Articles
<![CDATA[Penyimpanan Haloalkana Dehalogenase: Pengaruh Konsentrasi Terhadap Stabilitas dan Aktivitas Enzim ]]>
<![CDATA[Hasan, Khomaini]]>
<![CDATA[ Chimica et Natura Acta Vol 5, No 3 (2017) ]]>
Publisher : <![CDATA[Departemen Kimia ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (238.428 KB)
|
DOI: 10.24198/cna.v5.n3.16059
<![CDATA[Karena kebutuhan penyimpanan protein rekombinan dalam waktu yang sangat lama, berbagai macam kondisi penyimpanan telah disarankan dalam berbagai publikasi guna mempertahankan integritas struktur dan/atau aktivitas enzim asalnya. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mempelajari pengaruh konsentrasi protein terhadap kestabilan penyimpanan dari haloalkana dehalogenase murni. Haloalkana dehalogenase rekombinan dimurnikan dengan dua langkah pemurnian, yaitu kromatografi penukar ion dan afinitas. Dua kondisi konsentrasi enzim diobservasi selama 4 minggu. Aktivitas enzim diuji tiap minggu yang merefleksikan kestabilan dari enzim. Hasil menunjukkan bahwa konsentrasi enzim 0.5 mg/mL, dibandingkan dengan konsentrasi 2 mg/mL, lebih mudah mengalami inaktifasi dan kehilangan aktivitas. Peningkatan aktivitas dan stabilitas enzim bentuk konsentrat selama penyimpanan mungkin dipengaruhi oleh oligomerisasi protein. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konsentrasi tinggi dari haloalkana dehalogenase direkomendasikan untuk proses penyimpanan enzim dalam waktu yang lama.]]>
<![CDATA[Pemurnian Pretrombin-2pH Hasil Ko-Ekspresi Chaperone pada Escherichia coli ER2566 Menggunakan Sistem IMPACT ]]>
<![CDATA[Maksum, Iman Permana]]>;
<![CDATA[Budiantoro, Ogi]]>;
<![CDATA[Hasan, Khomaini]]>;
<![CDATA[Soemitro, Soetijoso]]>;
<![CDATA[Subroto, Toto]]>
<![CDATA[ Chimica et Natura Acta Vol 5, No 2 (2017) ]]>
Publisher : <![CDATA[Departemen Kimia ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (420.794 KB)
|
DOI: 10.24198/cna.v5.n2.14605
<![CDATA[Pemurnian pretrombin-2 merupakan tahap penting dalam produksi trombin sebagai salah satu komponen lem fibrin untuk mengganti teknik jahitan pascabedah mata. Pemurnian pretrombin-2 melalui sistem IMPACT memanfaatkan aktivitas pemotongan intein yang membawa penanda afinitas chitin-binding domain dan tidak memerlukan enzim protease tambahan. Pemotongan pretrombin-2pH dari CBD-intein dapat dilakukan melalui C-terminal intein dengan induksi perubahan pH dan suhu tanpa memerlukan reagen kimia tambahan. Namun dibutuhkan kondisi pH, suhu dan waktu inkubasi yang sesuai untuk memotong pretrombin-2pH dari C-terminal intein. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan kondisi pH, suhu dan waktu inkubasi pemotongan yang dibutuhkan dalam pemurnian pretrombin-2pH dengan memanfaatkan aktivitas pemotongan C-terminal intein. Metode yang dilakukan adalah ekspresi gen CBD-intein-pt2pH menggunakan vektor pTWIN1 dalam E. coli ER2566 disertai dengan ko-ekspresi chaperone menggunakan plasmid pG-KJE8, isolasi CBD-intein-PT2pH dengan metode sonikasi, pemurnian pretrombin-2pH menggunakan sistem IMPACT, serta karakterisasi pretrombin-2pH hasil pemurnian dengan metode SDS-PAGE. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kondisi inkubasi pemotongan yang dibutuhkan untuk mendapatkan pretrombin-2pH murni adalah pada suhu 25oC, selama 48 jam dengan perubahan pH lingkungan kolom dari 8,5 ke 7,0. Namun efisiensi pemotongan yang dihasilkan sangat kecil. Hal ini mungkin disebabkan oleh kondisi suhu dan waktu inkubasi yang belum optimum serta diduga masih terdapat reaksi proteolisis yang mendegradasi pretrombin-2pH murni yang dihasilkan.]]>
<![CDATA[Ekspresi Prethrombin-2 Manusia Recombinan dalamPichia pastoris dan Optimasi Kondisi Ekspresinya ]]>
<![CDATA[Gaffar, Shabarni]]>;
<![CDATA[Upay, Purba]]>;
<![CDATA[Maksum, Iman Permana]]>;
<![CDATA[Hasan, Khomaini]]>;
<![CDATA[Subroto, Toto]]>;
<![CDATA[Enus, Sutarya]]>;
<![CDATA[Soemitro, Soetijoso]]>;
<![CDATA[Pertiwi, Wulan]]>
<![CDATA[ Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology Vol 4, No 1 (2017) ]]>
Publisher : <![CDATA[Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (566.296 KB)
|
DOI: 10.15416/ijpst.v4i1.9766
<![CDATA[Pretrombin merupakan prekursor dari trombin yang memiliki aktivitas proteolitik. Trombin merubah fibrinogen menjadi benang fibrin yang salah satu aplikasinya adalah dapat digunakan sebagai lem untuk menggantikan teknik jahitan pasca bedah. Aplikasi trombin untuk pembuatan lem fibrin menuntut diproduksinya trombin rekombinan. Tujuan dari penelitian ini adalah ekspresi gen pretrombin-2 (PT2) manusia rekombinan menggunakan sistem ekspresi Pichia pastoris. Gen pengode PT2 dirancang sesuaidengan kodon preferensi P. pastoris. Fragmen PT2 diamplifikasi dengan metoda PCR dengan penambahan sisi restriksi EcoR1 pada ujung 5â dan sisi restriksi SacII pada ujung 3â. Produk PCR yang berukuran 924 pb diligasi dengan vektor ekspresi pPICZaB untuk P. pastoris dan disubkloning dalam inang Escherichia coli. Urutan nukleotida dikonfirmasi dengan metoda dideoxy Sanger. Plasmid rekombinan pPICZaB-PT2 kemudian digunakan untuk mentransformasi P. pastoris SMD1168 defisien protease dengan metoda elektroporasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen PT2 berhasil diamplifikasi dan dikloning dalam E. coli. Analisis restriksi dan penentuan urutan DNA menunjukkan bahwa PT2 rekombinan 100% homologi dengan hasil rancangan. Hasil ekspresi PT2 oleh P. pastoris menggunakan metanol sebagai inducer memperlihatkan bahwa PT2 dengan berat molekul 35 kDa berhasil diekspresikan. Optimasi kondisi ekspresi melalui variasi konsentrasi metanol sebagai inducer dan sorbitol sebagai sumber karbon tambahan menunjukkan bahwa metanol 2% dan sorbitol 2% merupakan kondisi optimum ekspresi PT2.]]>
<![CDATA[Pengaruh Suhu pada Ekspresi Pretrombin-2 Manusia Rekombinan di Escherichia coli ER2566 ]]>
<![CDATA[Silaban, Saronom]]>;
<![CDATA[Simorangkir, Murniaty]]>;
<![CDATA[Maksum, Iman Permana]]>;
<![CDATA[Subroto, Toto]]>;
<![CDATA[Hasan, Khomaini]]>
<![CDATA[ Jurnal Sains Indonesia Vol 42, No 1 (2018): Jurnal Sains Indonesia ]]>
Publisher : <![CDATA[Universitas Negeri Medan ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
<![CDATA[Human recombinant prethrombin-2 (rhPT-2) was expressed in Escherichia coli. Previous studies reported that the expression of rhPT-2 in E. coli tends to formed inclusion body. This study aims to determine the effect of temperature on the expression of rhPT-2 in E. coli ER2566. This study begins with the isolation of recombinant plasmids, competent cell preparation and transformation of competent cells of E. coli ER2566 strain, and rhPT-2 gene expression with various induction temperatures 12, 18, 22 and 30°C. Characterization results showed that the induction temperature of 22°C was the optimum temperature of rhPT-2 gene expression as a soluble fraction in E. coli ER2566 with IPTG concentration 0.1 mM. These results prove that the temperature affects the expression of rhPT-2 in E. coli ER2566.]]>
<![CDATA[Pengaruh Suhu pada Ekspresi Pretrombin-2 Manusia Rekombinan di Escherichia coli ER2566 ]]>
<![CDATA[Silaban, Saronom]]>;
<![CDATA[Simorangkir, Murniaty]]>;
<![CDATA[Maksum, Iman Permana]]>;
<![CDATA[Hasan, Khomaini]]>
<![CDATA[ Jurnal Sains Indonesia Vol 42, No 2 (2018): Edisi Juli - Desember ]]>
Publisher : <![CDATA[Universitas Negeri Medan ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
DOI: 10.24114/jsi.v42i2.12245
<![CDATA[Human recombinant prethrombin-2 (rhPT-2) was expressed in Escherichia coli. Previous studies reported that the expression of rhPT-2 in E. coli tends to formed inclusion body. This study aims to determine the effect of temperature on the expression of rhPT-2 in E. coli ER2566. This study begins with the isolation of recombinant plasmids, competent cell preparation and transformation of competent cells of E. coli ER2566 strain, and rhPT-2 gene expression with various induction temperatures 12, 18, 22 and 30°C. Characterization results showed that the induction temperature of 22°C was the optimum temperature of rhPT-2 gene expression as a soluble fraction in E. coli ER2566 with IPTG concentration 0.1 mM. These results prove that the temperature affects the expression of rhPT-2 in E. coli ER2566. [EFFECT OF TEMPERATURE ON RECOMBINANT HUMAN PRETROMBIN-2 EXPRESSION IN ESCHERICHIA COLI ER2566] (J. Sains Indon., 42(2): 25-30, 2018)Keywords:Induction Temperature, Soluble Fraction, Prethrombin-2, E. coli ER2566]]>
<![CDATA[Hypolipidemic Effects of Pea Protein Hydrolysates on Lipid Profile and Uric Acid in Cisplatin-Induced Nephropathy Rats ]]>
<![CDATA[Hidayat, Meilinah]]>;
<![CDATA[Prahastuti, Sijani]]>;
<![CDATA[Soemardji, Andreas A]]>;
<![CDATA[Hasan, Khomaini]]>;
<![CDATA[Audrey, Gabriella]]>;
<![CDATA[Gabriella, Janifer]]>;
<![CDATA[Luvina, Petrisia]]>;
<![CDATA[Liempapas, Cicilia]]>;
<![CDATA[al, et]]>
<![CDATA[ Journal of Medicine and Health Vol. 2 No. 3 (2019) ]]>
Publisher : <![CDATA[Universitas Kristen Maranatha ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (448.522 KB)
|
DOI: 10.28932/jmh.v2i3.1234
<![CDATA[The usage of Cisplatin (CP) can cause side effects such as toxicity and impaired kidneyfunction. Poor kidney function causes dyslipidemia and hyperuricemia. Researchers in Canadastate that pea protein hydrolysates can improve kidney function. The aim was to examine thehypolipidemic effect of 8 types of pea protein hydrolysate on lipid profiles and uric acid in CPinduced rats in purpose to find protein sources origin of Indonesia for kidney therapy. This is atrue experimental study using fifty female Wistar rats divided into 10 treatment groups.Weadministered 8 types of pea protein hydrolysate for 30 days. On day 7 all rats (except negativecontrol) were induced CP intraperitoneally. Study parameters was evaluated on days 12 and30. In general, all treatments showed good hypolipidemic effects, and differed significantly fromCP group (p <0.01). The group that showed lowest total cholesterol, LDL and triglycerideresults is yellow pea protein hydrolysate Neutrase; HDL: green peas protein hydrolysatebromelain, uric acid: protein hydrolysate of pea protein isolate bromelain. As conclusion,protein hydrolysates of pea has good hypolipidemic effects on Lipid profile and Uric Acid inCP-induced nephropathy Rats. Keywords: protein hydrolysates, green peas, neutrase, bromelain, lipid profiles]]>
<![CDATA[The Effect of Single Co-expression of The DnaK-DnaJ-GrpE and GroEL/ES Chaperones and Their Combination on Expression Intein-pretrombin-2 in Escherichia coli ER2566 ]]>
<![CDATA[Iman Permana Maksum]]>;
<![CDATA[D Agus Yusuf Wildan]]>;
<![CDATA[Khomaini Hasan]]>;
<![CDATA[Toto Subroto]]>
<![CDATA[ Jurnal Kimia Valensi Jurnal Kimia VALENSI Volume 6, No. 1, May 2020 ]]>
Publisher : <![CDATA[Syarif Hidayatullah State Islamic University ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (597.174 KB)
|
DOI: 10.15408/jkv.v6i1.11333
<![CDATA[The use of recombinant thrombin in the manufacture of fibrin glue allows diseases contamination to be avoided. However, the expression of recombinant protein in E. coli still has a disadvantage of the formation of inclusion bodies, so it needs to be minimized by co-expression of chaperones. Therefore, the aim of this study was to determine the effect of single DnaK-DnaJ-GrpE and GroEL/ES chaperone expression and their combination on the expression of intein-pretrombin-2Ti,pH on E. coli ER2566. The method started with isolation of pTWIN1-prethrombin-2Ti,pH and pG-KJE8 from E. coli TOP10F' and DH5α respectively, the co-transformation of the expression host E. coli ER2566 using pG-KJE8 and pTWIN1-prethrombin-2Ti,pHvectors, the chaperone co-expression was induced using L-Arabinosa before IPTG induction and cell culture growth was incubated at 22 oC. The expression products were characterized by using Sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) analysis. The results of the co-expression of chaperone showed that the number of soluble fraction was higher than the one without co-expression of chaperone. In addition, the co-expression of chaperone using pG-KJE8 in intein-prothrombin-2Ti,pH expression was sufficient using tetracycline as an inducer.]]>
<![CDATA[Penyimpanan Haloalkana Dehalogenase: Pengaruh Konsentrasi Terhadap Stabilitas dan Aktivitas Enzim ]]>
<![CDATA[Khomaini Hasan]]>
<![CDATA[ Chimica et Natura Acta Vol 5, No 3 (2017) ]]>
Publisher : <![CDATA[Departemen Kimia ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (238.428 KB)
|
DOI: 10.24198/cna.v5.n3.16059
<![CDATA[Karena kebutuhan penyimpanan protein rekombinan dalam waktu yang sangat lama, berbagai macam kondisi penyimpanan telah disarankan dalam berbagai publikasi guna mempertahankan integritas struktur dan/atau aktivitas enzim asalnya. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mempelajari pengaruh konsentrasi protein terhadap kestabilan penyimpanan dari haloalkana dehalogenase murni. Haloalkana dehalogenase rekombinan dimurnikan dengan dua langkah pemurnian, yaitu kromatografi penukar ion dan afinitas. Dua kondisi konsentrasi enzim diobservasi selama 4 minggu. Aktivitas enzim diuji tiap minggu yang merefleksikan kestabilan dari enzim. Hasil menunjukkan bahwa konsentrasi enzim 0.5 mg/mL, dibandingkan dengan konsentrasi 2 mg/mL, lebih mudah mengalami inaktifasi dan kehilangan aktivitas. Peningkatan aktivitas dan stabilitas enzim bentuk konsentrat selama penyimpanan mungkin dipengaruhi oleh oligomerisasi protein. Hasil penelitian menunjukkan bahwa konsentrasi tinggi dari haloalkana dehalogenase direkomendasikan untuk proses penyimpanan enzim dalam waktu yang lama.]]>
<![CDATA[Pemurnian Pretrombin-2pH Hasil Ko-Ekspresi Chaperone pada Escherichia coli ER2566 Menggunakan Sistem IMPACT ]]>
<![CDATA[Iman Permana Maksum]]>;
<![CDATA[Ogi Budiantoro]]>;
<![CDATA[Khomaini Hasan]]>;
<![CDATA[Soetijoso Soemitro]]>;
<![CDATA[Toto Subroto]]>
<![CDATA[ Chimica et Natura Acta Vol 5, No 2 (2017) ]]>
Publisher : <![CDATA[Departemen Kimia ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (420.794 KB)
|
DOI: 10.24198/cna.v5.n2.14605
<![CDATA[Pemurnian pretrombin-2 merupakan tahap penting dalam produksi trombin sebagai salah satu komponen lem fibrin untuk mengganti teknik jahitan pascabedah mata. Pemurnian pretrombin-2 melalui sistem IMPACT memanfaatkan aktivitas pemotongan intein yang membawa penanda afinitas chitin-binding domain dan tidak memerlukan enzim protease tambahan. Pemotongan pretrombin-2pH dari CBD-intein dapat dilakukan melalui C-terminal intein dengan induksi perubahan pH dan suhu tanpa memerlukan reagen kimia tambahan. Namun dibutuhkan kondisi pH, suhu dan waktu inkubasi yang sesuai untuk memotong pretrombin-2pH dari C-terminal intein. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan kondisi pH, suhu dan waktu inkubasi pemotongan yang dibutuhkan dalam pemurnian pretrombin-2pH dengan memanfaatkan aktivitas pemotongan C-terminal intein. Metode yang dilakukan adalah ekspresi gen CBD-intein-pt2pH menggunakan vektor pTWIN1 dalam E. coli ER2566 disertai dengan ko-ekspresi chaperone menggunakan plasmid pG-KJE8, isolasi CBD-intein-PT2pH dengan metode sonikasi, pemurnian pretrombin-2pH menggunakan sistem IMPACT, serta karakterisasi pretrombin-2pH hasil pemurnian dengan metode SDS-PAGE. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa kondisi inkubasi pemotongan yang dibutuhkan untuk mendapatkan pretrombin-2pH murni adalah pada suhu 25oC, selama 48 jam dengan perubahan pH lingkungan kolom dari 8,5 ke 7,0. Namun efisiensi pemotongan yang dihasilkan sangat kecil. Hal ini mungkin disebabkan oleh kondisi suhu dan waktu inkubasi yang belum optimum serta diduga masih terdapat reaksi proteolisis yang mendegradasi pretrombin-2pH murni yang dihasilkan.]]>
<![CDATA[Ekspresi Prethrombin-2 Manusia Recombinan dalamPichia pastoris dan Optimasi Kondisi Ekspresinya ]]>
<![CDATA[Shabarni Gaffar]]>;
<![CDATA[Purba Upay]]>;
<![CDATA[Iman Permana Maksum]]>;
<![CDATA[Khomaini Hasan]]>;
<![CDATA[Toto Subroto]]>;
<![CDATA[Sutarya Enus]]>;
<![CDATA[Soetijoso Soemitro]]>;
<![CDATA[Wulan Pertiwi]]>
<![CDATA[ Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology Vol 4, No 1 (2017) ]]>
Publisher : <![CDATA[Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology ]]>
Show Abstract
|
Download Original
|
Original Source
|
Check in Google Scholar
|
Full PDF (566.296 KB)
|
DOI: 10.15416/ijpst.v4i1.9766
<![CDATA[Pretrombin merupakan prekursor dari trombin yang memiliki aktivitas proteolitik. Trombin merubah fibrinogen menjadi benang fibrin yang salah satu aplikasinya adalah dapat digunakan sebagai lem untuk menggantikan teknik jahitan pasca bedah. Aplikasi trombin untuk pembuatan lem fibrin menuntut diproduksinya trombin rekombinan. Tujuan dari penelitian ini adalah ekspresi gen pretrombin-2 (PT2) manusia rekombinan menggunakan sistem ekspresi Pichia pastoris. Gen pengode PT2 dirancang sesuaidengan kodon preferensi P. pastoris. Fragmen PT2 diamplifikasi dengan metoda PCR dengan penambahan sisi restriksi EcoR1 pada ujung 5’ dan sisi restriksi SacII pada ujung 3’. Produk PCR yang berukuran 924 pb diligasi dengan vektor ekspresi pPICZaB untuk P. pastoris dan disubkloning dalam inang Escherichia coli. Urutan nukleotida dikonfirmasi dengan metoda dideoxy Sanger. Plasmid rekombinan pPICZaB-PT2 kemudian digunakan untuk mentransformasi P. pastoris SMD1168 defisien protease dengan metoda elektroporasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen PT2 berhasil diamplifikasi dan dikloning dalam E. coli. Analisis restriksi dan penentuan urutan DNA menunjukkan bahwa PT2 rekombinan 100% homologi dengan hasil rancangan. Hasil ekspresi PT2 oleh P. pastoris menggunakan metanol sebagai inducer memperlihatkan bahwa PT2 dengan berat molekul 35 kDa berhasil diekspresikan. Optimasi kondisi ekspresi melalui variasi konsentrasi metanol sebagai inducer dan sorbitol sebagai sumber karbon tambahan menunjukkan bahwa metanol 2% dan sorbitol 2% merupakan kondisi optimum ekspresi PT2.]]>
