Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
2.816
P-Index
This Author published in this journals
All Journal SAINS MEDIKA : JURNAL KEDOKTERAN DAN KESEHATAN Jurnal Ilmu Dasar AL KAUNIYAH Indonesian Journal of Cancer Chemoprevention UNEJ e-Proceeding Jurnal ORTOPEDAGOGIA BIOLINK (Jurnal Biologi Lingkungan, Industri, Kesehatan) NurseLine Journal Jurnal SOLMA Jurnal Biologi Tropis Jurnal Biolokus: Jurnal Penelitian Pendidikan Biologi dan Biologi Buletin Ilmiah Nagari Membangun INDONESIAN JOURNAL OF MEDICAL LABORATORY SCIENCE AND TECHNOLOGY Jurnal Mandala Pengabdian Masyarakat Lumbung Inovasi: Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat Livestock and Animal Research EduInovasi: Journal of Basic Educational Studies Jurnal Kesehatan Masyarakat
Kiky Martha Ariesaka
Universitas Negeri Malang
Religion Agriculture, Biological Sciences & Forestry Humanities Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Control & Systems Engineering Economics, Econometrics & Finance Education Engineering Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Languange, Linguistic, Communication & Media Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Materials Science & Nanotechnology Mathematics Medicine & Pharmacology Nursing Public Health Social Sciences Veterinary Other

Published : 23 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : AL KAUNIYAH

 1 
Desain Primer PCR Spesifik Secara In Silico Untuk Amplifikasi Gen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) DNA Mitokondria Pada Aedes aegypti Moh. Mirza Nuryady; Elly Purwanti; Siti Nur Aldina; Sri Wahyuni; Tutut Indria Permana; Zakiyatul Khoiriyah; Kiky Martha Ariesaka
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 18, No 1 (2025): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v1i1.33726

Abstract

AbstrakGen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) merupakan salah satu marker molekuler untuk identifikasi spesies berdasarkan DNA mitokondria. Tujuan dilakukannya penelitian ini, yaitu untuk mendapatkan primer gen COX-1 yang spesifik terhadap nyamuk A. aegypti. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif observasional yaitu dengan melakukan desain primer secara in silico dan konfirmasi secara in vitro ditandai dengan pita DNA hasil PCR. Langkah pertama dari metode ini, yaitu dengan mengunduh urutan DNA COX-1 Aedes aegypti dari Gene Bank (NCBI) dengan nomor aksesi DQ397892.1. Hasil dari Primer3web diperoleh dua primer yang spesifik, yaitu primer pertama memiliki sekuen F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA dan R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT dan pada primer kedua F¢ AGTCCAGCCCTTCTATGATCA dan R¢ TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Optimasi primer pada tahap konfirmasi dilakukan dengan kisaran suhu annealing 46, 48, dan 52 °C didapatkan hasil visualisasi elektroforesis yang menunjukkan adanya pita DNA dengan ukuran +600 bp pada ketiga kondisi suhu. Kesimpulan pada penelitian ini adalah didapatkan dua primer yang spesifik terhadap gen COX-1 Aedes egypti. AbstractThe COX-1 gene (Cytochrome Oxidase Subunit I) is one of the molecular marker for species identification based on mitochondrial DNA. The purpose of this study was to obtain specific COX-1 gene primers for A. aegypti mosquitoes. This research was an observational descriptive study, namely by carrying out the primary design in silico and in vitro confirmation marked by DNA bands from PCR results. The first step of this method is to download the COX-1 Aedes aegypti DNA sequence from the Gene Bank (NCBI) with accession number DQ397892.1. The results from Primer3web obtained two specific primers, namely, the first primer had the sequences F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT and the second primer had F¢AGTCCAGCCCTTCTATGATCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Primer optimization at the confirmation stage was carried out with annealing temperature ranges of 46, 48, and 52 °C. The results of electrophoretic visualization showed the presence of DNA bands with a size of +600 bp at all three temperature conditions. The conclusion of this study was that there were two specific primers  for the COX-1 gene of A. aegypti.
Desain Primer PCR Spesifik Secara In Silico Untuk Amplifikasi Gen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) DNA Mitokondria Pada Aedes aegypti Nuryady, Moh. Mirza; Purwanti, Elly; Aldina, Siti Nur; Wahyuni, Sri; Permana, Tutut Indria; Khoiriyah, Zakiyatul; Ariesaka, Kiky Martha
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol. 18 No. 1 (2025): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v1i1.33726

Abstract

AbstrakGen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) merupakan salah satu marker molekuler untuk identifikasi spesies berdasarkan DNA mitokondria. Tujuan dilakukannya penelitian ini, yaitu untuk mendapatkan primer gen COX-1 yang spesifik terhadap nyamuk A. aegypti. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif observasional yaitu dengan melakukan desain primer secara in silico dan konfirmasi secara in vitro ditandai dengan pita DNA hasil PCR. Langkah pertama dari metode ini, yaitu dengan mengunduh urutan DNA COX-1 Aedes aegypti dari Gene Bank (NCBI) dengan nomor aksesi DQ397892.1. Hasil dari Primer3web diperoleh dua primer yang spesifik, yaitu primer pertama memiliki sekuen F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA dan R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT dan pada primer kedua F¢ AGTCCAGCCCTTCTATGATCA dan R¢ TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Optimasi primer pada tahap konfirmasi dilakukan dengan kisaran suhu annealing 46, 48, dan 52 °C didapatkan hasil visualisasi elektroforesis yang menunjukkan adanya pita DNA dengan ukuran +600 bp pada ketiga kondisi suhu. Kesimpulan pada penelitian ini adalah didapatkan dua primer yang spesifik terhadap gen COX-1 Aedes egypti. AbstractThe COX-1 gene (Cytochrome Oxidase Subunit I) is one of the molecular marker for species identification based on mitochondrial DNA. The purpose of this study was to obtain specific COX-1 gene primers for A. aegypti mosquitoes. This research was an observational descriptive study, namely by carrying out the primary design in silico and in vitro confirmation marked by DNA bands from PCR results. The first step of this method is to download the COX-1 Aedes aegypti DNA sequence from the Gene Bank (NCBI) with accession number DQ397892.1. The results from Primer3web obtained two specific primers, namely, the first primer had the sequences F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT and the second primer had F¢AGTCCAGCCCTTCTATGATCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Primer optimization at the confirmation stage was carried out with annealing temperature ranges of 46, 48, and 52 °C. The results of electrophoretic visualization showed the presence of DNA bands with a size of +600 bp at all three temperature conditions. The conclusion of this study was that there were two specific primers  for the COX-1 gene of A. aegypti.
Co-Authors Agil Wahyu Wicaksono Agung Kurniawan Ain Yuanita Insani Ain Yuanita Insani Al Munawir Aldina, Siti Nur Anditri Weningtyas Andreas Budi Wijaya Ardhanu Kusumanto Arif Ladika Aulia, Sabrina Auliarahama, Zhafirah Auliarahma, Zhafirah Azka Darajat Bakhtiar, Fannia Yosa Brilliant Givya Ariansari Brilliant Givya Ariansari Devi, Athaayaa Nastiti Ulayya Diani Fatmawati Editya Fukata Elly Purwanti Erfan Efendi Fanani, Erianto Fannia Yosa Bakhtiar Faridatus Solikha Fatmawati, Diani Fuad Adi Prasetyo Fuad Adi Prasetyo Fuad Jaya Miharja Fulviansyah, Zaidhan Lucano Ganes, Tegar Gelaner, Nauval Akhmadian Haryono, Putri Dwinita Hilda Khairinnisa Hilma Tsurayya Iftitahurroza Iftitahurroza, Hilma Tsurayya Iftitahurroza, Iftitahurroza Ika Agus Rini, Ika Agus Ika Rahmawati Sutejo Ika Wahyuni Inggita Utami Ismaya, Matius Dimas Reza Dana Juliana, Levina Imelda Khodijah Khodijah Khoiriyah, Zakiyatul Khoiro, Aisha Azaria Nisa’ul KURNIAWATI, ANDINI Ladika, Arif Lintang Widya Sishartami Lintang Widya Sishartami Maliza, Rita Manggolono, Lintang Nirmalasari Gemalochaya Mochammad Yunus, Mochammad Moh Mirza Nuryady, Moh Mirza Moh. Mirza Nuryady Mudzakir Taufiqurrahman Mudzakkir Taufiqurrahman Mudzakkir Taufiqurrqhman Nanang Tri Wahyudi Nazila, Farah Nungki Anggorowati Prasetya, Ahmada Viosepta Purwanti, Elly Putra, Alvino Ramadhany Putri, Adhiena Liany Anastasia Putri, Angelica Igsanti Qurrataa'ayun, Ahmad Al Siti Nur Aldina Sri Wahyuni Sri Wahyuni Suhartanti, Ajeng Sri Susetyarini, Rr Eko Tsurayya, Hilma Tutut Indria Permana Ulfa, Darlah Immaria Wahyu Dian Puspita Wahyuni, Sri Wibisono, Taurisma Aulia Nanda Widya Sishartami, Lintang Wiratama, Arif Ladika Zakiyatul Khoiriyah Zucha, Muhammad Ary