Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Proceeding Biology Education Conference

ANALISIS DNA MITOKONDRIA BADAK SUMATERA DALAM KONSERVASI GENETIK Handayani Handayani; Dedy Duryadi Solihin; Hadi S Alikodra
Proceeding Biology Education Conference: Biology, Science, Enviromental, and Learning Vol 8, No 1 (2011): Prosiding Seminar Nasional VIII Biologi
Publisher : Universitas Sebelas Maret

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRAK   Populasi badak Sumatera dewasa ini semakin terancam keberadaannya. Hal ini disebabkan oleh beberapa faktor, diantaranya adalah semakin maraknya perburuan liar, rusaknya habitat alamnya yang disebabkan oleh konversi hutan yang cenderung tidak terkendali. Populasi kecil lebih rentan pada penurunan keragaman genetik karena efek inbreeding serta terfiksasinya beberapa alela tertentu dalam populasi sehingga hewan tersebut menjadi monomorf dan mengalami penurunan kemampuan berevolusi atau adaptasinya pada lingkungan yang berubah. Selain itu berkurangnya populasi, faktor lain adalah terjadinya fragmentasi suatu habitat yang akan mendorong putusnya aliran gen (gen flow) dan meningkatnya genetic drift. Keragaman genetik turut menentukan keberhasilan konservasi populasi. Oleh karena itu penelitian keragaman genetik dari populasi Badak Sumatera merupakan langkah penting yang harus dilakukan, dan keberhasilan penelitian ini merupakan langkah  dalam konservasi badak Sumatera. Pengumpulan sampel darah berasal dari SRS (Suaka Rhino Sumatera) TN Way Kambas Lampung. Sample berupa darah dari 2 ekor badak sumatera berjenis kelamin betina (Rosa & Bina) dan 2 ekor badak jantan (Torgamba & Andalas). Isolasi dan purifikasi DNA Total dilakukan menggunakan metode Duryadi. Amplifikasi daerah CO I pada badak Sumatera dilakukan dengan PCR menggunakan pasangan primer RHCOIF dan RHCOIR. Amplifikasi daerah CO I pada badak Sumatera dilakukan dengan menggunakan pasangan primer RHCOIF dan RHCOIR menghasilkan fragmen DNA berukuran 711 bp. Jarak genetik digunakan untuk melihat kedekatan hubungan genetik antar individu badak Sumatera dan spesies badak lain melalui penggunaan analisis perhitungan Pairwie Distance dengan p-distance dapat ditunjukkan matriks perbedaan genetik antara badak Sumatera dan badak outgroup (badak India dan badak Afrika), hasil perhitungan berdasarkan daerah CO I parsial menunjukkan nilai jarak genetik berkisar antara 0.016 sampai 0.147. Jarak genetik pada Bina (♀) terlihat dekat dengan Torgamba (♂) sebesar 0.007. Hubungan kekerabatan CO I menggunakan Neighbor-Joining dengan pengolahan bootstrap 1000 terlihat bahwa badak putih Afrika berbeda kelompok dengan badak Asia. Di dalam kelompok badak Asia terlihat bahwa badak India sama dengan kelompok dengan badak Sumatera (Indonesia). Di dalam badak Sumatera (Indonesia) sendiri terjadi keragaman. Berdasarkan hasil sekuen gen CO I terdapat situs-situs spesifik pada badak Sumatera sebesar adalah 67% hasil tersebut dapat digunakan sebagai data base dalam penelitian-penelitian selanjutnya.   Kata kunci: badak Sumatera, DNA, mitokondria, konservasi
Co-Authors . Hasnawati ABDUL HARIS MUSTARI Adjat Sudrajat Agus P. Kartono Agus Priyono Kartono Agustine, Ratna Ahmad Sudirman Abbas Alan Purbawiyatna Alan Purbawiyatna Andi Gunawan Andi Nuddin Ani Mardiastuti Bahruni . Bambang H. Saharjo Bambang H. Saharjo Bambang Pramudya N Bambang Purwantara Bismark, Muhammad Bunasor Salim Burhanuddin Masy'ud Burhanuddin Masyud Cut Maila Hanum Dadang R Priatna Darusman, Huda Shalahudi Dedy Darnaedi Dedy Soedharma Diah Zuhriana Dondin Sajuthi Donny Iskandar Dudung Darusman Dudung Darusman Ely Triana Endang Suhendang Endes N. Dahlan Endes N. Dahlan Endriatmo Sutarto Entang Iskandar Entang Iskandar Erly Sukrismanto Erly Sukrismanto Ervizal AMZU Fachruddin M. Mangunjaya Fahma Wijayanti Frida Purwanti H R Syaukani Handayani , Handayani Hariyadi, Hariyadi Hartisari S. Hartrisari Hardjomidjojo HENDRA GUNAWAN B11211055 Henny Apriyanty HERA MAHESHWARI Herry Purnomo Herry Purnomo Heru Setijanto Ibnu Maryanto Imtiyaaz, Cassytta Dhiya Jakaria Jakaria Jamhari Jamhari Jansen Manansang JARWADI BUDI HERNOWO Kaniwa Berliani Kartodihardjo, Hariadi Kooswardhono Mudikdjo Kooswardono M Kristiyanto Kristiyanto Kukuh Murtilaksono Kuncahyo, Bantista Adies Laksono Trisnantoro Lala M Kolopaking LILIK BUDIPRASETYO Liza Niningsih Liza Niningsih LUTHFIRALDA SJAHFIRDI M. Bismark Mahmud, Rois Maya Ambinari Mirza Dikari Kusrini Mochamad Arief Soendjoto Mochamad Arief Soendjoto Moh. Hasroel Thayib Mohammad Bismark Mozes R. Tolihere Muhammad Bismark Naik Sinukaban Nyoto Santoso Pricillia Azhani Priyadi Kardono Priyadi Kardono Pudji Astuti Pudji Astuti Puji Rianti R Garsetiasih R. Hamdani Harahap Reviany Widjajakusuma Reviany Widjajakusuma Ribai . Ricky Avenzora Rinekso Soekmadi Rini, Darlina Kartika Robert Sibarani, Robert Ruskhanidar Ruskhanidar Saharia Kassa Sambas Basuni SATRIYAS ILYAS Siti Badriyah Rushayati Soehartini Sekartjakrarini Soeryo Adiwibowo Sofian Iskandar, Sofian Sri Suci Utami Atmoko Sri Suci Utami Atmoko Sri Supraptini Mansjoer Sudhiani Pratiwi Suhadi Suhadi Suhadi Suhadi TARUNI SRI PRAWAST MIEN KAOMINI ANY ARYANI DEDY DURYADI SOLIHIN Trihastuti, Yohana Tutut Sunarminto U Mamat Rahmat Wanda Kuswanda Yeni A Mulyani Yeni Aryati Mulyani Yudha Heryawan Asnawi Yumarni .