Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
5.483
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Journal of Biomedicine and Translational Research Molecular and Cellular Biomedical Sciences (MCBS) Syntax Literate: Jurnal Ilmiah Indonesia SELAPARANG: Jurnal Pengabdian Masyarakat Berkemajuan Bioscientia Medicina : Journal of Biomedicine and Translational Research Jurnal Muara Sains, Teknologi, Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Syntax Idea Jurnal Bakti Masyarakat Indonesia Jurnal Scientia MAHESA : Malahayati Health Student Journal Bioscientia Medicina : Journal of Biomedicine and Translational Research Tarumanagara Medical Journal Jurnal Pengabdian Masyarakat Nusantara Ibnu Sina: Jurnal Kedokteran dan Kesehatan - Fakultas Kedokteran Universitas Islam Sumatera Utara Termometer: Jurnal Ilmiah Ilmu Kesehatan Dan Kedokteran Jurnal Keperawatan Bunda Delima Jurnal Pengabdian Kolaborasi dan Inovasi IPTEKS Jurnal Kabar Masyarakat Jurnal Abdimas Indonesia Ebers Papyrus Jurnal Muara Medika dan Psikologi Klinis Journal of Community Service and Society Empowerment Karunia: Jurnal Hasil Pengabdian Masyarakat Indonesia Jurnal Pengabdian Sosial Jurnal Serina Abdimas
Sidarta, Erick
Departemen Biologi Universitas Tarumanagara, Indonesia
Religion Aerospace Engineering Agriculture, Biological Sciences & Forestry Humanities Automotive Engineering Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Civil Engineering, Building, Construction & Architecture Computer Science & IT Control & Systems Engineering Decision Sciences, Operations Research & Management Dentistry Economics, Econometrics & Finance Education Electrical & Electronics Engineering Engineering Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Languange, Linguistic, Communication & Media Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Mathematics Medicine & Pharmacology Neuroscience Nursing Physics Public Health Social Sciences Veterinary Other

Published : 31 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : Syntax Literate: Jurnal Ilmiah Indonesia

 1 
Optimasi Gelred Sebagai Pewarna Dna Dalam Biologi Molekuler Sari M. Dewi Nataprawira; Erick Sidarta; Arlends Chris
Syntax Literate Jurnal Ilmiah Indonesia
Publisher : Syntax Corporation

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (188.012 KB) | DOI: 10.36418/syntax-literate.v7i12.9981

Abstract

Pewarnaan DNA merupakan sebuah proses penting dalam elektroforesis gel agarosa. Proses ini memungkinkan penggunanya untuk melihat pita asam deoksiribonukleotida (DNA) hasil dari proses amplifikasi oleh teknik polymerase chain reaction (PCR) ataupun modifikasinya seperti metode restriction fragment length polymorphism (RFLP). Pewarna DNA yang umum digunakan dalam proses tersebut adalah ethidium bromide yang memiliki bahaya karena bersifat mutagenik. Pewarna DNA Gelred merupakan alternatif untuk ethidium bromide yang dinilai memiliki tingkat keamanan yang lebih baik untuk penggunanya. Penelitian ini bertujuan untuk melihat kemampuan Gelred sebagai pewarna DNA, cara terbaik untuk menggunakannya serta melihat sensitivitasnya. Pada penelitian ini 100-1000 bp DNA Ladder dengan konsentrasi berbeda digunakan sebagai penanda untuk membandingkan metode terbaik (pre-cast, post-staining dan pre-loading/pre-staining) untuk menggunakan Gelred. Selain itu dua buffer elektroforesis umum (TAE dan TBE) digunakan untuk membandingkan hasil pewarnaan DNA. Hasil dari penelitian ini didapatkan bahwa Gelred mempengaruhi migrasi DNA pada gel agarosa. Migrasi tersebut juga dipengaruhi oleh jenis buffer yang digunakan, konsentrasi agarosa, ukuran DNA, konsentrasi DNA dan metode yang digunakan (pre-cast, post-staining atau pre-loading/pre-staining). Metode terbaik untuk mendapatkan hasil visualisasi yang tajam adalah metode pre-cast dengan buffer TAE, dengan kelemahannya adalah konsentrasi dan panjang DNA sangat mempengaruhi visualisasi. Metode yang paling stabil untuk digunakan adalah metode pre-loading/pre-staining dengan buffer TAE dengan kelemahan visualisasi pita DNA yang dihasilkan tidak setajam metode pre-cast. Menurut hasil penelitian ini peneliti menyarankan penggunaan metode pre-loading/pre-staining dengan buffer TAE apabila menggunakan Gelred yang disebabkan oleh efisiensi dan kecepatan proses.
Pentingnya Vaksinasi Influenza Rutin: Sebuah Pelajaran dari Data Evolusi Virus H3n2 di Indonesia Tahun 2005-2019 Anggasta, Giovani; Sidarta, Erick
Syntax Literate Jurnal Ilmiah Indonesia
Publisher : Syntax Corporation

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (228.803 KB) | DOI: 10.36418/syntax-literate.v8i2.11387

Abstract

Pentingnya Vaksinasi Influenza Rutin: Sebuah Pelajaran dari Data Evolusi Virus H3N2 di Indonesia Tahun 2005 – 2019. Virus H3N2 menyebabkan terjadinya salah satu pandemi sejak kemunculannya pada tahun 1968 yang mengakibatkan lebih dari satu juta kematian di seluruh dunia. Hal ini disebabkan oleh adanya evolusi virus, di mana pada evolusi tersebut terjadi perubahan pada gen hemaglutinin (HA) dan neuraminidase (NA) sebagai dua glikoprotein permukaan yang berperan penting sebagai target utama dari sistem imun pejamu. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pentingnya melakukan vaksinasi influenza rutin yang dibuktikan dari data evolusi virus H3N2 di Indonesia dengan melihat perubahan HA NA dan efeknya terhadap antigenisitas, di mana antigenisitas mempengaruhi kemampuan antibodi untuk mengenali virus influenza yang telah bermutasi. Terdapat 133 data HA dan 130 NA yang memenuhi kriteria inklusi dan eksklusi penelitian yang dikumpulkan dari bank data GISAID, lalu diolah dengan metode in silico dengan pembuatan pohon filogenetik menggunakan software MEGA-X dan prediksi antigenisitas menggunakan server IEDB dan Vaxijen 2.0. Pada penelitian ini terdapat evolusi pada gen HA dan NA dari virus H3N2 di Indonesia dari tahun 2005 sampai 2019 yang mengakibatkan munculnya berbagai varian epitop yang berbeda dari epitop sekuens ancestor. Di mana terdapat penurunan antigenisitas pada data gen HA dan NA tahun 2019 jika dibandingkan dengan sekuens ancestor. Penelitian ini membuktikan bahwa penting untuk melakukan vaksinasi influenza secara berkala yang dibuktikan dari adanya evolusi virus H3N2 berdasarkan adanya perubahan pada HA dan NA yang mengakibatkan adanya penurunan antigenisitas, sehingga memungkinkan virus masih terus berevolusi.
Co-Authors Alexander Halim Santoso Alexandro, Cristian Alvian Rendy Santoso Andianto, Ivan Christian Arlends Chris Arlends Chris Averina, Friliesa Bachri, Fiqi Afrizal Bryan Anna Wijaya Bryan Anna Wijaya Damar Sajiwo Damar Sajiwo Daniel Yohanes Putra David Limanan Destra, Edwin Dwiana, Alya Edbert, Juan Edwin Destra Fadhila, Arni Ismi Fajarivaldi, Kresna Bambang Fiona Valencia Setiawan Fiona Valencia Setiawan Giovani Anggasta Giovani Evangelista Alfonsius Giovani Evangelista Alfonsius Gunaidi, Farell Christian Herdiman, Alicia Herliani, Adellia Sheny Johny Hartawan Sutrisno Junius Kurniawan Kasvana, Kasvana Meilani Kumala Nataprawira, Sari Mariyati Dewi Ria Buana Ria Buana, Ria Riadi, Seravin Janet Rizqy Lazuardy Hasan S, Donatila Mano Sajiwo, Damar Santoso, Alexander Halim Saputera, Monica Djaja Sari M. Dewi Nataprawira Sari Mariyati Dewi Nataprawira Sari Mariyati Dewi Nataprawira Sari Mariyati Dewi Nataprawira Sartono, Stefanny Satyanegara, William Gilbert Setiawan, Fiona Valencia Sukianto, Louise Audrey Susy Olivia Lontoh Sutrisno, Johny Hartawan Tan, Nikita Tjie Haming Setiadi Triyana Sari Valdo, Louis Wijaya, Bryan Anna Wijaya, Christian Winata, Raymond