Claim Missing Document
Check
Articles

Interaksi Molekuler Senyawa D-Manitol (Kulit Kopi) terhadap PLPro Yohanes Bare; Frederiksen Novenrius Sini Timba; Maria Marcelina Dua Nurak; Dewi Ratih Tirto Sari; Marsiana Coo Mogi
Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi Vol 3 No 3 (2022): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Program Studi Pendidikan Biologi, FKIP, Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v3i3.79

Abstract

Perkembangan virus dalam proses replikasi menjadi target dalam menghambat siklus hidup virus. Protein yang memiliki peran dalam replikasi adalah PLPro. Terapi PLPro dilakukan dengan memanfaatkan limbah kopi yang diprediski memilki bioaktif D-manitol dengan sifat farmakologis. Tujuan penelitian ini adalah mengalisis potensi senyawa D-manitol yang terkandung dalam kulit kopisebagai kandidat terapi corona melalui penghambatan PLPro. Metode penelitian Ligan D-manitol (CID: 88038555) sedangkan Protein Papain like protease (PLPro) (PDB ID 6w9c), sebagai target protein anti-coronavirus diunduh struktur tiga dimensinya di Protein Data Bank. Selanjutnya struktur protein dipreparasi protein atau ligan, docking, visualisasi mengikuiti penelitian. Hasil docking senyawa dan protein menggunakan program PyMol versi 2.2. analisis docking dilakukan dengan mengeksplorasi interaksi kompleks baik 3D dan 2d, jenis ikatan, jumlah interaksi. Analisis menggunakkan program Discovery Studio ver 21.1.1.). Senyawa D-manitol memiliki potensi sebagai salah satu terapi covid-19 melalui penghambatan PLPro sehingga menyebabkan terhambatnya replikasi virus corona. Potensi ini didukung dengan adanya energi ikatan yang terbentuk sehingga meningkatkan stabilitas ikatan sebesar -156 Kj/mol. Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk konfirmasi terhadap aktivitas D-manitol sebagai terapi virus.
Etnobotani Tanaman Capsicum frutescens L. di Desa Magekapa, Kecamatan Maukaro, Kabupaten Ende Maria Nona Elci Lele; Yohanes Boli Tematan; Yohanes Bare
Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi Vol 4 No 1 (2023): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Program Studi Pendidikan Biologi, FKIP, Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v4i1.92

Abstract

Capsicum frutescens L merupakan salah satu jenis buah yang banyak dibudidayakan oleh petani Indonesia karena memiliki harga jual yang tinggi dan memiliki beberapa manfaat kesehatan. Masyarakat Kabupaten Ende menggunakan Capsicum frutescens L. sebagai salah satu bumbu dapur. Selain itu, mereka juga memanfaatkan Capsicum frutescens L. sebagai obat bisul, demam, anti parasite, antitussive, dan anti inflamasi. Pengetahuan lokal tersebut belum teruji secara ilmiah karena masyarakat hanya mempercayai pada hasil yang diperoleh. Pengetahuan yang diperoleh hanya diwariskan secara turun temurun pada suatu kelompok masyarakat. Penelitian ini memiliki tujuan untuk menganalisis pengetahuan etnobotani tanaman Capsicum frutescens L di Desa Magekapa, Kecamatan Maukaro, Kabupaten Ende. Metode yang digunakan adalah wawancara terstruktur. Hasil penelitian menunjukan bahwa masyarakat Desa Magekapa, Kecamatan Maukaro memanfaatkan daun cabai sebagai bahan untuk pengobatan bisul dan menurunkan panas.
Pengembangan Lembar Kerja Peserta Didik (LKPD) Berbasis Model Pembelajaran Student Teams Achievement Division (STAD) pada Materi Sistem Pernapasan Manusia SMP Kelas VIII Yosefina Suryanti Hejo; Yohanes Bare; Sukarman Hadi Jaya Putra
Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi Vol 4 No 1 (2023): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Program Studi Pendidikan Biologi, FKIP, Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v4i1.93

Abstract

Media Lembar Kerja Pesera Didik (LKPD) berperan dalam membantu siswa dalam memadukan latihan fisik dan mental, pengetahuan peserta didik selama sistem pembelajaran. Tinjauan ini dimaksudkan untuk menganalisis Lembar Kerja Peserta Didik (LKPD) berdasarkan model pembelajaran STAD pada materi  sistem pernafasan manusia Kelas VIII SMP. Penelitian lanjutan ini mengacu pada model 4-D, yang terdiri dari beberapa tahap antara lain: tahap pendefinisian (Define), tahap perencanaan (Design), tahap pengembangan (Develop), dan tahap penyebaran (Dessemination). Materi yang dikembangkan telah disetujui oleh para ahli materi, media dan bahasa dengan aktegori sangat valid dan kemudian diujicobakan di kelas kecil yang diberikan kepada satu guru sains dan sepuluh siswa dengan skor 88 dan 54,4 dengan klasifikasi yang sangat layak. Setelah kelas kecil, dilanjutkan kelas besar yang diberikan kepada dua orang guru IPA dan 22 siswa dengan nilai 86 dan 56,7 dengan klasifikasi yang sangat layak. Produk Lembar Kerja Peserta DidikBerbasis Model Pembelajaran STAD pada Materi Sistem Pernapasan Manusia Kelas VIII SMP ini sangat valid dan sangat layak untuk dimanfaatkan sebagai sumber media pembelajaran di sekolah.
Analisis Kendala Pembelajaran Biologi di SMAS St. Petrus Kewapante pada Masa Pandemi Covid-19 Yosefina Ngongo; Yohanes Bare; Mansur S
Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi Vol 4 No 1 (2023): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Program Studi Pendidikan Biologi, FKIP, Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v4i1.94

Abstract

Pandemi covid-19 berdampak terhadap berbagai bidang kehidupan masyarakat Indonesia salah satunya dunia pendidikan, sehingga pemerintah mengambil kebijakan untuk membatasi aktivitas manusia. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kendala yang dialami peserta didik pada pembelajaran biologi di SMAS St. Petrus Kewapante pada masa pandemi covid-19. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah pendekatan kualitatif yang bertujuan untuk mendapatkan gambaran yang objektif, faktual, akurat dan sistematis dari setiap masalah yang akan dideskripsikan dalam bentuk kata–kata. Sumber data dalam penelitian yaitu guru mata pelajaran biologi dan peserta didik kelas XI dan XII MIPA SMAS St. Petrus Kewapante yang merupakan narasumber utama bagi peneliti dalam mendapatkan informasi atau data mengenai kendala dan solusi dalam kegiatan pembelajaran biologi di masa pandemi covid-19. Teknik yang digunakan dalam penelitian ini adalah teknik observasi, wawancara, dokumentasi, penyebaran angket. Berdasarkan hasil penelitian menunjukan bahwa, kendala yang dialami peserta didik berbeda-beda diantaranya : aspek pemahaman : 2,94 termasuk kategori baik, aspek kuota internet atau jaringan : 2,70 termasuk kategori baik, aspek pelaksanaan : 2,29 masuk kategori tidak baik, aspek pembelajaran : 3,0 masuk kategori baik dan aspek media pembelajaran 2,5 masuk dalam kategori tidak baik. Kendala-kendala yang dialami peserta didik pada pembelajaran biologi pada masa pandemi covid-19 membuat pembelajaran tidak maksimal, sehingga dengan adanya penelitian ini diharapkan memiliki konsribusi sebagai evaluasi maupun bahan acuan agar pembelajaran kedepannya lebih baik.
In Silico Insight the Prediction of Chlorogenic Acid in Coffee through Cyclooxygenase-2 (COX2) Interaction Bare, Yohanes; Sari, Dewi Ratih Tirto; Rachmad, Yoga Tribakti; Krisnamurti, Gabriella Candrakirana; Elizabeth, Agustina; Maulidi, Andri
Biogenesis: Jurnal Ilmiah Biologi Vol 7 No 2 (2019)
Publisher : Department of Biology, Faculty of Sci and Tech, Universitas Islam Negeri Alauddin Makassar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24252/bio.v7i2.9847

Abstract

Inflammation was signs of pathological or abnormality in tissue to give an alert as a trouble signal to the system. Therapeutic using NSAIDs has some side effects. This research explored the potential role of chlorogenic acid as natural therapeutic compound to inhibit the inflammation target such as COX-2 by interaction model. The research method used in this study was the molecular docking approach, which binds ligand and protein. Protein data provided by Protein Data Bank (ID: 6cox) while, chlorogenic acid obtain from PubChem (CID: 1794427). We docked COX-2 and chlorogenic acid using Hex 8.0.0. Visualization and analysis of the molecular interactions of chlorogenic acid and COX-2 conducted by the Discovery Studio Client 4.1 software. Chlorogenic acid has a high permeability and is easily absorbed based on five Lipinski Rule. Interestingly, we found Fifteen amino acid was binding with chlorogenic acid that formed by hydrogen bond and van der Waals.The interaction between ligand-protein results in energy binding -327.59cal/mol. Chlorogenic acid has a potential role to inhibit inflammation pathway by inhibiting COX-2. We predicted chlorogenic acid has a potential as therapy anti-inflammatory to suppress COX-2 as mediator inflammation.
Co-Authors Agustina Elizabeth Ahmad, Nurul Imaniyah Andri Maulidi Andri Maulidi Angeliana Desimaris Nita Angeliana Desimaris Nita Anselmus Dawa Apriani Herni Rophi Aprianus Pani Pili Aprianus Pani Pili Daeng Tiring, Sri Sulistyaningsih Natalia Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Eci, Margaretha Nona Elfi, Theresia Nona fatchiyah . Fitra Arya Dwi Nugraha Fransiskus Xaverius Ndia Frederiksen Novenrius Sini Timba Gabriella Candrakirana Krisnamurti Gabriella Chandrakirana Krisnamurti Gabriella Chandrakirana Krisnamurti Gabriella Chandrakirana Krisnamurti Galis, Rofinus Gaso, Maria Triswanti Hejo, Yosefina Suryanti Heny Yusuf Hiko, Maria Filestina Indahsari, Lilin Ika Nur Jatmiko Eko Witoyo Kari, Magdalena Letek Klementinus Bhato Krisna Pada Krisna Pada Krisnamurti, Gabriella Candrakirana Krisnamurti, Gabriella Chandrakirana Kristina Novita Kuki, Agustina Dua Lailiyah, Fatinatul Laily Sifaiyah Lele, Maria Nona Elci Lopa, Maria Imelda Lorenza, Margaretha Rika Wahyu Gabrella Lute, Maria Alvensia Lydia Efliani Coriessa Meak Lydia Efliani Coriessa Meak M A Yohanita Nirmalasari Magdalena Letek Kari Mansur S Mansur s Margaretha Nona Eci Margaretha Rika W G L Margaretha Rika Wahyu Gabrella Lorenza Maria Alvensia Lute Maria Fatima Neno Maria Filestina Hiko Maria Helvina Maria Imelda Lopa Maria Marcelina Dua Nurak Maria Marcelina Dua Nurak Maria Nona Elci Lele Maria Triswanti Gaso Maria Yuniati Nona Ade Marsiana Coo Mogi Marsiana Coo Mogi Maximus M Taek Meak, Lydia Efliani Coriessa Mira Kurniawati Misa, Aljefridus Mogi, Marsiana Coo Ngongo, Yosefina Nita, Angeliana Desimaris Nur Dina Camelia Nurak, Maria Marcelina Dua Nurul Imaniyah Ahmad Nurul Imaniyah AHmad Oktavius Yoseph Tuta Mago Paula Yunita Seku Ra'o Paula Yunita Seku Ra'o Paulina Bewu Lele Rachmad, Yoga Tribakti Ratna Susana Dawa Rofinus Galis S, Mansur Saputra, Mansur Sari, Dewi Ratih Tirto Selmin, Yosefina Sizi, Yosefina Sri Sulistyaningsih Natalia Daeng Tiring Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng Tiring Sukarman Hadi Jaya Putra Taek, Maximus M Tematan, Yohanes Boli Theopilus W Watuguly Theresia Nona Elci Theresia Nona Elfi Theresia Nona Elfi Ujiana, Wa Ode Ule, Kristina Novita Ustiatik, Reni Vincentius, Angelinus Wa Ode Ujiana Wa Ode Ujiana Yoga Tribakti Rachmad Yohanes Boli Tematan Yohanes Boli Tematan Yohanes Nong Bunga Yosefina Ngongo Yosefina Selmin Yosefina Sizi Yosefina Suryanti Hejo