Surachmi Setiyaningsih
Departemen Ilmu Penyakit Hewan Dan Kesehatan Masyarakat Veteriner, Fakultas Kedokteran Hewan, Institut Pertanian Bogor, Jln. Agatis, Kampus IPB Dramaga, Bogor, Jawa Barat 16680

Published : 27 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 27 Documents
Search

Kasus Rabbit Haemorrhagic Disease (RHD) pada Kelinci: Sejarah, Penyebaran, serta Dampak RHDV di Beberapa Negara Asal Kelinci Impor Indonesia Murtini, Sri; Wibawan, I Wayan Teguh; Setiyaningsih, Surachmi; Handharyani, Ekowati; Setyaningsih, Retno
Acta VETERINARIA Indonesiana Vol. 12 No. 1 (2024): Maret 2024
Publisher : IPB University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29244/avi.12.1.8-16

Abstract

Virus Rabbit Haemorrhagic Disease (RHDV) adalah virus penyebab Rabbit Haemorrhagic Disease (RHD) pada kelinci Eropa (Oryctolagus cuniculus). Penyakit ini memiliki tingkat kematian dan morbiditas hingga 100%. Penyakit ini pertama kali dilaporkan di Republik Rakyat Tiongkok pada tahun 1984 dan menyebar ke seluruh dunia. Pada tahun 1996, kasus pertama infeksi RHDV pada kelinci tanpa gejala klinis menyebar di peternakan kelinci di Italia. Beberapa studi telah melapaorkan keberadaan variasi genetic RHDV termasuk varian RHDV terbaru. Penyakit ini berpotensi menimbulkan dampak ekologis dan kerugian ekonomi, terutama di peternakan kelinci. Pada studi sebelumnya diketahui bahwa terdapat serokonversi RHDV pada kelinci tanpa gejala klinis di daerah Bandung Barat, Provinsi Jawa barat, Indonesia, meskipun belum ada informasi mengenai keberadaan RHDV di Indonesia. Meskipun Indonesia diketahui berstatus bebas RHDV, namun kelinci yang diimpor berasal dari negara-negara di Eropa, Amerika, dan Australia yang terkenal sebagai negara endemik RHDV. Tulisan ini bertujuan untuk mengkaji penyebaran RHDV di negara asal kelinci impor Indonesia dan dampaknya. Selain itu, tulisan ini diharapkan dapat memberikan informasi tentang penyakit kelinci yang sedang berkembang.
Indonesian Herb Extracts Inhibit the Replication of Bovine Respiratory Syncytial Virus: In Vitro Study Priosoeryanto, Bambang Pontjo; Sudaryatma, Putu Eka; Lanniari, Nafrina; Setiyaningsih, Surachmi; Harlina, Eva; Wulansari, Retno; Ridho, Rachmi; Rostantinata, Riski; Wiradana, Putu Angga; Okabayashi, Tamaki
HAYATI Journal of Biosciences Vol. 32 No. 3 (2025): May 2025
Publisher : Bogor Agricultural University, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.4308/hjb.32.3.727-739

Abstract

Bovine respiratory syncytial virus (BRSV) is highly prevalent in cattle. It is a major viral cause of bovine respiratory disease complex, which is associated with morbidity, mortality and substantial economic impact. Currently available treatments are only symptomatic, but no specific treatments are available for BRSV infection. This study aimed to identify new antiviral agents against BRSV, which could be used to control bovine respiratory disease complex in cattle with Indonesian herb extracts. Ethanol extracts prepared from Indonesian herbs including Andrographis paniculata, Phyllanthus niruri, Curcuma aeruginosa, and Curcuma xanthorrhiza were evaluated for anti-BRSV activity in A549 cells. The cytotoxicity of the herb extracts was evaluated using a CCK-8 cell viability assay. Antiviral activities of the herb extracts were examined using cell activity and cytopathic assays. The effect on virus production was evaluated by qRT-PCR and plaque-formation assays. Extracts of Curcuma xanthorrhiza (125 μg/ml), Andrographis paniculata (250 μg/ml), and Phyllanthus niruri (62.5 μg/ml) inhibited BRSV activity in A549 in pre-, simultaneously-, and post-infection treatment assays, respectively, as measured by the selective index. Reduction of BRSV activities by the herb extracts correlated with inhibition of viral gene expression and inhibition of plaque formation in a concentration- and time-dependent manner. Our findings suggest that these herb extracts have sufficient potency to be used not only as a therapeutic agent but also as a preventive agent to limit BRSV infection.
Identification and Molecular Characterization of Newcastle Disease Virus Circulates in some districts in Aceh Daud AK, M; Setiyaningsih, Surachmi; Sudirman, Idwan
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 13, No 1 (2019): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v13i1.5832

Abstract

The objectives of this study were to assess the diversity of Newcastle Disease Virus (NDV) isolates; to detect and isolate NDV from poultry; and to identify and characterize NDV by serological and molecular assays. A total of 84 cloacal-oropharynx isolates of poultry was collected from privately owned poultries and poultry markets from 12 districts in Aceh Besar and Banda Aceh. Screening was performed by real time reverse transcriptation-polymerase chain reaction (rRT-PCR) to 15 isolates of poultry. Selected isolates were inoculated in 9-11 days old embryonated specific pathogen free (SPF) eggs and showed positive hemagglutination (HA). Characterization was performed through hemagglutination inhibition (HI) test using Komarov and Hitchner B1 antisera, elution test, RT-PCR and realtime RT-PCR fusion (F). All isolates had a higher affinity to Komarov antisera (titer up to 4 log), indicating virulent strain. This was supported by elution test which showed that 93.66% isolates were virulent and 6 % non-virulent. In conclusion, RT-PCR can detect Matrix gene from 15 isolates (100%), while Fusion gene only detected from 11 isolates (73.3%). rRT-PCR is more capable of detecting antigenic diversity compared to RT-PCR.
VERIFIKASI UJI CEPAT KOMERSIAL Escherichia coli PADA CONTOH UJI DAGING SAPI BEKU (Verification of Escherichia coli Commercial Rapid Test Kit on Frozen Meat) Ayunina, Yasmine Qurrota; Purnawarman, Trioso; Setiyaningsih, Surachmi
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 10, No 2 (2016): September
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v10i2.5088

Abstract

This study was aimed to assess the performance and suitability of commercial rapid test compared to the conventional test through verification process. This study used frozen meat from laboratory routine samples which divided into five groups, those were: natural group, low bacteria level group, medium bacteria level group, high bacteria level group, and control group, each sample test performed 9 replicates. All samples were tested for E. coli by conventional method (SNI 2897:2008) and commercial rapid test method. E. coli test result from both methods was calculated as precision (relative standard deviation), sensitivity, specificity, false negative, false positive, and kappa. The results showed that the commercial kit test had good precision with relative standard deviations score was 0.103. The sensitivity, specificity, false negative, false positive, and kappa score were 94.44%, 100%, 5.56%, 0%, and 0.872, respectively, indicates an equal performance with conventional method. The t student test showed that commercial rapid test method and conventional method had suitability on natural group, low bacteria levels group and medium bacteria level group.
DETEKSI MOLEKULER DAN KERAGAMAN VIRUS NEWCASTLE DISEASE PADA AYAM KAMPUNG DI WILAYAH ACEH D, Darniati; Setiyaningsih, Surachmi; Indrawati, Agustin
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 9, No 2 (2015): September
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v9i2.2841

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan virus Newcastle disease (VND) dan mengkaji keragaman dari virus terisolasi. Sampel penelitian berupa usapan kloaka dan orofaring dari 177 ekor ayam kampung yang diambil dari unggas pekarangan dan pasar unggas di 12 kecamatan dalam wilayah Kabupaten Aceh Besar dan Kota Banda Aceh. Penapisan virus dilakukan pada sampel pool dengan real-time reverse transcriptation-polymerase chain reaction (rRT-PCR) dengan target gen matriks. Inokulasi 309 sampel representasi 157 ayam asal pool positif matriks pada telur ayam berembrio spesifik pathogen free (SPF) menghasilkan 69 isolat yang berasal dari 51 ekor ayam. Sebagian besar (45,09%)ayam mengeluarkan virus melalui orofaring, 25,39% melalui kloaka dan orofaring, serta 19,61% melalui kloaka. Karakterisasi keragaman isolat dilakukan dengan uji hemagglutination inhibition (HI) menggunakan serum Komarov dan Hitchner B1, rRT-PCR gen fusi dan uji elusi. Adanya keragaman epitop permukaan virus ditunjukkan dengan titer HI yang bervariasi antar isolat, perbedaan mencapai 4 log dengan serum Komarov, dan 3 log dengan B1. Sebagian besar isolat mempunyai afinitas yang lebih tinggi terhadap serum Komarov yang mengindikasikan kecenderungan kepada galur virulen. Penentuan patogenisitas menggunakan rRT-PCR menunjukkan 73,95% isolat termasuk ke dalam galur virulen (mesogenik/velogenik), sementara dari uji elusi menunjukkan 72,46% isolat termasuk galur velogenik, 20,29% mesogenik dan 7,25% dari galur lentogenik.
ISOLASI DAN KARAKTERISASI BIOLOGIK VIRUS NEWCASTLE DISEASE A, Emilia; Setiyaningsih, Surachmi; Soejoedono, Retno Damayanti
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 9, No 1 (2015): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v9i1.2789

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah memperoleh informasi infeksi dan sifat-sifat biologis virus Newcastle disease (ND) pada ayam ras maupunayam buras. Sejumlah 529 sampel usap kloaka dikoleksi dari pasar-pasar tradisional dan peternakan rakyat di daerah Bogor dan Tangerang. Sebanyak 20 sampel terdeteksi positif melalui real time reverse transcription-polymerase chain reaction (RRT-PCR) sedangkan dengan isolasi virus terdeteksi positif sebanyak 11 sampel. Selanjutnya empat isolat representasi lokasi dipilih untuk karakterisasi patogenisitas dengan metode mean death time (MDT) pada telur ayam berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF), dan karakterisasi antigenisitas menggunakan metode haemagglutination inhibition (HI) dan virus netralisasi (VN) untuk melihat keragaman antar isolat virus. Uji MDT memperlihatkan dua isolat(kode isolat II dan XIII) adalah mesogenik, satu isolat (kode isolate VIII) termasuk lentogenik, dan satu isolat (kode isolat TW) bersifat velogenic. Tiga dari empat isolat menunjukkan hubungan antigenik dengan virus ND strain Komarov dan G7 (genotipe 7) tetapi tidak dengan strain referensi Lasota, sementara isolat velogenic (kode TW) yang berasal dari ayam kampung menunjukkan reaksi silang tinggi dengan antiserum terhadap tiga strain referensi di atas. Sampel-sampel yang diambil di lapang baik itu berasal dari pasar dan peternakan rakyat meskipun secara klinis tidak memperlihatkan gejala sakit dapat diisolasi virus ND dengan karakteristik yang beragam.
KAJIAN RISIKO Campylobacter sp. PADA AYAM PANGGANG a, Andriani; Soedarwanto, Mirnawati; Setiyaningsih, Surachmi; Kusumaningrum, Harsi Dewantari
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 7, No 1 (2013): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v7i1.570

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah melakukan analisis kuantitatif risiko mengonsumsi ayam panggang apabila terjadi salah penanganan. Proses pemanggangan yang digunakan pada penelitian ini menggunakan suhu dan waktu komersial yaitu 150 C selama 30 menit. Simulasi penambahan kultur Campylobacter sp. 106 cfu/ml sebelum dilakukan pemanggangan dilakukan untuk mengetahui angka reduksi Campylobacter sp. Model probabilitas digunakan untuk memperkirakan variabilitas data yang digunakan pada penelitian ini adalah model beta poisson. Hasil yangdiperoleh adalah terjadi penurunan jumlah mikroorganisme sebanyak 2 log cfu/gram dan peluang sakit bagi manusia yang mengonsumsi daging ayam yang dipanggang berkisar antara 9 dari 1.000 manusia.