Claim Missing Document
Check
Articles

Pengembangan LKPD Berbasis Guided Discovery Pada Materi Pewarisan Sifat Kelas IX SMP Angeliana Desimaris Nita; Yohanes Bare; Sukarman Hadi Jaya Putra
Jurnal Ilmiah Wahana Pendidikan Vol 8 No 24 (2022): Jurnal Ilmiah Wahana Pendidikan
Publisher : Peneliti.net

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (343.581 KB) | DOI: 10.5281/zenodo.7495949

Abstract

The advancement of science and technology has a significant influence on various of human life. One of them is education, an inseparable part of the human maturation process, which needs to take advantage of advances in science and technology to achieve its goals effectively and efficiently. The lack of student participation makes the material inheritance of traits in view easier. This research study aims to develop Guided Discovery-Based Learning on Inheritance Materials. The development model used is the 4D model. The results showed that the student worksheet grew declared very valid by material experts, media experts, and linguists. The student worksheet tested had an eligibility level with a category worthy of use in the trait inheritance material at SMP K Yapenthom 1 Maumere.
Meningkatkan Hasil Belajar Siswa pada Konsep Perubahan dan Pelestarian Lingkungan Hidup dengan Model Discovery Learning di SMAS Katolik ST Gabriel Maumere Mansur S; Yohanes Bare
BIOEDUSCIENCE Vol 3 No 2 (2019): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29405/j.bes/3284-893298

Abstract

Background: Hasil belajar merupakan kemampuan tertentu baik secara kognitif, afektif maupun psikomotorik yang dicapai oleh siswa setelah mengikuti pembelajaran. Penelitian tindakan kelas (PTK) yang digunakan dalam penelitian ini, dengan tujuan untuk meningkatkan hasil belajar siswa SMAS Katolik St Gabriel Maumere pada konsep perubahan dan pelestarian lingkungan hidup, melalui penerapan model Discovery Learning. Metode: Penelitian Tindakan Kelas ini dilaksanakan pada siklus I dan siklus II dengan setiap siklus terdiri dari dari dua kali pertemuan. Presentase ketuntasan dari siklus I adalah 55% yang selanjutnya dilakukan siklus II dengan hasil presentase ketuntasan 90%. Hasil: penelitian yang dilakukan menunjukan adanya peningkatan hasil belajar siswa yang dilihat dari siklus II. Kesimpulan: Dengan demikian model Discovery Learning terbukti dapat meningkatkan hasil belajar siswa pada konsep perubahan dan pelestarian lingkungan hidup.
Analysis of Molecular Interactions of 8-Gingerol Compounds in Ginger (Zingiber officinale) as ACE Inhibitor Yohanes Bare; Mansur s; Aprianus Pani Pili; Maria Helvina
BIOEDUSCIENCE Vol 4 No 2 (2020): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22236/j.bes/424944

Abstract

Background: Hypertension is a disease with increasing characteristics of blood pressure. The ACE gene has a role in the conversion of ATI to ATII in hypertensive conditions. Healing is done by using the 8-gingerol content contained in ginger. The purpose of this study is to analyze the molecular interaction that occurs between 8-gingerol and ACE. Method: ACE model proteins (ID: 3bkk) were obtained from the Bank Data Protein database (PDB) through 8-gingerol ligands (CID: 168114) obtained from the PubChem database. ACE and 8-gingerol were docked by Discovery Study Client 4.1 software. Analysis of amino acid residues, binding energy, Van der Waals forces, and hydrogen bonds formed using Discovery Studio Client 4.1. Results: The interaction between 8-gingerol and ACE showed that there were seven amino acid residues that interacted with 8-gingerol, also found hydrogen bonds, hydrophobic and Van der Waals forces that strengthen and stabilize these bonds. Conclusion: the interaction of 8-ginger with the active side of ACE is determined as an ACE inhibitor, the inhibition is a significant effect on the obstruction of ACE conversion.
Studi in Silico Prediksi Potensi 6-Gingerol sebagai inhibitor c-Jun N-terminal kinases (JNK): Prediction Potential of 6-gingerol as c-Jun N-terminal kinases (JNK): In Silico approach Bare, Yohanes; Maulidi, Andri; Sari, Dewi Ratih Tirto; Tiring, Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng
Jurnal Jejaring Matematika dan Sains Vol. 1 No. 2 (2019): Edisi Desember 2019
Publisher : Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Palangka Raya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36873/jjms.v1i2.211

Abstract

Revolusi industri 4.0 mendorong pendidikan harus sesuai perkembangan teknologi. Penggunaan in silico merupakan metode dalam bidang biologi yang menggunakan komputer dan internet dalam kajiannya. Penyembuhan penyakit diabetes melitus tipe 2 (DMT2) menjadi perhatian dalam kajian in silico. Senyawa 6-gingerol dari jahe diinteraksikan dengan protein JNK. Tujuan dari penelitian dari penelitian ini untuk menganalsisi potensi 6-gingerol sebagai inhibitor JNK. Penelitian ini menggunakan metode in silico. Protein JNK (ID: 464Y) diperoleh dari Protein Data Bank (PDB) sedangkan ligan 6-gingerol (CID: 44559528) diperoleh dari database PubChem. Ligan dan protein diinteraksikan menggunakan HEX 8.0.0, visualisasi dan analisis data menggunakan Discovery studi client 4.1. Analisis yang dikaji adalah jumalah residu asam amino yang berinteraksi dengan JNK, ikatan hidrogen, dan energi yang dibentuk. Interaksi 6-gingerol dan JNK terdapat dua residu Arg107 dengan ikatan hidropobik dan Ser217 dengan ikatan hydrogen. Gaya van der Waals yang terbentuk pada residu asam amino ALA74, GLN75, ALA211, ALA214, LYS106, THR213, THR103, GLN1022, GLU384, dan HIS104. Energi yang terbentuk adalah -299.65cal/mol. Ligan 6-gingerol diprediksi memiliki potensi sebagai inhibitor JNK.
Meningkatkan Hasil Belajar Siswa pada Konsep Perubahan dan Pelestarian Lingkungan Hidup dengan Model Discovery Learning di SMAS Katolik ST Gabriel Maumere Mansur S; Yohanes Bare
BIOEDUSCIENCE Vol 3 No 2 (2019): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29405/j.bes/3284-893298

Abstract

Background: Hasil belajar merupakan kemampuan tertentu baik secara kognitif, afektif maupun psikomotorik yang dicapai oleh siswa setelah mengikuti pembelajaran. Penelitian tindakan kelas (PTK) yang digunakan dalam penelitian ini, dengan tujuan untuk meningkatkan hasil belajar siswa SMAS Katolik St Gabriel Maumere pada konsep perubahan dan pelestarian lingkungan hidup, melalui penerapan model Discovery Learning. Metode: Penelitian Tindakan Kelas ini dilaksanakan pada siklus I dan siklus II dengan setiap siklus terdiri dari dari dua kali pertemuan. Presentase ketuntasan dari siklus I adalah 55% yang selanjutnya dilakukan siklus II dengan hasil presentase ketuntasan 90%. Hasil: penelitian yang dilakukan menunjukan adanya peningkatan hasil belajar siswa yang dilihat dari siklus II. Kesimpulan: Dengan demikian model Discovery Learning terbukti dapat meningkatkan hasil belajar siswa pada konsep perubahan dan pelestarian lingkungan hidup.
Analysis of Molecular Interactions of 8-Gingerol Compounds in Ginger (Zingiber officinale) as ACE Inhibitor Yohanes Bare; Mansur s; Aprianus Pani Pili; Maria Helvina
BIOEDUSCIENCE Vol 4 No 2 (2020): BIOEDUSCIENCE
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. Dr. Hamka

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22236/j.bes/424944

Abstract

Background: Hypertension is a disease with increasing characteristics of blood pressure. The ACE gene has a role in the conversion of ATI to ATII in hypertensive conditions. Healing is done by using the 8-gingerol content contained in ginger. The purpose of this study is to analyze the molecular interaction that occurs between 8-gingerol and ACE. Method: ACE model proteins (ID: 3bkk) were obtained from the Bank Data Protein database (PDB) through 8-gingerol ligands (CID: 168114) obtained from the PubChem database. ACE and 8-gingerol were docked by Discovery Study Client 4.1 software. Analysis of amino acid residues, binding energy, Van der Waals forces, and hydrogen bonds formed using Discovery Studio Client 4.1. Results: The interaction between 8-gingerol and ACE showed that there were seven amino acid residues that interacted with 8-gingerol, also found hydrogen bonds, hydrophobic and Van der Waals forces that strengthen and stabilize these bonds. Conclusion: the interaction of 8-ginger with the active side of ACE is determined as an ACE inhibitor, the inhibition is a significant effect on the obstruction of ACE conversion.
KAJIAN IN SILICO 6-PARADOL SEBAGAI HERBAL ALTERNATIF PENGOBATAN PENYAKIT ALZHEIMER: IN SILICO REPURPOSING OF 6-PARADOL AS AN ALTERNATIVE HERBAL MEDICINE FOR ALZHEIMER DISEASE Yohanes Bare; Dewi Ratih Tirto Sari; Wa Ode Ujiana; Paula Yunita Seku Ra'o; Krisna Pada
Medical Sains : Jurnal Ilmiah Kefarmasian Vol 7 No 2 (2022)
Publisher : Sekolah Tinggi Farmasi Muhammadiyah Cirebon

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.37874/ms.v7i2.289

Abstract

Jahe mengandung beberapa senyawa volatil dan non-volatil yaitu 6-paradol yang memiliki manfaat kesehatan dan kinerja nutrisi dan antioksidan yang tinggi. Penelitian ini mengeksplorasi dan menyelidiki potensi senyawa bioaktif dari jahe sebagai anti-alzheimer. Aplikasi In silico dilakukan dalam penelitian, beberapa senyawa bioaktif disaring dan senyawa terpilih dari jahe digunakan 6-paradol (CID 94378), diperoleh struktur 3D dari Database PubChem. Choline acetyltransferase (PDB ID 2FY3) dipilih sebagai protein alzheimer dan berinteraksi dengan senyawa jahe. Kolin sebagai ligan asli untuk Choline acetyltransferase digunakan sebagai kontrol. Struktur tiga dimensi senyawa jahe dengan Choline acetyltransferase menunjukkan interaksi yang tepat, menunjukkan semua senyawa terpilih menurunkan aktivitas Choline acetyltransferase Menariknya, 6-paradol berinteraksi dengan Choline acetyltransferase di situs choline yang berarti menghambat interaksi kolin- Kolin asetiltransferase. Kesimpulan, senyawa 6-paradol memiliki aktivitas potensial untuk mengurangi Choline acetyltransferase Dinamika molekuler lebih lanjut, penelitian in vitro dan in vivo diperlukan
Analisis In silico Heksosa, D-Manitol dan Asam Malat Kulit Kopi sebagai Penghambat Infeksi Virus Corona Bare, Yohanes; Timba, Frederiksen Novenrius Sini; Nurak, Maria Marcelina Dua; Sari, Dewi Ratih Tirto
Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati Vol 8, No 2 (2023): June 2023
Publisher : Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24002/biota.v8i2.5970

Abstract

COVID-19 merupakan penyakit infeksi saluran pernapasan yang disebabkan oleh virus corona, dan telah menjadi pandemik dari 2019 hingga 2022. Berbagai terapi telah dilakukan dan dikembangkan oleh banyak peneliti, termasuk pembuatan vaksin COVID-19. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis potensi senyawa pada kulit kopi sebagai agen penghambat kompleks antara spike glycoprotein SARS-CoV-2 dan Angiotensin-Converting Enzyme 2 (ACE2) secara in silico. Kajian in silico dilakukan dengan mengunduh struktur 3D senyawa yaitu heksosa, asam malat, dan D-manitol dari PubChem NCBI, serta kompleks spike glycoprotein SARS-CoV-2 – ACE2 dari Protein Data Bank. Interaksi masing-masing senyawa uji dan kompleks dianalisis dengan Molegro Virtual Docker dan divisualisasi dengan Discovery Studio. Hasil analisis menunjukkan bahwa heksosa, asam malat dan D-manitol mengikat bagian diantara spike glycoprotein SARS-CoV-2 dan ACE2. Residu sisi aktif ikatan antara kompleks dengan ketiga senyawa uji merupakan residu protein dari ACE2 dan spike glycoprotein SARS-CoV-2. Jenis ikatan yang terbentuk antara senyawa dan kompleks protein didominasi oleh ikatan hidrogen, dan beberapa gaya Van der Waals. Dari hasil analisis dapat disimpulkan bahwa senyawa heksosa, asam malat, dan D-manitol yang ada pada kulit kopi memiliki potensi sebagai anti SARS-CoV-2, namun demikian itu perlu dilakukan pembuktian secara in vitro dan in vivo. 
Virtual Screening: Prediksi potensi 8-shogaol terhadap c-Jun N-Terminal Kinase (JNK) Bare, Yohanes; S, Mansur; Tiring, Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng; Sari, Dewi Ratih Tirto; Maulidi, Andri
Jurnal Penelitian dan Pengkajian Ilmu Pendidikan: e-Saintika Vol. 4 No. 1: March 2020
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pemberdayaan Masyarakat (LITPAM)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36312/e-saintika.v4i1.157

Abstract

JNK adalah gen yang berperan dalam metabolisme DMT2. Dalam pengobatan T2DM digunakan JNK sebagai potensi terapi dengan menggunakan bahan alam. 8-shogaol adalah komponen kimia yang terkandung dalam jahe yang memiliki aktivitas antioksidan. Tujuan dari penelitina ini adalah menginversitagasi dan menganalisis peran 8-shogaol terhadap JNK. Protein JNK (ID: 464Y) diperoleh dari Protein Data Bank dan ligan 8-shogaol (CID:6442560 ) didapat dari pubchem. Ligan dan protein didocking menggunakan Hex 8.0.0. File dalam bentuk pdb divisualtisasi dan analisis menggunakan Discovery Studio Client 4.1 software. Interaksi ligan-protein menunjukan ikatan hidrogen pada residu asam amino LYS93 dan van der Waals pada 18 residu asam amino dengan energi ikatan-289.68cal/mol. Interkasi ini berpotensi sebagai penghambat kerja JNK dan dapat digunakan dalam terapi DMT2.Virtual screening: potential prediction of 8-shogaol againts c-Jun N-Terminal Kinase (JNK)AbstractJNK is one of gene that has a role in T2DM condition. To curve T2DM use JNK as potential healing using natural compounds. Eight-shogaol which found in ginger has function as a antioxidant.. The aim of the research is to investigate and analyze role 8-shogaol againts JNK. Protein JNK (ID: 464Y) was taken from Protein Data Bank and ligand 8-shogaol (CID:6442560 ) acquired from pubchem. Ligand and protein model were docked using Hex 8.0.0 software. Visualization and analysis molecular interactions by the Discovery Studio Client 4.1 software. Interaction ligand-protein showed one hydrogen bond in amino acid residue LYS93 and formed van der Waals in eighteen amino acid residues which energy binding -289.68cal/mol. This interaction has a potential to inhibit JNK role and lead to therapy T2DM.
ANALISIS SENYAWA FITOSTEROL Cymbopogon citratus dan Curcuma longa SEBAGAI ANTIALZHEIMER Bare, Yohanes
BIOPENDIX: Jurnal Biologi, Pendidikan dan Terapan Vol 7 No 2 (2021): Biopendix: Jurnal Biologi, Pendidikan & Terapan
Publisher : Program Studi Pendidikan Biologi FKIP Unpatti

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30598/biopendixvol7issue2page153-159

Abstract

Background: Alzheimer is a disease with decreased episodic memory function and cognitive function. Thetreatment system is carried out by inhibiting the performance of genes that have an Alzheimer's stimulus function.Alzheimer sufferers have a component that functions as a cholin stimulator and Acetyl CoA isAcetylcholintransferase. Treatment is done by inhibiting Acetylcholintransferase with Cymbopogon citratus andCurcuma longa. The purpose of this study was to analyze the potential phytoserol content of Cymbopogoncitratus and Curcuma longa as anti-AlzheimerMethods: The method used is the in-silico study approach. Protein Acetylcholintransferase (2fy3) was obtainedfrom Protein Data Bank (PDB). The three-dimensional structure of phytosterol compounds identified inCymbopogon citratus and Curcuma longa were downloaded from the PubChem database. Proteins and bioactivecompounds were prepared sequentially using the Discovery studio ver 19.0.0 and the PyRX 0.8 program.Proteins and compounds were interacted with the PyRX 0.8 program and analyzed using the Discovery Studiover.21.1.0 softwareResults: The results showed that the phytoserol content of Cymbopogon citratus and Curcuma longa (1,8Cineole, 3,7-dimethyl-1,3,6-octatriene, Champene, Decanal Selina-6-en-4-ol, Zingiberene) inhibited the activeside of acetylcholinesterase by inhibiting acetylcholinesterase bind amino acid residues through essential oils.This inhibition directly stops the hydrolysis process of acetylcholine into cholin and acetyl CoA so that it canprevent damage to brain cells.Conclusion: The phytoserol content of Cymbopogon citratus and Curcuma longa is predicted to have potentialas anti-Alzheimer through inhibition of Acetylcholintransferase
Co-Authors Agustina Elizabeth Ahmad, Nurul Imaniyah Andri Maulidi Andri Maulidi Angeliana Desimaris Nita Angeliana Desimaris Nita Anselmus Dawa Apriani Herni Rophi Aprianus Pani Pili Aprianus Pani Pili Daeng Tiring, Sri Sulistyaningsih Natalia Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Dewi Ratih Tirto Sari Eci, Margaretha Nona Elfi, Theresia Nona fatchiyah . Fitra Arya Dwi Nugraha Fransiskus Xaverius Ndia Frederiksen Novenrius Sini Timba Gabriella Candrakirana Krisnamurti Gabriella Candrakirana Krisnamurti Gabriella Chandrakirana Krisnamurti Gabriella Chandrakirana Krisnamurti Galis, Rofinus Gaso, Maria Triswanti Hejo, Yosefina Suryanti Heny Yusuf Hiko, Maria Filestina Indahsari, Lilin Ika Nur Jatmiko Eko Witoyo Kari, Magdalena Letek Klementinus Bhato Krisna Pada Krisna Pada Krisnamurti, Gabriella Candrakirana Krisnamurti, Gabriella Chandrakirana Kristina Novita Kuki, Agustina Dua Lailiyah, Fatinatul Laily Sifaiyah Lele, Maria Nona Elci Lopa, Maria Imelda Lorenza, Margaretha Rika Wahyu Gabrella Lute, Maria Alvensia Lydia Efliani Coriessa Meak M A Yohanita Nirmalasari Magdalena Letek Kari Mansur S Mansur s Margaretha Rika W G L Margaretha Rika Wahyu Gabrella Lorenza Maria Alvensia Lute Maria Fatima Neno Maria Filestina Hiko Maria Helvina Maria Marcelina Dua Nurak Maria Marcelina Dua Nurak Maria Yuniati Nona Ade Marsiana Coo Mogi Marsiana Coo Mogi Maximus M Taek Meak, Lydia Efliani Coriessa Mira Kurniawati Misa, Aljefridus Mogi, Marsiana Coo Ngongo, Yosefina Nita, Angeliana Desimaris Nur Dina Camelia Nurak, Maria Marcelina Dua Nurul Imaniyah AHmad Oktavius Yoseph Tuta Mago Paula Yunita Seku Ra'o Paula Yunita Seku Ra'o Paulina Bewu Lele Ratna Susana Dawa S, Mansur Saputra, Mansur Sari, Dewi Ratih Tirto Selmin, Yosefina Sizi, Yosefina Sri Sulistyaningsih Natalia Daeng Tiring Sri Sulystyaningsih Natalia Daeng Tiring Sukarman Hadi Jaya Putra Taek, Maximus M Tematan, Yohanes Boli Theopilus W Watuguly Theresia Nona Elci Theresia Nona Elfi Ujiana, Wa Ode Ule, Kristina Novita Ustiatik, Reni Vincentius, Angelinus Wa Ode Ujiana Yoga Tribakti Rachmad Yoga Tribakti Rachmad Yohanes Boli Tematan Yohanes Boli Tematan Yohanes Nong Bunga