Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
3.018
P-Index
This Author published in this journals
All Journal ILMU KELAUTAN: Indonesian Journal of Marine Sciences BULETIN OSEANOGRAFI MARINA Bioma : Berkala Ilmiah Biologi SAINS DAN MATEMATIKA Jurnal Akademika Biologi Jurnal Kesehatan Masyarakat Current Biochemistry Journal of Tropical Biodiversity and Biotechnology Biosaintifika: Journal of Biology & Biology Education Berkala Bioteknologi Jurnal Biologi Tropika Jurnal Pascapanen dan Bioteknologi Kelautan dan Perikanan Greensphere: Journal of Environmental Chemistry Prosiding Seminar Kesehatan Masyarakat Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI)
Anto Budiharjo
Departemen Biologi, Fakultas Sains Dan Matematika, Universitas Diponegoro, Semarang, Indonesia
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemistry Dentistry Earth & Planetary Sciences Education Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Mathematics Medicine & Pharmacology Nursing Public Health Veterinary

Published : 60 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 60 Documents
Search

 2   3   4   5   6 
Deteksi Gen tlh dan tdh pada Bakteri Vibrio parahaemolyticus dari Air Tambak Udang Vanname (Litopenaeus vannamei) di Kabupaten Rembang Hasrimi, Adila Nawan; Budiharjo, Anto; Jannah, Siti Nur
Berkala Bioteknologi Vol. 4, No. 2, November 2021
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Vibrio parahaemolyticus merupakan bakteri halofilik gram negatif pada lingkungan aquatik. Semua strain Vibrio parahaemolyticus memiliki thermolabile hemolysin yang diregulasi oleh gen tlh. Thermostable direct hemolysin yang diregulasi oleh gen tdh adalah salah satu faktor virulensi utama pada Vibrio parhaemolyticus yaitu. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan gen tlh dan tdh pada bakteri Vibrio parahaemolyticus dari air tambak udang vanname di Kabupaten Rembang. Isolasi bakteri dari air tambak udang vanname pada media CD-VP menunjukkan pertumbuhan koloni bakteri berwarna hijau-kebiruan yang teridentifikasi spesifik sebagai bakteri Vibrio parahaemolyticus. Isolat bakteri teridentifikasi sebagai bakteri spesies Vibrio parahaemolyticus berdasarkan penyandi gen tlh. Analisis molekuler menunjukkan hasil tdh negatif, yang mengindikasikan bahwa bakteri tidak memiliki gen tdh untuk menyandi thermostable direct hemolysin yang menentukan faktor virulensi. Uji konfirmasi gen tdh pada isolat bakteri Vibrio parahaemolyticus dengan media agar wagatsuma menunjukkan hasil Kanagawa negatif yang mengindikasikan bahwa bakteri tidak menghasilkan thermostable direct hemolysin. Isolat Vibrio parahaemolyticus tidak mempunyai faktor virulensi untuk memulai kolonisasi pada organisme inang di lingkungan aquatik ini.
Deteksi Gen DXS dan Penentuan Jalur Biosintesis Karotenoid pada Chlorella pyrenoidosa Monalita, Ramadhebi; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti; Budiharjo, Anto
Berkala Bioteknologi Vol. 5, No. 1, April 2022
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Natural carotenoid synthesis has never exceeded synthetic products on a commercial scale. Lack of understanding of the microbiological and ecophysiological aspects of carotenoid-producing isolates leads to misidentification of species. One local isolate of green algae is used as a natural food source of carotenoids in the food industry, namely Chlorella pyrenoidosa. Carotenoid accumulation of the nonMVA pathway in green algae is determined by the enzyme D-1-deoxyxylulose 5-phosphate synthase, which is encoded by the D-1-deoxyxylulose 5-phosphate synthase (DXS) gene. The main purpose of this study was to detect the DXS gene as a carotenoid biosynthetic key enzyme encoder in C. pyrenoidosa whether or not to follow the non-MVA pathway for carotenoid biosynthesis or not. Morphological and ecophysiological characterization methods are carried out based on periodic observations and DXS gene detection using the guide Kuzuyama (2000). The results of the analysis of the similarity of the C. pyrenoidosa DXS gene in sustainable areas show that it can detect partial DXS genes from Chlamydomonas reinhardtii. The absence of growth inhibition in C. pyrenoidosa with lovastatin shows a non-MVA pathway that is the pathway used in carotenoid biosynthesis.
Biofilm Inhibition Activity from Obligate Marine Fungi Against Pathogenic Vibrio Bacteria in Whiteleg Shrimp, Penaeus vannamei Kristina, Kristina; Soowanayan, Chumporn; Suetrong, Satinee; Budiharjo, Anto; Rukmi, Isworo
Berkala Bioteknologi Vol. 5, No. 2, November 2022
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Early mortality syndrome (EMS) is caused by toxic strains of Vibrio bacteria that are produced when bacteria colonize and form biofilm in the digestive tract of cultivated shrimp. One possible control strategy for shrimp Vibriosis is biofilm inhibition. In the present study we tested cell-free culture broth (CF-CB) of 31 strains obligate marine fungi for its ability to inhibit growth and biofilm formation with 2 isolates of Vibrio bacteria, Vibrio harveyi (VH1) and Vibrio parahaemolyticus (3HP). CF-CB with the highest biofilm inhibitory activity were then prepared as feed additives and mixed with commercial feed (1 ml to 1 g ratio) to examined its potency on Vibrio-challenged shrimp. The supplemented feed were administered to post-larvae (PL) shrimps for 7 days before and after they were challenged with VH1 and 3HP which shrimp health and mortality were monitored. Overall, CF-CB from 9 out of 31 isolates examined inhibited biofilm formation by VH1 and 17 out of 31 isolates inhibited biofilm formation by 3HP. Survival rate in the un-challenged negative control was 66% while PLs fed with MCR00984 (Linocarpon appendiculatum) and challenged with VH1 and 3HP were 42% and 60% which was not significantly different (p≥0,05). This results shows some promise for possible application against Vibriosis in shrimp.
Potensi Rhizobakteri dari Tanaman Kubis (Brassica oleracea var. capitata L.) Daerah Getasan Semarang sebagai Agen Biobakterisida Terhadap Patogen Xanthomonas campestris Fahmi, Maya Fitriana Ilul; Budiharjo, Anto; Suprihadi, Agung
Berkala Bioteknologi Vol. 4, No. 2, November 2021
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Rhizobakteri merupakan bakteri yang hidup di sekitar perakaran tanaman, tidak menimbulkan efek negatif pada tanaman inangnya, dan diketahui dapat berperan sebagai agen biobakterisida. Penggunaan pestisida kimia untuk mengendalikan patogen tanaman dapat digantikan dengan memanfaatkan rhizobakteri. Tujuan penelitian ini ialah mengisolasi rhizobakteri dari tanaman kubis di daerah Getasan, Semarang serta menguji kemampuan isolat tersebut untuk menghambat pertumbuhan koloni patogen Xanthomonas campestris penyebab penyakit busuk hitam pada kubis secara in vitro. Penelitian ini dilakukan dengan isolasi rhizobakteri, karakterisasi isolat bakteri secara morfologi, uji antibakteri, identifikasi secara molekuler dengan 16S rRNA, dan uji konfirmasi biokimia. Hasil isolasi diperoleh tujuh belas isolat rhizobakteri dan terdapat empat isolat yang memiliki potensi sebagai agen biobakterisida terhadap patogen X. campestris. Isolat tersebut adalah K.1, K.3, K.9 dan K.12. Isolat K.9 memiliki daya hambat terbesar terhadap X. campestris yaitu 12,6 mm. Isolat ini diidentifikasi secara molekuler sebagai Bacillus cereus strain BF15. Hasil uji konfirmasi morfologi dan biokimia menunjukkan bahwa isolat K.9 merupakan bakteri gram positif berbentuk basil, dapat membentuk endospora, positif terhadap hidrolisis pati, fermentasi glukosa, bersifat motil serta hidup pada kondisi aerob dan negatif terhadap fermentasi arabinosa dan manitol.
Potensi Rizobakteri Pembentuk Endospora Dari Tanaman Padi Sebagai Biokontrol Fitopatogen Xanthomonas oryzae Sumarno, Maerani; Budiharjo, Anto; Pujiyanto, Sri
Berkala Bioteknologi Vol. 5, No. 1, April 2022
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Xanthomonas oryzae is phytopathogen causing bacterial leaf blight which decreases in agricultural product reaching 20-70 % in Asia. Bacterial leaf blight symptoms is characterized by the formation of lines in the leaf blade turnings yellow, then white, causing the plant to wither and die. Endospore-forming rhizobacteria are soil microbes potential as biocontrol to inhibit phytopathogen growth. The aims of this study were to isolate endospore-forming rhizobacteria from rice plant and determine its ability as biocontrol against X. oryzae. The methods used consisted of isolation, antibacterial activity test, molecular identification, and biochemical characterization. Twenty isolates of endospore-forming rhizobacteria were obtained from the isolation of the rice crop. Isolate P-10 had the greatest ability against X. oryzae with inhibition zone of 18.89 mm. Molecular identification using 16S rRNA gene showed that isolates P-10 had 98 % homology with Bacillus pumilus. Biochemical characterization showed the isolate P-10 had a rod- shaped with center of endospores, gram-positive, catalase positive, are motile, negative in starch hydrolyze, not forming gas on glucose, these characteristics fitted with B. pumilus character.
Ekstraksi Dan Uji Stabilitas Zat Warna Daun Jambu Biji (Psidium guajava L.) Pardede, Lasria; Kusdiyantini, Endang; Budiharjo, Anto
Berkala Bioteknologi Vol. 5, No. 1, April 2022
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Guava leaves is known as a traditional medicine to treat various diseases, such as diarrhea, dengue fever, etc. Along with the development of technology, guava leafs is now used as a color contributor on textiles. This study aims to extract on the solvent distilled water and ethanol and to test the stability of guava leaf color pigment against the influence of storage temperature, time span of the addition of an oxidant and pH. Leaves extracted by soaked for 24 hours in distilled water solvent that has been preheated to 30°C, 50ºC, 70º C and 90ºC and ethanol with a concentration of 20%, 40%, 60%, 80% and 96%. Absorbance measurements of guava leaf extract is using spectrophotometer at a wavelength of 525 nm. The results showed that guava leaf extract has the optimum absorbance value on distilled water solvent at 90ºC and 20%ethanol. Stability test is done by storage temperature effect, oxidizing agents adding, and pH treatment. Stability test of guava leaf extract showed that extracted guava leaf color pigment is stable on 9°C storage temperature
Isolasi dan Identifikasi Molekuler Bakteri Pelarut Fosfat dari Gua Gamelan di Kawasan karst Kiskendo Kendal, Jawa Tengah Mahmudah, Hawari Rosdiana; Suprihadi, Agung; Budiharjo, Anto
Berkala Bioteknologi Vol. 5, No. 1, April 2022
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Phosphate solubilizing bacteria is a group of bacteria that dissolves unavailable phosphate into the form that can be absorbed by plants. This research aimed at isolation and moleculer identification of phosphate solubilizing bacteria based on 16s rRNA from bat cave guano and potential microorganisms which were able to dissolved phosphate. Several stages of this research are, isolation PSB in Pikovskayaand NBRIP agar, Gram staining, and molecularidentification. The isolation result obtained two isolates phosphate solubilizing bacteria, which are G4-1 and G5. Isolate G5 is the highest on solubilizing phosphate with a diameter of clear zone 22.01 mm, and Isolate G4-1 exhibited diameter of clear zone 19.8 mm. Isolates G4-1 and G5 are the gram-negative bacteria. DNA amplification of these bacteria employing universal primers 27 F (5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’) dan Primer 1492 R (5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’) generated the 1520 bp and 1235 bp PCR product. The result of the analysis of 16s rRNA gene sequence showed that isolate G4-1 has 80% similarity with Acinetobacteriwofii strain-JCM partial sequence, and isolate G5 has 92% similarity with Serratia marcesens strain-NBRC.
Analisis SNP (Single Nucleotide Polymorphism) Promotor GEN IL-10 pada Penderita Filariasis Maria, Atina; Budiharjo, Anto; Kusumaningrum, Hermin Pancasakti
Berkala Bioteknologi Vol. 4, No. 2, November 2021
Publisher : Berkala Bioteknologi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Filariasis limfatik merupakan suatu penyakit yang disebabkan oleh nematoda dari jenis Wuchereria bancrofti dan Brugia malayi dewasa yang menghuni jaringan limfatik. Filariasis limfatik ini disebarkan oleh empat genus nyamuk, yaitu, Anopheles, Culex, Aedes dan Mansonia. Respon imun terhadap parasit filaria terdiri dari Thelper2 (Th2) dan melibatkan produksi cytokin –IL-4, IL-5, IL-9, IL-10, dan IL-13, isotype antibody—IgG1, IgG4 and IgE, dan meningkatnya populasi eosinophils dan makrofag yang aktif. Polimorfisme pada daerah promotor gen IL-10 diidentifikasi berhubungan dengan tinggi rendahnya produksi IL-10 pada sel darah perifer pada stimulasi in vitro dengan lipopolysacharide (LPS). Sampel diambil dari penderita filariasis, kemudian diekstraksi dan diamplifikasi pada posisi -1082, -819, -592. Hasil amplifikasi kemudian di restriksi dan di sekuensing. Hasil penelitian dari sampel penderita filariasis yang diteliti menunjukan memiliki haplotip ACA pada analisis RFLP. Analisis hasil sekuensing menggunakan dua aplikasi, yaitu DNA baser dan Bioedit. Analisis menggunakan DNA baser dan Bioedit serta dibandingkan dengan tag SNP didapatkan satu SNP. Perbandingan antara sekuens DNA yang didapatkan dengan tag SNP mandapatkan haplotip CC.
Pengembangan Beras Putih Tinggi Protein Rendah Glikemik (RASPUTIN) untuk Penderita Diabetes Berbasis CRISPR/Cas9 Abhinaya, Danendra Daryl; Fitria, Lutfiah Rahmadini; Asgasatya, Syahid Fattah; Budiharjo, Anto
Current Biochemistry Vol. 12 No. 1 (2025): 2025
Publisher : IPB University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29244/cb.12.1.3

Abstract

Diabetes merupakan salah satu penyakit mematikan yang banyak menjangkit masyarakat Indonesia dengan jumlah penderita yang terus meningkat setiap tahunnya. Salah satu faktor yang menjadi pemicunya adalah konsumsi beras putih yang bernilai indeks glikemik tinggi sebagai makanan pokok sehari-hari. Salah satu alternatif untuk mengatasi masalah tersebut adalah dengan memproduksi beras RASPUTIN, yakni beras terekayasa genetik dengan indeks glikemik rendah. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi beras RASPUTIN dalam menurunkan risiko diabetes serta cara memproduksi beras RASPUTIN secara efektif menggunakan CRISPR/Cas9. Penelitian ini menggunakan metode studi literatur yang bersumber dari artikel ilmiah dan jurnal penelitian. Gen OsSPL16 diisolasi dengan menggunakan bulir padi sebagai sampel. Sel dilisiskan dengan manual grinding dan diekstraksi menggunakan metode CTAB. Plasmid direkonstruksi dengan melibatkan promoter U6 dan CAG yang secara berturut-turut mampu mengekspresikan sgRNA dan SpCas9. Agrobacterium-delivered CRISPR/Cas9 digunakan sebagai model sel kompeten yang akan ditransfer ke dalam kecambah padi setelah dikloning pada media lysogeny broth (LB). Kecambah RASPUTIN dikultivasi dan tanaman dewasa diaklimatisasi. Analisis dilakukan secara kualitatif dan kuantitatif. Hasil yang diperoleh, yaitu diperoleh rancangan rekonstruksi plasmid serta desain sgRNA yang kompatibel untuk memproduksi beras putih termodifikasi secara genetik. Beras RASPUTIN diproduksi melalui teknologi rekayasa genetika CRISPR/Cas9 dapat menjadi solusi alternatif untuk menurunkan risiko terjadinya diabetes melitus.
Kerentanan Nyamuk Aedes Aegypti dan Aedes Albopictus terhadap Cypermethrin Berdasarkan Ketinggian Daerah di Provinsi Jawa Tengah Ariani, Nur Frida; Budiharjo, Anto; Sayono
PROSIDING SEMINAR KESEHATAN MASYARAKAT Vol 1 No Oktober (2023): Seminar (NiCe-PHResComS - 1)
Publisher : Fakultas Kesehatan Masyarakat, Universitas Muhammadiyah Semarang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.26714/pskm.v1iOktober.242

Abstract

Latar Belakang: Nyamuk Aedes aegypti dan Aedes albopictus merupakan vektor primer dan sekunder dalam transmisi virus dengue. Pengendalian berbasis insektisida terus dilakukan seiring dengan tingginya insidensi Demam Berdarah Dengue. Resistensi Aedes aegypti terhadap insektisida telah banyak dilaporkan, namun kerentanan Aedes albopictus terhadap insektisida tersebut masih terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan resistensi nyamuk Aedes spp. terhadap insektisida sipermetrin 0,05% di dua wilayah yang berbeda. Metode: Suvei vektor dilakukan selama dua bulan sejak mei 2016 sampai juni 2016. Larva dikumpulkan dari tendon air di dalam dan luar rumah termasuk tendon air alami, di rumah penderita DBD dan radius 50meter rumah di sekitarnya. Larva dipelihara menjadi nyamuk dewasa berumur 3 sampai 5 hari, nyamuk dewasa kenyang darah dan dijadikan subjek uji bioassay standar WHO. Hasil: Mortalitas nyamuk Aedes aegypti dari kota semarang berkisar antara 72% - 92% dengan rerata 86%, sedangkan dari Kabupaten Semarang berkisar antara 8% - 20% dengan rerata 16%. Mortalitas nyamuk Aedes albopictus dari Kota Semarang berkisar antara 96% - 100% dengan rerata 99%, sedangkan dari Kabupaten Semarang berkisar antara 80% - 92% dengan rerata 87%. Simpulan: Aedes aegypti dari Kota Semarang masih berstatus toleran, sedangkan nyamuk dari Kabupaten Semarang telah resisten terhadap sipermetrin 0,05%, Aedes albopictus dari Kota Semarang masih rentan, sedangkan dari Kabupaten Semarang sudah toleran terhadap sipermetrin 0,05%.
Co-Authors AB SUSANTO Abhinaya, Danendra Daryl Ade Fajrian Adila Nawan Hasrimi Agung Suprihadi Agung Suprihadi Ahmad Thontowi Anggoro, Naufal Sebastian Aninditia Sabdaningsih Ariani, Nur Frida Asgasatya, Syahid Fattah Barri Pratama Budi Raharjo Bunga Fajriani CATUR RIANI Christina Ratna Handayani, Christina Ratna Christina Retna Handayani, Christina Retna Deverina Mergypta Dian Wahyu Kemalaputri Dudi Hardianto, Dudi Dyah Ayu Riani Dyah Wulandari Edwin Setiawan Elfira, Yolanda Elke Gildantia Elvi Yetti Endang Kusdiyantini Endang Kusdiyantini Fahmi, Maya Fitriana Ilul Fauziah Citra Rahmawati Fitri Arum Sasi, Fitri Arum Fitria, Lutfiah Rahmadini Florentina Kusmiyati HARTAJANIE, LAKSMI Hasrimi, Adila Nawan Heni Wijayanti, Heni Hermanto, Michael Einstein Hermin P. Kusumaningrum Hermin Pancasakti Kusumaningrum Hermin Pancasakti Kusumaningrum Husna, Faza Laili IS HELIANTI Khoirul Huda Kristina Kristina Kurniawati, Mufida Budi Kusumaningrum, Hermin Laila Nur Faizah Lasria Pardede Lindayani, Lindayani Luthfy AN M Masfuroh Maerani Sumarno Mahmudah, Hawari Rosdiana Maria, Atina Maulana, Anand Reyna Mawarni, Risa Arum Maya Fitriana Ilul Fahmi MG Isworo Rukmi Mia Tri Wardani Monalita, Ramadhebi Muhammad Adib Mubarok Muhammad Mulyadi, Muhammad Muhammad Zainuri Norma Sainstika Pangestu Novita Rahmawati, Novita Nur Endah Wahyuningsih Nurhayati Nurhayati Nurlita Abdulgani Octavia Dewi Christiningrum Olivia Nisa Mumtianah Pardede, Lasria Prayogo, Fitra Adi Rahayu, Annisa Rizky Rahmah Putri Sunarno Ratna Cempaka Lingga Rejeki Siti Ferniah Risky Panji Nugroho Risma Wiharyanti Safirah, Dearesty Saniha Adini, Saniha Sayono Setyo Nugroho Shabrina, Jauhara Siti Nur Jannah Siti Nur Jannah Siu S.S Langden Sonny Abdi Setiyawan, Sonny Abdi Soowanayan, Chumporn Sri Pujiyanto Suetrong, Satinee Sumarno, Maerani Suprihadi Susiana Purwantisari Teuku Tajuddin Thu'ti Alawiyyah Tony Hadibarata, Tony w wijanarka Wahyu Dewi U. Haryanti Wien Kusharyoto Wijanarka Wijanarka Yason Lukman Sudjito, Yason Lukman Yohanes Chandrawijaya Yopi Yopi Yuliandini Pangestika