Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
2.589
P-Index
This Author published in this journals
All Journal HAYATI Journal of Biosciences Jurnal Ilmu Pertanian Indonesia Jurnal Fitopatologi Indonesia Jurnal Hortikultura Indonesia (JHI) Microbiology Indonesia Agrovigor: Jurnal Agroekoteknologi Jurnal Hortikultura Jurnal Penelitian Tanaman Industri Buletin Palawija AGRIVITA, Journal of Agricultural Science Jurnal Perlindungan Tanaman Indonesia JURNAL HAMA DAN PENYAKIT TUMBUHAN TROPIKA Jurnal Penelitian Pertanian Tanaman Pangan Jurnal Entomologi Indonesia Jurnal Penelitian Tanaman Industri (Littri) Buletin Palawija
TRI ASMIRA DAMAYANTI
Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian IPB, Jln. Kamper, Kampus IPB Dramaga, Bogor, Jawa Barat, Indonesia, 16680
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Earth & Planetary Sciences Immunology & microbiology Industrial & Manufacturing Engineering Medicine & Pharmacology

Published : 66 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 66 Documents
Search

 1   2   3   4   5 
Penyakit Bercak Kuning Ubi Jalar di Bogor, Jawa Barat Anastasya Hondo; Kartika Catur Damaiyanti; Muhammad Fikri Hafizh; Niky Elfa Amanatillah; Tri Asmira Damayanti
Jurnal Fitopatologi Indonesia Vol. 14 No. 2 (2018)
Publisher : The Indonesian Phytopathological Society (Perhimpunan Fitopatologi Indonesia)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (357.9 KB) | DOI: 10.14692/jfi.14.2.69

Abstract

Yellow Spot Disease on Sweet Potato in Bogor, West JavaYellow spot symptom on sweet potato red cultivar was observed in Cikarawang and Leweung kolot area, Bogor regency. Symptomatic leaf samples gave positive reaction in serological detection by DIBA method using polyclonal antiserum for Potyvirus. DNA fragment of ± 700 bp in length was successfully amplified by RT-PCR using degenerate primer for cylindrical inclusion gene (CI) of Potyvirus.  Further nucleotide sequence analysis indicated high homology to Sweet potato feathery  mottle virus (SPFMV). The homology of SPFMV Cikarawang (Crkw) isolate ranging from 89–98% to several isolates from other countries with the highest homology to Japan and Spain isolates. SPFMV Crkw isolate was in the same cluster with the Japan and Spain isolates based on phylogenetic analysis of both nucleotide and amino acid sequences. This is the first report of SPFMV on sweet potato in Bogor, West Java, Indonesia.
Karakterisasi Molekuler Papaya ringspot virus tipe P pada Tanaman Mentimun di Jawa Listihani Listihani; Tri Asmira Damayanti; Sri Hendrastuti Hidayat; Suryo Wiyono
Jurnal Fitopatologi Indonesia Vol. 14 No. 3 (2018)
Publisher : The Indonesian Phytopathological Society (Perhimpunan Fitopatologi Indonesia)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (526.327 KB) | DOI: 10.14692/jfi.14.3.75

Abstract

Moleculer Characterization of Papaya ringspot virus type P on Cucumber in JavaInfection of Papaya ringspot virus (PRSV) on cucumber plants showing mosaic symptom was detected using specific antibody.  Further investigation was conducted to determine molecular characters and status of PRSV infecting cucumber in Java.  Infection of PRSV was detected from leaf samples collected from the field using dot immunobinding assay (DIBA).  Disease frequency caused by PRSV infection reached 81.11%, 95.86%, 91.66%, and 92.3% in East Java, Central Java, Yogyakarta, and West Java, respectively.  Characterization of PRSV isolates was conducted by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) using specific primers for PRSV-P and PRSV-W, followed by cloning, and DNA sequencing.  DNA fragment of 470 bp was successfully amplified using specific primers for PRSV-P from several samples from Nganjuk, Brebes, Kulon Progo, and Subang; but no amplification was achieved using specific primers for PRSV-W.  Nucleotide and amino acid analysis showed high homology among PRSV-P isolates from Nganjuk, Brebes, Kulon Progo, and Subang, i.e. 98.6%-99.7% and 99.3%-100%, respectively.  This is an indication of a low genetic variation among PRSV-P from Java. Further phylogenetic analysis indicated that PRSV-P isolate cucumber is in the same cluster with PRSV-P isolate papaya from Bali, Indonesia.  This is the first report of PRSV-P infecting cucumber in Indonesia.
Infeksi Alami Pepper Yellow Leaf Curl Virus dan Sweet potato virus C Pada Ubi Jalar di Malang, Jawa Timur Tri Asmira Damayanti; Anastasya Hondo; Yusmani Prayogo
Jurnal Fitopatologi Indonesia Vol 15 No 6 (2019)
Publisher : The Indonesian Phytopathological Society (Perhimpunan Fitopatologi Indonesia)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (345.581 KB) | DOI: 10.14692/jfi.15.6.248-254

Abstract

Virus-like infection with vein yellowing and leaf malformation symptoms were observed on sweet potato IR Melati at Kendalpayak, Malang, East Java. Amplification of DNA/cDNA was carried out using universal primer of Begomovirus, Potyvirus and Cucumovirus showed successfully amplified by universal primer of Begomovirus and Potyvirus, while negatively to universal primer of Cucumovirus. Based on nucleotide sequences, the vein yellowing and leaf malformation symptoms on sweet potato caused by double infection of Pepper yellow leaf curl virus (PYLCV) and Sweet potato virus C (SPVC). DNA identity analysis using BioEdit software showed highest homology up to 98.5% to one of PYLCV isolates from Bali, and up to 98.0% to sweet potato isolate of SPVC from Japan and USA. This is a new finding of natural infection of PYLCV and SPVC on sweet potato in Indonesia.
Identifikasi Begomovirus yang Berasosiasi dengan Penyakit Kuning pada Mentimun di Jawa Barat dan Bali Rizki Haerunisa; Gede Suastika; Tri Asmira Damayanti
Jurnal Hortikultura Indonesia Vol. 7 No. 1 (2016): Jurnal Hortikultura Indonesia
Publisher : Indonesian Society for Horticulture / Department of Agronomy and Horticulture

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (528.815 KB) | DOI: 10.29244/jhi.7.1.9-20

Abstract

ABSTRACTA survey conducted from several cucumber cultivation area of West Java and Bali found some plants showing yellow mosaic, vein banding, and stunting symptoms, caused by Begomovirus infection. This study aimed to detect and determine incidence of Begomovirus on cucumber plants, and analyze variation of Begomovirus coat protein gene in West Java dan Bali. Leaf samples from 50 plants were taken randomly from each location in Sumedang, Karawang, Sukabumi (West Java) and Tabanan, Gianyar, Klungkung (Bali). Disease incidence was determined based on serological assay using specific antiserum of Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) dan Squash leaf curl virus (SLCV). Incidence of ToLCNDV and SLCV were 28-100% and 30-80%, respectively. PCR using Begomovirus degenerate primers successfully amplified coat protein gene about ± 550bp. There were three Begomovirus species associated with yellowing disease on cucumber plant i.e Squash leaf curl China virus (SLCCNV), ToLCNDV, and Ageratum yellow vein virus (AYVV). Based on nucleotide sequences analysis, it was found that isolate SLCCNV had highest nucleotide homology with SLCCNV isolate Malaysia (EF197940) about 94.5%, and was considered as a strain “China”, whereas ToLCNDV has highest nucleotide similarity with ToLCNDV isolate Indonesia (AB613825) about 99.4% and was considered as a strain “Indonesia”. The AYVV sequences showed highest nucleotide AYVV isolate Nicotiana benthamiana from Indonesia (AB100305) about 92.1%.Keywords: Cucumis sativus, Dot immunobinding assay, Squash leaf curl China virus, Tomato leaf curl New Delhi virusABSTRAKSurvei yang dilakukan di beberapa pertanaman mentimun di Jawa Barat dan Bali menemukan gejala mosaik kuning, daun keriting, penebalan tulang daun, dan kerdil akibat infeksi Begomovirus. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi dan menghitung insidensi penyakit yang disebabkan oleh Begomovirus pada tanaman mentimun, serta menganalisis keragaman gen protein selubung Begomovirus di Jawa Barat dan Bali. Sampel daun diambil secara acak sebanyak 50 tanaman dari tiap lokasi pertanaman mentimun di Sumedang, Karawang, dan Sukabumi (Jawa Barat), Tabanan, Gianyar, dan Klungkung (Bali). Deteksi Begomovirus dan insidensi penyakit ditentukan dengan uji serologi DIBA menggunakan antiserum Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) dan Squash leaf curl virus (SLCV). Insidensi ToLCNDV dan SLCV berturut-turut berkisar 28-80% dan 30-80%. Deteksi dengan teknik PCR menggunakan primer universal Begomovirus berhasil mengamplifikasi gen protein selubung berukuran ± 550 pb. Hasil perunutan nukleotida menunjukkan terdapat tiga spesies Begomovirus yang menginfeksi tanaman mentimun di Jawa Barat dan Bali, yaitu Squash leaf curl China virus (SLCCNV), ToLCNDV, dan Ageratum yellow vein virus (AYVV). Isolat SLCCNV Bali memiliki kesamaan nukleotida dan asam amino terhadap isolat SLCCNV dari negara lainnya berkisar antara 89.8-94.5% dan 94.2-96.3%, dan dikelompokkan ke dalam strain “Cina”. ToLCNDV isolat Jawa Barat dan Bali memiliki kesamaan nukleotida dan asam amino berkisar antara 92.8-99.4% dan 97.3-99.4% dengan isolat ToLCNDV dari negara lainnya, tergolong ke dalam strain “Indonesia”. Gen protein selubung AYVV Bali memiliki kesamaan nukleotida dan asam amino berkisar antara 89.5-92.1% dan 94.7-95.2%, dengan kesamaan tertinggi dengan isolat AYVV asal Indonesia yang menginfeksi Nicotiana benthamiana.Kata kunci: Cucumis sativus, Dot immunobinding assay, Squash leaf curl China virus, Tomato leaf curl New Delhi virus.
Tanaman Penghalang dan Ekstrak Daun Pagoda untuk Mengendalikan Bean Common Mosaic Virus pada Kacang Panjang di Lapangan Tri Asmira Damayanti; L Pebriyeni
Jurnal Hortikultura Vol 25, No 3 (2015): September 2015
Publisher : Indonesian Center for Horticulture Research and Development

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jhort.v25n3.2015.p238-245

Abstract

Bean common mosaic virus (BCMV) merupakan salah satu virus penting penyebab penyakit mosaik pada kacang panjang. Di lapangan, virus ini ditularkan dan disebarkan oleh kutudaun secara nonpersisten dan terbawa benih sehingga pengendalian BCMV yang tepat perlu diupayakan. Penelitian bertujuan menguji keefektifan tanaman penghalang dan ekstrak daun pagoda yang diaplikasi secara tunggal atau kombinasi terhadap penekanan infeksi BCMV di lapangan. Jagung sebagai tanaman penghalang ditanam 4 minggu sebelum kacang panjang. Penyemprotan ekstrak daun pagoda pada daun dilakukan 1 hari sebelum penularan BCMV. Penularan BCMV oleh Aphis craccivora bersayap yang mengandung virus serta dilepaskan pada empat titik di lapangan. Peubah yang diamati adalah periode inkubasi, kejadian dan keparahan penyakit, serta titer BCMV. Gejala yang teramati bervariasi dari mosaik ringan sampai mosaik berat, mosaik kuning, kuning, tulang daun menjaring, serta malformasi daun dan buah. Periode inkubasi dari tanaman perlakuan relatif 1–2 hari lebih lama dibanding kontrol tanpa perlakuan. Kejadian, keparahan penyakit, dan titer BCMV dari tanaman perlakuan nyata lebih rendah dibandingkan kontrol. Di antara semua perlakuan yang diuji, aplikasi tanaman penghalang dikombinasikan dengan ekstrak daun pagoda merupakan perlakuan yang paling baik dalam menekan BCMV sebesar 68,43% di lapangan.
Deteksi Virus-Virus pada Kentang di Jawa Barat dengan Menggunakan Teknik Molekuler Tri Asmira Damayanti; R Kartika
Jurnal Hortikultura Vol 25, No 2 (2015): Juni 2015
Publisher : Indonesian Center for Horticulture Research and Development

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jhort.v25n2.2015.p171-179

Abstract

ABSTRAK. Gejala infeksi virus ditemukan bervariasi di sentra pertanaman kentang di Jawa Barat (Rancabali, Pangalengan, dan Bayongbong). Diagnosis virus berdasarkan gejala sulit untuk menentukan identitas suatu virus. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan mendeteksi virus-virus pada tanaman kentang dengan teknik molekuler. Sebanyak 50 sampel daun dikoleksi secara acak dari tanaman kentang yang bergejala di setiap lokasi. Parameter yang diamati adalah gejala, kejadian penyakit, dan runutan DNA virus yang dominan ditemukan. Kejadian penyakit ditentukan dengan uji serologi menggunakan antiserum PVY, PVX, PVS, dan CMV, sedangkan deteksi asam nukleat dilakukan dengan RT-PCR dan perunutan DNA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gejala yang ditemukan bervariasi pada daun kentang, seperti vein clearing, vein banding, rugose, dan malformasi daun. Kejadian penyakit oleh PVY, PVX, PVS, dan CMV di Rancabali berturut-turut adalah 28%, 0%, 0%, dan 28%, di Pangalengan adalah 80%, 24%, 2%, dan 82%, serta di Bayongbong adalah 82%, 0%, 6%, dan 74%. RT-PCR menggunakan primer spesifik PVY dan CMV berhasil mengamplifikasi gen coat protein PVY dan CMV asal Bayongbong masing-masing  berukuran ~800 pb dan ~650 pb. Homologi nukleotida dan asam amino PVY asal Bayongbong terhadap PVY dari negara lain berkisar 89,5–99,7% dan 92,0–100%. Homologi tertingginya yaitu dengan PVY-NTN asal Cina dan Jepang, sedangkan homologi nukleotida dan asam amino CMV asal Bayongbong terhadap CMV asal negara lain berkisar 87,6–96,9% dan 86,9–93,7%. Homologi tertingginya yaitu dengan CMV strain soybean stunt (S) asal Bogor (Indonesia). Kedua strain virus (PVY-NTN dan CMV-S) pertama kali terdeteksi pada kentang di Jawa Barat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa teridentifikasinya kedua strain virus baru harus dipertimbangkan sebagai pembatas penting produksi kentang di Jawa Barat
Insidensi dan Sebaran Tungau Hama pada Pepaya di Pulau Lombok (Incidence and Distribution of Mites on Papaya in Lombok Island) Wieke Mei Dina; Sugeng Santoso; Tri Asmira Damayanti
Jurnal Hortikultura Vol 31, No 1 (2021): Juni 2021
Publisher : Indonesian Center for Horticulture Research and Development

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jhort.v31n1.2021.p61-70

Abstract

Tungau hama merupakan salah satu penyebab penurunan produksi pepaya di Pulau Lombok. Penelitian bertujuan menentukan insidensi, sebaran, dan identitas tungau hama pepaya di Pulau Lombok. Sebaran ditentukan berdasarkan insidensi tungau hama pada 50 lokasi pengambilan contoh dan tungau hama diidentifikasi secara morfologi dan molekuler berdasarkan runutan rDNA ITS2. Hasil penelitian menunjukkan terdapat 12 spesies tungau berdasarkan identifikasi morfologi, yaitu Aculops pelekassi, Calacarus carinatus, Brevipalpus californicus, B. obovatus, B. phoenicis, Tenuipalpus pasificus, Eutetranychus africanus, Panonychus citri, Tetranychus fijiensis, T. kanzawai, T. piercei, dan Tarsonemus bilobatus dengan insidensi berkisar antara 2–72%. Di antara spesies yang ditemukan, P. citri merupakan tungau hama dengan sebaran dan insidensi tertinggi (72%). Hasil analisis persebaran menunjukkan bahwa keanekaragaman spesies tungau hama pada tanaman pepaya di Pulau Lombok adalah tinggi dengan tingkat dominansi rendah dan tingkat kemerataan spesies yang tinggi. Uji PCR dan analisis runutan DNA berhasil mendeteksi dan mengidentifikasi enam spesies tungau hama, yaitu T. piercei, T. kanzawai, E. africanus, dan P. citri (Tetranychidae), pada 500–600 pb serta B. californicus dan B. phoenicis (Tenuipalpidae) pada 600–700 pb. Similaritas tertinggi ditemukan pada T. piercei dan T. kanzawai (100%). Ini merupakan laporan pertama keberadaan B. californicus sebagai hama pada tanaman pepaya di Pulau Lombok.KeywordsFrekuensi kemunculan; PCR; Perunutan DNA; SebaranAbstractMites are one obstacle of papaya production in Lombok Island. Thus, the aim of research was to determine incidence, distribution and identity of mites on papaya plant in Lombok Island. Distribution is determined based on incidence of in 50 sampling area, while mites identified morphological and molecularly based on rDNA ITS2. This studies revealed that there were 12 species of mites based on morphological, namely Aculops pelekassi, Calacarus carinatus, Brevipalpus californicus, B. obovatus, B. phoenicis, Tenuipalpus pacificus Eutetranychus africanus, Panonychus citri, Tetranychus fijiensis, T. kanzawai, and T. pierce with an incidence ranging 2-72%. Among species found, P. citri has the highest distribution and incidence of 72%. The results of the distribution analysis showed that diversity of mite species was high, with low dominance and high evenness. PCR assay successfully amplified DNA of six species, namely T. piercei, T. kanzawai, E. africanus, P. citri with the DNA size of 500-600 bp and B. californicus, B. phoenicis with the DNA size of 600-700 bp. The highest similarity species was found on T .piercei and T. kanzawai (100%). This was the first report of B. californicus infestating on papaya in Lombok.
Penekanan Penularan Bean Common Mosaic Virus oleh Efek Penghambat Makan Kitosan Terhadap Aphis craccivora Koch. (Bean Common Mosaic Virus Transmission Inhibition by Antifeedant Chitosan Against Aphis craccivora Koch.) Dita Megasari; Tri Asmira Damayanti; Sugeng Santoso
Jurnal Hortikultura Vol 29, No 2 (2019): Desember 2019
Publisher : Indonesian Center for Horticulture Research and Development

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jhort.v29n2.2019.p209-218

Abstract

Bean common mosaic virus (BCMV) merupakan virus penting pada kacang panjang di Indonesia. Salah satu cara untuk mengendalikan BCMV adalah dengan penggunaan kitosan. Pada penelitian sebelumnya, kitosan komersial dengan konsentrasi 0,9% dilaporkan mampu menekan infeksi BCMV yang ditularkan oleh Aphis craccivora dengan mekanisme yang belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk mengkaji mekanisme kitosan dalam menekan transmisi BCMV yang ditularkan oleh A. craccivora. Kitosan yang diuji yaitu kitosan murni dengan konsentrasi 0,1%–1,1% dan kitosan komersial konsentrasi 0,9% sebagai pembanding. Kitosan diaplikasikan dengan cara penyemprotan daun dengan volume 3 ml/tanaman pada hari sebelum penularan BCMV menggunakan tiga ekor kutudaun yang mengandung virus. Peubah yang diamati, yaitu periode inkubasi, insidensi penyakit, keparahan penyakit, akumulasi virus pada tanaman dan kutudaun, serta deteksi gen CP BCMV, PR1, dan PR3 dengan RT-PCR. Secara umum perlakuan kitosan mampu menekan transmisi BCMV oleh A. craccivora. Periode inkubasi tanaman perlakuan berkisar antara 7–9 hari. Perlakuan kitosan murni menekan insidensi dan keparahan penyakit antara 40%–80% dan 35,71%–78,57% tergantung konsentrasi kitosan. Kitosan komersial menghambat insidensi dan keparahan penyakit sampai 100%. Perlakuan kitosan pada konsentrasi 0,9% baik kitosan murni maupun komersial menunjukkan akumulasi BCMV yang lebih rendah dibandingkan kontrol tanpa perlakuan, yaitu pada kitosan komersial 0,9% memiliki nilai absorbansi ELISA (NAE) sebesar 0,26 ± 0,29 dan pada kitosan murni 0,9% memiliki NAE sebesar 1,15 ± 1,69, sedangkan kontrol tanpa perlakuan memiliki NAE sebesar 3,13 ± 0,17. BCMV positif terdeteksi pada kutudaun menunjukkan bahwa kutudaun tidak makan inokulasi pada tanaman perlakuan. Amplifikasi gen CP BCMV dengan RT-PCR menunjukkan positif teramplifikasi pada semua perlakuan kitosan kecuali perlakuan kitosan komersial. Gen PR1 tidak teramplifikasi, sedangkan gen PR3 teramplifikasi pada semua perlakuan. Akumulasi PR3 tertinggi terdapat pada perlakuan 0,5% dan 0,7% dibandingkan dengan perlakuan lain dan kontrol. Berdasarkan hasil tersebut, perlakuan kitosan lebih berperan sebagai penghambat makan kutudaun daripada sebagai penginduksi ketahanan tanaman.KeywordsBCMV; Kutu daun; Pathogenesis-related protein; PCR; Vigna sinensis L.AbstractBean common mosaic virus (BCMV) is an important virus on beans in Indonesia. One of methods to control BCMV is by chitosan. The previous report showed that commercial chitosan was able to suppress BCMV infection transmitted by Aphis craccivora with an unknown mechanism. This study aimed to examine the mechanism of chitosan in suppressing the transmission of BCMV by A. craccivora. Chitosan used in this research is a pure chitosan with a concentration of 0.1%–1.1% and 0.9% of commercial chitosan as a comparison. Chitosan is applied by spraying the leaves at one day before the transmission of BCMV. BCMV transmitted by using three viruliferous aphids. The incubation period of virus, disease incidence, and severity, virus accumulation in plants and aphids by ELISA were observed, BCMV CP, PR1, and PR3 genes was detected by RT-PCR. In general, chitosan treatments suppressed the transmission of BCMV by A. craccivora. The incubation period ranges from 7–9 days. The pure chitosan treatments suppressed the disease incidence and severity ranged from 40%–80% and 35.71%–78.57%, respectively depends on concentration of chitosan. The commercial chitosan inhibited disease incidence and severity up to 100%. The treated plants at concentration 0.9% either pure or commercial chitosan showed accumulation of BCMV significantly lower in compared with untreated control plants, i.e. 0.9% in commercial chitosan had ELISA absorbance value (NAE) of 0.26 ± 0.29 and pure chitosan 0.9% had NAE of 1.15 ± 1.69 while the untreated control had an NAE of 3.13 ± 0.17. Further, BCMV were detected aphids which feed on treated plants during inoculation feeding period, indicating virus left over on aphids. Amplification of BCMV CP gene by RT-PCR showed positively amplified by all treatments except commercial chitosan treatment. PR1 gene are not amplified, whereas PR3 gene amplified in all the treatments, but the accumulation higher on treated plants at concentration 0.5% and 0.7% in compare with other treatments. Based on those results, chitosan treatment suppress the BCMV transmission by aphids due to the role of chitosan as anti-feedant which hampered aphids transmit the virus during inoculation feeding period rather than as resistance inducer.
DETEKSI SECARA SEROLOGI DAN MOLEKULER BEBERAPA JENIS VIRUS YANG BERASOSIASI DENGAN PENYAKIT MOSAIK TANAMAN NILAM (Pogostemon cablin Benth) MIFTAKHUROHMAH MIFTAKHUROHMAH; GEDE SUASTIKA; TRI ASMIRA DAMAYANTI
Jurnal Penelitian Tanaman Industri Vol 19, No 3 (2013): September 2013
Publisher : Pusat Penelitian dan Pengembangan Perkebunan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jlittri.v19n3.2013.130-138

Abstract

ABSTRAKPenyakit mosaik pada tanaman nilam disebabkan oleh beberapajenis virus, yaitu Potyvirus, Potexvirus, Cucumber mosaic virus (CMV),dan Broad bean wilt virus 2 (BBWV2). Penelitian ini bertujuan untukmengidentifikasi secara serologi dan molekuler virus-virus yangberasosiasi dengan gejala mosaik pada nilam di KP. Manoko, KP. Cicurugdan lahan petani di Cijeruk. Sampel daun nilam baik yang menunjukkangejala mosaik atau pun tidak diambil dari setiap lokasi penanamanmasing–masing sebanyak 30 sampel. Kejadian penyakit ditentukan melaluideteksi serologi dengan Direct-ELISA dan Indirect-ELISA terhadap sampelmenggunakan empat antiserum, yaitu CMV, Cymbidium mosaic virus(CymMV), Potyvirus, dan BBWV2. Deteksi molekuler dengan RT-PCRdilakukan untuk mengonfirmasi virus baru yang ditemukan. Hasilpenelitian menunjukkan bahwa gejala infeksi virus yang ditemukan padanilam bervariasi, yaitu mosaik lemah, mosaik kuning hijau, mosaik denganpenebalan, mosaik dengan malformasi daun, dan bintik kuning. Secaraserologi, kejadian virus pada setiap kebun bervariasi. Di KP Manoko,Potyvirus dan BBWV2 lebih dominan (100%) dibandingkan CymMV. DiKP Cicurug, kejadian Potyvirus dan CMV terlihat lebih dominan (83,3 dan80%) dibandingkan BBWV2 dan CymMV, sedangkan di Cijeruk, BBWV2lebih dominan (90%) dari Potyvirus (50%) dan CMV (13,3%). Hasil RT-PCR dengan primer degenerate BBWV, diidentifikasi BBWV2 padasampel daun nilam dari Manoko, Cicurug, dan Cijeruk, sedangkan denganprimer general Potexvirus, diidentifikasi CymMV hanya dari sampel daunnilam dari asal Manoko. Hasil penelitian ini merupakan laporan pertamatentang BBWV2 dan CymMV pada tanaman nilam di Jawa Barat yangmengindikasikan bahwa virus merupakan kendala utama pada perbenihannilam yang harus segera diatasi.Kata kunci: BBWV2, CymMV, mosaik, Pogostemon cablin Benth, PCRABSTRACTMosaic symptoms on patchouli plant are associated with severalviruses, i.e. Potyvirus, Potexvirus, CMV, and BBWV2. The objective ofthe study was to detect virus(es) associated with mosaic symptoms onpatchouli at the the patchouli seed nurseries, in Manoko, Cicurug, andCijeruk. Thirty leaf samples either showing typical symptomatic mosaic orasymptomatic were taken from each location. Serological testing byDirect-ELISA and Indirect-ELISA using four antisera namely CMV,Cymbidium mosaic virus (CymMV), Potyvirus, and BBWV2 was carriedout to test the incidence of each virus. Molecular detection by RT-PCR wasperformed to confirm the new virus(es). The results showed that symptomsof virus infection were found vary, i.e. weak mosaic, green yellow mosaic,mosaic with thickening, mosaic with leaf malformations, and yellow spot.Based on the serological detection, virus(es) incidence varied at each seednurseries. In Manoko, Potyvirus, and BBWV2 were more dominant(100%) compared with CymMV. In Cicurug, Potyvirus and CMV weremore dominat (83.3 and 80%) compared with BBWV2 and CymMV.While in Cijeruk, BBWV2 was the most dominant (90%) than Potyvirus(50%) and CMV(13.3%). Result of RT-PCR with degenerate primers pairof BBWV was succesfully identified BBWV2 from Manoko, Cicurug, andCijeruk samples, whereas by using Potexvirus general primary, CymMVwas identified only from Manoko samples. BBWV2 and CymMV werefirst reported to infect patchouli in West Java. The result indicate thatvirus(es) are the major constraint on patchouli seed that should bemanaged immediately.Key words: BBWV2, CymMV, mosaic, Pogostemon cablin Benth, PCR
Respons Varietas Kedelai Unggul terhadap Cucumber mosaic virus Strain Soybean (CMV-S) Yunita Fauziah Rahim; Tri Asmira Damayanti; Munif Ghulamahdi
Buletin Palawija Vol 18, No 2 (2020): Buletin Palawija Vol 18 No 2, 2020
Publisher : Balai Penelitian Tanaman Aneka Kacang dan Umbi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/bulpa.v18n2.2020.p105-112

Abstract

ABSTRAK Cucumber mosaic virus strain Soybean (CMV-S) merupakan salah satu jenis virus terbawa benih yang menyebabkan penurunan produksi kedelai dan dominan menginfeksi kedelai di Jawa. Penggunaan varietas kedelai unggul tahan merupakan cara terbaik mengendalikan infeksi virus. Namun, varietas kedelai unggul hasil pemuliaan yang ada saat ini umumnya untuk peningkatan produksi dan belum memprioritaskan  ketahanan terhadap penyakit virus, sehingga diperlukan pengujian respons ketahanan varietas terhadap CMV-S. Varietas unggul yang diuji ketahanannya dalam percobaan di rumah kaca yaitu Argomulyo, Anjasmoro, Burangrang, Cikuray, Detam 1, Detam 2, Grobogan, Sinabung, dan Wilis. Respons ketahanan terhadap CMV-S diukur berdasarkan parameter penyakit (periode inkubasi, tipe gejala, indeks keparahan penyakit, titer virus) dan parameter pertumbuhan tanaman (tinggi tanaman, jumlah bunga, indeks sensitivitas cekaman). Data percobaan dianalisis secara deskriptif untuk parameter penyakit dan pertumbuhan tanaman. Hasil penelitian menunjukkan bahwa periode inkubasi, ekspresi gejala, keparahan dan titer virus CMV-S bervariasi antarvarietas. Infeksi CMV-S dapat menghambat pertumbuhan tanaman pada semua varietas dan jumlah bunga yang lebih sedikit pada varietas Argomulyo, Anjasmoro, Grobogan, Sinabung, dan Wilis. Varietas Grobogan dikategorikan rentan, varietas Argomulyo, Anjasmoro, Cikuray, Sinabung, dan Wilis termasuk toleran, dan varietas Burangrang, Detam 1, dan Detam 2 termasuk tahan terhadap infeksi CMV-S. Indeks sensitivitas cekaman dari varietas kedelai yang diuji beragam, yang menunjukkan perbedaan genetik antarvarietas dalam merespons infeksi CMV-S. Tiga varietas unggul tahan (Burangrang, Detam 1, dan Detam 2) dapat digunakan sebagai tetua pada perakitan varietas tahan terhadap CMV-S.
Co-Authors . Giyanto . Haryanto Abdjad Asih Nawangsih Ade Syahputra Akhiruddin Akhiruddin Anastasya Hondo Anastasya Hondo Annisa Nur Imamah Cahyati, Iwe Dewa Gede Wiryangga Selangga DEWI SARTIAMI Dita Megasari Dwi Subekti Efendi, Darda Efi Toding Tondok Endah Muliarti Erniawati Diningsih Erniawati Diningsih Erniawati Diningsih Erniawati Diningsih Farida, Naimatul Gede Suastika Gede Suastika Gede Suastika GEDE SUASTIKA Gede Suastika Gede Suastika GEDE SUASTIKA GEDE SUASTIKA Gede Suastika Giyanto Giyanto Giyanto Giyanto Gusti Ngurah Alit Susanta Wirya Haerani Haerani Hagia Sophia Khairani Hamdayanty Hamdayanty HENDRA PARDEDE I Dewa Nyoman Nyana Ida Parida Imamah, Annisa Nur Imaniasita, Vidya Irwan Lakani IRWAN LAKANI Islami, Nisa Fadhila Januarsih, Vera Jati Adiputra Kartika Catur Damaiyanti Ketut Ayu Yuliadhi Kikin H Mutaqin L Pebriyeni Ladja, Fausiah T. Laras Anjarsari Lilik Koesmihartono Putra Listihani, Listihani Lulu Kurnianingsih Martha Theresia Panjaitan Melinda . Mhd Rifqi Abdillah Miftakhurohmah . Miftakhurohmah Miftakhurohmah MIFTAKHUROHMAH MIFTAKHUROHMAH MIFTAKHUROHMAH MIFTAKHUROHMAH, MIFTAKHUROHMAH Mimi Sutrawati Muhammad Fikri Hafizh Munif Ghulamahdi N Mattjik Ni Putu Pandawani Niken Nur Kasim, Niken Nur Niky Elfa Amanatillah NISA RACHMANIA MUBARIK Nur Unsyah Laili Nurfadillah NURHAJATI MATTJIK OLUFEMI JOSEPH ALABI Pratiwi, Rizky Nomi Purnamawati, Iis Purwono Purwono Putri, Maharani Mustika R Kartika RAUF, AUNU RAYAPATI ADIKESAVULU NAIDU Rita Noveriza Rita Noveriza Rizki Haerunisa S Susanto Slamet Susanto Sofranita Syifa Fitriyati SRI HENDRASTUTI HIDAYAT Sugeng Santoso Sugeng Santoso Supramana Suryo Wiyono Syaiful Khoiri TRISNA AGUNG PHABIOLA Wahyudin, Denih Wieke Mei Dina Yunita Fauziah Rahim Yunita Fauziah Rahim Yusmani Prayogo Zulfi, Fahma Zakiya