Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search
Journal : Biota: Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati

Construction of Soil Metagenomic Library to Obtain Recombinant Clones with an Indigenous Lipase Activity Susanto, Agus Hery; Pramono, Hendro; Lestari, Puji
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 14, No 3 (2009): October 2009
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (350.658 KB) | DOI: 10.24002/biota.v14i3.2577

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengonstruksi perpustakaan metagenom tanah dari sekitar lokasi industri pengolahan minyak kelapa di Kabupaten Banyumas, Jawa Tengah, dalam upaya mendapatkan klon rekombinan dengan aktivitas lipase indigenuos. Penelitian dilakukan di Laboratorium Genetika, Fakultas Biologi, Universitas Jenderal Soedirman mulai bulan Mei hingga Desember 2006. Secara umum tahapan penelitian terdiri atas ekstraksi dan pemurnian DNA tanah, isolasi pUC19, pemotongan DNA tanah, pemotongan dan defosforilasi pUC19, ligasi fragmen-fragmen DNA tanah ke dalam pUC19 untuk menghasilkan molekul DNA rekombinan, dan transformasi sel inang E. coli JM109 menggunakan molekul DNA rekombinan yang diperoleh untuk mengonstruksi perpustakaan metagenom tanah. Pemotongan DNA tanah menghasilkan fragmen-fragmen yang sebagian besar berukuran lebih kurang 5 kb sehingga gen lipase dimungkinkan untuk dibawa di dalamnya. Transformasi sel inang E. coli JM109 memperlihatkan efisiensi 1.7 x 105 cfu/μg plasmid. Di antara koloni-koloni yang diperoleh, terdapat 102 koloni berwarna putih, yang menunjukkan keberadaan molekul DNA rekombinan. Koloni putih ini dapat digunakan sebagai materi untuk skrining klon rekombinan dengan aktivitas lipase.
Variasi Biokimia Genetik Populasi Ikan Betutu (Oxyeleotris marmorata, BLKr.) di Waduk Penjalin Brebes Susanto, Agus Hery; Suryaningsih, Suhestri
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 11, No 3 (2006): October 2006
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (178.602 KB) | DOI: 10.24002/biota.v11i3.2539

Abstract

Penjalin water reservoir in Brebes Regency, Central Java, is one of the habitats of the sand goby. A study on its genetic diversity using approaches of isozyme analysis was needed to support domestication of the fish in this area. This study was aimed at the biochemical-genetic variation of sand goby population in Penjalin water reservoir based on esterase (EST), peroxidase (PER), malate dehydrogenase (MDH), aspartate amino-transferase (AAT), and acid phosphatase (ACP) polymorphisms. Visualization of the isozymes was carried out employing horizontal electrophoretic technique with potato starch gel and buffer system of L-histidin monohydrate. Of the five isozymes, ACP was not well-visualized in all samples tested while the remaining four showed no polymorphisms. It could be concluded that there is no biochemical-genetic variation of sand goby population in Penjalin water reservoir based on isozymes of EST, PER, MDH, and AAT.
Variasi Biokimia Genetik Populasi Ikan Betutu (Oxyeleotris marmorata, BLKr.) di Waduk Penjalin Brebes Agus Hery Susanto; Suhestri Suryaningsih
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 11, No 3 (2006): October 2006
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24002/biota.v11i3.2539

Abstract

Penjalin water reservoir in Brebes Regency, Central Java, is one of the habitats of the sand goby. A study on its genetic diversity using approaches of isozyme analysis was needed to support domestication of the fish in this area. This study was aimed at the biochemical-genetic variation of sand goby population in Penjalin water reservoir based on esterase (EST), peroxidase (PER), malate dehydrogenase (MDH), aspartate amino-transferase (AAT), and acid phosphatase (ACP) polymorphisms. Visualization of the isozymes was carried out employing horizontal electrophoretic technique with potato starch gel and buffer system of L-histidin monohydrate. Of the five isozymes, ACP was not well-visualized in all samples tested while the remaining four showed no polymorphisms. It could be concluded that there is no biochemical-genetic variation of sand goby population in Penjalin water reservoir based on isozymes of EST, PER, MDH, and AAT.
Construction of Soil Metagenomic Library to Obtain Recombinant Clones with an Indigenous Lipase Activity Agus Hery Susanto; Hendro Pramono; Puji Lestari
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 14, No 3 (2009): October 2009
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24002/biota.v14i3.2577

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengonstruksi perpustakaan metagenom tanah dari sekitar lokasi industri pengolahan minyak kelapa di Kabupaten Banyumas, Jawa Tengah, dalam upaya mendapatkan klon rekombinan dengan aktivitas lipase indigenuos. Penelitian dilakukan di Laboratorium Genetika, Fakultas Biologi, Universitas Jenderal Soedirman mulai bulan Mei hingga Desember 2006. Secara umum tahapan penelitian terdiri atas ekstraksi dan pemurnian DNA tanah, isolasi pUC19, pemotongan DNA tanah, pemotongan dan defosforilasi pUC19, ligasi fragmen-fragmen DNA tanah ke dalam pUC19 untuk menghasilkan molekul DNA rekombinan, dan transformasi sel inang E. coli JM109 menggunakan molekul DNA rekombinan yang diperoleh untuk mengonstruksi perpustakaan metagenom tanah. Pemotongan DNA tanah menghasilkan fragmen-fragmen yang sebagian besar berukuran lebih kurang 5 kb sehingga gen lipase dimungkinkan untuk dibawa di dalamnya. Transformasi sel inang E. coli JM109 memperlihatkan efisiensi 1.7 x 105 cfu/μg plasmid. Di antara koloni-koloni yang diperoleh, terdapat 102 koloni berwarna putih, yang menunjukkan keberadaan molekul DNA rekombinan. Koloni putih ini dapat digunakan sebagai materi untuk skrining klon rekombinan dengan aktivitas lipase.