Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
3.11
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Journal of Tropical Life Science : International Journal of Theoretical, Experimental, and Applied Life Sciences International Journal of Biosciences and Biotechnology Jurnal Bios Logos Jurnal Natur Indonesia Jurnal Keteknikan Pertanian AL KAUNIYAH Jurnal Online Mahasiswa (JOM) Bidang Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Jurnal Penelitian Kehutanan Sumatrana Jurnal Riau Biologia Jurnal Pengabdian UntukMu NegeRI BIOLINK (Jurnal Biologi Lingkungan, Industri, Kesehatan) Jurnal Biologi Tropis Biosaintifika: Journal of Biology & Biology Education Bio-Lectura Jurnal Agronomi Tanaman Tropika (JUATIKA) Dinamika Pertanian Science, Technology, and Communication Journal Biosaintifika: Journal of Biology & Biology Education
Dewi Indriyani Roslim
Unknown Affiliation
Religion Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Computer Science & IT Economics, Econometrics & Finance Education Electrical & Electronics Engineering Engineering Environmental Science Immunology & microbiology Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Materials Science & Nanotechnology Mathematics Medicine & Pharmacology Social Sciences

Published : 56 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search
Journal : AL KAUNIYAH

 1 
Sekuen DNA Parsial Dari Gen GAPDH Pada Sirsak (Annona muricata L.) Roslim, Dewi Indriyani; Asih, Hastini; Herman, Herman
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 13, No 2 (2020): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v13i2.13964

Abstract

AbstrakGen glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) merupakan salah satu gen referensi yang sering bertindak sebagai kontrol internal pada analisis ekspresi gen di beberapa spesies tumbuhan. Penelitian ini bertujuan menganalisis sekuen gen GAPDH parsial pada sirsak (Annona muricata L.). Metode meliputi persiapan sampel tanaman, isolasi DNA total menggunakan Genomic DNA mini kit Plant (Geneaid), amplifikasi gen GAPDH dengan teknik polymerase chain reaction (PCR), elektroforesis pada 1% gel agarose dan analisis data sekuen DNA. Studi ini telah memperoleh sekuen DNA dari gen GAPDH parsial sirsak sepanjang 961 pb. Sekuen tersebut memiliki kemiripan sekitar 68,93–84,35% dengan sekuen mRNA gen GAPDH pada beberapa spesies tumbuhan. Sekuen ini diprediksi terdiri dari 5 ekson dan 4 intron. Total ekson diprediksi terdiri dari 429 pb. Sekuen ini adalah yang pertama kali dilaporkan dari genus Annona dan juga dari famili Annonaceae. Sekuen ini dapat dimanfaatkan untuk analisis ekspresi gen pada sirsak dan dapat menjadi dasar untuk mengisolasi gen GAPDH spesies lain di dalam genus Annona dan famili Annonaceae. Abstract GAPDH (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase) gene is one of reference genes that is frequently became an internal control in any plant species. This study reports a DNA sequence of parsial GAPDH gene on soursop (Annona muricata L.). Methods included sample preparation, total DNA isolation using Genomic DNA mini kit Plant (Geneaid), amplification of GAPDH gene using PCR (polymerase chain reaction) technique, electrophoresis using 1% agarose gel and data analysis. This study had been obtained the DNA sequence of soursop partial GAPDH gene sizing 961 bp. The sequence had 68.93–84.35% similarity to GAPDH mRNA of some plants species. The soursop partial GAPDH gene was predicted consisting of 5 exons and 4 introns. The total exons length was 429 bp. The sequence is the first reported from Annona genus and also Annonaceae family. The sequence can be used for gene expression in soursop and also can be used to isolate GAPDH gene of other species in Annona genus and Annonaceae family.
KEANEKARAGAMAN FENOTIPIK NGENGAT (Subordo Heterocera) BERDASARKAN KARAKTER MORFOLOGI DI KAWASAN UNIVERSITAS RIAU DAN DESA SIABU, PROVINSI RIAU Ennie Chahyadi; Nuryani Nuryani; Dewi Indriyani Roslim
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 12, No 1 (2019): Al-Kauniyah Jurnal Biologi
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (1231.909 KB) | DOI: 10.15408/kauniyah.v12i1.6793

Abstract

AbstrakPenelitian tentang ngengat masih sangat sedikit dilakukan di Indonesia terutama di kawasan Universitas Riau dan Desa Siabu Kampar belum ada datanya. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis keanekaragaman fenotip ngengat berdasarkan karakter morfologi untuk mengetahui jarak genetik ngengat di kawasan Universitas Riau dan Desa Siabu. Penelitian dilakukan pada bulan Desember 2016 hingga Mei 2017. Lokasi pengambilan sampel terdapat di dua kawasan dengan enam lokasi yang berbeda yaitu Universitas Riau (Arboretum, Kebun FMIPA, Rusunawa) dan Desa Siabu (perumahan warga, Bukit Tentado dan hutan sekunder). Metode sampling mengunakan perangkap layar (light trap) sebagai sumber cahaya digunakan lampu mercuri merk Philips 160 watt. Bagian tubuh ngengat yang diamati adalah kepala, torak, abdomen dan sayap, jumlah karakter morfologi yang diamati adalah 24 karakter. Setiap karakter morfologi diberi skor kemudian dianalisis menggunakan program NTSYS ps versi 2.02i. Hasil yang didapat yaitu 61 spesies dengan 414 individu dari 10 famili ngengat.  Keanekaragaman fenetik ngengat di Universitas Riau dan Desa Siabu berturut turut adalah 87% dan 78%. Ngengat dari kedua kawasan menunjukkan perbedaan pada karakter ukuran, namun tidak pada karakter morfologi dan warna. Terdapat adanya kemiripan sebesar 66% antara ngengat yang dikoleksi dari Universitas Riau (kebun FMIPA, rusunawa) dengan Desa Siabu (Bukit Tentado dan hutan sekunder).Abstract Research on moths is still very few in Indonesia. Especially in the area of Riau University and Siabu Kampar Village. There is no datum about moths. The objective of this research is to analyze the genetic diversity of moths in Riau University and Siabu Vilage, Riau Province based on morphological characters. The study was conducted from December 2016 to May 2017. The moths were collected from two areas with six different locations such as Riau University (arboretum of mathematics and science faculty) and Siabu Village (village residence, Tentado Hill, and secondary forest). The sampling method that used was the light trap, with 160 watts of mercury, was used as a light source. The parts of the body observed were head, thorax, abdomen, and wings with the number of morphological characters observed by 24 characters. Morphological characters were observed and scored and then analyzed using the NTSYSp c version 2.02i software. The results showed that there were 61 species with 414 individuals from 10 families of moths. The genetic diversity of moth in the Riau University and Siabu Village was 87% and 78%. Moths on both locations indicated no difference in the shape and color, but they were different in size. Moths from FMIPA garden and rusunawa had 66% genetic similarity to one from Tentado Hill and secondary forest.
Analisis Empat Sekuen Barkode DNA Pada Pandan (Benstonea sp.) Asal Danau Kajuik, Riau Dewi Indriyani Roslim; Intan Sari Nuraini; Siti Nurhayati; Ciska Vivian Sianturi; At-Thahirah At-Thahirah; Herman Herman
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 16, No 1 (2023): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v16i1.21697

Abstract

Barkode DNA merupakan sekuen DNA berukuran pendek yang digunakan untuk identifikasi organisme secara molekuler. Penelitian bertujuan menganalisis empat barkode DNA pada tumbuhan pandan (Benstonea sp.) asal Danau Kajuik, Riau. Metode meliputi isolasi DNA, PCR, elektroforesis, purifikasi, sekuesing, serta analisis bioinformatika. Pada penelitian ini telah diperoleh sekuen DNA untuk atpB-rbcL IGS, trnV-ndhC IGS, ndhF-rpl32 IGS, dan trnQ-5’rps16 IGS sepanjang 812 pb, 924 pb, 952 pb, dan 886 pb, secara berturut-turut. Aksesi yang muncul paling atas pada analisis BLASTn pada keempat sekuen tersebut tidak ada yang memiliki kemiripan 100% dengan Benstonea sp. asal Danau Kajuik, Riau. Walaupun nilai query cover tinggi (93–100%) dan E-value sebesar 0,00. Pada keempat barkode DNA yang diteliti, terdapat beberapa perbedaan nukleotida yang disebabkan oleh mutasi insersi-delesi (indel) (6,99%) maupun subtitusi (4,96%). Mutasi indel paling banyak dijumpai pada sekuen trnV-ndhC IGS dan mutasi subtitusi paling banyak terjadi pada sekuen ndhF-rpl32 IGS. Nukleotida kritis yang menjadi penciri bagi Benstonea sp. asal Danau Kajuik, Riau, dijumpai pada sekuen ndhF-rpl32 IGS dan trnQ-5’rps16 IGS.  Simpulan, dua sekuen DNA yaitu ndhF-rpl32 IGS dan trnQ-5’rps16 IGS berpotensi menjadi barkode DNA untuk identifikasi tumbuhan ini secara molekuler. Ketersediaan barkode DNA pada database publik sangat diperlukan untuk menunjang identifikasi organisme secara molekuler.AbstractDNA barcode is a piece of short DNA that is developed for molecular identification of organisms. This study aims to analyze four DNA barcodes in pandan plant (Benstonea sp.) from Kajuik Lake, Riau. Methods included DNA extraction, PCR, electrophoresis, purification, sequencing, and bioinformatics analysis. The DNA sequences of atpB-rbcL IGS, trnV-ndhC IGS, ndhF-rpl32 IGS, and trnQ-5’rps16 IGS have been obtained with the length of 812 pb, 924 pb, 952 pb, and 886 pb, respectively. The top accession in BLASTn analysis results showed that there was no accession that had 100% similarity to Benstonea sp. from Kajuik Lake, Riau even though the query cover high (93–100%) and E-value of 0,00. There were some nucleotide variations caused by insertion-deletion (indel) mutation (6,99%) and subtitution (4,96%). Indel was most occur in trnV-ndhC IGS and subtitution in ndhF-rpl32 IGS. Critical nucleotides that were be a characteristic for Benstonea sp. from Kajuik Lake, Riau were seen in ndhF-rpl32 IGS and trnQ-5’rps16 IGS. Conclusion,  both of ndhF-rpl32 IGS and trnQ-5’rps16 IGS are potentially as DNA barcodes for molecular identification of this plant. The avaibility of the DNA barcodes is very important to support of organisms molecular identifications.
Analisis Empat Sekuen Barkode DNA Pada Pandan (Benstonea sp.) Asal Danau Kajuik, Riau Dewi Indriyani Roslim; Intan Sari Nuraini; Siti Nurhayati; Ciska Vivian Sianturi; At-Thahirah At-Thahirah; Herman Herman
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 16, No 1 (2023): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v16i1.21697

Abstract

Barkode DNA merupakan sekuen DNA berukuran pendek yang digunakan untuk identifikasi organisme secara molekuler. Penelitian bertujuan menganalisis empat barkode DNA pada tumbuhan pandan (Benstonea sp.) asal Danau Kajuik, Riau. Metode meliputi isolasi DNA, PCR, elektroforesis, purifikasi, sekuesing, serta analisis bioinformatika. Pada penelitian ini telah diperoleh sekuen DNA untuk atpB-rbcL IGS, trnV-ndhC IGS, ndhF-rpl32 IGS, dan trnQ-5’rps16 IGS sepanjang 812 pb, 924 pb, 952 pb, dan 886 pb, secara berturut-turut. Aksesi yang muncul paling atas pada analisis BLASTn pada keempat sekuen tersebut tidak ada yang memiliki kemiripan 100% dengan Benstonea sp. asal Danau Kajuik, Riau. Walaupun nilai query cover tinggi (93–100%) dan E-value sebesar 0,00. Pada keempat barkode DNA yang diteliti, terdapat beberapa perbedaan nukleotida yang disebabkan oleh mutasi insersi-delesi (indel) (6,99%) maupun subtitusi (4,96%). Mutasi indel paling banyak dijumpai pada sekuen trnV-ndhC IGS dan mutasi subtitusi paling banyak terjadi pada sekuen ndhF-rpl32 IGS. Nukleotida kritis yang menjadi penciri bagi Benstonea sp. asal Danau Kajuik, Riau, dijumpai pada sekuen ndhF-rpl32 IGS dan trnQ-5’rps16 IGS.  Simpulan, dua sekuen DNA yaitu ndhF-rpl32 IGS dan trnQ-5’rps16 IGS berpotensi menjadi barkode DNA untuk identifikasi tumbuhan ini secara molekuler. Ketersediaan barkode DNA pada database publik sangat diperlukan untuk menunjang identifikasi organisme secara molekuler.AbstractDNA barcode is a piece of short DNA that is developed for molecular identification of organisms. This study aims to analyze four DNA barcodes in pandan plant (Benstonea sp.) from Kajuik Lake, Riau. Methods included DNA extraction, PCR, electrophoresis, purification, sequencing, and bioinformatics analysis. The DNA sequences of atpB-rbcL IGS, trnV-ndhC IGS, ndhF-rpl32 IGS, and trnQ-5’rps16 IGS have been obtained with the length of 812 pb, 924 pb, 952 pb, and 886 pb, respectively. The top accession in BLASTn analysis results showed that there was no accession that had 100% similarity to Benstonea sp. from Kajuik Lake, Riau even though the query cover high (93–100%) and E-value of 0,00. There were some nucleotide variations caused by insertion-deletion (indel) mutation (6,99%) and subtitution (4,96%). Indel was most occur in trnV-ndhC IGS and subtitution in ndhF-rpl32 IGS. Critical nucleotides that were be a characteristic for Benstonea sp. from Kajuik Lake, Riau were seen in ndhF-rpl32 IGS and trnQ-5’rps16 IGS. Conclusion,  both of ndhF-rpl32 IGS and trnQ-5’rps16 IGS are potentially as DNA barcodes for molecular identification of this plant. The avaibility of the DNA barcodes is very important to support of organisms molecular identifications.
Co-Authors ', Herman ', Tasiah , Deviona, , , HERMAN Abd. Rasyid Syamsuri Adiwirman Adiwirman, Adiwirman Akmal, Fidia Al Khairi, Hapiz Aldri Frinaldi ALEX HARTANA Altuhaish, Adeel Abdulkarim Fadhl Andariyusti, Felly Andriani, Lestari Anna Safarrida, Anna Arief Priyadi Ashfira Ashfira Ashfira, Ashfira Asih, Hastini Aslim Rasyad Aslim Rasyad At-Thahirah At-Thahirah Awitdrus Awitdrus, Awitdrus Azrial Azrial Azrial, Azrial Baehaqi Budiono, Deanne Yoshe Fidela Cahyati, Isa Endar Ciska Vivian Sianturi Daniel Happy Putra Defrianto Defrianto Desriani Ritawati Hutagalung Dilla Mutiarawati Dini Septya Nastiti Dita Deanesia Dodi Frianto, Dodi Endah Budi Lestari ENNIE CHAHYADI, ENNIE Fadel Nugraha Faizah, Niswah Fifi Puspita Fitriadi, Zul Fitriani, Ana Fitriyatun Nisa, Fitriyatun Frederika Sinuraya Furqoni, Aries Tri Hadiwiyono Hadiwiyono HAJRIAL ASWIDINNOOR Hasibuan, Aldy Riau Wansyah Herman Herman Herman - Herman - Herman Herman Herman Herman Herman Herman Hestia Hairima Hutagalung, Desriani Ritawati Imra Atul Uswah Ingga Yurisna Fitriani Intan Sari Nuraini Jumin, Hasan Basri Lambok Nia Natalya Larissa Anggisti Lestari Andriani Linda Novita Liza Aulia Yusfi Martupa Nainggolan Mayang Sari Mayta Novaliza Isda Miftahudin . Miftahul Rahmah Muhamad Fauzan Muhammad Luthfi Multivasari, Nella Mutiarawati, Dilla Nery Sofiyanti Niswah Faizah Nur Aisyah Nur Aisyah Nurin Nuryani NURKHAIRANI, PUTRI Nurwijayanti Nuryani Nuryani PATMASARI, MUDRIKA Putri Agustina PUTRI PANJAITAN, KHAIRIZA UMAMI Putri, Fatma Jumaita Putri, Shalsadila Rahmadani Rahmi Anandia Rio Riduan Rosmeilinda, Tio Fanny Roza Elvyra Saktioto Saktioto SARAGIH, JESSICA RODEARNI Siahaan, Citra Winarni Siti Fatonah Siti Khumairoh, Siti Siti Nurhayati Sofhya, Putri Tri Sri Wahyuningsih Sugeng Santoso Suha Maudina Berampu Suhardi Suhardi Suharyanto Suharyanto Susilo Hambeg Poromarto Tio Fanny Rosmeilinda Tisha Melia Utut Suharsono Vera Magdaleni Manullang Wahyu Lestari Wahyu Lestari Yolla Putri Ardilla Yolla Putri Ardilla YULMINARTI, YULMINARTI Yundari, Yundari