Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Pharmascience

Penambatan Molekul Kandungan Eurycoma longifolia Jack. (Pasak bumi) terhadap Human Phosphodiesterase 5 Samsul Hadi; Khoerul Anwar; Amalia Khairunnisa; Noer Komari
Jurnal Pharmascience Vol 7, No 2 (2020): Jurnal Pharmascience
Publisher : Program Studi Farmasi FMIPA Universitas Lambung Mangkurat

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20527/jps.v7i2.8731

Abstract

Pasak bumi sebagai obat tradisional pria telah digunakan oleh masyarakat melayu, khususnya orang Sumatra dan kalimantan, akan tetapi mekanisme secara molekuler belum dikatahui dengan jelas. Salah satu pendekatan yang dapat digunakan untuk mengetahui mekanisme pasak bumi sebagai obat tradisional yang bermanfaat mengatasi disfungsi ereksi adalah penambatan molekul. Penambatan melekul dilakukan dengan cara melihat interaksi ligand dengan reseptor. Ligand yang berasal dari pasak bumi adalah 5-methoxycanthin-6-one, 9-methoxycanthin-6-one, eurycomalactone, eurycomalide A, eurycomanone, eurycomaoside, laurycolactone A, longilactone, niloticin, picrasidine O. Sehingga kesepuluh ligand ini didocking menggunakan salah satu aplikasi docking yaitu PLANTS 1.1 untuk melihat ikatan dengan PDE5. Sebelum dilakukan docking terhadap ligand pasak bumi, terlebih dahulu dilakukan docking terhadap ligand Sildenafil untuk melhat nilai RMSD. RMSD ini diperlukan sebagai alat validasi metode, berdasarkan percobaan, nilai RMSD dari Sildenafil adalah 1,2517 A0. Hasil terbaik dari penambatan molekul pasak bumi adalah niloticin dengan skor doking -97,8802, sehingga nilai interaksinya terhadap reseptor sebesar 93,71% dari Sildenafil.Pasak bumi as traditional male medicine has been used by Malay people, especially Sumatra and Borneo people, but the molecular mechanism is not yet known clearly. One approach that can be used to determine the mechanism of the Pasak Bumi as a traditional medicine that is useful to overcome erectile dysfunction is docking molecules. Molecular docking is done by looking at the interaction of ligands with receptors. Ligands originating from the Pasak Bumi are 5-methoxycanthin-6-one, 9-methoxycanthin-6-one, eurycomalactone, eurycomalide A, eurycomanone, eurycomaoside, laurycolactone A, longilactone, niloticin, picrasidine O. docking application namely PLANTS 1.1 to see the bond with PDE5. Before docking Pasak Bumi ligand, it is first docking Sildenafil ligand to see the RMSD value. The RMSD is needed as a method validation method, based on experiments, the RMSD value of Sildenafil is 1.2517 A0. The best results from docking of the Pasak bumi molecule is niloticin with a doctor score of -97.8802, so interaction skor to the receptor is 93.71% of Sildenafil.Keywords: Pasak Bumi, PDE5, PLANTS
Co-Authors A.A. Ketut Agung Cahyawan W Abdullah Abdullah Adi Rahmadi Afdella, Nor Afni Ahmad Budi Junaidi Akmal Rizky Harun Amalia Khairunnisa Aminuddin Prahatama Putra Anang Kadarsah Anang Kadarsah, Anang Anjang Yudistri Annisa Rizqi Dwi Oktaviani An’nisa, Windy Sidratul Awin Fauzi Azidi Irwan Bambang Setiawan Dahlena Ariyani Desiya Ramayanti Azhara Dewi Umaningrum Diah Aulia Rosanti Dona Marisa, Dona Dwi Rasy Mujiyanti Dwi Rasy Mujiyanti Dwi Rasy Mujiyanti Eko Suhartono Eko Suhartono Erfanur Adlhani Etty Novita Febriyanti, Nur Fatma Fitri Hady Amrullah Habibah, Hanna HANNA HABIBAH Hanna Habibah Ina Risnawati INDAH SAPUTRI Indah Saputri Indah Setiawati INDAH SETIAWATI Kamilia Mustikasari Karlina Karlina Khoerul Anwar Kholifatu Rosyidah Laksono Trisnantoro Lisda Hayatie, Lisda Lusi Thenios Mardi Santoso Maria Dewi Astuti Marisa Shellyanti Megayulia Nooryaneti Melina Arini Sylvia Dewi Mirza Maulana Ahmad Mukarramah Mukarramah, Mukarramah Nadia Sasanti NAFISAH Nafisah Nafisah Nafisah Nafisah Ningtyas Indah Sari Noor Malinda Nurhidayati Pratiwi Prahatama Putra, Aminuddin Puji Astuty Putra, Andifa Anugerah Putri, Amaris Nathania Hanindia Rabiatul Adawiyah Rahmat Eko Sanjaya Rahmi Hardini Retno Agnestisia ROBIATUL ADAWIYAH Rusdiana Rusdiana Rusdiana Rusdiana Salmon Charles Pardomuan Tua Siahaan Samsul Hadi Samsul Hadi Samsul Hadi Saputri, Indah SARMILA Sarmila Sarmila Sarmila, Sarmila Siti Juliati Siti Ratna Jinan F Sri Hendriani Sujatmiko Sujatmiko Sujatmiko Sujatmiko Sunardi Sunardi Sunardi sunardi sunardi Sunardi, Ph.D., Sunardi Taslim Ersam Tri Ayu Novelena Umi Baroroh Lili Utami Utami Irawati Veronica Shania Aprillia Widiyanto, Gregorius Yenny Era Nova