cover
Article Per Year (5 Year)
All
Home Page
OAI Link
Editorial Team
Contact
Reviewer
Google Scholar
Contact Name
Hayati Minarsih
Contact Email
menaraperkebunanppbbi@gmail.org
Phone
-
Journal Mail Official
menaraperkebunan@iribb.org
Editorial Address
Jalan Taman Kencana No.1 Bogor 16128, Jawa Barat
Location
Kab. bogor,
Jawa barat
INDONESIA
Menara Perkebunan
Published by Pusat Penelitian Kelapa Sawit
ISSN : 01259318     EISSN : 18583768     DOI : -
Core Subject : Agriculture,
Agriculture, Biological Sciences & Forestry
Menara Perkebunan as a communication medium for research in estate crops published articles covering original research result on the pre- and post-harvest biotechnology of estate crops. The contents of the articles should be directed for solving the problems of production and/or processing of estate crops of smallholder, private plantations and state-owned estates, based on the three dedications of plantation. Analyses of innovative research methods and techniques in biotechnology, which are important for advancing agricultural research. Critical scientific reviews of research result in agricultural and estate biotechnology.
Arjuna Subject : -
Articles 541 Documents
 32   33   34   35   36 
Biosorpsi ion tembaga dalam limbah tailing menggunakan jamur pelapuk putih amobil Biosorption of copper ion in tailing mining effluent using immobilizede white-rot fungi Firda DIMAWARNITA; . SUHARYANTO; . TRI-PANJI1; Nur RICHANA; Achmad ZAINUDIN
Menara Perkebunan Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v83i1.11

Abstract

Abstract         Copper and gold mining industry produce large amount of tailings effluent containing heavy metals such as Cu and Hg that will polute  environment and agricultural land, if it is not properly treated.  Effort in reducing pollution level and recovery of metal in tailing could be conducted with biosorption process using microbial cell as an absorbent agent. This study aims to determine the ability of selected white rot fungi (WRF) immobilized on empty fruit bunches of oil palm (EFB)  to absorb Cu (II) metals in tailing. Based on growth rate, ligninolytic enzymes activity, and the absorption capacity of heavy metals, the superior WRF candidate was Omphalina sp. The ability of biomass Omphalina sp. to decrease the con-centrateion of Cu (II) with an initial concentration of 150 ppm, up to 63%. Omphalina sp. that immobilized on TKKS was able to reduce Cu (II) as much as 66-77% at pH 4.0 for 60 minutes. Abstrak                Eksploitasi tambang tembaga dan emas banyak menghasilkan limbah tailing yang masih me-ngandung logam berat seperti Cu (II) dan Hg (II). Limbah tersebut berpotensi mencemari perairan dan lahan pertanian bila tidak ditangani dengan baik.  Usaha untuk mengatasi limbah tailing dan sekaligus memekatkan (recovery) logam di dalam-nya dapat dilakukan dengan proses biosorpsi menggunakan sel mikroba. Penelitian ini bertujuan menetapkan kemampuan biomassa jamur pelapuk putih (JPP) yang diimobilisasi pada tandan kosong kelapa sawit (TKKS) dalam mengabsorpsi ion logam Cu (II). Metode biosorpsi logam yang digunakan dengan sistem batch dengan kadar logam 300 ppm, 200 ppm,dan 150 ppm. Hasil seleksi JPP berdasarkan laju pertumbuhan, aktivitas enzim ligninolitik, dan penyerapan logam berat telah  diperoleh   kandidat   JPP   unggul  yaitu Omphalina sp. Dalam media PDB,  Omphalina sp. toleran terhadap Cu (II) hingga konsentrasi 150 ppm. Kemampuan biomassa Omphalina sp. untuk penurunan konsentrasi Cu (II) dengan konsentrasi awal 150 ppm yaitu mencapai 63%. Omphalina sp. yang diimobilisasi dengan TKKS mampu menurun- kan kandungan Cu (II) sebesar 66-77%  pada pH 4.0 selama 60 menit. 
Enzymatic hydrolysis of oil palm empty fruit bunch to produce reducing sugar and its kinetic Hidrolisis enzimatik tandan kosong kelapa sawit untuk menghasilkan gula pereduksi dan kinetikanya Vera BARLIANTI; Deliana DAHNUM; . MURYANTO; Eka TRIWAHYUNI; Yosi ARISTIAWAN; Yanni SUDIYANI
Menara Perkebunan Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v83i1.12

Abstract

Abstrak Sebagai salah satu Negara penghasil minyak kelapa sawit mentah (CPO), Indonesia juga menghasilkan tandan kosong kelapa sawit (TKKS) dalam jumlah besar. TKKS terdiri dari-tiga-komponen utama, yaitu selulosa, hemiselulosa, dan lignin. Pengolahan awal TKKS secara alkalindi ikuti dengan hidrolisis TKKS secara enzimatik menggunakan kombinasi enzim selulase dan β-glukosidase akan menghasilkan gula-gula yang mudah difermentasi.  Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari pengaruh konsentrasi substrat, kon-sentrasi enzim, dan suhu selama proses hidrolisis berlangsung.  Hasil yang diperoleh menunjukkan bahwa konsentrasi gula maksimum (194,78 g/L) dicapai pada konsentrasi TKKS 20% (b/v), konsentrasi campuran enzim yang terdiri dari selulase dan β-1,4 glukosidase sebesar 3,85% (v/v), dan suhu 50oC. Perbandingan antara selulase dan β-1,4 glukosidase adalah 5:1 dengan masing-masing aktivitas enzim sebesar 144.5 FPU/mL dan 63 FPU/mL. Hasil penelitian juga menunjukkan bahwa model kinetika yang sesuai untuk proses hidrolisis TKKS secara enzimatik adalah model kinetika Shen dan Agblevor dengan reakside aktivasi enzim orde satu.  Hasil ini mendukung studi kelayakan ekonomi dalam pemanfaatan TKKS untuk produksi bioetanol.AbstractAs one of the crude palm oil producers, Indonesia also produces empty fruit bunches (EFB)in large quantities. The oil palm EFB consist of cellulose, hemicellulose and lignin. Alkaline pretreatment of EFB, followed by enzymatic hydro-lysis of cellulose using combination of cellulase and β-glucosidase enzymes produce fermentable sugars. This paper reported the effects of substrate loading, enzyme concentration, and temperature of hydrolysis process on reducing sugar production. The  maximum  sugar  concentration (194.78 g/L) was produced at 50oC using 20% (w/v) EFB and 3.85% (v/v) mixed enzymes of cellulase and β-1,4 glucosidase in volume ratio of 5:1 (v/v), with enzyme activity of 144.5 FPU/mL and 63 FPU/mL, respectively. The results also showed that the suitable kinetic model for enzymatic hydrolysis process of oil palm EFB follow Shen and Agblevor model with first order of enzyme deactivation. These results support the economic feasibility study in utilization of EFB of oil palm for bioethanol production.    
Peranan rizobakteri dan fungi mikoriza arbuskular dalam proses fotosintesis dan produksi gula sorgum manis (Sorghum bicolor L. Moench) Role of rhizobacteria and arbuscular mycorrhizal fungi in increasing photosynthesis process and sugar production of sweet sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) Bedah RUPAEDAH; Iswandi ANAS; Dwi Andreas SANTOSA; Wahono SUMARYONO; Sri Wilarso BUDI
Menara Perkebunan Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v83i1.13

Abstract

AbstractDual inoculation effects of rhizobacteria andAMF as well as the addition of chemical fertilizerson photosynthesis were studied by analyzingprocess of CO2 gas exchange, chlorophyll content,nutrient uptake, sugar content and growth of sweetsorghum. AMF inoculation as a single cultureincreased carbon assimilation, stomatal conductance,intercellular CO2 concentration, phosphoruscontent, chlorophyll content, sugar content, plantheight, shoot weight and mycorrhizal colonization.Interaction of AMF and rhizobacteria increasedsugar content of sweet sorghum stems andpotassium content of sweet sorghum leaves,whereas its interaction with chemical fertilizerssignificantly increased chlorophyll content, sugarcontent and mycorrhizal colonization of sorghumplant roots. Interaction of AMF, rhizobacteria andchemical fertilizers increased sugar content, rootweight and mycorrhizal colonization. The use ofAMF solely or its interaction with rhizobacteriaand chemical fertilizers had a great potential inimproving photosynthesis process of sweetsorghum. The process is associated with increasingcrop productivity, such as sugar content ofsorghum which is potential as a source ofrenewable energy.AbstrakPengaruh inokulasi ganda rizobakteri danFMA dengan penambahan pupuk kimia dipelajaridengan cara menganalisis proses pertukaran gas CO2, kandungan klorofil, kandungan hara dan gula,pertumbuhan dan produktivitas sorgum manis.Inokulasi FMA sebagai kultur tunggal dapatmeningkatkan asimilasi karbon, konduktansistomata, konsentrasi CO2 interselular, kandunganfosfor, kandungan klorofil, kandungan gula, tinggitanaman, berat batang dan derajat kolonisasimikoriza. Interaksi antara rizobakteri dan FMAdapat meningkatkan kandungan gula batang dankalium daun sorgum manis, sedangkan interaksinyadengan pupuk kimia dapat meningkatkan kandunganklorofil dan gula serta derajat kolonisasimikoriza pada perakaran sorgum manis. Sementaraitu, interaksi FMA, rizobakteri dan pupuk kimiadapat meningkatkan kandungan gula batang, beratakar dan derajat kolonisasi mikoriza pada perakaransorgum manis. Penggunaan FMA baik sendirimaupun interaksinya dengan rizobakteri dan pupukkimia memiliki potensi besar dalam meningkatkanproses fotosintesis sorgum manis. Proses tersebutberkaitan dengan peningkatan produktivitas sorgummanis dalam hal ini kandungan gula sorgum manisyang berpotensi sebagai sumber energi terbarukan.
Kemampuan jamur pelapuk kayu isolat JPA dan Trichoderma Sp. S2-2 dalam mendegradasi tandan kosong kelapa sawit untuk menghasilkan selulosa The capability of wood rot fungus JPA isolate and Trichoderma sp. S2-2 in degradation of oil palm empty fruit bunches to produce cellulose . ALHIDAYATULLAH; Lisdar I SUDIRMAN1; Okky Setyawati DHARMAPUTRA
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i2.17

Abstract

Abstract  Oil palm empty fruit bunches (OPEFB) are the ligno-cellulosic wastes from palm oil processing. They can be used to produce raw materials for value-added products. The purpose of this study was to determine the degradation capacity of JPA wood rot fungi and Trichoderma sp. S2-2 on OPEFB. The 500 g of substrates consisted of 81% of OPEFB, 15% bran, 1.5% lime and 1.5% gypsum were used for growing. The substrates were inoculated with five treatments i.e without isolate (K); with JPA isolate (JPA); with Trichoderma sp. S2-2 (T); with the two isolates (JPA + T); and with JPA isolate and after four weeks of incubation inoculated with Trichoderma sp. S2-2 [(JPA)+T]. All treatments were incubated for eight weeks. The results showed that JPA+T was the best treatment which the two isolates must be inoculated simultaneously for degradation of OPEFB. Lignin and cellulose content on JPA+T treatment respectively were 20.83% and 33.77%. C/N ratio of OPEFB degraded with JPA+T was lower than the C/N ratio of TKKS degraded with Trichoderma harzianum and TKKS degraded with EM4 in previous study. AbstrakTandan kosong kelapa sawit (TKKS) merupakan limbah lignoselulosa dari pengolahan minyak kelapa sawit. TKKS dapat dimanfaatkan untuk memperoleh bahan baku untuk produk bernilai tambah. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui kemampuan degradasi jamur pelapuk kayu isolat JPA dan Trichoderma sp. S2-2 pada TKKS. Sebanyak 500 g substrat terdiri dari 81% TKKS, 15% dedak, 1,5% kapur, dan 1,5% gypsum digunakan untuk per-tumbuhan. Substrat diinokulasi dengan lima perlakuan yaitu tanpa isolat (K); dengan isolat JPA (JPA); dengan Trichoderma sp. S2-2 (T); dengan isolat JPA dan setelah empat minggu inkubasi, diinokulasi dengan Trichoderma sp. S2-2 [(JPA+T)]. Semua perlakuan diinkubasi selama delapan minggu. Hasil percobaan menunjukkan bahwa perlakuan JPA+T adalah perlakuan terbaik yaitu kedua isolat tesebut harus diinokulasi secara bersamaan untuk mendegradasi TKKS. Kandungan lignin dan selulosa TKKS dengan  perlakuan  JPA+T   masing-masing  adalah  20,83% dan 33,77%. Rasio C/N TKKS hasil degradasi dengan JPA+T lebih  rendah  daripada  rasio C/N pada TKKS yang didegradasi dengan Trichoderma harzianum dan TKKS yang didegradasi dengan EM4 pada penelitian sebelumnya.
Karakterisasi PHA yang dihasilkan oleh Pseudomonas aeruginosa dan Bacillus subtilis yang ditumbuhkan dalam media limbah cair pabrik kelapa sawit Characterization of PHA produced by Pseudomonas aeruginosa and Bacillus subtilis inoculated in palm oil mill effluent (POME) media Irma KRESNAWATY; Agustin Sri MULYATNI; Deden Dewantara ERIS; Haryo Tejo PRAKOSO
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i2.20

Abstract

AbstractThe difficulties in processing of petroleum-based plastic waste had encouraged the development of biodegradable plastics polyhydroxyalkanoate (PHA). Researchers isolated the PHA-producing microorganisms from various sources to obtain new species with high PHA production capability. In addition, the high cost of PHA production might be overcome by using carbon-rich waste, such as palm oil mill effluent (POME). This research conducted characterization of produced PHA and optimization of PHA production in POME. In previous research, three potential isolates were obtained, which are one Pseudomonas aeruginosa isolate and two Bacillus subtilis isolates. Analysis of Scanning Electron Microscopy (SEM) and Transmission Electron Microscopy (TEM) showed the presence of PHA accumu-lation within the bacterial cell. The results of Spectra of Fourier Transform Infra Red Spectroscopy (FT-IR) revealed differences in C-C and C-H alipathic regions of PHA produced by Pseudomonas aeruginosa and Bacillus subtilis. Optimum production of PHA was obtained using POME at concentration of 50-25% during 6 days of incubation time in an enriched media pretreatment.Abstrak Sulitnya pengolahan limbah plastik berbasis minyak bumi mendorong pengembangan plastik biodegradable poli-hidroksialkanoat (PHA). Beberapa peneliti mengisolasi mikroorganisme penghasil  PHA dari berbagai sumber karena diharapkan akan diperoleh spesies baru dengan kemampuan produksi PHA yang tinggi. Selain itu kendala tingginya biaya produksi PHA dapat diatasi dengan peman-faatan limbah yang kaya akan  karbon, seperti limbah cair pabrik kelapa sawit (LCPKS). Pada penelitian ini dilakukan karakterisasi PHA yang dihasilkan dan optimasi produksi PHA pada LCPKS. Pada penelitian sebelumnya telah diperoleh  tiga isolat potensial, yaitu : satu isolat  Pseudo-monas aeruginosa dan dua isolat  Bacillus subtilis.  Analisis Scanning Electron Microscopy (SEM) dan Transmission Electon Microscopy (TEM) menunjukkan adanya akumulasi PHA di dalam sel bakteri. Dari hasil analisis FT-IR disimpulkan bahwa senyawa PHA yang dihasilkan Pseudo-monas aeruginosa  berbeda dengan  Bacillus subtilisyang ditandai   perbedaan   pada  spectra   gugus  C-C  dan   C-H alifatik.  Produksi optimum PHA diperoleh pada konsentrasi LCPKS 50-25%, waktu inkubasi  enam hari dan optima-lisasi pertumbuhan pada media kaya di awal untuk mening-katkan populasi mikroba.
Identifikasi dan pencegahan kontaminasi pada kultur cair sistem perendaman sesaat Identification and prevention of contamination in liquid culture of temporary immersion system Masna Maya SINTA; Imron RIYADI; . SUMARYONO
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i2.21

Abstract

AbstractLiquid culture is commonly used to scale up in vitro culture production as well as to optimize the developmental phase of plant in vitro culture. One of the liquid cultures that has been used widely is temporary immersion system (TIS). The main problem of liquid culture is contamination. The use of antibiotics sometimes controls the contaminants less effectively and hinders the growth of plant culture. The purpose of this research was to determine sources of contaminant on whole sequence of TIS to identify and to prevent the emergence of the contaminants. Sampling method was applied to each section and stage of TIS culture and the contaminants found were identified. The results revealed that compartment of TIS was the main source of contaminant (100%). Furthermore, from all components of TIS compartment, washer (a small ring seal connecting screen disc and basket) was the main source of TIS contaminant (41.2%). Four contaminants found were identified as Bacillus macerans, Bacillus megaterium, Bacillus sphaericus and Bacillus firmus. Two times sterilization of washer in an autoclave at temperature of 121 oC and air pressure of 1 kg/cm2 for 20 minutes before and after being installed reduced the contamination level on TIS culture significantly.AbstrakKultur cair umumnya digunakan untuk meningkatkan skala produksi dan mengoptimalkan fase perkembangan kultur in vitro tanaman. Salah satu jenis kultur cair yang banyak digunakan adalah sistem perendaman sesaat (SPS). Masalah utama dalam kultur cair adalah kontaminasi. Penggunaan antibiotika terkadang kurang efektif dalam me-ngendalikan kontaminan dan menghambat pertumbuhan kultur tanaman. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui sumber kontaminan pada seluruh rangkaian kultur SPS serta mengidentifikasi dan mencegah munculnya kontaminan tersebut. Metode yang digunakan adalah  pengambilan contoh pada tiap bagian dan fase kultur SPS, serta kontaminan yang ditemukan kemudian diidentifikasi. Hasil penelitian memperlihatkan bahwa kompartemen SPS merupakan sumber utama kontaminan (100%). Selanjutnya, dari seluruh komponen kompartemen SPS, washer (cincin penutup yang menghubungkan penyaring dan keranjang) di dalam rangkaian SPS merupakan sumber utama kontaminan (41,2%).  Empat  kontaminan yang ditemukan diidentifikasi sebagai Bacillus macerans, Bacillus megaterium, Bacillus sphaericus dan Bacillus firmus. Sterilisasi cincin penutup sebanyak  dua  kali  dalam  autoklaf pada suhu 121 oC dan tekanan udara 1 kg/cm2selama 20 menit sebelum dan sesudah dirangkai secara nyata menurunkan tingkat konta-minasi pada kultur SPS. 
Respons molekuler Hevea brasiliensis ethylene response factors (HbERFs) sebagai marka ekspresi gen terhadap stimulasi ethephon pada klon-klon tanaman karet Moleculer response of Hevea brasiliensis ethylene response factors (HbERFs) as expression marker genes in response to ethephon stimulation in rubber tree clones Riza Arief PUTRANTO; . KUSWANHADI; Pascal MONTORO
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i2.22

Abstract

Abstract Real-Time quantitative RT-PCR technique is a sensitive method for measuring the accumulation of gene transcripts. This widely used technique in a variety of plant species; including rubber tree (Hevea brasiliensis) must meet basic criteria in order to produce accurate gene expression markers. Gene expression markers associated to the response of ethephon stimulation such as the Hevea brasiliensis Ethylene Response Factors (HbERFs) family has been characterized in a single rubber clone. It is known that the effect of genotype on rubber tree clones can give different expression of the same gene. This difference can be converted into a profile that characterizes clones to a certain trait. This study aimed to identify gene expression profile in response to ethephon stimulation using six HbERFs (HbORA47, HbRAP2.3, HbERF12, HbERF3, HbABR1, HbRRTF1) in three rubber tree clones having contrasted latex metabolism (PB 260, SP 217, and RRIM 600). Total RNA was isolated from 18 samples and used for cDNA synthesis. The quality of cDNAs was examined by PCR using HbActin primer. HbRH2b was selected among the 11 housekeeping genes to be used as an internal control in gene expression analysis. Gene expression analysis resulted to an induction and inhibition of  HbERFs by ethephon stimulation which are specific to a particular clone. Expression profile of three Hevea clones showed distinct characteristics. The high latex metabolism clone PB 260 was characterized by the upregulated expression of  HbRAP2.3 and HbERF12. The low latex metabolism clone SP 217 was characterized by the upregulated expression of HbRAP2.3 and HbRRTF1. Meanwhile, the profile of intermediate latex metabolism clone RRIM 600 was shown by downregulated expression of HbORA47 and up-regulated expression of HbABR1. This study shows that HbERFs gene family is an important expression marker because it can inform physiological conditions of rubber clones associated in response to ethephon. AbstrakTeknik Real-Time quantitative RT-PCR merupakan metode sensitif untuk mengukur akumulasi transkrip dari gen. Teknik yang telah banyak digunakan pada berbagai spesies tanaman, termasuk tanaman karet (Hevea brasiliensis) ini harus memenuhi kriteria dasar agar meng-hasilkan marka ekspresi gen yang akurat. Beberapa marka ekspresi gen terkait respons terhadap stimulasi ethephon seperti famili gen Hevea brasiliensis Ethylene Response Factors (HbERFs) telah dikarakterisasi pada satu klon tanaman karet. Sebagaimana diketahui, efek genotip pada klon tanaman karet dapat memberikan ekspresi yang berbeda dari gen yang sama. Perbedaan ekspresi tersebut dapat dikonversi menjadi sebuah profil yang menjadi karakteristik klon karet terhadap perlakuan tertentu. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil ekspresi gen HbERFs pada tiga klon tanaman karet (PB 260, SP 217, dan RRIM 600) yang memiliki metabolisme lateks yang berbeda terhadap respons stimulasi ethephon dengan menggunakan enam gen HbERFs (HbORA47, HbRAP2.3, HbERF12, HbERF3, HbABR1, HbRRTF1). RNA total diisolasi dari 18 sampel dan digunakan untuk sintesis cDNA. Kualitas cDNA diperiksa dengan PCR menggunakan primer HbActin. Gen HbRH2b terseleksi diantara 11 gen housekeeping digunakan sebagai kontrol internal pada analisis ekspresi gen. Hasil dari analisis ekspresi gen menunjukkan bahwa stimulasi ethephon memiliki efek induksi dan inhibisi gen yang spesifik untuk klon tertentu. Profil ekspresi dari tiga klon tanaman karet yang diuji memperlihatkan perbedaan karakteristik. Klon metabolisme tinggi PB 260 ditunjukkan dengan ekspresi positif dari gen HbRAP2.3 dan HbERF12. Klon meta-bolisme rendah SP 217 ditunjukkan oleh ekspresi positif gen HbRAP2.3 dan HbRRTF1. Sedangkan klon metabo-lisme intermedier RRIM 600 memiliki profil ekspresi negatif dari HbORA47 dan ekspresi positif dari HbABR1. Penelitian ini memperlihatkan bahwa famili gen HbERFs merupakan marka ekspresi yang penting karena dapat menginformasikan kondisi fisiologis klon tanaman karet terkait respons terhadap ethephon.
Evaluasi 18 primer SSR untuk pengembangan sidikjari DNA tanaman karet (Hevea brasiliensis Muell. Arg.) Evaluation of 18 SSR primers to develop DNA fingerprint of rubber tree (Hevea brasiliensis Muell. Arg.) Asmini BUDIANI; Sekar WOELAN; Hayati MINARSIH; . NUHAIMI-HARIS; Riza Arief PUTRANTO
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i2.23

Abstract

Abstract Breeding program of rubber tree to produce elite clones is hampered by the length of selection cycles. On the other hand, attempts to increase production by extensification of the plantation area is also facing a problem from the availability of the rootstock, causing the occurence of fake clones without any information of their origin. Therefore, the availability of molecular markers to be used as DNA fingerprint of rubber tree clones is needed. This will help the breeder to shorten the length of selection program and to identify the purity of the clone. This research was aimed to evaluate 18 SSR primer pairs that had been published to identify 17 rubber clones. Pure genomic DNAs were isolated from 17 clones, followed by experiment to optimize annealing tempe-rature for each primer to obtain the best amplification product. Initially, the PCR product was run in both the agarose and polyacrylamide gels. However, the analysis of all PCR products were then conducted on SDS polyacrylamide gel, since this gel can separate DNA fragments with only a few bases differences. The results showed that 14 clones have been identified specifically using 11 primers. Four out of 18 primer pairs used could identify 12 rubber tree clones, which are PR 107, PR 261, SP 217, PB 330, PB 340, IRR 5, IRR 112, IRR 118, IRR 220, GT 1, BPM 101 and RRIM 712. Each clone can be distinguished from each other using only one primer pair. Identification of the other tree clones (PB 5/51, PB 260, and RRIC 110) has to be conducted by combining the several PCR products using different primer pairs. Although these results showed that SSR markers had high potential to be used as DNA fingerprint on rubber tree clones, the set of the primer pairs should be tested among other clones, as well as other SSR primers should be tested to identify the clones which could not be identified using the 18 primer pairs in this experiment.Abstrak Pemuliaan tanaman karet untuk menghasilkan klon-klon unggul baru menghadapi masalah lamanya siklus seleksi. Di sisi lain, upaya peningkatan produksi melalui pembukaan lahan baru, juga terkendala oleh ketersediaan bibit, yang memicu beredarnya bibit palsu, yang umumnya tidak jelas asal usulnya. Oleh karena itu, diperlukan ketersediaan marka yang dapat digunakan sebagai sidikjari DNA bagi klon-klon tanaman karet yang ada, sehingga dapat membantu mempercepat proses seleksi dan mengetahui kemurnian bibit. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi 18 primer SSR yang telah dipublikasikan untuk mengidentifikasi 17 klon karet. DNA yang murni diisolasi dari 17 klon, kemudian dilakukan optimasi suhu annealing untuk setiap jenis primer agar diperoleh hasil amplifikasi terbaik.  Pada awal percobaan hasil PCR dicek pada gel agarosa dan gel poliakrilamida, namun analisis untuk seluruh hasil PCR dilakukan pada gel SDS poliakrilamid, karena gel ini secara nyata dapat memisahkan fragmen DNA yang hanya berbeda beberapa basa. Hasil percobaan menunjukkan bahwa 14 klon dapat diidentifikasi secara spesifik menggunakan 11 primer. Empat dari 18 pasang primer yang diuji dapat mengidentifikasi 12 klon yang dianalisis, yaitu PR 107, PR 261, SP 217, PB 330, PB 340,. IRR 5, IRR 112, IRR 118, IRR 220, GT 1, BPM 101 dan RRIM 712. Masing-maing klon tersebut dapat dibedakan dari klon lainnya hanya dengan menggunakan satu jenis primer. Sedangkan identifikasi tiga klon lainnya (PB 5/51, PB 260, dan RRIC110) harus dilakukan dengan menggabungkan hasil PCR menggunakan beberapa primer. Meskipun hasil percobaan ini menunjukkan bahwa marka SSR sangat berpotensi untuk digunakan sebagai sidikjari DNA klon-klon karet, namun primer yang sama perlu diuji untuk klon-klon lainnya. Demikian pula primer lain perlu diuji untuk mengidentifikasi klon-klon yang belum teridentifikasi menggunakan 18 primer dalam penelitian ini.
Penilaian mutu tanah secara cepat berdasarkan faktor penentu aktivitas biologinya Rapid assessment of soil quality as based on its biology activity determining factors Didiek Hadjar GOENADI
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i2.24

Abstract

Abstract  Agricultural practices are still heavily dependent on the use those socalled marginally-suitable soils with low soil fertility level.  On the other hand, fertilization has been long known offering fertility solution, but it is indicative that its efficiency is low without soil amelioration.  The conditions have been intensified by climatic change phenomena particularly increased atmospheric CO2 concentration which widely affects the soilbiological activity and crop performance as well.  This review tries to discuss a thought to find the right method to assist management in determining the right solution for the problems encountered in the field based on soil and plant indicators.  The method should be simple, fast, and reliable to express close relationship between soil characteristics and plant performance.  The indicators should be those of very important soil characteristics determining soil biological activities as a measure for its fertility.  Moreover, the indicators used must have highly sensitive to climatic change, anthropogenic activities, and their impacts on soil biological activity are significant. Soil organic matter (chemistry), bulk density, soil texture, and infiltration rate(physics), and worm population and soil respiration (biology) are main characters related to whole soil pro-ductivity. In addition, chlorophyll content and root density are the most potentiallyrelated indicators to crop performanceAbstrakKegiatan pertanian masih banyak tergantung pada pe-manfaatan tanah-tanah sub-optimal yang memiliki hambatan berupa rendahnya kesuburan tanah.  Di sisi lain, pemupukan telah menawarkan solusi untuk mengatasinya, tetapi pada tanah-tanah seperti itu tidak akan banyak manfaatnya jika kemampuan tanah tidak diperbaiki. Kondisi ini diperparah dengan fenomena perubahan iklim, khususnya peningkatan kadar CO2 atmosfir yang berpengaruh luas terhadap aktivitas biologi tanah dan kinerja tanaman. Tulisan ini mengulas tentang perlunya perangkat pengambilan keputusan di lapangan untuk memilih solusi praktis yang tepat untuk me-nyelesaikan hambatan pertumbuhan dan/atau produksi tanaman  dengan   memanfaatkan  indikator   tanah     dan/atau tanaman secara tepat. Metode yang dikembangkan adalah berdasarkan teknik penetapan yang mudah, cepat, dan cukup akurat dalam menggambarkan hubungan antara indikator terpilih dan kinerja tanaman.  Indikator yang dimaksud adalah sifat tanah yang paling penting dalam menentukan aktivitas biologi di dalam tanah sebagai penanda dari kesuburan-nya.Selain itu, indikator yang digunakan harus cukup peka dalam menanggapi perubahan iklim dan perlakuan budidaya dan pengaruhnya nyata terhadap aktivitas biologi di dalam tanah.  Kadar bahan organik tanah (kimia), bobot isi, tekstur tanah, dan laju infiltrasi (fisik), dan populasi cacing dan respirasi tanah (biologi) merupakan faktor tanah yang secara praktis mewakili daya dukung tanah secara keseluruhan.  Di sisi lain, indikator tanaman yang diperkirakan memiliki hubungan erat dengan pertumbuhan dan produktivitas adalah kadar khlorofil daun dan kerapatan akar.
Produksi Spirulina platensis dalam fotobioreaktor kontinyu menggunakan media limbah cair pabrik kelapa sawit Production of Spirulina platensis in continous photobioreactor using palm oil mill effluent media . SUHARYANTO; . TRI-PANJI; Shinta PERMATASARI; Khaswar SYAMSU
Menara Perkebunan Vol. 82 No. 1: 82 (1), 2014
Publisher : INDONESIAN OIL PALM RESEARCH INSTITUTE

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22302/iribb.jur.mp.v82i1.25

Abstract

AbstractCultivation of Spirulina platensis in an abundant available and inexpensive medium such as palm oil mill effluent (POME) will produce biomass and valuable active materials at competitive price.  Utilization of POME  will also reduce pollution level and support cleaned production.  The objectives of this research were to determine the dilution rate of  S. platensis and the reduction rate of pollution level of POME on continuous photobioreactor. Preliminary research was conducted by growing S. platensis on POME medium with various concentration, namely 25%, 50%, 75%, and 90% POME on batch system. The experiment was conducted in 1.2 L capacity continous photobioreactor using medium containing a mixture of POME and synthetic medium. Feeding rate was set up at 0.05 mL/5 sec. (dilution rate of  0.03 hr -1), 0,05 mL/10 sec. (dilution rate of  0.015 hr -1), and 0.05 mL/15 sec. (dilution rate of 0.01 hr -1). For optimum dilution rate, the experiment was scaled up eight times using 10 L capacity continous photobioreactor. The results showed that optimum growth rate of S. platensis (µmax) = 0.233, was achieved using medium consisting of 90% POME and 10% synthetic medium after two weeks. Dilution rate of 0.015 hr -1 on photobioreactor was the optimum dilution rate for growth of S. platensis as well as for decreasing polution level of POME. The result of the eight-times scale up photobioreactor using flow rate of 0.4 mL/10 sec and dilution rate of 0.015 hr -1 showed that the growth of S. platensis was relatively constant as reflected by the OD value of the suspension culture and the concentration of cellular biomass. At the optimum condition, production of S. platensis biomass was 0.267g/L and pollution level was decrease 24%. The rate of outflow also resulted the constant decrease of polution level based on total carbon (TC), total dissolve solid (TDS), dissolve oxygen (DO), BOD, and COD parameters indicating that  continuous photobioreactor was running at steady state.Abstrak Kultivasi S. platensis dalam media yang tersedia me-limpah dan murah seperti limbah cair pabrik kelapa sawit (LC-PKS) akan menghasilkan biomassa dan bahan aktif bernilai ekonomi tinggi dengan harga kompetitif. Pemanfaatan  LC-PKS  juga  akan  mengurangi  dampak pen-cemaran lingkungan dan membantu menciptakan sistem produksi bersih. Penelitian ini bertujuan menetapkan laju dilusi optimum per-tumbuhan S. platensis dan laju penurunan tingkat cemaran LC-PKS pada fotobioreaktor sistem kontinyu. Untuk mengukur laju alir sistem kontinyu, pertama S. platensis ditumbuhkan pada media LC-PKS 25%, 50%, 75%, dan 90% dengan sistem batch.  Pertum-buhan S. platensis  pada fotobioreaktor sistem kontinyu kapasitas 1,2 L dirancang dengan variasi laju alir umpan berupa LC-PKS yang dicampur media sintetik pada konsentrasi optimum. Variasi laju alir pengumpanan diatur pada variasi 0.05 mL/5 detik (laju dilusi 0,03 jam-1), 0,05 mL /10 detik (laju dilusi 0,015 jam -1), dan 0,05 mL/15 detik (laju dilusi 0,01 jam-1). Pada laju alir optimum, skala percobaan diperbesar delapan kali menggunakan foto-bioreaktor berkapasitas 10 L. Hasil penelitian menunjukkan bahwa laju pertumbuhan maksimum (µ maks) adalah 0,233 jam-1 yang diperoleh dengan campuran media LC-PKS 90% dan media sintetik 10%  selama dua minggu. Fotobioreaktor dengan laju dilusi 0,015 jam-1 merupakan laju alir umpan yang optimum untuk pertumbuhan S. platensis serta menghasilkan penurunan tingkat cemaran LC-PKS yang optimum.  Hasil penelitian dengan perbesaran skala delapan kali menggunakan laju alir pengumpan 0,4 mL/10 detik  (laju dilusi 0,015 jam-1)  menunjukkan bahwa pertumbuhan S. platensis relatif konstan. Produksi biomassa sel rata-rata sebesar 0,267g/L dan kadar cemaran limbah rata-rata menurun sebesar 24%. Laju alir keluar (outflow) juga menghasilkan kadar cemaran limbah yang konstan ber-dasarkan parameter total karbon (TC), total dissolve solid (TDS), dissolve oxygen (DO), BOD, dan COD yang menunjukkan bahwa sistem fotobioreaktor kontinyu ini berjalan dengan baik.

Page 34 of 55 | Total Record : 541

 32   33   34   35   36 

Filter by Year

2000 2025


Reset
Filter By Issues
All Issue Vol. 93 No. 1 (2025): 93(1), 2025 Vol. 92 No. 2 (2024): 92(2), 2024 Vol. 92 No. 1 (2024): 92(1), 2024 Vol. 91 No. 2 (2023): 91 (2), 2023 Vol. 91 No. 1 (2023): 91 (1), 2023 Vol. 90 No. 2 (2022): 90 (2), 2022 Vol. 90 No. 1 (2022): 90 (1), 2022 Vol. 90 No. 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 2 (2022): Oktober, 2022 Vol 90, No 1 (2022): April, 2022 Vol. 89 No. 2 (2021): 89 (2), 2021 Vol. 89 No. 1 (2021): 89 (1), 2021 Vol 89, No 2 (2021): Oktober, 2021 Vol 89, No 1 (2021): April, 2021 Vol. 88 No. 2 (2020): 88 (2), 2020 Vol. 88 No. 1 (2020): 88 (1), 2020 Vol 88, No 2 (2020): Oktober,2020 Vol 88, No 1 (2020): April, 2020 Vol. 87 No. 2 (2019): 87 (2), 2019 Vol. 87 No. 1 (2019): 87 (1), 2019 Vol 87, No 2 (2019): OKTOBER, 2019 Vol 87, No 1 (2019): April, 2019 Vol. 86 No. 2 (2018): 86 (2), 2018 Vol. 86 No. 1 (2018): 86 (1), 2018 Vol 86, No 2 (2018): Oktober 2018 Vol 86, No 1 (2018): April, 2018 Vol. 85 No. 2 (2017): 85 (2), 2017 Vol. 85 No. 1 (2017): 85 (1), 2017 Vol 85, No 2 (2017): Oktober 2017 Vol 85, No 1 (2017): April, 2017 Vol. 84 No. 2 (2016): 84 (2), 2016 Vol. 84 No. 1 (2016): 84 (1), 2016 Vol 84, No 2 (2016): Desember 2016 Vol 84, No 1: Oktober 2016 Vol. 83 No. 2: 83 (2), 2015 Vol. 83 No. 1: 83 (1), 2015 Vol 83, No 2: Desember 2015 Vol 83, No 1: Juni 2015 Vol. 82 No. 2: 82 (2), 2014 Vol. 82 No. 1: 82 (1), 2014 Vol 82, No 2: Desember 2014 Vol 82, No 1: Juni 2014 Vol. 81 No. 2: 81 (2), 2013 Vol. 81 No. 1: 81 (1), 2013 Vol 81, No 2: Desember 2013 Vol 81, No 1: Juni 2013 Vol. 80 No. 2: 80 (2), 2012 Vol. 80 No. 1: 80 (1), 2012 Vol 80, No 2: Desember 2012 Vol 80, No 1: Juni 2012 Vol. 79 No. 2: 79 (2), 2011 Vol. 79 No. 1: 79 (1), 2011 Vol 79, No 2: Desember 2011 Vol 79, No 1: Juni 2011 Vol. 78 No. 2: 78 (2), 2010 Vol. 78 No. 1: 78 (1), 2010 Vol 78, No 2: Desember 2010 Vol 78, No 1: Juni 2010 Vol. 77 No. 2: 77 (2), 2009 Vol. 77 No. 1: 77 (1), 2009 Vol 77, No 2: Desember 2009 Vol 77, No 1: Juni 2009 Vol. 76 No. 2: 76 (2), 2008 Vol. 76 No. 1: 76 (1), 2008 Vol 76, No 2: Desember 2008 Vol 76, No 1: Juni 2008 Vol. 75 No. 2: 75 (2), 2007 Vol. 75 No. 1: 75 (1), 2007 Vol 75, No 2: Desember 2007 Vol 75, No 1: Juni 2007 Vol. 74 No. 2: 74 (2), 2006 Vol. 74 No. 1: 74 (1), 2006 Vol 74, No 2: Desember 2006 Vol 74, No 1: Juni 2006 Vol. 73 No. 2: 73 (2), 2005 Vol. 73 No. 1: 73 (1), 2005 Vol 73, No 2: Desember 2005 Vol 73, No 1: Juni 2005 Vol. 72 No. 2: 72 (2), 2004 Vol. 72 No. 1: 72 (1), 2004 Vol 72, No 2: Desember 2004 Vol 72, No 1: Juni 2004 Vol. 71 No. 2: 71 (2), 2003 Vol. 71 No. 1: 71 (1), 2003 Vol 71, No 2: Desember 2003 Vol 71, No 1: Juni 2003 Vol. 70 No. 2: 70 (2), 2002 Vol. 70 No. 1: 70 (1), 2002 Vol 70, No 2: Desember 2002 Vol 70, No 1: Juni 2002 Vol. 69 No. 2: 69 (2), 2001 Vol. 69 No. 1: 69 (1), 2001 Vol 69, No 2: Desember 2001 Vol 69, No 1: Juni 2001 Vol. 68 No. 2: 68 (2), 2000 Vol. 68 No. 1: 68(1), 2000 Vol 68, No 2: Desember 2000 Vol 68, No 1: Juni 2000 More Issue