningkatkan indeks kemantapan agregat tetapi tidak mempengaruhi nilai kerapatan lindak dan total ruang pori di dalam fraksi pasir sedang.

Ekspresi gen penyandi ACCase subunit biotin karboksilase dari mesokarp buah kelapa sawit pada Escherichia coli Expression of gene encoding ACCase subunit biotin carboxylase from oil palm fruit mesocarp in Escherichia coli Asmini BUDIANI
E-Journal Menara Perkebunan Vol 82, No 1: Juni 2014
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

Abstract Production of palm oil could be increased, one of which is by increasing oil content in the mesocarp of oil palm. This might be done by increasing the activity of key enzymes of the oil biosynthesis pathway in the oil palm mesocarp. Acetyl-CoA carboxylase has been reported as the enzyme that plays important role in oil accumulation in the oil palm mesocarp. Gene encoding one subunit of ACCase, biotin carboxylase (BC) had been isolated from oil palm mesocarp and cloned in E. coli. This reseach was aimed to examine the expression of the cloned BC gene in the E. coli. The cloned cDNA encoding BC was reisolated from recom-binant E. coli by PCR using spesific primers. The PCR products were verified in the agarose gel, and then ligated to pTrcHis-TOPO expression vector. The ligation product, recombinant vector pTrcHis-TOPO/BC, was introduced into E. coli XL1-Blue. Recombinant colonies grew in the selection media were analyzed using PCR to confirm the existent of the target DNA. The colonies, which have been confirmed to contain target DNA were then subcultured in the LB media, for extraction of total protein. The protein extract was then analyzed quantitatively by Lowry method, and qualitatively by electrophoresis on SDS polyacrylamide gel. The result showed that recombinant plasmid pTrcHis-TOPO/BC has been successfully inserted into E. coli XL-1 Blue. SDS-PAGE analysis of the extracted protein showed that recombinant E. coli produced specific protein with MW of about 43 kDa, much higher compared with that of untransformed E. coli. This results demonstrate that the cloned BC was strongly expressed in E. coli Abastrak Produksi minyak sawit dapat ditingkatkan, salah satu-nya dengan meningkatkan rendemen minyak. Hal ini dapat dilakukan dengan cara meningkatkan aktivitas enzim kunci biosintesis minyak pada mesokarp buah sawit. Acetyl-CoA carboxylase telah dilaporkan merupakan enzim yang berperan penting dalam akumulasi minyak pada mesokarp kelapa sawit. Pada penelitian sebelumnya, gen penyandi salah satu subunit ACCase, yaitu biotin carboxylase (BC), telah diisolasi dari jaringan mesokarp kelapa sawit dan diklon pada E.coli. Tujuan penelitian ini adalah untuk menguji ekspresi gen tersebut pada E. coli. cDNA penyandi BC diisolasi kembali dari E. coli rekombinan dengan PCR menggunakan pasangan primer spesifik. Hasil isolasi diveri-fikasi pada gel agarose, kemudian diligasikan dengan vektor ekspresi pTrcHis-TOPO. Vektor rekombinan (pTrcHis-TOPO/BC) hasil ligasi diintroduksikan ke dalam E. coli XL1-Blue. Koloni rekombinan yang tumbuh pada media seleksi dianalisis menggunakan PCR untuk mengkonfirmasi ada tidaknya sisipan DNA target. Koloni yang terbukti mengandung sisipan DNA target dikulturkan pada media LB kemudian protein total diekstrak dari kultur E. coli dan dianalisis dengan elektroforesis SDS-PAGE. Hasil PCR koloni menunjukkan bahwa transformasi E. Coli XL-1 Blue menggunakan konstruk vektor rekombinan pTrcHis-TOPO/ BC berhasil baik. Analisis SDS-PAGE dari ekstrak protein menunjukkan bahwa E. coli rekombinan menghasilkan protein dengan berat molekul sekitar 43 kDa yang inten-sitasnya jauh lebih tinggi dibandingkan dengan protein yang sama yang dihasilkan oleh E. coli yang tidak ditrans-formasi. Hal ini membuktikan bahwa gen penyandi BC dalam vektor pTrcHis-TOPO dapat diekspresikan dengan kuat pada E. coli.

Kloning gen penyandi β-1,6-glukanase kapang secara cepat dengan teknik RT-PCR menggunakan primer spesifik Rapid cloning for gene encoding fungal β-1,6-glucanase by means of RT-PCR using specific primers Asmini BUDIANI; Riza A. PUTRANTO; Hayati MINARSIH; Niyyah FITRANTI; Djoko SANTOSO
E-Journal Menara Perkebunan Vol 77, No 1: Juni 2009
Publisher : INDONESIAN RESEARCH INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY AND BIOINDUSTRY

AbstractProduction of bioethanol from biomass ofagricultural waste has been hindered with a highproduction cost because enzymes needed for theprocess has to be imported with relatively a highprice. Genetic engineering using its encodinggenes is able to produce those enzymes withlower cost. In this report we described a researchaimed to clone gene encoding β-1,6-glucanasefrom Trichoderma harzianum with a relativelyrapid and inexpensive method, by means of RT-PCR using gene specific primers. The primerswere designed based on the DNA sequence of thetarget gene from the same species of organismused in this research. RT-PCR using that primersresulted in DNA fragment with sizescorresponding to the predicted size of full lengthgene encoding β-1,6-glucanase, about 1300 bp.After a sequential experiments of cloning usingpGEM-T Easy vector, DNA sequencing andBlastN - BlastX analyses of the sequences, it wasproven that the isolated DNA was full length geneof β-1,6-glucanase. This was implied from thepercentage of Identity and E-value which were96% and 0.0 (< e-04) respectivety.AbstrakProduksi bioetanol dari biomassa limbahpertanian, terkendala oleh tingginya biayaproduksi karena enzim yang diperlukan untukproses tersebut masih harus diimpor denganharga yang relatif mahal. Melalui rekayasagenetika menggunakan gen-gen penyandinya,enzim-enzim tersebut dapat diproduksi denganbiaya yang lebih murah. Penelitian ini bertujuanuntuk mengklon gen penyandi β-1,6-glukanasedari Trichoderma harzianum secara cepat danekonomis, dengan RT-PCR menggunakan primerspesifik. Primer tersebut dirancang berdasarkansekuen DNA dari gen target asal spesiesorganisme yang sama dengan yang digunakandalam penelitian. RT-PCR dengan primertersebut menghasilkan fragmen DNA yangukurannya sesuai dengan gen lengkap penyandiβ-1,6-glukanase, yaitu sekitar 1300 bp. Setelahsecara berurutan diklon menggunakan vektorpGEM-T Easy, sekuensing urutan DNA dananalisis BlastN maupun BlastX dari sekuen yangdiperoleh, terbukti bahwa fragmen DNA tersebutadalah gen lengkap penyandi β-1,6-glukanase.Hal ini ditunjukkan oleh Nilai Kesamaan(Identity) dan E-Value yang masing-masingmencapai 96% dan 0.0.

Page 14 of 55 | Total Record : 541

12 13 14 15 16

Filter by Year

2000 2025

Filter By Issues

All Issue Vol. 93 No. 1 (2025): 93(1), 2025 Vol. 92 No. 2 (2024): 92(2), 2024 Vol. 92 No. 1 (2024): 92(1), 2024 Vol. 91 No. 2 (2023): 91 (2), 2023 Vol. 91 No. 1 (2023): 91 (1), 2023 Vol. 90 No. 2 (2022): 90 (2), 2022 Vol. 90 No. 1 (2022): 90 (1), 2022 Vol 90, No 2 (2022): Oktober, 2022 Vol. 90 No. 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 1 (2022): April, 2022 Vol. 89 No. 2 (2021): 89 (2), 2021 Vol. 89 No. 1 (2021): 89 (1), 2021 Vol 89, No 2 (2021): Oktober, 2021 Vol 89, No 1 (2021): April, 2021 Vol. 88 No. 2 (2020): 88 (2), 2020 Vol. 88 No. 1 (2020): 88 (1), 2020 Vol 88, No 2 (2020): Oktober,2020 Vol 88, No 1 (2020): April, 2020 Vol. 87 No. 2 (2019): 87 (2), 2019 Vol. 87 No. 1 (2019): 87 (1), 2019 Vol 87, No 2 (2019): OKTOBER, 2019 Vol 87, No 1 (2019): April, 2019 Vol. 86 No. 2 (2018): 86 (2), 2018 Vol. 86 No. 1 (2018): 86 (1), 2018 Vol 86, No 2 (2018): Oktober 2018 Vol 86, No 1 (2018): April, 2018 Vol. 85 No. 2 (2017): 85 (2), 2017 Vol. 85 No. 1 (2017): 85 (1), 2017 Vol 85, No 2 (2017): Oktober 2017 Vol 85, No 1 (2017): April, 2017 Vol. 84 No. 2 (2016): 84 (2), 2016 Vol. 84 No. 1 (2016): 84 (1), 2016 Vol 84, No 2 (2016): Desember 2016 Vol 84, No 1: Oktober 2016 Vol. 83 No. 2: 83 (2), 2015 Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015 Vol 83, No 2: Desember 2015 Vol 83, No 1: Juni 2015 Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014 Vol. 82 No. 1: 82 (1), 2014 Vol 82, No 2: Desember 2014 Vol 82, No 1: Juni 2014 Vol. 81 No. 2: 81 (2), 2013 Vol. 81 No. 1: 81 (1), 2013 Vol 81, No 2: Desember 2013 Vol 81, No 1: Juni 2013 Vol. 80 No. 2: 80 (2), 2012 Vol. 80 No. 1: 80 (1), 2012 Vol 80, No 2: Desember 2012 Vol 80, No 1: Juni 2012 Vol. 79 No. 2: 79 (2), 2011 Vol. 79 No. 1: 79 (1), 2011 Vol 79, No 2: Desember 2011 Vol 79, No 1: Juni 2011 Vol. 78 No. 2: 78 (2), 2010 Vol. 78 No. 1: 78 (1), 2010 Vol 78, No 2: Desember 2010 Vol 78, No 1: Juni 2010 Vol. 77 No. 2: 77 (2), 2009 Vol. 77 No. 1: 77 (1), 2009 Vol 77, No 2: Desember 2009 Vol 77, No 1: Juni 2009 Vol. 76 No. 2: 76 (2), 2008 Vol. 76 No. 1: 76 (1), 2008 Vol 76, No 2: Desember 2008 Vol 76, No 1: Juni 2008 Vol. 75 No. 2: 75 (2), 2007 Vol. 75 No. 1: 75 (1), 2007 Vol 75, No 2: Desember 2007 Vol 75, No 1: Juni 2007 Vol. 74 No. 2: 74 (2), 2006 Vol. 74 No. 1: 74 (1), 2006 Vol 74, No 2: Desember 2006 Vol 74, No 1: Juni 2006 Vol. 73 No. 2: 73 (2), 2005 Vol. 73 No. 1: 73 (1), 2005 Vol 73, No 2: Desember 2005 Vol 73, No 1: Juni 2005 Vol. 72 No. 2: 72 (2), 2004 Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004 Vol 72, No 2: Desember 2004 Vol 72, No 1: Juni 2004 Vol. 71 No. 2: 71 (2), 2003 Vol. 71 No. 1: 71 (1), 2003 Vol 71, No 2: Desember 2003 Vol 71, No 1: Juni 2003 Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002 Vol. 70 No. 1: 70 (1), 2002 Vol 70, No 2: Desember 2002 Vol 70, No 1: Juni 2002 Vol. 69 No. 2: 69 (2), 2001 Vol. 69 No. 1: 69 (1), 2001 Vol 69, No 2: Desember 2001 Vol 69, No 1: Juni 2001 Vol. 68 No. 2: 68 (2), 2000 Vol. 68 No. 1: 68(1), 2000 Vol 68, No 2: Desember 2000 Vol 68, No 1: Juni 2000 More Issue

Home Page

OAI Link

Editorial Team

Contact

Reviewer

Google Scholar

Contact Name
Hayati Minarsih

Contact Email
menaraperkebunanppbbi@gmail.org

Phone
-

Journal Mail Official
menaraperkebunan@iribb.org

Editorial Address
Jalan Taman Kencana No.1 Bogor 16128, Jawa Barat

Location
Kab. bogor,

Jawa barat

INDONESIA

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Home Page

OAI Link

Editorial Team

Contact

Reviewer

Google Scholar

Contact Name Hayati Minarsih

Contact Email menaraperkebunanppbbi@gmail.org

Phone -

Journal Mail Official menaraperkebunan@iribb.org

Editorial Address Jalan Taman Kencana No.1 Bogor 16128, Jawa Barat

Location Kab. bogor, Jawa barat INDONESIA

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Abstract

Contact Name
Hayati Minarsih

Contact Email
menaraperkebunanppbbi@gmail.org

Phone
-

Journal Mail Official
menaraperkebunan@iribb.org

Editorial Address
Jalan Taman Kencana No.1 Bogor 16128, Jawa Barat

Location
Kab. bogor,

Jawa barat

INDONESIA