cover
Contact Name
Tika Hairani
Contact Email
jurnal@rmpi.brin.go.id
Phone
+6287770346919
Journal Mail Official
beritabiologi@brin.go.id
Editorial Address
Jl. Ir. H. Juanda No.18, RT.04/RW.08, Paledang, Kecamatan Bogor Tengah, Kota Bogor, Jawa Barat 16122
Location
Kota bogor,
Jawa barat
INDONESIA
Berita Biologi
ISSN : 23378751     EISSN : 23378751     DOI : https://doi.org/10.55981/berita_biologi
Berita Biologi is the journal features articles showcasing advancements in biological research and related sciences in Indonesia. Berita Biologi comprises original scientific papers presenting research findings, short communications, and reviews that are unpublished or not under consideration elsewhere. Covered topics are expected to introduce novel aspects or information.
Articles 126 Documents
POTENSI RHIZOBAKTERI DALAM MENDUKUNG PERTUMBUHAN STEK BATANG SINGKONG (Manihot esculenta Crantz) [The Potential of Rhizobacteria in Supporting the Growth of Cassava (Manihot esculenta Crantz ) Stem Cuttings] Nugroho, Agung Adi; Agustiyani, Dwi; Sutisna, Entis; Mulyani, Nani; Dewi, Tirta Kumala; Nditasari, Achirul; Antonius, Sarjiya; Purwaningsih, Sri
Berita Biologi Vol 22 No 3 (2023): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2023.120

Abstract

Cassava (Manihot esculenta Crantz) is an important food plant in Indonesia, particularly as a carbohydrate source. We require a plan to increase production and quality. The use of Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR) in organic fertilizers is one option. The aim of this study is to isolate, characterize, and evaluate potential microbial candidates for cassava greenhouse growth. K solubilizing, P solubilizing, N fixing, IAA production, protease production, ACC-deaminase, and siderophore production were investigated in 15 tuber root rhizobacteria isolates. The bacterial isolates' ability to grow cassava stem cuttings was then assessed. The rhizobacterial inoculation treatments in this study included fifteen single isolates, a combination of isolates, and controls. With three replications, the experimental design was completely randomized. Five P-solubilizing bacterial isolates (PK AL.2.2, PK LAS 4A.4, PK 4.1, PK Al.2.6, PK Kbm 6.1), two protease-producing isolates (Pro LAS 4B.6 and Pro LAS 5A.3), and one IAA-producing isolate (TSB LAS 1A.6) increased wet plant weight by 20-41% as compared to controls. The results of molecular identification of the six excellent isolates were Burkholderia sp. (PK AL.2.2), Paenarthrobacter nicotinovorans (Pro LAS 4B.6), Burkholderia territorii (PK 4.1), Burkholderia cenocepacia (Pro LAS 5A.3), Burkholderia territorii (PK LAS 4A.4), and Kocuria rhizophila (TSB LAS 1A.6).
THE GROWTH OF Dendrobium spectabile (Blume) Miq. ORCHID PLANTLET IN VACIN AND WENT (VW) MEDIUM WITH DIFFERENT CONCENTRATIONS OF COCONUT WATER Zakiyah, Aisyah; Setiari, Nintya; Nurchayati, Yulita
Berita Biologi Vol 24 No 2 (2025): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/berita_biologi.2025.222

Abstract

Dendrobium spectabile is an epiphytic orchid that grows slowly and experiences natural exploitation, so it needs to be conserved ex-situ through in vitro culture. One of the essential steps for in vitro culture is subculture to supply the nutrients needed by plantlets. Increasing the growth of these plantlets can be done by adding coconut water. This study aimed to determine the effect of adding coconut water and the optimal concentration of coconut water on the growth of D. spectabile plantlets in VW medium. The method used is growing plantlets in VW medium with different concentrations of coconut water. The research design was completely randomized with a single factor, the concentration of coconut water (0%, 5%, 10%, 15%, 20%). Data were analyzed by ANOVA at a 5% significance level. Plantlet growth was observed for two months. Parameters observed were new shoots, leaves, and roots emergence time; number of new shoots, leaves, and roots; and new leaves length. The addition of coconut water affected the growth of D. spectabile orchid plantlets. Five to ten percent of coconut water is the optimal concentration for shoots and leaves growth of D. spectabile orchid plantlets. Therefore, coconut water can increase the growth of in vitro plantlets.
PERBANDINGAN SPASIO-TEMPORAL KESEIMBANGAN LINGKUNGAN PLANKTON DI EMBUNG DAERAH BANTUL YOGYAKARTA Sudarsono; Ratnawati; Budiwati; Latifa, Annisa
Berita Biologi Vol 23 No 1 (2024): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2024.390

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perbandingan keseimbangan lingkungan dilihat dari komposisi jenis plankton, produktivitas primer, kelimpahan, indeks keanekaragaman, indeks dominansi dan indeks saprobik di Embung Potorono dan Embung Imogiri pada April dan Oktober 2021. Penelitian ini dilakukan pada bulan April 2021 sampai Juli 2022. Desain penelitian ini adalah deskriptif eksploratif. Pengambilan sampel dilakukan pada 5 stasiun dengan 5 pengulangan. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kualitas perairan di keempat lokasi dan waktu termasuk dalam kategori tercemar ringan. Parameter yang berkontribusi terhadap kualitas air di Embung Imogiri dan Embung Potorono pada April 2021 adalah kedalaman air, curah hujan, dan suhu air yang tinggi. Curah hujan memiliki hubungan yang tidak signifikan dengan kelimpahan jenis yang tinggi namun melalui COD dapat dilihat adanya hubungan yang signifikan antara COD dengan kelimpahan jenis. Parameter yang berkontribusi terhadap kualitas air di Embung Imogiri pada Oktober 2021 adalah bahan organik, nitrat, DO, kekeruhan air dan magnesium yang cukup tinggi. Intensitas cahaya memiliki hubungan yang tidak signifikan dengan indeks dominansi fitoplankton namun nitrat, DO dan kekeruhan air memiliki hubungan yang signifikan dengan indeks dominansi fitoplankton. Parameter yang berkontribusi terhadap kualitas air di Embung Potorono pada Oktober 2021 adalah intensitas cahaya, BOD, COD, kalium dan fosfat. DO berpengaruh terhadap indeks keanekaragaman zooplankton yang dapat dilihat dari hubungan yang signifikan antara DO dengan indeks dominansi zooplankton.
TUNGAU VEKTOR DEMAM SEMAK PADA TIKUS DI CALON IBU KOTA NEGARA, KALIMANTAN TIMUR Marsongko, Wigati; Ristiyanto; Widayati, Anis N.; Mulyono, Arief; Garjito, Triwibowo A.; Handayani, Farida D.; Mujiyanto; Hidajat, Muhammad C.; Anggraeni, Yusnita M.; Wahono, Tri; Kesuma, Agung P.
Berita Biologi Vol 23 No 2 (2024): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2024.437

Abstract

Penelitian terkait fauna tungau trombikulid, yang merupakan vektor penyakit demam semak, telah dilakukan di calon Ibu Kota Negara, yaitu Kalimantan Timur. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui jenis tungau trombikulid dan jenis tikus sebagai inangnya di Kalimantan Timur. Penelitian bersifat deskriptif dan berlangsung di tahun 2019. Penelitian dilakukan dengan survei tikus di dalam dan luar rumah, juga tungau trombikulid pada tubuh tikus yang tertangkap. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jenis tungau trombikulid pada tikus di calon Ibu Kota Negara terdiri atas 10 spesies yang termasuk dalam 6 genera. Berdasarkan hasil penelitian ini, disimpulkan bahwa daerah Kalimantan Timur berpotensi terjadi penularan demam semak oleh tungau trombikulid yang disebabkan oleh habitat spesifik tungau tersebut.
ISOLATION, IDENTIFICATION, AND ANTIBIOTIC SENSITIVITY AGAINST Salmonella sp. FROM HATCHERY KUB CHICKEN IN YOGYAKARTA [Isolasi, Identifikasi, dan Sensitivitas Antibiotik Terhadap Salmonella sp. dari Penetasan Ayam KUB di Yogyakarta] Suwito, Widodo; Setya Adji, Rahmat; Faiz Karimy, Moh.
Berita Biologi Vol 22 No 3 (2023): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2023.454

Abstract

Salmonella sp. is responsible bacteria that causes salmonellosis in hatchery-produced local chicken (KUB) in Yogyakarta. The objective of this study was to determine of character Salmonella sp. from hatchery KUB chicken in Yogyakarta. This study was carried out in KUB chicken hatcheries in Yogyakarta province, specifically in the Sleman district (n = 5), Bantul (n = 3), Kulonprogo (n = 3), and Gunungkidul (n=2). Isolation and identification of Salmonella sp. were done from eggshells (n=17) and chick fluff of KUB chicken (n = 13) based on conventional methods with the bacteriological analytical manual (BAM). Sensitivity of Salmonella sp. against antibiotics is determined by antimicrobial diffusion agar with a paper disc antibiotic. A total of 3 isolates of Salmonella sp. were isolated from eggshells (n=2) and chick fluff from KUB chicken (n=1). Salmonella sp. was sensitive to tetracycline, oxytetracycline, enrofloxacin, sulfamethoxazole and resistant to ampicillin and erythromycin. The study showed that the hatchery of KUB chicken in Yogyakarta was contaminated with Salmonella sp. and had resistance to several antibiotics. Therefore, desinfection in incubator hatcheries using KUB chicken should continue after the egg hatches.
UJI SITOTOKSISITAS TAURIN DAN EKSTRAK ETANOL MAKROALGA COKELAT DENGAN METODE BSLT (Brine Shrimp Lethality Test) Bareta, Ainun Rohmawati; Widiastuti, Endang Linirin; Nurcahyani, Nuning
Berita Biologi Vol 22 No 2 (2023): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2023.660

Abstract

Makroalga cokelat Padina australis dan Sargassum duplicatum diketahui mengandung metabolit sekunder yang bermanfaat bagi kesehatan, salah satunya sebagai bahan baku antikanker. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui kandungan senyawa bioaktif yang terdapat dalam ekstrak etanol P. australis dan S. duplicatum dari perairan Pantai Dollar Beach Padada, Kec. Ketapang, Lampung Selatan dan perairan Pantai Tegal Mas, Kec. Teluk Pandan, Pesawaran, serta mengetahui toksisitas dari taurin, ekstrak etanol P. australis dan S. duplicatum dengan metode BSLT (Brine Shrimp Lethality Test). Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa ekstrak etanol P. australis dan S. duplicatum mengandung saponin, steroid, alkaloid dan flavonoid. Toksisitas taurin, ekstrak etanol P. australis dan S. duplicatum tergolong dalam toksisitas rendah terhadap Artemia salina dengan nilai LC50 berturut-turut adalah 133,73 ppm, 176,95 ppm, dan 140,42 ppm.
POTENSI PRODUK ALAMI LAUT DARI EKSTRAK ETANOL Sargassum duplicatum DAN Padina australis SECARA SITOTOKSIK TERHADAP SEL HeLa Saputra, Yosi Dwi; Widiastuti, Endang Linirin; Berliana, Melisa Intan; Nurcahyani, Nuning
Berita Biologi Vol 23 No 1 (2024): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2024.661

Abstract

Salah satu penyebab utama kematian wanita Indonesia adalah kanker serviks. Pertumbuhan sel jaringan tubuh yang tidak terkendali yang berubah menjadi tumor adalah akar penyebab penyakit ini. Banyak peneliti sedang menyelidiki beragam bahan kimia alami dari habitat laut sebagai pilihan pengobatan antikanker karena pengobatan kanker serviks memiliki efek samping yang besar dan durasi pengobatan yang panjang. Makroalga merupakan salah satu organisme laut yang dapat berpotensi sebagai sumber obat alami untuk terapi kanker. Bahan aktif seperti flavonoid, alkaloid, saponin dan steroid berpotensi sebagai agen anti kanker yang diduga dapat mempengaruhi siklus sel dalam pertumbuhan kanker melalui mekanisme apoptosis. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pengaruh senyawa bioaktif yang terkandung didalam ekstrak Sargassum duplicatum dan Padina australis terhadap sitotoksisitas sel kanker serviks, HeLa. Aktivitas sitotoksik terhadap sel HeLa dievaluasi dengan menggunakan metode WST-8 dengan variasi kosentrasi ekstrak etanol 62,5; 125; 250; 500; 1.000; dan 2.000 ppm. Hasil uji sitotoksik memperlihatkan bahwa ekstrak S. duplicatum dan P. australis memiliki aktivitas sitotoksik terhadap sel HeLa. Nilai IC50 Sargassum duplicatum dan Padina australis terhadap sel HeLa masing-masing sebesar 1.108,7 dan 681,1 μg/ml. Hasil penelitian mengindikasikan bahwa S. duplicatum dan P. australis mempunyai aktivitas sitotoksik melawan sel HeLa, sehingga dapat dijadikan sumber obat antikanker serviks.
ANALISIS IN SILICO PROTEIN BIOSINTESIS LIGNIN PADA TANAMAN SORGUM (Sorghum bicolor L. Moench) Windiastri, Vincentia Esti; Ardie, Sintho Wahyuning; Nugroho, Satya
Berita Biologi Vol 22 No 2 (2023): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2023.690

Abstract

Lignin adalah bahan alam yang dapat dimanfaatkan sebagai bahan mentah dalam industri biofuel dan bioenergi. Peningkatan produksi lignin mendorong tersedianya sumber lignin terbaharukan dan ramah lingkungan. Sorgum berpotensi digunakan sebagai sumber biomassa untuk produksi lignin. Produksi lignoselulosa dari sorgum per tahunnya mencapai 19–47 ton/ha. Meskipun demikian, untuk memanfaatan sorgum sebagai sumber lignin secara optimal diperlukan peningkatan kandungan total lignin pada tanaman sorgum. Rekayasa genetika dalam modifikasi kandungan lignin dapat menjadi jawaban. Namun, informasi mengenai gen biosintesis lignin masih terbatas. Untuk memperoleh informasi protein biosintesis lignin pada sorgum (Sorghum bicolor L.Moench) dan protein homolognya dari tanaman monokotil yang lain, analisis bioinformatika mengenai protein biosintesis lignin telah dilakukan. Analisis dilakukan menggunakan program Blast-p, Mega-X, Conserved Domain Database, InterPro dan MEME. Hasil dari analisis yang dilakukan menggambarkan bahwa protein biosintesis lignin membentuk klaster searah dengan arah divergensi taksonomi tanaman monokotil. Protein lignin dari sorgum mengelompok bersama Mischanthus, tebu dan jagung. Pohon kekerabatan protein COMT menghasilkan bootstrap tertinggi untuk protein lignin sorgum di antara pohon filogeni protein-protein yang lain. Hasil penyejajaran keluarga protein COMT sorgum (XP_002445083.1) dengan protein COMT dari Mischanthus, tebu, jagung dan Arabidopsis menunjukkan bahwa protein XP_002445083.1 mempunyai karakter fungsional yang saling mirip. Sehingga dapat disimpulkan bahwa XP_002445083.1 diduga adalah protein COMT dari sorgum.
KELIMPAHAN DAN KARAKTERISTIK BAKTERI DALAM BAKASANG BIA GARU (Tridacna gigas L) [Abundance and Characteristics of Bacteria in Bakasang Bia Garu (Tridacna gigas)] Mahulette, Ferymon; Pattipeilohy, Mery; Pelamonia, Alamanda
Berita Biologi Vol 22 No 3 (2023): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2023.697

Abstract

Bakasang bia garu is a clam-based fermented product processed by the people of the Babar Islands, Maluku. Uncontrolled processing allows the presence of unwanted bacteria in these local food products. Preservatives added in the processing of bakasang bia garu are very diverse. This study aims to isolate and characterize lactic acid, halotolerant, and coliform bacteria from bakasang bia garu which are processed using different preservatives. Lactic acid bacteria were isolated using de Man Rogosa and Sharpe Agar (MRSA) media while halotolerant and coliform bacteria used Mannitol Salt Agar (MSA) and Eosin Methylene Blue Agar (EMBA) media, respectively. Characterization was carried out macroscopically and microscopically. The results showed that lactic acid bacteria were only found in bakasang with synthetic salt and vinegar preservatives of 3.5x103 CFU/g which was dominated by Pediococcus pentosaceous. Halotolerant and coliform bacteria have diverse characteristics that belong to the genera Staphylococcus, Escherichia, and Enterobacter. Bakasang bia garu needs to optimize its controlled processing to improve the quality of this local food product in the future
EVALUASI SENYAWA BIOAKTIF Nasturtium montanum Wall. SEBAGAI KANDIDAT AGEN ANTIPIRETIK TERHADAP RESEPTOR PROSTAGLANDIN SYNTASE 2 (PTGS2) SECARA IN SILICO [Evaluation of Bioactive Compounds of Nasturtium montanum Wall. as Antipyretic Agent Candidate Toward Prostaglandin Syntase 2 (PTGS2) Through in Silico] Ikhtira, Dilla Anisa; Rohman , Fatchur; Lestari, Sri Rahayu
Berita Biologi Vol 22 No 3 (2023): Berita Biologi
Publisher : BRIN Publishing (Penerbit BRIN)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55981/beritabiologi.2023.703

Abstract

The inhibition of prostaglandin syntase 2 ( PTGS2 route is necessary in order to prevent an feverfever. Antipyretic drugs such as the Non steroids ( NSAIDs are fever medication which acts as non-selective inhibitor of PTGS2. NSAID overdose cases have led to herbal ingredients utilization as alternative remedies, such as the Nasturtium montanum leaves. This research aimed to observe the interaction of selected bioactive compounds within N. montanum with the PTGS2 target protein through molecular docking. In addition, this research used in silico approach conducted with molecular docking method trough several stages such as preparation of 3D ligand structure and protein, protein sterilization by PyMOL, docking compounds with PyRx and visualization of docking results via LigPlot+. Results obtained from this research shows the bond dissociation energy value of 1-O-sinapoyl-beta-D-glucose, kaempferol 3-O-sophoroside, patuletin 3-gentiobioside and quercetin 3-O-malonylglucoside substances are smaller compared to meclofenamic acid causing the four ligand tests more stable in their binding to PTGS2 receptor. Meclofenamic acid and 1-O-sinapoyl-beta-D-glucose both bind to PTGS2 receptor with the same amino acid residue as well as the same interaction. Whereas meclofenamic acid, kaempferol 3-O-sophoroside, patuletin 3-gentiobioside and quercetin 3-O-malonylglucoside bind to PTGS2 receptor with the same amino acid residue yet have different bond interaction.

Page 1 of 13 | Total Record : 126