Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
1.203
P-Index
This Author published in this journals
All Journal HAYATI Journal of Biosciences Jurnal Sain Veteriner Biota: Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia (JBBI) Jurnal Kedokteran Hewan Animal Production
Rini Widayanti
Bagian Klinik Hewan, Fakultas Kedokteran Hewan, Universitas Udayana, Bali
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Earth & Planetary Sciences Economics, Econometrics & Finance Immunology & microbiology Medicine & Pharmacology Veterinary

Published : 20 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 20 Documents
Search

 1   2 
HISTOLOGICAL CHARACTERISTIC OF THE CEREBELLUM IN THE CLIMBING PERCH (Anabas testudineus) Sari, Yuslikha Khaniif Anggita; Ariana, Ariana; Widayanti, Rini; Pangestiningsih, Tri Wahyu
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 19, No 3 (2025): September
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v19i3.48332

Abstract

Anatomical variations in brain shape and size among fish can be influenced by both species and habitat. The cerebellum of the fish brain, plays an essential role in balance regulation and the coordination of motor activity. However, information regarding the fundamental structure of the cerebellum in the climbing perch (Anabas testudineus) is still limited compared with zebrafish (Danio rerio) as the animal model. This study aimed to investigate the histological features of the climbing perch cerebellum. Transverse and sagitttal sections of the cerebellum were fixed in 10% neutral buffered formalin (NBF), processed into histological slides, and stained using cresyl violet. The parts of cerebellum and neurons morphology were observed using a light microscope equipped with Optilab then the resulting data were analyzed descriptively. The findings revealed that the cerebellum comprises three main parts: the corpus cerebelli, valvula cerebelli, and the vestibulolateral lobe, which includes the eminentia granularis and caudal lobe. The cerebellar cortex of the corpus and a valvula cerebelli consists of the molecular layer, ganglionic layer, and granular layer, while the vestibulolateral lobe is made up of a granular layer. Various neuronal types were identified, including rounded stellate cells, pear-shaped Purkinje cells, spindle-shaped eurydendroid cells, small rounded granular cells, and rounded or polygonal Golgi cells. In conclusion, while the cerebellar histology of Anabas testudineus is largely comparable to that of Danio rerio, its valvula cerebelli lacks the medial and lateral subdivisions found in the zebrafish.
ANALYSIS OF APOLIPOPROTEIN-B (APO-B) GENE IN ATHEROSCLEROSIS MICE GIVEN CURCUMINOID EXTRACT OF ZANTHORRIZA IN ORAL Susmiati, Trini; Widayanti, Rini; Purwantoro, Aris; Airin, Claude Mona; Sarmin, Sarmin
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 13, No 2 (2019): June
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v13i2.10219

Abstract

The aim of this study was to investigate the apolipoprotein-B (apo-B) gene in atherosclerosis mice which were orally given curcuminoid extract of Curcuma xanthorriza. A total number of 30 white mice were split into 6 groups, the first group considered as control (without any treatment), second group as atherogenic feed control, the third group as extract control, while the fourth, fifth and sixth groups as atherogenic feed and curcuminoid Curcuma xanthorriza extract group treated with 5 mg/mouse, 10 mg/mouse and 15 mg/ mouse, respectively for three months. The blood samples were taken from all six groups for the deoxyribonucleic acid (DNA) analysis using total DNA isolation, DNA amplification with polymerase chain reaction (PCR), and DNA sequencing. The data analysis showed that 374 bp nucleotide sequence gen of apo-B from Rattus norvegicus in groups B, C, D, E, and F did not cause any changes in genes. The analysis showed the sequence of apo-B Rattus norvegicus gene in the treatment group was apparently identical with that of Rattus norvegicus group A as the control group without treatment. As conclusion, the administration of curcuminoid zanthorrizza to atherosclerosis mice did not change the gene structure of apo-B 100.
KAJIAN MOLEKULER LUMBA-LUMBA HIDUNG BOTOL (Tursiops sp.) ASAL LAUT JAWA BERDASAR URUTAN GEN CYTOCHROME C OXIDASE SUB-UNIT II (COX II) (Molecular Studies of Bottlenose Dolphins (Tursiops sp.) from Java Sea by Gene Sequences of Cytochrome C Oxidase Sub-Unit II (COX II)) Widayanti, Rini; Fibrianto, Yuda Heru
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 10, No 1 (2016): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v10i1.3357

Abstract

The purpose of this study was to examine the molecular basis of Tursiops sp. originated from Java sea based on gene sequences ofCytochrome C Oxidase sub-unit II. Samples of blood were collected from five male bottlenose dolphins from PT. Wersut Seguni Indonesiacaptivity. Total deoxyribonucleic acid (DNA) was isolated from blood samples, then amplified by polymerase chain reaction (PCR), sequenced,and the data were analyzed using MEGA version 5.1 program. The amplification result of the PCR product obtained 824 base pairs (bp), andDNA sequencing obtained 684 nucleotides constituent of COX II genes that encode 228 amino acids making up the COX II. Nucleotide andamino acid sequence of COX II bottlenose dolphins originated from Java sea has a very high homology to Tursiops aduncus that are 99.13%and 100% respectively. Phylogram by neighbour joining method based on the nucleotide sequence of COX II gene indicating bottlenose dolphinsfrom Java sea belongs to group of Tursiops aduncus.Key words: bottlenose dolphin, COX II gene, nucleotide, Jawa Sea
KAJIAN DIVERSITI GENETIKA Tarsius sp. ASAL INDONESIA MENURUT URUTAN GEN NADH DEHIDROGENASE SUBUNIT 4 (ND4) H, Herrialfian; Widayanti, Rini; Wijayanto, Hery; J, Jalaluddin
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 8, No 1 (2014): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v8i1.1268

Abstract

Penelitian ini bertujuan mengkaji keragaman genetik gen penyandi ND4 pada Tarsius bancanus, T. b. borneanus, T. dianae dan T. spectrum dan untuk penegakan taksonominya. Deoxyribonucleic acid (DNA) diisolasi dari biopsi jaringan masing-masing spesies Tarsius dengan cara diekstraksi untuk digunakan sebagai DNA cetakan dalam proses amplifikasi dengan metode polymerase chain reaction (PCR). Primer yang digunakan dalam penelitian ini didesain untuk mengamplifikasi gen ND4 dan dilanjutkan dengan elektroforesis. Produk PCR hasil amplifikasi yang telah dimurnikan, selanjutnya dipergunakan sebagai DNA cetakan untuk reaksi penentuan runutan nukleotida. Runutan nukleotida gen ND4 hasil pengurutan dilakukan penjajaran berganda dengan primata lain yang diambil dari Genbank menggunakan Clustal W. Selain berdasarkan runutan nukleotida, gen ND4 dianalisis berdasarkan runutan asam amino dari basa-basa yang diterjemahkan mengikuti vertebrate mitochondrial translation code yang ada pada program MEGA versi 4.1. Konstruksi pohon filogenetika menggunakan metode neighbor joining. Hasil penelitian menunjukkan dari 1378 nukleotida ditemukan 119 situs yang bersifat beragam. Jarak genetika berdasarkan nukleotida gen ND4 yang dihitung menggunakan model dua parameter Kimura, terdapat nilai paling kecil 0,6%, nilai terbesar 13%, dan nilai rata-rata sebesar 6,1%. Filogram berdasarkan hasil runutan nukleotida gen ND4 yang menggunakan metode neighbor joining, dapat mengidentifikasi dan membedakan percabangan antar spesies Tarsius.
PENENTUAN SUBTIPE VIRUS AVIAN INFLUENZA DENGAN METODE SINGLE STEP MULTIPLEX REVERSE TRANSCRIPTASE- POLYMERASE CHAIN REACTION (RT-PCR) ISOLAT ASAL PROVINSI ACEH Helmi, Teuku Zahrial; Widayanti, Rini; Haryanto, Aris
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 8, No 1 (2014): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v8i1.1265

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah mengidentifikasi keberadaan gen M, H5, dan N1 virus avian influenza (AI) melalui metode single step multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), sebagai acuan untuk peneguhan diagnosis secara molekuler virus AI di Provinsi Aceh. Penelitian ini menggunakan 11 isolat virus AI asal Provinsi Aceh yang diperoleh dari Laboratorium Balai Penyidikan dan Pengujian Veteriner (BPPV) Regional I Medan di Sumatera Utara dari tahun 2006-2008. Penelitian dilakukan di Laboratorium Virologi BPPV Regional I di Medan, Sumatera Utara. Amplifikasi terhadap gen matriks (M) virus AI menggunakan metode simplex RT-PCR. Hasil simplex RT-PCR terhadap gen M diperoleh 10 isolat yang menunjukkan pita deoxyribonucleic acid (DNA) pada 276 bp dan satu isolat yang tidak muncul, kemudian dilanjutkan dengan metode single step multiplex RT-PCR menggunakan pasangan primer gen penyandi protein N1, H5, dan M. Produk PCR 131 bp (N1), 189 bp (H5), dan 276 bp (M) muncul sebagai hasil elektroforesis dari semua isolat virus AI. Semua virus AI yang mewabah dari tahun 2006-2008 di Provinsi Aceh termasuk ke dalam virus influenza A subtipe H5N1.
ANALISIS GENETIKA MOLEKULER KUDA SUMBA BERDASARKAN URUTAN D-LOOP MITOKONDRIA Y, Yuriadi; Widayanti, Rini; Artama, Tunas
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 8, No 1 (2014): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v8i1.1250

Abstract

Penelitian ini bertujuan mengkaji daerah nonkoding (D-loop) deoxyribonucleic acid (DNA) mitokondria kuda sumba. Tiga sampel darah kuda Sandel Wood dari Kabupaten Sumba Timur digunakan untuk isolasi DNA. Produk isolasi DNA diamplifikasi pada daerah D-loop parsial mitokondria dengan metode PCR, primer ECLOOP forward 5-CGCACATTACCCTGGTCTTG-3 dan primer ECLOOP reverse 5GAACCAGATGCCAGGTATG-3, pada kondisi predenaturasi 94 C selama 5 menit, denaturasi 94 C selama 30 detik, annealing 56 C selama 30 detik, elongation 72 C selama 45 detik, dan post elongation 72 C selama 5 menit sebanyak 35 siklus. Reaksi polymerase chain reaction (PCR) menghasilkan produk sepanjang 492 bp kemudian dilakukan pengurutan. Produk pengurutan D-loop dibandingkan dengan spesies kuda lain dari Genbank dan dianalisis menggunakan MEGA versi 4.1. Hasil analisis diperoleh 66 situs nukleotida yang berbeda. Urutan nukleotida D-loop yang dianalisis menggunakan Kimura 2- parameter ditemukan nilai paling kecil 0% dan nilai paling besar 2,9%. Konstruksi pohon filogenetika menggunakan metode neighbour joining dengan nilai bootstrap 1000 kali menunjukkan hubungan kekerabatan yang sangat dekat di antara kuda Sandel Wood. Artinya kuda Sandel Wood 2, 3, dan 4 berasal dari satu keturunan.
KAJIAN DIVERSITI GENETIKA Tarsius sp. ASAL INDONESIA MENURUT URUTAN GEN NADH DEHIDROGENASE SUBUNIT 4 (ND4) H, Herrialfian; Widayanti, Rini; Wijayanto, Hery; J, Jalaluddin
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 8, No 1 (2014): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v8i1.1247

Abstract

Penelitian ini bertujuan mengkaji keragaman genetik gen penyandi ND4 pada Tarsius bancanus, T. b. borneanus, T. dianae dan T. spectrum dan untuk penegakan taksonominya. Deoxyribonucleic acid (DNA) diisolasi dari biopsi jaringan masing-masing spesies Tarsius dengan cara diekstraksi untuk digunakan sebagai DNA cetakan dalam proses amplifikasi dengan metode polymerase chain reaction (PCR). Primer yang digunakan dalam penelitian ini didesain untuk mengamplifikasi gen ND4 dan dilanjutkan dengan elektroforesis. Produk PCR hasil amplifikasi yang telah dimurnikan, selanjutnya dipergunakan sebagai DNA cetakan untuk reaksi penentuan runutan nukleotida. Runutan nukleotida gen ND4 hasil pengurutan dilakukan penjajaran berganda dengan primata lain yang diambil dari Genbank menggunakan Clustal W. Selain berdasarkan runutan nukleotida, gen ND4 dianalisis berdasarkan runutan asam amino dari basa-basa yang diterjemahkan mengikuti vertebrate mitochondrial translation code yang ada pada program MEGA versi 4.1. Konstruksi pohon filogenetika menggunakan metode neighbor joining. Hasil penelitian menunjukkan dari 1378 nukleotida ditemukan 119 situs yang bersifat beragam. Jarak genetika berdasarkan nukleotida gen ND4 yang dihitung menggunakan model dua parameter Kimura, terdapat nilai paling kecil 0,6%, nilai terbesar 13%, dan nilai rata-rata sebesar 6,1%. Filogram berdasarkan hasil runutan nukleotida gen ND4 yang menggunakan metode neighbor joining, dapat mengidentifikasi dan membedakan percabangan antar spesies Tarsius.
KAJIAN DEOXYRIBONUCLEIC ACID (DNA) BARCODE PADA SPESIES Tarsius bancanus, Tarsius spectrum, DAN Tarsius dianae DENGAN MENGGUNAKAN GEN CYTOCHROME OXIDASE SUB-UNIT I (COX1) Baaka, Alnita; Widayanti, Rini
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 7, No 2 (2013): September
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v7i2.926

Abstract

Tujuan penelitian ini adalah mengetahui keragaman genetik gen COX1 pada Tarsius spectrum (T. spectrum), Tarsius dianae (T. dianae), dan Tarsius bancanus (T. bancanus). Sampel yang digunakan adalah 4 sampel jaringan T. spectrum asal Sulawesi Utara, 1 sampel jaringan T. dianae asal Sulawesi Tengah, 2 sampel jaringan T. bancanus asal Lampung, dan 3 sampel jaringan T. bancanus asal Kalimantan. Selanjutnya dilakukan isolasi deoxyribonucleic acid (DNA), amplifikasi dengan teknik polymerase chain reaction (PCR), pengurutan, dan data dianalisis menggunakan program MEGA v. 5.0. Hasil amplifikasi diperoleh produk PCR sebesar 1633 pasang basa (pb), hasil pengurutan DNA ditemukan 240 situs nukleotida dan 16 situs asam amino yang berbeda. Jarak genetika menggunakan Kimura-2 parameter paling tinggi 16,1%, paling kecil 0%, dan rata-rata 8,3%. Pohon filogenetika menggunakan metode Neighbor joining berdasarkan urutan nukleotida dan asam amino COX1 dapat membedakan antara T. bancanus, T. spectrum, dan T. dianae, namun tidak dapat membedakan antara T. bancanus asal Kalimantan dan T. bancanus asal Lampung.
ANALISIS FILOGENETIK ISOLAT VIRUS AVIAN INFLUENZA SUBTIPE H5N1 ASAL PROVINSI ACEH Helmy, Teuku Zahrial; Widayanti, Rini; Haryanto, Aris
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 6, No 1 (2012): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v6i1.348

Abstract

Penelitian ini bertujuan melakukan studi filogenetik virus AI tipe A subtipe H5N1 isolat asal Provinsi Aceh yang dapat memberikaninformasi secara molekuler tentang kekerabatan antar isolat virus AI tipe A subtipe H5N1. Sebanyak 11 isolat virus AI asal Provinsi Aceh yang dikoleksi oleh Laboratorium Virologi Balai Penyidikan dan Pengujian Veteriner (BPPV) Regional I di Medan, Sumatera Utara selama kurun waktu 2007-2008 digunakan dalam penelitian ini. Metode penelitian meliputi preparasi sampel isolat virus, ekstraksi RNA, amplifikasi gen H,elektroforesis DNA hasil amplifikasi, sekuensing, dan analisis data hasil sekuensing dengan software MEGA 4.0. Hasil sekuensing diketahui bahwa daerah yang teramplifikasi sebesar 191 bp. Hasil allignment dari nukleotida 191 bp ditemukan urutan nukleotida yang menyandi 5 asam amino yang berbeda pada posisi asam amino ke-493, 498, 499, 504, dan 515 antara isolat virus AI subtipe H5N1 asal Provinsi Aceh selama tahun 2007-2008 dengan isolat dari pembanding dari gene bank. Kontruksi pohon filogenetik menunjukkan bahwa virus AI subtipe H5N1 asal Provinsi Aceh tahun 2007-2008 mengelompok secara terpisah dari isolat Indonesia yang lain, tetapi masih dalam klaster virus AI subtipe H5N1 Indonesia.
STUDI KERAGAMAN GENETIK Tarsius sp. ASAL KALIMANTAN, SUMATERA, DAN SULAWESI BERDASARKAN SEKUEN GEN NADH DEHIDROGENASE SUB-UNIT 4L (ND4L) Widayanti, Rini; Susmiati, Trini
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 6, No 2 (2012): September
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v6i2.339

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah mengaji keragaman genetik gen ND4L masing-masing spesies Tarsius yang dapat digunakan sebagaipenanda genetik. Hasil polymerase chain reaction (PCR) gen ND4L menggunakan primer ND4LF dan ND4LR diperoleh 478 bp, setelah dilakukan sekuensing didapatkan sekuen gen ND4L sebesar 297 nt. Sekuen gen ND4L disejajarkan berganda dengan primata lain dari Genbank menggunakan Clustal W, dan kemudian keragaman genetik antar spesies dianalisis menggunakan program MEGA versi 5.0 (Nei dan Kumar, 2002). Di antara sampel Tarsius ditemukan satu situs nukleotida beragam, yaitu pada situs ke 162. Jarak genetik berdasarkan basa nukleotida ND4L dihitung menggunakan model dua parameter-Kimura menunjukkan paling kecil sebesar 0%, paling besar 0,3%, dan rata-rata 0,1 %. Pohon filogenetik menggunakan metode Neighbor joining tidak dapat membedakan antara Tarsius dari Sumatera, Kalimantan, dan Sulawesi, dan mengelompokkan Tarsius dalam subordo Strepshirrini.
Co-Authors Alek Ibrahim Alhadz, Ghias Ghifari Alnita Baaka Aninta, Sabhrina Gita Ariana Ariana Aris Haryanto Aris Purwantoro Atmoko, Bayu Andri Christin Marganingsih Santosa Claude Mona Airin Fajar Budi Lestari Handayani, Niken Satuti Hardian, Andreas Bandang Herrialfian H Hery Wijayanto I Gede Suparta Budisatria Jalaluddin J Laksono Trisnantoro Michael Haryadi Wibowo Pakpahan, Suhendra Pakpahan, Suhendra Rahmawati, Irhamna Putri Santoso, Ferdinand Prayogo Cahyo Sari, Yuslikha Khaniif Anggita Sarmin Sarmin Sitarina Widyarini Siti Isrina Oktavia Salasia Slamet Raharjo Soedarmanto Indarjulianto Solihin, Dedi Duryadi Sri Hartati Teuku Zahrial Helmi Teuku Zahrial Helmy Tri Wahyu Pangestiningsih Trini Susmiati Tunas Artama Wasissa, Madarina Wayan Tunas Artama Yosyana, Alyaa Rifqoh Putri Yuda Heru Fibrianto Yuriadi Y