Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : Prosiding

KARAKTERISASI RESISTENSI GULMA Synedrella nodiflora TERHADAP HERBISIDA REFLEX MENGGUNAKAN GEN PPX2L SEBAGAI PENANDA MOLEKULER Dwiati, Murni; Susanto, Agus Hery
Prosiding Vol 3, No 1 (2012)
Publisher : Prosiding

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Fomesafen as an active substance of Reflex herbicide can inhibit PPOase, an enzyme playing important role in chlorophyl biosynthesis. Deletion of three bases at gene encoding PPOase, i.e. PPX2L, was reported as one of resistance mechanisms against PPOase inhibiting herbicides. Nevertheless, only a few studies on molecular characterization of Synedrella nodiflora resistance against Reflex were reported. Therefore, this study was aimed to (1) know the sequence of PPX2L gene isolated from resistant S. nodiflora against Reflex, (2) perform homology study of PPX2L gene from resistant S. nodiflora and various plant species in data base, and (3) know the sequence of PPX2L gene responsible to S. nodiflora resistance against Reflex. The PCR products of susceptible S. nodiflora showed three bands, in that of 500 bp is strongly assumed as PPX2L gene. Susceptible S. nodiflora is genetically different from susceptible A. tuberculatus, indicated by the absence of three base pairs at position 834, 835 and 836 in susceptible S. nodiflora, where in susceptible A. tuberculatus this position is occupied by CAG. Then, in both susceptible S. nodiflora and A. tuberculatus there is C at position 919 but T in resistant A. tuberculatus. At amino acid level this position is CCC (proline) in susceptible S. nodiflora, CTA (leucine) in susceptible A. tuberculatus and TTA (leucine) in resistant A. tuberculatus. Therefore, inspite of base alteration from C in susceptible A. tuberculatus to T in resistant A. tuberculatus, the amino acid formed remains constant, i.e. leucine. Significant difference is, however, observed in susceptible S. nodiflora because there is proline at the same posistion.
STUDI KEANEKARAGAMAN GENETIK TANAMAN KECIPIR (PSOPHOCARPUS TETRAGONOLOBUS (L.) DC): UPAYA MENUJU LABORATORIUM GENETIKA SEBAGAI PUSAT KAJIAN KETAHANAN PANGAN DAN BIOENERGI Amurwanto, Adi; Yuniaty, Alice; Susanto, Agus Hery; Sasongko, Nurtjahjo Dwi; Aziz, Saefuddin
Prosiding Vol 3, No 1 (2012)
Publisher : Prosiding

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kecipir mempunyai potensi untuk dimanfaatkan sebagai bahan pangan segar maupun olahan bernilai gizi tinggi dan sebagai bahan dasar dalam industri biodiesel. Pemanfaatan kecipir yang belum optimal mendorong dilakukannya penelitian tentang keanekaragaman genetik tanaman kecipir sebagai langkah awal untuk mengembangkan potensi tanaman ini. Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh data mengenai keanekaragaman genetik pada level molekuler kecipir polong panjang dan polong pendek dengan teknik RAPD. Dari 32 primer yang diskrining, 20 dipilih untuk analisis menggunakan Program GenAlEx 6.1. Hasilnya 156 buah fragmen dengan 140 diantaranya menunjukkan polimorfisme sehingga didapatkan polimorfisme total sebesar 89,74%. Polimorfisme dalam populasi kecipir polong pendek bernilai 64.10% dan polimorfisme dalam populasi kecipir polong panjang sebesar 51.28%. Kemiripan genetik Nei (bias) antara kecipir polong panjang dan kecipir polong pendek adalah 0,805 sementara jarak genetik antara keduanya adalah 0,218. Adapun kemiripan genetik tidak bias antara kedua populasi adalah 0,873, sementara jarak genetik tidak bias sebesar 0,136.