Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
2.012
P-Index
This Author published in this journals
All Journal HAYATI Journal of Biosciences Jurnal Sain Veteriner VALENSI Science and Technology Indonesia Biosaintifika: Journal of Biology & Biology Education Jambura Journal of Chemistry JURNAL MEDIA KESEHATAN Makara Journal of Science Jurnal Kedokteran Hewan
SILMI MARIYA
Primate Research Center, Institut Pertanian Bogor
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Earth & Planetary Sciences Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Materials Science & Nanotechnology Medicine & Pharmacology Physics Veterinary

Published : 12 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Jambura Journal of Chemistry

 1 
Analisis Kemiripan Obat, Prediksi Toksisitas dan Studi Molecular Docking Metabolit Sekunder Dari Streptomyces carpaticus Terhadap Protein Caspase-3 Sebagai Antikanker Leukemia Suduri, Adam; Darusman, Huda Shalahudin; Mariya, Silmi
Jambura Journal of Chemistry Vol 6, No 2 (2024): August
Publisher : Universitas Negeri Gorontalo

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.37905/jambchem.v6i2.26802

Abstract

Caspase-3 merupakan enzim protease yang berperan dalam proses apoptosis, dan menjadi target senyawa metabolit dalam menghambat pertumbuhan sel kanker. Tujuan penelitian adalah untuk mengetahui sifat kemiripan obat metabolit sekunder hasil produksi Streptomyces carpaticus yang diperoleh berdasarkan analisis klaster gen biosintesis pada program antiSMASH version 7.1.0, mengetahui hasil prediksi mutagenicity dan toxicity serta mengetahui hasil interaksi metabolit sekunder dengan protein Caspase-3 yang merupakan reseptor terkait sel kanker leukemia menggunakan molecular docking. Hasil analisis kemiripan obat dan prediksi ADME menunjukkan bahwa ketiga metabolit memenuhi aturan Lipinski Rule of Five dan memiliki kemiripan dengan obat. Ketiga metabolit tergolong pada Toxicity Class 5, dan memiliki sifat mutagenic inactive dengan probability Pristinol: 0.93, Raimonol: 0.91 dan Cyslabdan: 0.80 dan toxicity inactive dengan probability Pristinol: 0.75, Raimonol: 0.94 dan Cyslabdan: 0.76. Hasil studi molecular docking, analisis dan validasi situs ikatan dengan protokol penambatan ulang (redocking) ligan standar 5-[4-(1-carboxymethyl-2-OXO-propylcarbamoyl)-benzylsulfamoyl]-2-Hydroxy-Benzoic Acid memiliki nilai RMSD yaitu 0.000. Energi ikatan bebas masing-masing ligan yaitu sebesar -8,9 kkal/mol -9.2 kkal/mol, -7.0 kkal/mol, -7.1 kkal/mol, dan -7.0 kkal/mol. Hasil ini menunjukan bahwa energi ikatan hasil penambatan metabolit sekunder dengan protein Caspase-3 yang paling baik adalah metabolit cyslabdan dengan nilai ikatan bebas -7.4 kkal/mol dan jumlah interaksi 12.
Co-Authors Agus Setiyono Al Azhar Annisa Dewi, Fitriya Nur Arif Rakhman Hakim Bambang Pontjo Priosoeryanto Bintoro, Yudha Dayana, Hepy Deby Anggraini, Deby Dewa, Wisnu Jaka Dian Pratiwi Dondin Sajuthi Ekowati Handharyani Elok Budi Retnani Huda Shalahudin Darusman Ichsan Ichsan IETJE WIENTARSIH Indriawati, Iin Irma Herawati Suparto Irmanida Batubara Jusak Nugraha KARTINI ERIANI Krisnayanti, Ni Putu Eka Mia Audina, Mia Muhammad Hamdan Mulyatni, Agustin Sri Ningrum, Emilna Mega Noviana, Rachmitasari PERMANAWATI, PERMANAWATI Putri, Indah Aprianti Ratu, Safira Pinaka Pramestika Rayendra, Raendi Raymond R. Tjandrawinata ROHAYATI SUPRIHATINI Saifanah Setiawan, Nabilah Sebayang, Shalina Sri Purwaningsih Subu Taopan, Harrold Halilintar MR Suduri, Adam SUMINAR SETIATI ACHMADI UUS SAEPULOH Valentina Sokoastri Yuliana Yuliana Yusuf Ryadi Zaelani, Bella Fatima Dora