Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : Pharmacoscript

PENAMBATAN SENYAWA KOMPONEN TANAMAN KUMIS KUCING (Orthosiphon stamineus Benth) SEBAGAI DIURETIK MENGGUNAKAN METODE DOCKING Fatwa Hasbi; Saeful Amin; Tita Nofianti
Pharmacoscript Vol. 1 No. 2 (2018): Pharmacoscript
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat, Universitas Perjuangan Tasikmalaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36423/pharmacoscript.v1i2.100

Abstract

Orthosiphon Benth Stamineus is an herbal remedy that has a diuretic effect empirically. The 98’s chemical compounds from orthosiphon has been docking into some receptors ; 1Z9Y receptor with Furosemide as comparator ligand (native), 3HS4 receptor with Acetazolamide as comparator ligand (native) and 3VHU receptor with Spironolactone as comparator ligand (native). The results showed that litospermat acid 1 has -120,0670 kcal of energy which is the lowest bond energy to the receptor 1Z9Y, Dikafeoil tartaric has -107,0110 kcal of energy which is the lowest bond energy to the receptor 3HS4, but for 3VHU receptors did not get any lowest bond energy from 98’candidates compared with the energy of spironolactone is -114,5740 kcal. Ortosifonon C as component of chemical compound java’s tea which according to the literature has a diuretic effect, evidanced the data it has -91,2897 kcal to bind with 1Z9Y and -79,4270 kcal to bind with 3HS4, thus energy are lower than the native ligand (Acetazolamide). Lower energy to bind with the receptor it can makes more stable for the binding. The results of visualization showed thus are has similarities of the hydrogen bonds between the compound Litospermat acid I, Dikafeoil tartaric and Ortosifonon C with native ligand. So that 3 of chemical compounds is predicted to have the highest potential as a diuretic.
STUDI IN SILICO SENYAWA AKTIF DAUN KELOR (Moringae oleifera F) SEBAGAI ANTI SARS-CoV-2 Amin Saeful; Julian Rahmat; Prasetyo Andri
Pharmacoscript Vol. 7 No. 2 (2024): Pharmacoscript
Publisher : Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat, Universitas Perjuangan Tasikmalaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36423/pharmacoscript.v7i2.1661

Abstract

SARS-CoV-2 adalah virus RNA untai positif yang dapat menginfeksi semua orang. Senyawa metabolit sekunder yang terkandung pada daun kelor berpotensi sebagai antivirus yang bekerja spesifik. Tujuan penelitian adalah untuk mengetahui aktivitas antivirus senyawa metabolit daun kelor pada reseptor SARS-CoV-2 main protease. Metode yang digunakan adalah studi komputasi dengan molekular docking, dan simulasi molecular dynamic serta prediksi sintesis dari senyawa uji. Dari hasil studi komputasi molecular docking senyawa uji daun kelor terhadap 4 reseptor SARS-CoV-2 dengan kode PDB 5R7Y, 7JKV, 7TLL, 7VH8 yang sudah divalidasi didapatkan 2 senyawa terbaik dari 29 senyawa dan obat pembanding pada masing-masing reseptor, untuk senyawa uji terbaik dari reseptor 7TLL yaitu senyawa 4-(4-asetilrhamnosida) dan pada reseptor 5R7Y, 7JKV, dan 7VH8, yaitu senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin dengan binding affinity terendah dari senyawa terbaik ada pada reseptor 7JKV yakni dengan skor docking -108,15. Hasil uji molecular dynamic masing masing senyawa uji terbaik didapatkan hasil yang stabil terhadap ligan reseptor rata-rata nilai RMSD dan RMSF masing-masing tidak melebihi parameter yang ditentukan. Hasil prediksi sintesis dari masing-masing senyawa uji, senyawa bisa disintesis dengan menggunakan prosedur yang dihasilkan oleh chemical.ai. Hasil in silico kedua senyawa dapat dikatakan berpotensi sebagai pengobatan Anti SARS-CoV-2.