Claim Missing Document
Check
Articles

PENINGKATAN AKTIVITAS SELULASE PADA TANAH HUTAN MANGROVE PANTAI SUWUNG BALI DENGAN PENGAYAAN SUBTRAT SELULOSA JANUR KELAPA (Cocos nucifera) Ika Kurniawati; I Nengah Wirajana; I Gede Mahardika
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 7, No. 1 Januari 2013
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (113.45 KB) | DOI: 10.24843/JCHEM.2013.v07.i01.p10

Abstract

The aim of this study is to determine the effect of coconut (Cocos nucifera) leaf enrichment to soil of mangrove forest of Bali Suwung coastal on the cellulase activity. The measurement of cellulase activity was conducted by CMC method (Carboxymethyl Cellulose Assay) on soil sample with and without enrichment of coconut leaf substrate in incubation time of 1, 2, 3, and 4 weeks. The results showed that the enrichment increased cellulase activity. In addition, cellulase activited the soil samples, increase with incubation times.  
PERBANDINGAN KUALITAS DNA DENGAN MENGGUNAKAN METODE BOOM ORIGINAL DAN BOOM MODIFIKASI PADA ISOLAT Mycobacterium tuberculosis 151 Dewi Andayani Farmawati; I Nengah Wirajana; Sagung Chandra Yowani
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 9, no. 1 Januari 2015
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (66.834 KB) | DOI: 10.24843/JCHEM.2015.v09.i01.p07

Abstract

Tuberculosis (TB) is a disease caused by the Mycobacterium tuberculosis. Isolation  DNA is a necessary step to obtain the bacterial chromosomal DNA used in the Polymerase Chain Reaction (PCR). Boom isolation method is an isolation method commonly used in isolation DNA of M. tuberculosis. In Bali, the isolation DNA of M. tuberculosis conducted at the Laboratory of Biomolecular FK UNUD uses boom modification method. This research aims to compare the quality of DNA produced by the Boom methods and Boom modification methods. This research was started with the isolation process using Boom method and Boom modification  and subsequently amplified by PCR. Detection of PCR products was performed with electrophoresis method. DNA quality was determined by the thickness of bands DNA PCR product and purity analysis by spectrophotometry UV-Vis. The results obtained show that the quality of DNA Mycobacterium tuberculosis 151  isolate using Boom modification method (Laboratory of Biomolecular FK UNUD) is relatively better than Boom original methods (Boom et al, 1990).
PENGARUH PENAMBAHAN SUSU SKIM TERHADAP HASIL DNA METAGENOMIK DIISOLASI DARI TANAH HUTAN MANGROVE Ni Putu Frida Oktaningtias Widiarthi; Ketut Ratnayani; I Nengah Wirajana
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 8, No. 1 Januari 2014
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (125.962 KB) | DOI: 10.24843/JCHEM.2014.v08.i01.p03

Abstract

Cell lysis is the most important step for quality and quantity of metagenomic DNA isolated from an environmental samples. The aim of the research was to compare the quality (integrity and purity) of the metagenomic DNA isolated using the direct cell lysis method from mangrove forest soil with and without skim milk. The total of metagenomic DNA isolated from mangrove forest soil result was analyzed by the spectrophotometric UV-Vis method at ? 230, 260, and 280 nm; and also by using the agarose gel electrophoresis. The results showed that metagenomic DNA can be isolated from mangrove forest soil. The agarose gel electrophoresis results showed that the total DNA quality obtained by the direct cell lysis using buffer lysis with skim milk was relatively less fragmented and the band intensity of DNA was higher compared with direct cell lysis using buffer lysis without skim milk. The results of spectrophotometry indicated that the purity of DNA isolated with and without skim milk was not significantly different against the humic acid (ratio on A260/230). As shown by the A260/280 ratio, the total DNA isolated without skim milk had higher purity level than with skim milk.
AKTIVITAS EFFECTIVE MICROORGANISMS (EM) DALAM TANAH PERTANIAN ORGANIK YANG TERPAPAR KLORPIRIFOS D. Rizkiyanti; I N. Wirajana; I W. B. Suyasa
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 14, No. 2 Juli 2020
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24843/JCHEM.2020.v14.i02.p04

Abstract

Salah satu cara untuk mengembalikan kesuburan tanah yang terpapar pestisida, seperti klorpirifos adalah dengan bioremediasi menggunakan Effective Microorganisms (EM). Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui ketahanan mikroba EM dan aktivitas enzim pendegradasi klorpirifos dalam sampel tanah pertanian organik.Tanah pertanian organik yang digunakan sebelumnya telah terpaparEM dalam jangka waktu yang lama. Sampel tanah ini dibagi menjadi dua perlakuan, yaitu disterilkan dengan autoklaf dan tidak disterilkan (agar mikroba indigenous tetap hidup). Kedua sampel tanah ini selanjutnya ada yang tidak dan ditambahkan EM dengan waktu inkubasi 3, 5, dan 7 hari. Mikroba EM dapat bertahan terhadap paparan klorpirifos sampai konsentrasi 56 ppm. Fenomena aktivitas enzim pendegradasi klorpirifos sebesar 0,017 U/mL selama waktu inkubasi 7 hari dengan penurunan kadar klorpirifos sebesar 16,65% ditemukan pada sampel tanah steril dengan penambahan EM. Aktivitas enzim pendegradasi klorpirofos tertinggi, yaitu sebesar 0,039 U/mL selama waktu inkubasi 3 hari, dengan penurunan kadar klorpirifos sebesar 74,11% ditemukan pada sampel tanah tidak steril. Penurunan kadar klorpirifos tertinggi terdapat pada sampel tanah tidak steril sebesar 80,04% dengan waktu inkubasi 5 hari. Kata Kunci: klorpirifos, bioremediasi, mikroba EM (Effective Microorganisms)
PERBANDINGAN METODE UJI GULA PEREDUKSI DALAM PENENTUAN AKTIVITAS ?-L-ARABINOFURANOSIDASE DENGAN SUBSTRAT JANUR KELAPA (COCOS NUCIFERA) Y. H. Pratiwi; O. Ratnayani; I N. Wirajana
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol.12 No.2 Juli 2018
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (262.228 KB) | DOI: 10.24843/JCHEM.2018.v12.i02.p07

Abstract

Pengujian gula pereduksi umumnya dilakukan dengan reagen asam 2,3-dinitrosalisilat (DNS) dan Nelson-Somogyi (NS) dalam penentuan aktivitas enzim pendegradasi polisakarida. Tujuan penelitian ini adalah untuk membandingkan metode uji gula pereduksi DNS dan NS dalam penentuan aktivitas ?-L-Arabinofuranosidase (AbfA) termostabil, dengan substrat janur kelapa (Cocos nucifera). Enzim AbfA diperoleh dari Saccharomyces cerevisiae rekombinan yang dikultivasi selama 3 hari pada suhu inkubasi 30 °C. Penentuan aktivitas enzim AbfA dilakukan pada kondisi pH 6, suhu 70 °C dan waktu inkubasi 15 menit. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penentuan aktivitas enzim AbfA dengan metode NS lebih teliti atau memiliki standar deviasi yang jauh lebih kecil dibandingkan dengan metode DNS, namun kurva kalibrasi larutan standar metode DNS lebih linear dibandingkan metode NS.
OPTIMASI DIGESTI ENZIM RESTRIKSI SacII PADA ISOLAT Mycobacterium tuberculosis H37Rv UNTUK DETEKSI MUTASI PROMOTER inhA PADA KASUS MDR-TB DENGAN METODE PCR-RFLP Ida Ayu Ratih Dwi Nugraha Putri; Sagung Chandra Yowani; I Nengah Wirajana
Metamorfosa: Journal of Biological Sciences Vol 4 No 1 (2017)
Publisher : Prodi Magister Ilmu Biologi, Fakultas MIPA, Universitas Udayana

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24843/metamorfosa.2017.v04.i01.p14

Abstract

The aim of this study was to optimize the digestion process of SacII restriction enzyme in Mycobacterium tuberculosis H37Rv isolate. SacII enzyme that have CCGC^GG restriction site could be used to detect the mutation at -24 promoter region of inhA M. tuberculosis. The mutation in this position is one of the causes of isoniazid resistance. The methods of this study were conducted in several step, respectively: DNA isolation of M. tuberculosis H37Rv, amplification of inhA promoter region of M. tuberculosis H37Rv using PCR method, and digest optimization using SacII. In this study, optimization of SacII digestion was conducted for formulaion and incubation time. The formulation was optimized by GM-ONE Buffer and GM-Buffer IV, meanwhile the incubation time was optimized in 1 hour, 2 hour, and 3 hour. The result of this study showed that SacII work optimally in GM-Buffer IV compared to GM-ONE Buffer and incubate for 3 hours. Under the optimal digest condition, SacII enzyme could be used to detect the mutation at -24 promoter region of inhA in the case of MDR-TB using PCR-RFLP method.
PENGETAHUAN DAN PEMAHAMAN DINI NARKOBA DAN ZAT ADITIF PADA GENERASI MUDA SEBAGAI ASET BANGSA DI DESA MENGWI BADUNG N.M. Suaniti; I N. Wirajana; N.K. Ariati; M. Manurung
Buletin Udayana Mengabdi Vol 17 No 4 (2018): Buletin Udayana Mengabdi
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (391.346 KB) | DOI: 10.24843/BUM.2018.v17.i04.p11

Abstract

Era globalisasi sebagai suatu peluang dan tantangan kaum muda Indonesia untuk berpartisipasi aktif memperoleh hal-hal yang tidak baik, salah satunya memahami pengetahuan awal tentang obat dan zat aditif yang memungkinkan dapat menyesatkan generasi muda. Drugs (narkotika dan obat / bahan berbahaya lainnya) dikenal sebagai obat-obatan yang disalahgunakan (narkotika, psikotropika dan zat adiktif lainnya) oleh Kementerian Kesehatan Republik Indonesia yang merujuk pada sekelompok senyawa yang umumnya memiliki risiko penambahan bagi pengguna. Selanjutnya, aditif makanan juga bisa menyebabkan keracunan. Badung adalah salah satu bagian dari dunia di mana tujuan wisata desa Mengwi menghubungkan daerah utara dan selatan menjadi rentan terhadap efek dari upaya pencegahan yang dilakukan sehingga salah satunya dengan memberikan pengetahuan obat-obatan dan aditif oleh otoritas yang relevan. Metode ini dilakukan dengan memberikan kuliah dan sesi tanya jawab dengan mengisi kuesioner pre dan posttest. Hasil kuesioner dianalisis dan menunjukkan peningkatan pemahaman obat dan aditif secara signifikan untuk menyebar secara merata pada generasi muda di desa Mengwi setelah kegiatan, tetapi kegiatan pendidikan ini perlu dilakukan secara berkala di setiap banjar dan diperluas di komunitas pedesaan lainnya di Bali.
PENGETAHUAN DAN PEMAHAMAN DINI NARKOBA DAN ZAT ADITIF PADA GENERASI MUDA SEBAGAI ASET BANGSA DI DESA MENGWI BADUNG N.M. Suaniti; I.N. Wirajana; N.K. Ariati; M. Manurung
Buletin Udayana Mengabdi Vol 16 No 3 (2017)
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (408.374 KB)

Abstract

The era of globalization is an opportunity and challenges Indonesian youths to participate actively obtain in things that are not good, one of them understood early knowledge of drugs and additives that enable the younger generation can be misleading. Drugs (narcotics and drug/ hazardous materials) with another term drug (narcotics, psychotropic and other addictive substances) by the Ministry of Health of the Republic of Indonesia refers to a group of compounds generally have a risk of addition for users. Furthermore, food additives can also cause poisoning. Badung is one of part of the world where tourist destinations Mengwi village is connecting northern and southern regions become vulnerable to the effects of prevention efforts of prevention efforts undertaken so that one of them by giving lectures drugs and additives by the relevant authorities. The method is performed by giving a lecture and question and answer session with filling out the questionnaire pre and posttest. The results of the questionnaire were analyzed and showed an increase understanding of drugs and additives significantly to the spread evenly on the younger generation in Mengwi village after the activity, but this dedication activities need to be carried out periodically in each row and expanded in other rural communities in Bali
DESAIN PRIMER SECARA IN SILICO UNTUK AMPLIFIKASI FRAGMEN GEN rpoB Mycobacterium tuberculosis DENGAN POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) Pradnyaniti, D.G; Wirajana, I.N; Yowani, S.C
Jurnal Farmasi Udayana Vol. 2, No. 3, Tahun 2013
Publisher : Departement of Pharmacy, Faculty of Mathematics and Natural Science, Udayana University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (271.524 KB)

Abstract

Amplifikasi DNA Mycobacterium tuberculosis dari gen rpoB dilakukan dengan metode polymerase chain reaction (PCR). Amplifikasi DNA dengan PCR diperlukan sepasang primer (forward dan reverse) untuk membatasi daerah yang ingin diamplifikasi. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain sepasang primer agar dapat mengamplifikasi fragmen 0,5 kb gen rpoB M.tuberculosis. Desain primer dilakukan secara in silico dengan bantuan program clone manager suite 6 (University of Groningen). Template yang digunakan dalam mendesain primer adalah sekuen gen rpoB M. tuberculosis H37RV wild type, yang diperoleh dari database NCBI dengan kode genbank U12205.1. Penelitian ini telah berhasil memperoleh sekuen sepasang primer (forward dan reverse) dengan panjang masing-masing adalah 22 oligonukleotida. Primer ini dapat mengamplifikasi secara in silico fragmen 0,5 kb gen rpoB M. tuberculosis pada rentang daerah 990-1496 pb dengan panjang fragmen sebesar 507 pb.
PERBANDINGAN KUALITAS DNA DENGAN MENGGUNAKAN DUA METODE BOOM MODIFIKASI PADA ISOLAT Mycobacterium tuberculosisP10 DI BALI Mirawati N.K.W.; Wirajana I.N.; Yowani S.C.
Jurnal Farmasi Udayana Vol. 3, No. 1, Tahun 2014
Publisher : Departement of Pharmacy, Faculty of Mathematics and Natural Science, Udayana University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (201.191 KB)

Abstract

Isolasi DNA bakteri merupakan salah satu metode penunjang yang dapat digunakan untuk mendeteksi bakteri penyebab infeksi. Metode yang umum digunakan dalam mengisolasi DNA Mycobacterium tuberculosis adalah metode Boom. Metode ini masih perlu mengalami modifikasi agar pelepasan DNA menjadi lebih optimal serta mengurangi inhibitor pada proses PCR. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk membandingkan kualitas DNA yang dihasilkan dari masing-masing metode Boom modifikasi dalam mengisolasi DNA M. tuberculosis. Hasil isolasi ini nantinya akan diamplifikasi dengan teknik PCR sehingga bakteri dapat terdeteksi dengan cepat.Visualisasi produk PCR akan dianalisis dengan menggunakan 1,5 % gel agarosa. Dalam penelitian ini, dibandingkan 2 metode Boom yang telah dimodifikasi. Hasil yang diperoleh diketahui bahwa pita DNA produk PCR terlihat tebal pada masing-masing metode. Kemudian dilanjutkan analisis untuk mengetahui ketebalan pita yang dihasilkan dengan menghitung area pita. Hasil yang diperoleh diketahui bahwa metode Boom modifikasi yang dikerjakan di Laboratorium Biomolekular FK Unud lebih baik dibandingkan dengan metode Boom modifikasi yang dikerjakan oleh Traore.
Co-Authors A. A. B. Putra Anak Agung Istri Agung Mayun Laksmiwati D. Rizkiyanti Darma Asih Yuliana Dewi Andayani Farmawati Dewi, I Gusti Ayu Agung Gangga Samala Diah Suci Eddy Bagus Wasito Gusti A Malelak H.M. Soekry Erfan Kusuma I Gede Mahardika I Gusti Ngurah Bagus Andre Hartawan I Ketut Gede Dharma Dewantara I Made Agus Gelgel Wirasuta I P. J. D. A. Suartama I Putu Mahendra I W BUDIARSA SUYASA I Wayan Gede Gunawan I Wayan Suarsa I. A. Gede Widihati Ida Ayu Ratih Dwi Nugraha Putri Ida Bagus Amertha Putra Manuaba Ida Bagus Putra Manuaba Ida Bagus Putu Eristya Putra Ika Kurniawati Indra Juana Adikara Inten Hardianti Nizar Iryanti Eka Suprihatin James Sibarani Kazuo Sakka Ketut Ratnayani Khisan Qamariya Kimura, Tetsuya Kusuma, Soekry Erfan Luh De Dwi Jayanthi Luk Ketut Budi Maitriani M. Manurung Made Arsa Made Dharmesti Wijaya Made Rai Dwitya Wiradiputra Mirawati N.K.W. N. M. T. Juliasari N. W. Bogoriani Ni Komang Ariati Ni Komang Lia Wahyuni Ni Luh Md. Widayantini Ni Luh Putu Mustika Praptiwi Ni Made Suaniti Ni Made Yustikarini Ni Nengah Kartini Asih Ni Nyoman Tri Puspaningsih Ni Putu Ariantari Ni Putu Citra Anggryni Sugitha Ni Putu Frida Oktaningtias Widiarthi Ni Putu Rahayu Artini O. Ratnayani Oka Ratnayani P. Suarya Pradnyaniti, D.G Putra, Pramana Kumala Putri, Ni Wayan Prasanthi Swarna Putu Elvira Yulianthi Putu Suarya R. R. Sirait Ro’yal Aini Sagun Chandra Yowani Sakka, Kazuo Satriya Putra Prakoso Soekry Erfan Kusuma Tetsuya Kimura Wahyu Dwijani Sulihingtyas Y. H. Pratiwi