Claim Missing Document
Check
Articles

Found 29 Documents
Search

STUDI FARMAKOFOR DAN DOCKING MOLEKUL RESEPTOR σ2 SEBAGAI TARGET PENGOBATAN KANKER PAYUDARA Nursalam Hamzah; Haeria Haeria; Kamsia Dg Paewa
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 3 No 1 (2015): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v3i1.2175

Abstract

The σ2 receptor is an important target for the development of molecules in oncology because of its density (density) is ten-fold in proliferating tumor cells compared with tumor cells silence/benign (quiescent tumor cells) and also because of the observation that the σ2 receptor agonists are able to kill tumor cells through the mechanism of apoptosis and non-apoptotic. The purpose of this study is the Find features farmakofor compounds responsible for the activity and selectivity of σ2 receptor agonist. The procedure begins with the determination of farmakofor using MOE, 2009 to obtain the interaction between ligand and amino acids. Then performed molecular docking. Molecular docking also use MOE 2009 using thousands of compounds in a database downloaded from zinc. Results indicate amino acids that are important in the interaction with the ligand in the protein code is Gln725 and Asn719 (polar amino acids), and Arg766 (basic amino acids). The query farmakofor that play a role in the interaction of ligand-receptor features a group of donor and proton acceptor (F1: Don & Acc), group proton acceptor (F2: Acc), group proton donor (F3: Don) and the aromatic group (F4: Aro). The compounds that have potential as σ2 agonist activity based on the results of the virtual screening contained 10 compounds with ΔG = -19.6319 kkal/mol, -20.9598 kkal/mol, -19.2058 kkal/mol, -17.4499 kkal/mol, -22.4364 kkal/mol, -18.0056 kkal/mol, -5.5653 kkal/mol, -9.5687kkal/mol, and -9.8045 kkal/mol.
QSAR DAN MOLECULAR DOCKING SENYAWA DERIVAT LUMIRACOXIB, INHIBITOR OKSIGENASI 2-AG PADA TERAPI INFLAMASI Nursalam Hamzah; Haeria Haeria; Nurul Muhlisa Mus
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 3 No 2 (2015): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v3i2.2202

Abstract

Cyclooxygenase-2 (COX-2) is a molecular target that is widely studied and has a crucial role in the last decade. The high contribution of COX-2 in inflammation and inhibiting function of 2-AG oxygenation by COX-2 inhibitors in inflammatory, open a new chapter dealing with the research on inhibition of COX-2. The purpose of this study is to determine the physical-chemical properties that play an important role in the activity of lumiracoxib derivates based QSAR equation and look from the interaction of ligand-receptor through docking simulations. Statistical analysis was calculated by multilinear regression analysis using SPSS Statistics 17.0. Leave One Out cross validation, Pearson correlation, and the relationship of IC50 experiments and IC50 predictions curve are used to obtain QSAR equation with significantly statistic criteria. Molecular docking to study ligand-receptor interactions, performed using MOE 2009.10. Hydrogen bonds with amino acid residues on the receptor 4OTY include Ser A530 and Tyr A385 with the best scoring value in compound 8 is -8.0976 and the receptor 3HS6 include Ser A530, Tyr A385, Tyr A355 with the best scoring value in compound 1 is -6.34934. QSAR models show the best QSAR equation: Log (1/IC50) = -92.2384 + 0.5327 AM1_dipole + (-0.00049) AM1_E + 13.3123 log S + 35.7654 mr + (-0.5770 VSA).
Pengembangan dan Profil Farmakokinetik Senyawa Turunan Pirazolo-(3,4-D)-Pirimidin Sebagai Inhibitor Mer Secara Insilico Nursalam Hamzah; Nurmaya Efendi; Muh. Hidayat
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 2 No 2 (2014): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v2i2.2207

Abstract

The Mer receptor is an important target for development of molecular probes in oncology because just expressed by T cell Acute Leukemia Lymphboblastic and not expressed by T-cell normal and a ATP kinase competitive inhibitor. The purpose of this research is development derivate Pyrazolo-[3,4-D]-pyrimidin then choose candidate active and selective chemicals for Mer receptor to be a treatment for acute leukemi lymphoblastic by insilico. Procedures are began with modelingand geometry optimization of molecular structure which made by HyperChem 8.0. Geometry optimization was performed by Ab initio method. QSAR descriptors were calculated by MOE 2009. The next step is determine pharmacokinetic profile with AdmetSAR and DemPred. Based on pharmacokinetic predictions overall koefisian compounds have the same choice 1.0000 on human intestinalabsorption can be absorbed properly. the most well permeabiltas Caco2 cells are compounds 008 and 115. Compounds 008 and 115 also has the lowest coefficient on thepenetration of blood brain barrier. Compounds 008 and 115 have the smallest volume of distribution is 2.400352 L / kg means that the volume of the compounds 008 and 115.Compounds with the best clearance of compounds 001 and 111 with a clearan  of 2.058811 ml / min / kg.
STUDI INSILICOHUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR-AKTIVITAS (HKSA)SENYAWA TURUNAN BENZIMIDAZOLE, DOCKING MOLEKUL, PENELUSURAN FARMAKOFOR, VIRTUAL SCREENING, UJI TOKSISITAS, PROFIL FARMAKOKINETIK SEBAGAI ANTI-TUBERKULOSIS Nursalam Hamzah; Nur Syamsi Dhuha; Reza Ramadhan
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 3 No 3 (2015): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v3i3.2215

Abstract

Telah dilakukan Telah dilakukan penelitian studi hubungan kuantitatif struktur-aktivitas (HKSA), docking molekul, penelusuran farmakofor, virtual screening, uji toksisitas, dan profil farmakokinetik pada turunan Benzimidazole sebagai inhibitor DNA Gyrase pada penyakit Tuberkulosis secara in silico. Penelitian ini bertujuan untuk menemukan model persamaan HKSA senyawa, menemukan fitur-fitur farmakofor senyawa yang  bertanggung jawab atas aktivitas dan selektivitas DNA Gyrase, serta memilih senyawa hasil virtual screening yang kemudian ditentukan profil farmakokinetik, toksisitas, dan toksisitas metabolit untuk pengobatan Tuberkulosis. Prosedur dimulai dengan pemodelan dan optimasi geometri struktur molekul pada perangkat lunak HyperChem 8.0. Optimasi geometri dilakukan dengan metode Ab initio. Perhitungan Deskriptor HKSA, penentuan fitur farmakofor dan docking molekul dilakukan  dengan menggunakan perangkat lunak MOE 2009. Selanjutnya pengujian toksisitas dengan perangkat lunak Toxtree dan AdmetSAR, serta penentuan profil farmakokinetik dengan menggunakan program berbasis web PreADME dilakukan untuk 150.000 senyawa natural product dari zinc database. Dari penelitian didapatkan persamaan: Log 1/MIC = -8.6816 + 1.6938 AM1_LUMO + 0.0160 ASA_H – 3.9194 mr  + 0.1087 VSA, dimana r2 = 0,955 dan q2 = 0,8761, selanjutnya diperoleh hasil docking molekul pada protein kode 2XCS, senyawa 23 menunjukkan nilai docking score (S) -190.9309. Hasil virtual screening pada zinc database diperoleh senyawa dengan kode ZINC08964902 adalah senyawa yang paling baik diantara 150.000 senyawa yang dilihat dari sisi kecocokan pada query farmakofor, docking dengan metode farmakofor, prediksi bioavailabilitas menggunakan rule of 5 Lipinski, dan prediksi ADME/T
STUDI HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR-AKTIFITAS (HKSA)SENYAWA TURUNAN 4-AMINOQUINOLIN PIRIMIDIN, DOCKING MOLEKUL, PENELUSURAN FARMAKOFOR, VIRTUAL SCREENING, UJI TOKSISITAS, DAN PROFIL FARMAKOKINETIK SEBAGAI ANTIMALARIA SECARA IN SILICO Nursalam Hamzah; Afrisusnawati Rauf; Ariwanti Ariwanti
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 3 No 4 (2015): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v3i4.2225

Abstract

A research of quantitative structure-activity relationship (QSAR), molecular docking, searching pharmacophore, virtual screening, toxicity test, and Pharmacokinetic Profile of 4-Aminoquinoline Pyrimidine Derivative Compounds as Plasmepsin enzyme inhibitor as Antimalarial by in silico has been conducted. This study aims to find the QSAR model equation of 4-Aminoquinoline Pyrimidine derivative compounds,  to find pharmacophore features of compounds that responsible for inhibition activity of Plasmepsin enzyme in Plasmodium falciparum, as well as to select compounds from virtual screening results then determine the pharmacocinetic profile, and the toxicity of metabolites for malaria treatment. The procedure begins with the modelling and ab initio geometry optimization of the molecular structure by HyperChem 8.0. QSAR descriptors calculation, pharmacophore feature determination and molecular docking are done by using MOE 2009. Furthermore, toxicity testing by Toxtree and AdmetSAR, as well as pharmacokinetic profile determination by using PreADME done to 150.000 natural product compounds from zinc database. From the experiments, the equation obtained: 1/IC50 = 5.3757 + (0.7514 AM1_HOMO) + (-0.3100 log P (o/w)) + (0.0065 vdw_vol), where r2 = 0.9282 dan q2 = 0.9282, beside that molecular docking results for protein code 2IGX compound 13 showed better results with the value of docking score (S) is -129.7491.  As for the compounds of zinc database, the result is a compound with code ZINC32501354 and ZINC32501366 are choosen compound among 150.000 compounds in terms of suitability of the pharmacophore query, docking by pharmacophore method, bioavailability prediction using Lipinski rule of five and from the prediction of ADME/T
HUBUNGAN KUANTITATIF SKRUKTUR AKTIVITAS SENYAWA TURUNAN 1-BENZENE ACYL-2-(METHYLINDOL-3-YL)-BENSIMIDAZOLE SEBAGAI INHIBITOR PERTUMBUHAN MCF-7 Nursalam Hamzah; Nur Syamsi Dhuha; Hasma Nur Putrianti
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 5 No 2 (2017): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v5i2.3397

Abstract

Tujuan penelitian ini adalah menentukan sifat fisika-kimia yang berperan penting sebagai inhibitor polimerisasi tubulin dan antiprolifeasi MCF-7 untuk pengobatan kanker payudara berdasarkan persamaan Hubungan Kuantitatif Struktur dengan Aktivitas (HKSA). Prosedur dimulai dengan pemodelan dan optimasi geometri struktur molekul yang dibuat dengan HyperChem 8.0. Optimasi geometri dilakukan dengan metode Ab initio. Deskriptor HKSA dihitung dengan menggunakan MOE 2009. Selanjutnya dilakukan analisis statistik untuk melihat hubungan antara aktivitas dengan sifat kimia fisika. Validasi silang Leave One Out digunakan untuk memperoleh persamaan HKSA dengan kriteria statistik yang signifikan. Hasil penelitian menunjukkan model persamaan HKSA terbaik dari deskriptor persamaan terbaik di atas, yaitu: Log IC50= 8,660 – 0,000209 AM1-E – 0,0000164 AM1_Eele – 3,825 Glob + 0,762 log P (O/W), dimana nilai r = 0,926; q2 = 0,789; F = 28,765; standar error = 0,218 dan nilai R2 dari kurva MIC eksperimen vs MIC prediksi = 0,792.
TEKNIK SINTESIS POVIDON Nursalam Hamzah
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 5 No 3 (2017): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v5i3.4358

Abstract

Povidon telah luas digunakan dalam bidang farmasi. Mekanisme sintesisnya berdasarkan reaksi polimerisasi adisi. Teknik sintesisnya sangat luas meliputi metode massal, larutan, suspensi, emulsi dan endapan. Metode massal dan larutan kadang menghasilkan povidon dengan bobot molekul yang rendah. Sedangkan metode endapan menghasilkan povidon dengan bobot molekul yang tinggi. Selain itu, inisiator yang digunakan untuk reaksi adisi juga beragam, tetapi senyawa turunan peroksida merupakan inisiator reaksi yang paling luas digunakan. Hal ini karena bobot molekul yang dihasilkan lebih tinggi dan strukturnya tidak mengalami percabangan.Povidon dapat ditingkatkan kualitasnya dengan membentuknya menjadi kopolimer dan ikat silang. Molekul yang dihasilkan dapat memperbaiki higroskopisitas, kekentalan dan daya rekatnya. Tetapi terkadang mempengaruhi kemampuannya dalam mengikat air. Povidon telah luas digunakan dalam dunia farmasi sebagai bahan penghancur dalam tablet dan penstabil suspensi. Selain itu digunakan juga dalam campuran obat luka.
AKTIVITAS INHIBISI PERTUMBUHAN MICOBACTERIUM TUBERCULOSIS DAN PLASMODIUM FALCIPARUM DARI EKSTRAK METANOL DAUN BOTTO-BOTTO (Chromolaena odorata Linn) Nursalam Hamzah; Nurfadilah Absa; St Rahmah Akbar; Syamsuri Syakri; Nur Syamsi Dhuha; Isriany Ismail
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 5 No 4 (2017): Jurnal Farmasi
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v5i4.4470

Abstract

Tuberkulosis dan malaria merupakan dua penyakit infeksi berbahaya yang menyebabkan kematian jutaan orang, hampir setiap tahun. Pengobatannya mengalami kendala sebab terjadinya resistensi antituberkulosis dan antimalaria saat ini. Untuk itu dibutuhkan obat baru untuk mengatasi resistensi oleh penyakit-penyakit infeksi tersebut. Salah satu sumber obat baru Indonesia adalah tumbuhan botto-botto. Tumbuhan ini telah dimanfaatkan dalam etnofarmakologi sebagai obat antibakteri. Untuk itu perlu diteliti kemampuan tumbuhan botto-botto sebagai obat antituberkulosis dan malaria. Prosedur dimulai dengan ekstraksi daun botto-botto yang telah kering dengan pelarut metanol. Ekstrak yang diperoleh diuji aktivitas antiplasmodium dengan metode Desjardins dan antituberkulosis dengan metode MODS. Hasilnya bahwa ekstrak metanol daun botto-botto menghambat pertumbuhan Plasmodium falciparum dan mungkin menghambat pertumbuhan Mycobacterium tuberculosis.
EKSTRAKSI DAN PEMBUATAN GELATIN DARI KULIT DAN TULANG RAWAN SAPI DALAM PENGGUNAANNYA SEBAGAI BAHAN DASAR PEMBUAT GEL (Gelling Agent) Afrisusnawati Rauf; Nursalam Hamzah; Uliyanti Uliyanti
Jurnal Farmasi UIN Alauddin Makassar Vol 8 No 2 (2020): Jurnal Farmasi Edisi November
Publisher : Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/jurfar.v8i2.19083

Abstract

Gelatin merupakan salah satu bahan baku terpenting di dunia yang dibutuhkan oleh industri pangan dan non pangan. Di Indonesia, produk gelatin yang halal sangat penting untuk dihadirkan karena mayoritas penduduk Indonesia beragama Islam. Tujuan penelitian ini adalah melakukan ekstraksi gelatin dari kulit dan tulang rawan sapi sebagai bahan dasar dalam pembuat gel (gelling agent). Ekstraksi gelatin dari kulit dan tulang rawan sapi dilakukan melalui perendaman dalam asam klorida 5%. Kulit dan tulang rawan sapi dicuci dengan air mengalir dan ditambahkan NaOH sampai pH netral (6-7) dan diekstraksi dengan aquadest pada suhu 700C. Ekstrak gelatin yang dihasilkan disaring dengan kain flanel, dan filtrat dikeringkan dengan freezer dryer ±60 jam sehingga diperoleh lembaran gelatin yang kemudian dihaluskan. Gelatin yang diperoleh diformulasikan dalam sediaan gel dan dibuat tiga formula yaitu (F1) formula gelain kulit sapi; (F2) formula gelatin tulang rawan sapi; dan (F3) formula gelatin komersil. Gel yang diperoleh diuji sifat fisiknya meliputi organoleptis, homogenitas, daya sebar, viskositas, dan pH. Hasil uji organoleptis, homogenitas, daya sebar, viskositas, dan pH dianalisis menggunakan analisis deskriptif secara visual, sedangkan daya sebar dianalisis dengan uji regresi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua formula memenuhi kriteria untuk uji pH, daya sebar, organoleptik, homogenitas kecuali uji viskositas. Pada uji viskositas menunjukkan bahwa formula gel gelatin tulang rawan sapi (F2) memenuhi kriteria dibandingkan dengan formula gel gelatin kulit sapi (F1). 
STUDI HKSA SENYAWA PIRAZOLO-(3,4-D)-PIRIMIDIN SEBAGAI INHIBITOR AXL DAN TYRO3 SERTA PERBANDINGANNYA DESKRIPTORNYA DENGAN INHIBITOR MER TIROSIN KINASE Nursalam Hamzah
PHARMACY: Jurnal Farmasi Indonesia (Pharmaceutical Journal of Indonesia) Jurnal Pharmacy, Vol. 09 No. 03 Desember 2012
Publisher : Pharmacy Faculty, Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30595/pji.v9i3.748

Abstract

ABSTRAK Mer Tirosin Kinase diekspresikan secara ektopik dalam sel T dan B pasien Leukemia Limfoblatik Akut (LLA), tetapi tidak diekspresikan pada sel T dan B manusia normal pada setiap tahap perkembangannya. Oleh karena itu, Mer tirosin kinase dapat menjadi target pengobatan LLA dengan selektifitas yang baik. Penghambatan fosforilasi reseptor Mer oleh suatu inhibitor tranduksi sinyal dapat menurunkan proliferasi sel dan meningkatkan apoptosis, sehingga menekan perkembangan sel leukemia. Pirazolo-[3,4-d]-pirimidin adalah obat generasi baru yang bertindak sebagai inhibitor dari Mer tirosin kinase. Tujuan penelitian ini adalah untuk menentukan deskriptor yang berpengaruh terhadap aktivitas penghambatan reseptor Axl dan Tyro3, serta membandingkannya dengan deskriptor inhibitor Mer tirosin kinase, sehingga diperoleh senyawa turunan pirazolo-(3,4-d)-pirimidin dengan yang spesifik untuk inhibisi Mer. Pemodelan dan optimasi geometri mengunakan perangkat lunak HyperChem®. Struktur molekul optimasi geometri menggunakan metode Ab initio. Nilai prediktor dihitung menggunakan MOE® dan perhitungan statistik untuk menyusun persamaan HKSA menggunakan SPSS®. Persamaan terpilih ditentukan dengan kriteria statistik terbaik, yaitu r2, korelasi pearson, dan q2 validasi Leave One Out. Lima deskriptor berperan penting dalam aktivitas inhibisi Axl dan Tyro3. Pengembangan senyawa yang selektif untuk menghambat aktivitas Mer dapat dibuat dengan modifikasi gugus yang meningkatkan volume van der waals dan penambahan gugus penarik elektron, sehingga dapat diperoleh obat dengan efek samping minimal. Kata kunci: leukemia limfoblastik akut, pirazolo-[3,4-d]-pirimidin, Mer, Axl, Tyro3. ABSTRACT Mer Tyrosine Kinase is ectopically expressed in T and B cells of Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) patient, but is not expressed in normal human T and B cells at any stage of its development. Therefore Mer Tyrosine Kinase can be a treatment target ALL with a good selectivity. Phosphorylation inhibition of Mer receptor by signal transduction inhibitor decreases cell proliferation and increases apoptosis, thereby suppressing the development of leukemia cells. Pirazolo-[3,4-d]-pyrimidines area new generation of drugs that act as inhibitors of Mer tyrosine kinase. The purposes of the present research are to determine descriptors that influence the inhibitory activity on Axl and Tyro3, and compare it with the Mer tyrosine kinase inhibitors descriptors, so that we can make derivative compounds pirazolo-(3,4-d)-pirimidin with the specific inhibition on Mer. Modeling and optimization geometry was carried out using HyperChem® software. Molecules structure were geometrically optimized using Ab initio method. Predictors values were computed using MOE® and statistical calculations of QSAR equations was carried out using SPSS®. The selected equation was determined by the best statistical criteria, such as r2, Pearson correlations, and q2Leave One Out validation. 5 descriptors play an important role in the inhibitory activity of Axl and Tyro3. Development of compounds that selectively inhibit the activity of Mer can be made by modifying groups that increases the volume of van der waals and the addition of an electron withdrawing groups, to obtain the drugs with minimal side effects. Key words: acute lymphoblastic leukemia, pyrazolo-[3,4-d]-pyrimidine, Mer, Axl, Tyro3.