Claim Missing Document
Check
Articles

Found 29 Documents
Search

Nuclear Magnetic Resonance (NMR) as A Method of Characterizing Antigen Synthesis for Successful Antibody Production Assaat, Lusiani Dewi; Saepudin, Endang; Soejoedono, Retno Damayanti; Adji, Rahmat Setya; Fajriah, Sofa; Ivandini, Tribidasari Anggraningrum
EduChemia: Jurnal Kimia dan Pendidikan Vol 8, No 1 (2023)
Publisher : Department of Chemical Education Faculty of Teacher Training and Education Universitas Su

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30870/educhemia.v8i1.15572

Abstract

Antibody production is becoming a trend, especially during a pandemic like now, although there have been many developments in antibody production in previous research. Antigen synthesis and characterization is one of the determining factors for the success of antibody production. This research developed a method of antigen characterization using the Nuclear Magnetic Resonance (NMR) method. The research conducted in these 4 stages begins with antigen synthesis, then continues with antigen characterization using NMR, then antibody production, and the last stage is antibody characterization using the Enzyme Linked ImmunoAssay (ELISA) method. The results of antigen characterization using NMR show that NAS has been perfectly conjugated with BSA and produces a NAS-BSA conjugate. This is shown by the presence of 1 methylene (CH2) olefinic at δH chemical shift of 6.27 ppm with an integral of 4 and having 1 piece of methine (CH) sp2 at δH chemical shift of 5.73 ppm with an integral of 2. NAS-BSA antigens have been shown to successfully produce antibodies. This is shown from the anti-NAS-BSA, NAS, and Acrylamide antibodies that begin to appear in the second, third and fourth boosting (respectively)
TERAPAN ELSA (ENGLISH LEARNING SPEECH ASSISTANT) SEBAGAI INOVASI MODEL PEMBELAJARAN BAHASA INGGRIS PADA ANAK Usman Nurhasan; Anugrah Nur Rahmanto; Retno Damayanti; Bagas Setya Dian Nugraha; Rudy Ariyanto
Kohesi: Jurnal Sains dan Teknologi Vol. 5 No. 3 (2024): Kohesi: Jurnal Sains dan Teknologi
Publisher : CV SWA Anugerah

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.3785/kohesi.v5i3.7084

Abstract

Abstract This study aimed to evaluate the acceptance and effectiveness of an Augmented Reality (AR)-based English language learning system, ELSA, among students. Through the analysis of Technology Acceptance Model (TAM) questionnaire data and statistical tests, it was found that students had a positive perception of the usefulness and ease of use of the AR system. The use of ELSA significantly improved students' English language proficiency, particularly in vocabulary and pronunciation. Moreover, ELSA was also able to increase student motivation. However, this study identified disparities in student abilities and a lack of relevance of the material to the local context as challenges. Efforts have been made to address these issues, such as adjusting learning groups and revising materials. Overall, the results of this study demonstrate the great potential of AR in revolutionizing English language learning, especially for young learners, by providing a more interactive, personalized, and effective learning experience.
IMPLEMENTASI DESAIN INTERIOR BIOPHILIC PADA GEDUNG STAFF ADMINISTRASI FAKULTAS SENI RUPA DAN DESAIN, UNIVERSITAS TRISAKTI: IMPLEMENTATION OF BIOPHILIC INTERIOR DESIGN IN THE ADMINISTRATIVE STAFF BUILDING OF THE FACULTY OF ART AND DESIGN UNIVERSITAS TRISAKTI Retno Damayanti; Layla Nurina Kartika Iskandar; Makmur Iknu Wijaya
Jurnal Seni dan Reka Rancang: Jurnal Ilmiah Magister Desain Vol. 7 No. 3 (2024): Jurnal Seni dan Reka Rancang : Jurnal Ilmiah Magister Desain
Publisher : Universitas Trisakti

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25105/jsrr.v7i3.21636

Abstract

Implementasi Desain Interior Biophilic Pada Gedung Staff Administrasi Fakultas Seni Rupa Dan Desain, Universitas Trisakti menghadapi masalah kurangnya keterhubungan antara ruang pendidikan dan elemen alami, yang dapat memengaruhi kenyamanan dan produktivitas penggunanya. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi bagaimana integrasi elemen alami ke dalam desain interior dapat meningkatkan kesejahteraan pengguna. Metodologi yang digunakan mencakup analisis kualitatif terhadap desain interior yang ada, wawancara dengan pengguna ruang, dan tinjauan literatur mengenai prinsip-prinsip desain biofilik. Pembahasan meliputi penerapan elemen seperti pencahayaan alami, material ramah lingkungan, dan ruang hijau yang berfungsi menciptakan lingkungan belajar yang lebih inspiratif dan mendukung kesehatan. Dengan memperkenalkan elemen-elemen tersebut, desain ini bertujuan tidak hanya untuk memenuhi standar estetika tetapi juga untuk selaras dengan praktik berkelanjutan yang memprioritaskan harmoni lingkungan. Inklusi elemen alami berkontribusi dalam mengurangi tingkat stres, meningkatkan kualitas udara, dan memperkuat hubungan antara pengguna dengan lingkungannya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penerapan prinsip desain biofilik tidak hanya meningkatkan kualitas estetika ruang, tetapi juga menciptakan suasana yang lebih mendukung kesehatan mental dan fisik. Peningkatan kesejahteraan pengguna ini berimplikasi pada fokus dan efisiensi yang lebih baik di antara penghuni, menjadikan desain biofilik sebagai pendekatan strategis dalam lingkungan pendidikan. Temuan ini menyoroti potensi desain biofilik untuk diterapkan secara lebih luas, mendorong adopsinya di bangunan pendidikan lainnya di masa depan untuk menciptakan ruang yang fungsional sekaligus mendukung kesejahteraan.
Kloning gen virulen Streptococcus agalactiae sebagai bahan dasar vaksin rekombinan Sutanti, ,; Soejoedono, Retno Damayanti; Faizal, Irvan
Jurnal Akuakultur Indonesia Vol. 15 No. 2 (2016): Jurnal Akuakultur Indonesia
Publisher : Indonesian Society of Scientific Aquaculture (ISSA)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (3901.326 KB) | DOI: 10.19027/jai.15.2.147-155

Abstract

ABSTRACT Streptococcus agalactiae has emerged as an important pathogen that affects Nile tilapia in Indonesia aquaculture. Vaccination is one of the most effective tools for enhancing host defense and protecting fish from pathogens. DNA vaccine is a third generation of vaccines based on the gene encoding a vaccine antigen rather than the antigen itself. Mga is DNA-binding protein that activates expression of several important virulence gene, including those encoding M protein (emm), C5a peptidase (SCPA) and mga. The goals of this study were to isolate and molecular characterize the mga gene of local isolate of S. agalactiae to support the development of DNA vaccine. Local bacterial strain was isolated from Nile tilapia  farming in West Java, Indonesia. Bacterial identification was accomplished by PCR, using 16S rRNA primers, which revealed the 1,500 bp PCR product. Mga gene isolation was accomplished by PCR using mga gene S. agalactiae SAF and SAR- specific primers, which revealed the 1,494 bp PCR product. Mga gene was cloned into pGEM T-easy and sequenced using M13 primers. SalI and NotI restriction enzymes were used to digest the pGEM T-easy vector containing mga gene. Mga gene was cloned into pMBA containing beta actin promoter of Japanese medaka. The 16S rRNA sequence analyses confirmed that the local bacteria was 97% similarity with S. agalactiae strain 15-92MPnew. The nucleotide sequence analyses confirmed that the clones were contained 98% similarity with M protein mga  S. agalactiae. The mga gene  controlled by MBA promoter has constructed successfully as a candidate of DNA vaccine to against S. agalactiae infection in Nile tilapia. Keywords: DNA Vaccine, Streptococcus agalactiae, mga gene, Oreochromis niloticus, recombinant DNA  ABSTRAK Streptococcus agalactiae merupakan patogen penting yang mempengaruhi budidaya ikan nila di Indonesia. Vaksinasi merupakan salah satu metode yang paling efektif untuk meningkatkan pertahanan dan melindungi ikan dari patogen. Vaksin DNA adalah vaksin generasi ketiga yang mengandung gen penyandi antigen vaksin. Mga adalah protein DNA-binding yang mengaktifkan ekspresi beberapa gen virulensi, termasuk M protein (emm), C5a peptidase (SCPA) dan mga. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan karakterisasi secara molekuler gen mga dari isolat lokal S. agalactiae untuk mendukung pengembangan vaksin DNA. Identifikasi bakteri dilakukan dengan PCR, menggunakan primer 16S rRNA dengan produk PCR 1.500 bp. Isolasi gen mga dilakukan dengan metode PCR menggunakan primer SAF dan SAR dengan ukuran target 1.494 bp. Gen mga dikloning ke vektor pGEMT–easy dan disekuensing menggunakan primer M13.  Enzim Sal I dan Not I digunakan untuk memotong gen mga dari vektor pGEMT- easy, selanjutnya gen mga dikloning ke vektor pMBA yang mengandung promoter beta-aktin ikan medaka Jepang. Berdasarkan analisis menggunakan gen 16S rRNA diperoleh bahwa sampel memiliki kesamaan 97% sebagai S. agalactiae. Analisis sekuen nukleotida menunjukkan bahwa klon mengandung gen mga dengan 98% kesamaan dengan M protein mga S. agalactiae. Konstruksi mga gene yang dikendalikan oleh promoter MBA telah berhasil dibuat dan ini merupakan kandidat vaksin DNA untuk mengendalikan infeksi S. agalactiae pada ikan nila. Kata kunci: Vaksin DNA, Streptococcus agalactiae, gen mga, Oreochromis niloticus, DNA rekombinan 
PELATIHAN PENGGUNAAN SOFTWARE SKETCHUP UNTUKMENINGKATKAN KETERAMPILAN DESAIN 3D DALAM INDUSTRI MEBEL Wijaya, Makmur; Erick Teguh Leksono; Retno Damayanti; R.A. Heryani Wahyuningrum
JUARA: Jurnal Wahana Abdimas Sejahtera Volume 6, Nomor 2, Juli 2025
Publisher : Jurusan Teknik Lingkungan Fakultas Arsitektur Lanskap dan Teknologi Lingkungan, Universitas Trisakti

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25105/82y7v623

Abstract

Kegiatan Pengabdian kepada Masyarakat (PkM) ini dilaksanakan untuk meningkatkan keterampilan desaintiga dimensi (3D) para pekerja di industri mebel melalui pelatihan penggunaan perangkat lunak SketchUp.Latar belakang kegiatan ini adalah masih rendahnya kemampuan pekerja produksi, seperti tukang, kepalatukang, dan supervisi lapangan dalam memvisualisasikan gagasan desain, sehingga komunikasi antaradesainer dan pelaksana teknis tidak berjalan efektif. Pelatihan ini dilaksanakan secara daring karena pandemiCOVID-19, yang membatasi interaksi langsung. Metode pelaksanaan mencakup ceramah, demonstrasi,praktik langsung, dan evaluasi melalui pre-test dan post-test. Materi pelatihan berfokus pada pemahamandan penerapan fitur dasar serta lanjutan SketchUp, seperti Line Tool, Push/Pull Tool, Follow Me Tool, danMaterial Tool. Peserta juga diajak menyusun simulasi dummy desain mebel sebagai studi kasus praktis. Hasilpelatihan menunjukkan adanya peningkatan signifikan dalam pemahaman dan keterampilan pesertaterhadap pemodelan 3D. Umpan balik dari peserta sangat positif, menyoroti peningkatan kepercayaan dirimereka dalam menggunakan perangkat lunak desain digital. Dukungan dari manajemen perusahaan danantusiasme peserta turut mendorong efektivitas pelatihan. Beberapa tantangan yang dihadapi antara lainketerbatasan waktu dan beragamnya latar belakang kemampuan awal peserta. Oleh karena itu,direkomendasikan adanya pelatihan lanjutan yang lebih mendalam dan penyediaan sesi bimbingan teknis.Secara keseluruhan, program ini terbukti menjadi langkah awal yang efektif dalam meningkatkan kompetensidesain digital di kalangan pekerja industri mebel, serta dapat berkontribusi pada peningkatan efisiensi daninovasi dalam produksi. 
ISOLASI DAN KARAKTERISASI BIOLOGIK VIRUS NEWCASTLE DISEASE A, Emilia; Setiyaningsih, Surachmi; Soejoedono, Retno Damayanti
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 9, No 1 (2015): March
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v9i1.2789

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah memperoleh informasi infeksi dan sifat-sifat biologis virus Newcastle disease (ND) pada ayam ras maupunayam buras. Sejumlah 529 sampel usap kloaka dikoleksi dari pasar-pasar tradisional dan peternakan rakyat di daerah Bogor dan Tangerang. Sebanyak 20 sampel terdeteksi positif melalui real time reverse transcription-polymerase chain reaction (RRT-PCR) sedangkan dengan isolasi virus terdeteksi positif sebanyak 11 sampel. Selanjutnya empat isolat representasi lokasi dipilih untuk karakterisasi patogenisitas dengan metode mean death time (MDT) pada telur ayam berembrio (TAB) specific pathogen free (SPF), dan karakterisasi antigenisitas menggunakan metode haemagglutination inhibition (HI) dan virus netralisasi (VN) untuk melihat keragaman antar isolat virus. Uji MDT memperlihatkan dua isolat(kode isolat II dan XIII) adalah mesogenik, satu isolat (kode isolate VIII) termasuk lentogenik, dan satu isolat (kode isolat TW) bersifat velogenic. Tiga dari empat isolat menunjukkan hubungan antigenik dengan virus ND strain Komarov dan G7 (genotipe 7) tetapi tidak dengan strain referensi Lasota, sementara isolat velogenic (kode TW) yang berasal dari ayam kampung menunjukkan reaksi silang tinggi dengan antiserum terhadap tiga strain referensi di atas. Sampel-sampel yang diambil di lapang baik itu berasal dari pasar dan peternakan rakyat meskipun secara klinis tidak memperlihatkan gejala sakit dapat diisolasi virus ND dengan karakteristik yang beragam.
RESPONS ANTIBODI AYAM PETELUR YANG DIBERIKAN PROTEIN EKSKRETORI/SEKRETORI DAN DITANTANG DENGAN TELUR INFEKTIF Ascaridia galli D, Darmawi; Balqis, Ummu; Tiuria, Risa; Soejoedoeno, Retno Damayanti; Pasaribu, Fachriyan Hasymi; Hambal, Muhammad; Daud, Razali
Jurnal Kedokteran Hewan Vol 7, No 2 (2013): September
Publisher : Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21157/j.ked.hewan.v7i2.929

Abstract

Penelitian ini bertujuan mengetahui respons antibodi dalam serum ayam petelur terhadap ekskretori/sekretori, dan ditantang dengan telur infektif Ascaridia galli (A. galli) Sebanyak 12 ekor ayam dibagi dalam empat kelompok. Kelompok pertama adalah ayam yang tidak diimunisasi dan tidak diinfeksi (kontrol), kelompok kedua adalah ayam yang diimunisasi dengan dosis 260 g ekskretori/sekretori larva A. galli, kelompok ketiga adalah ayam yang diinfeksi dengan dosis 1000 telur infektif A. galli, dan kelompok keempat adalah ayam yang diimunisasi dengan dosis 260 g ekskretori/sekretori dan satu minggu kemudian ditantang dengan dosis 1000 telur infektif A. galli. Respons antibodi pada masing-masing kelompok dianalisis dengan uji enzymelinkedimmunosorbantassay (ELISA) setiap satu minggu selama 10 minggu pascainfeksi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa imunisasi dan atau infeksi dapat memicu peningkatan titer antibodi serum secara signifikan (P0,05) selama 10 minggu pascainfeksi. Titer tertinggi adalah 2,631,20 OD (optical density) dicapai pada minggu ke-3 pascainfeksi dan titer terendah adalah 1,510,48 OD pada minggu ke-0. Ekskretori/sekretori dapat memicu respons antibodi serum ayam petelur terhadap A. galli.
Fecal Lipid Content, Serum Lipid Profile, and Intra-Abdominal Fat Accumulation in Normal Rats Supplemented with Rice Bran Oil Navratilova, Hana Fitria; Damayanthi, Evy; Ardiansyah, Romadhony; Fitriyana, Intan Nur; Soejoedono, Retno Damayanti; Thenawidjaja, Maggy
Jurnal Gizi dan Pangan Vol. 15 No. 2 (2020)
Publisher : The Food and Nutrition Society of Indonesia in collaboration with the Department of Community Nutrition, IPB University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (295.286 KB) | DOI: 10.25182/jgp.2020.15.2.119-124

Abstract

This study aimed to investigate the mechanism of rice bran oil on altering lipid absorption and blood lipid level in normal rat. Male Sprague Dawley rat age 3 months old, weighted 250–300 g were grouped into three groups: control (aquabidest 1 ml), orlistat (2.16 mg / 200 g body weight), and rice bran oil (1.04 mg γ-oryzanol / 200 g body weight). The intervention was given through oral gavage, daily for 28 days. Indicators observed were growth performance, total cholesterol and serum triglyceride levels, lipid levels in feces, and accumulation of intra-abdominal fat. The results showed that the treatment did not significantly affect body weight gain. Fecal lipid levels of orlistat, rice bran oil and control group respectively were 0.19g; 0.17g and 0.13 g (p<0.05), while the percentage of indigestible lipids for orlistat, control and rice bran oil group were 26%, 17% and 13% respectively (p<0.05). Total cholesterol and serum triglyceride levels in rice bran oil group were significantly lower than controls. Rice bran oil did not significantly affect the percentage of total intra-abdominal fat and the weight of the heart and kidney (p>0.05). The intervention of rice bran oil was shown to reduce blood cholesterol and triglyceride levels in normal mice and did not accumulate intra-abdominal fat. The results suggest that rice bran oil might have an effect on blood lipid regulation but not by preventing lipid absorption.
Construction and Expression of Immunotoxin Anti EGFRvIII scFv-HPR Conjugate in Pichia pastoris as A Targeted Drug Candidate for Cancer Therapy Yuliawati, Yuliawati; Soejoedono, Retno Damayanti; Fuad, Asrul Muhamad
Annales Bogorienses Vol. 18 No. 1 (2014): Annales Bogorienses
Publisher : BRIN

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Epidermal growth factor receptor variant III (EGFRvIII) is a mutant of EGFR lacking 267 amino acids (exon-2 through 7) within its extracellular domain, resulting in the formation of a new epitope as a tumor specific target. EGFRvIII is commonly found in GBM, breast, ovarian, prostate, and lung carcinomas. Antibodies or part of antibodies (e.g. single chain variable fragment or scFv) with specific activity against this receptor have been developed. These antibodies are internalized into the cell after receptor binding. Ribonucleases can be cytotoxic due to their inherent ability to degrade RNA, therefore causing cell death via inhibition of protein synthesis. The aim of this research is to construct, clone and express an immunotoxin-based conjugate combining an anti-EGFRvIII scFv with a HPRmut (human pancreatic ribonuclease mutant variant) in Pichia pastoris. The anti-EGFRvIII scFv gene was cloned into yeast expression vector pPICZαA and fused with EGFP gene as a marker. The HPRmut gene was subsequently cloned at the C-terminal of the scFv::EGFP fusion, resulting in the scFv::EGFP::HPR fusion construct. The fusion construct was successfully obtained and nucleotide sequence of plasmid was verified. This construct was used to transform P. pastoris SMD 1168H. The gene fusion was successfully transformed and expressed in P. pastoris with a transformation efficiency of 102 cfu/μg DNA. The transformed yeasts were screened on agar media containing up to 1000 μg/ml zeocin. Yeast transformants showed green fluorescent due to the expression of EGFP gene. The recombinant proteins have been expressed and secreted from P. pastoris as showed by immunoblotting and SDS-PAGE analyses, then purified by affinity chromatography method. The selected yeast transformant produced at least 15.85 mg of purified protein per liter of yeast culture. 
Co-Authors . Darmawi Achmad Agus Priyono Adji, Rahmat Setya Agus Setiyono Agus Wahyudi Agustin Indrawati Anneke Anggraeni Anugrah Nur Rahmanto Ardiansyah, Romadhony Asrul Muhamad Fuad Asrul Muhamad Fuad, Asrul Muhamad Assaat, Lusiani Dewi Ayi Santika Bagas Setya Dian Nugraha Bagus Nanang Luwito Bambang Susilo BIBIANA W LAY Darmawi D Dewi Elfidasari Dwi Desmiyeni Putri Ekowati Handharyani Emilia A Emilia A, Emilia Erick Teguh Leksono Etih Sudarnika Evy Damayanthi Fachriyan Hasmi Pasaribu Fachriyan Hasmi Pasaribu Fachriyan Hasymi Pasaribu Fachriyan Hasymi Pasaribu Fajriah, Sofa Fitrianti Rahayu Fitriyana, Intan Nur Hadri Latif Hana Fitria Navratilova Handika Martu Kurniawan Hapsari Mahatmi Harry Tetra Antono I Nyoman Suartha I wayan Teguh Wibawan Irvan Faizal Iskandar, Layla Nurina Kartika Ivandini Tribidasari Anggraningrum Ketut Karuni Nyanakumari Natih Komar Sumantadinata Lilis Suryani M. Lutfi Maggy Thenawidjaja Suhartono Makmur iknu wijaya Mangaraja Pidoli Tampubolon Melani Wahyu Adiningsih Mirnawati Sudarwanto Monika Danaparamitha Andriani Muhammad Hambal Natih, Ketut Karuni Nyanakumari Ni Luh Putu Ika Mayasari Nova Dilla Yanthi Novera Nirmalasanti Nurhidayah Nurhidayah Okti Nadia Poetri R.A. Heryani Wahyuningrum Rahmat Setya Adji Ramlah Ramlah Razali Daud Razali Daud Retno Wijayanti Risa Tiuria Risma Juniarti Silitonga Rizky Alviodinasyari Rudy Ariyanto Saepudin, Endang Sandra Sandra Siti Gusti Ningrum, Siti Gusti sri murtini . Sri Nuryati Suherman . Sukenda . Surachmi Setiyaningsih Sutanti, , Syafril Daulay Syahruddin Said TARUNI SRI PRAWAST MIEN KAOMINI ANY ARYANI DEDY DURYADI SOLIHIN Trioso Purnawarman Ummu Balqis Usman Nurhasan Yuliawati Yuliawati Yuliawati Yus Rusila Noor Yus Rusila Noor Yusuf Hendrawan