Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
5.909
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Pharmaciana: Jurnal Kefarmasian Biogenesis: Jurnal Ilmiah Biologi Jurnal Riset Kimia Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology Jurnal Biodjati ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia JSFK (Jurnal Sains Farmasi & Klinis) Jurnal Ilmu Kefarmasian Indonesia JURNAL FARMASI GALENIKA Majalah Farmasetika Jurnal Ilmiah Farmasi Farmasyifa Abdi Dosen : Jurnal Pengabdian Pada Masyarakat Jurnal Riset Farmasi Pharmaceutical Sciences and Research (PSR) Bandung Conference Series: Pharmacy Borneo Journal of Pharmacy Jurnal Farmasi Galenika
Fitrianti Darusman
Farmasi, Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Islam Bandung
Religion Agriculture, Biological Sciences & Forestry Humanities Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Computer Science & IT Earth & Planetary Sciences Education Energy Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Materials Science & Nanotechnology Medicine & Pharmacology Public Health Social Sciences

Published : 61 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 61 Documents
Search

 3   4   5   6   7 
Studi In Silico Aktivitas Analog Senyawa Zizyphine dari Bidara Arab (Zizyphus spina-christi) sebagai Antivirus SARS-CoV-2 terhadap Reseptor 3CLpro Taufik Muhammad Fakih; Firda Aulia Jannati; Annisa Meilani; Dwi Syah Fitra Ramadhan; Fitrianti Darusman
ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia Vol 18, No 1 (2022): March
Publisher : UNIVERSITAS SEBELAS MARET (UNS)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20961/alchemy.18.1.52188.70-79

Abstract

COVID-19 merupakan penyakit yang penularannya human to human yang pertama kali ditemukan di China (Kota Wuhan). Tanaman bidara arab mengandung banyak metabolit sekunder yang bermanfaat, hasil fraksinasi dari buah bidara memiliki aktivitas sebagai antivirus yang signifikan terhadap virus herpes simpleks tipe 1. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui afinitas dan interaksi antara senyawa uji Zizyphine dengan reseptor 3CLpro secara in silico. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi aktivitas biologis menggunakan PASS prediction dan sifat fisikokimia pada senyawa uji Zizyphine menggunakan webserver Swiss-ADME. Senyawa uji Zizyphine dioptimasi secara geometris menggunakan software Quantum ESPRESSO versi 6.6. Konformasi senyawa uji Zizyphine terbaik dilanjutkan ke tahap simulasi docking terhadap reseptor 3CLpro yang telah dipisahkan dengan ligan alaminya dan telah divalidasi menggunakan software MGL Tools versi 1.5.6 yang telah dilengkapi dengan Autodock Tools versi 4.2. Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan dapat disimpulkan bahwa senyawa uji Zizyphine C memiliki afinitas yang lebih baik dibandingkan senyawa Zizyphine A, Zizyphine F, dan Zizyphine I dengan nilai energi bebas ikatan sebesar -9,32 kcal/mol dan konstanta inhibisi 146,89 nM, sehingga senyawa Zizyphine C berpotensi sebagai agen terapi COVID-19 yang bekerja terhadap reseptor 3CLpro. Selanjutnya dari hasil analisis aktivitas biologis, keseluruhan senyawa analog Zizyphine menunjukkan potensi sebagai antivirus. Akan tetapi dari prediksi ADME, senyawa-senyawa tersebut tidak menunjukkan profil yang baik sebagai obat oral.In Silico Study of Zizyphine Analog Compound Activity of Christ's Thorn Jujube (Zizyphus spina-christi) as SARS-CoV-2 Antivirus against 3CLpro Receptors. COVID-19 is a disease with human-to-human transmission that was first discovered in China (Wuhan City). The arabian bidara plant (Christ's Thorn Jujube) contains many useful secondary metabolites, fractionated from bidara fruit has significant antivirus activity against herpes simplex virus type 1. The purpose of this study was to determine the affinity and interaction between the Zizyphine test compound and the 3CLpro receptor through in silico. In this study, the identification of biological activity using PASS prediction and physicochemical properties of Zizyphine test compounds using the Swiss-ADME webserver. The Zizyphine test compound was optimized for geometry using Quantum ESPRESSO version 6.6 software. The conformation of the best Zizyphine test compound was continued to the docking simulation stage for the 3CLpro receptor which has been separated from its natural ligand and has been validated using MGL Tools version 1.5.6 with Autodock Tools version 4.2 software. Based on the results, it can be concluded that the test compound Zizyphine C has a better affinity than Zizyphine A, Zizyphine F, and Zizyphine I with a binding free energy value of -9.32 kcal/mol and inhibition constant of 146.89 nM. Therefore, the compound Zizyphine C has potential as a COVID-19 therapeutic agent that acts against the 3CLpro receptor. Furthermore, from the results of the analysis of biological activity, all Zizyphine analog compounds showed potential as antiviruses. However according to ADME predictions, these compounds did not show a good profile as oral drugs.
Co-Authors Amila Amila Anan Suparman Anan Suparman Annisa Meilani Aprian Dwiatama Aprian Dwiatama Astrid Feinisa Khairani Aulia Fikri Hidayat Azyyati Adzhani Budi Prabowo Soewondo Cepy Hadiansyah Cepy Hadiansyah, Cepy Dara Azalea Wahdah Debby Prihasti Ayustine Dewi, Mentari Luthfika Dinnanda Yussepina Wulansari Dinnanda Yussepina Wulansari Dwi Oktariani Dwi Syah Fitra Ramadhan Dwiatama, Aprian Endah Rahayu Endah Rahayu, Endah Fia Siti Nopalia Firda Aulia Jannati Frida Anggita Amalia Gina Fuji Nurfarida Gita Cahya Eka Darma Hamdi Azwir, Hery Hanifa Rahma Hilda Aprilia, Hilda Hirawati Oemar Inayah Fitri Wulandari Inayah Fitri Wulandari Indra Topik Indra Topik, Indra Jihan Sahira Khodimul Haramain Khuza’i, Rodliyah Larasati Sofiyandini Legina Ayu Kusumah, Dea Marillia, Viola Mega Suryani Putri Mentari Lutfika Dewi Mentari Luthfika Dewi Millati Hanifa Suparno Muhamad Rizqy Maulana Muhammad Sultan Ramadhan Mutiara Haifania Nadya Azzahra Nawang Wulan Rachmatillah Prastowo Putri Niken Fitria Yuliar Nurrayyan Nurrayyan Nurrayyan, Nurrayyan Nyayu Ista Yulita Putri, Nawang Wulan Rachmatillah Prastowo Rachmat Mauludin Rachmat Mauludin Ratih Aryani Riza Ramadhan Saadiya Noerman Sani Ega Priani Shannie Megaliane Silvi Sandi Putri Sitorus, Mido Ester Soewandhi, Sundani N Sundani N Soewandhi Syafanisa Alifia Rahma Syifa Nur Oktaviani Syifa Siti Fatimah Azzahro Syilfiana Anwar Taufik Muhammad Fakih Teti Sofia Yanti Tia Aulia Silvianti Triandri Permana Uci Ary Lantika Uci Ary Lantika Ulfa Siti M Viola Marillia Widad Aghnia Shalannandia Widad Aghnia Shalannandia Yan Orgianus Yukeu Fazriah Yukeu Fazriah, Yukeu Zalfa Ainun Rozak