Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : TROPICAL GENETICS

Genotyping Of Sumatera Local Variety Of Citrus Using Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD) Technique Rinti Mutiara Sari; Afifatul A Achyar; Yuni Ahda; Dwi Hilda Putri
Tropical Genetics Vol. 2 No. 2 (2022):
Publisher : Genetikawan Muda Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24036/tg.v2i2.29

Abstract

Indonesia memiliki varietas jeruk lokal yang tidak kalah dengan jeruk impor, terutama dalam hal kesegaran buah. Namun, masyarakat lebih tertarik dengan warna kulit jeruk sehingga masyarakat lebih memilih jeruk impor ketimbang jeruk lokal, khususnya di Sumatera. Oleh karena itu, perlu dilakukan upaya pelestarian dan peningkatan karakteristik jeruk ini untuk meningkatkan kualitasnya melalui pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimalkan metode isolasi DNA sampel buah jeruk dengan Chelex-TE dan untuk mengetahui profil genetik jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan genotipe RAPD. Sampel yang digunakan adalah beberapa jeruk lokal di Sumatera (Citrus Siam Gunung Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu dan Citrus Pasaman) dan Citrus impor (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot dan Citrus Wokam). DNA diisolasi menggunakan metode Chelex-TE 10% yang dioptimalkan untuk beberapa parameter seperti ukuran butir, kulit buah dan daun. RAPD dilakukan dengan menggunakan 10 primer RAPD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode isolasi Chelex Chelex-TE 10% yang optimal adalah ukuran sampel 1 butir. Amplifikasi jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan 10 primer tunggal menghasilkan pita polimorfik. Nilai kesamaan jaccard menunjukkan bahwa kelima sampel jeruk tersebut merupakan varietas lokal Sumatera yang diamati memiliki variasi genetik yang tinggi dibandingkan dengan keempat jeruk impor tersebut. Indonesia memiliki varietas jeruk lokal yang tidak kalah dengan jeruk impor, terutama dalam hal kesegaran buah. Namun, masyarakat lebih tertarik dengan warna kulit jeruk sehingga masyarakat lebih memilih jeruk impor ketimbang jeruk lokal, khususnya di Sumatera. Oleh karena itu, perlu dilakukan upaya pelestarian dan peningkatan karakteristik jeruk ini untuk meningkatkan kualitasnya melalui pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimalkan metode isolasi DNA sampel buah jeruk dengan Chelex-TE dan untuk mengetahui profil genetik jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan genotipe RAPD. Sampel yang digunakan adalah beberapa jeruk lokal di Sumatera (Citrus Siam Gunung Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu dan Citrus Pasaman) dan Citrus impor (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot dan Citrus Wokam). DNA diisolasi menggunakan metode Chelex-TE 10% yang dioptimalkan untuk beberapa parameter seperti ukuran butir, kulit buah dan daun. RAPD dilakukan dengan menggunakan 10 primer RAPD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode isolasi Chelex Chelex-TE 10% yang optimal adalah ukuran sampel 1 butir. Amplifikasi jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan 10 primer tunggal menghasilkan pita polimorfik. Nilai kesamaan jaccard menunjukkan bahwa kelima sampel jeruk tersebut merupakan varietas lokal Sumatera yang diamati memiliki variasi genetik yang tinggi dibandingkan dengan keempat jeruk impor tersebut.
Co-Authors Abdul Rasak Abdul Razak Abdul Razak Achyar, Afifatul Afandi, Echa Azkia Afriandi, Muhammad Agusminarti, Agusminarti Ahmad Fauzan Ahmad Saleh Akbar, Imam Qodri Ambiyar, Ambiyar Ananda, Azwir Anggun, Septiasri Angreni, Siska Anisha S Anni Faridah Arfianti, Fina Aripin, Nurul Atifah, Yusni Ayesa, Putri Ayu, Duni Azalia, Salsa Novela Azeli, Saskia Putri Azwir Anhar Azzahra, Yolanda Belia Putri BR Tarigan, Siti Nadiah Zahra D. N. Putri, Dini Daniel Happy Putra Darmanella Dian Eka Wati Darussyamsu, Rahmawati Dezi Handayani Diana Lyrawati Diana Susanti Dualom, Siti Dwi Hilda Putri Efdillah, Syilvia Eriza, Deni Septia Evi Suryawati Fachry Abda El Rahman Fadhil Ramadhan, Bintang FAJRINA, SUCI Fatni Mufit Ferdyan, Rhavy Festiyed Festiyed Fidela, Wita Fitri Arsih Fitri, Anisa Fitri, Lel Fitria, Davina Fitria, Yanti Gunawan, Revi Gina Haryanto Haryanto Hastutin, Sri Yuni Hayu, Elvira Heffi Alberida Herisanti, Dini Ilahi, Threesia Anugrah Indra Hartanto Iqra, Kuntum Nurul IRDAWATI Irdes Hidayana Siregar Jörg Gromoll Junil Adri K. Sari, Jelly Keiko Kasy Billah Keiko Kasy Billah Khairunnisa Lasmana, Oria Linda Advinda Linda Wati Lufri Lufri Marcloryne Agnesia Masyitoh Masyitoh Maulina, Adinda Rizky Meisya, Divia Yuda Miftahul Jannah Monica, Della Trya Muhammad Ikbal Mulia, Nanta Muslima, Risa Ukhti Mutia Dwi Herakasih Mutia, Ravena Najib Rahman. G Neng Sholihat Nining Nuraida Nukman Moeloek Nurbaiti, Desy Nurpatri, Yeni NURUL HIDAYAH P. Ningky, Yiyin Pratama, Sandi Fransisco Purnomo Soeharso Rahma Amelia, Anisha Chahya Rahmadhani Fitri Rahmawati Darussyamsu Ramadhan Sumarmin Ratih Komala Dewi Ratna Nila Sari Regina Rinti Mutiara Sari Rona Taula Sari, Rona Taula safitri, fira Sagurung, Mariance Dartiani Salsabil, Velina Samsudin, Syakirah Santosa, Tomi Apra Sari, Rinti Mutiara Sefina, Nadia Sepriyani, Eria Marina Septelia I. Wanandi Siagian, Gunaria Siregar, Titik Ermila Sri Suciati Ningsih Syafrilianto, Syafrilianto Syahrastani, Syahrastani Syamsurizal Syari, Elsy Melia T. Berlian Taufiqa, Zuhrah Valofi, Nagra Aulia Wahyuni, Nur Anisa Wahyuni, Sisri Winda Ayu Fietri Yerimades, Yerimades Yerimadesi Yerimadesi Yerimadesi Yuda Meisya, Divia Yusi Febriani Zalni, Tita Yunia Zega, Dwi Junita Zhafira