Claim Missing Document
Check
Articles

Deteksi Kontaminasi Babi pada Olahan Daging dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR) Nurrusyda, Fajriana S; Ishmayana, Safri; Fadhlillah, Muhammad; Safari, Agus; Zamzahra, Salma; Septiana, Reysha A. Q. A.; Wiliandini, Fadilla; Nabila, Najwa; Sumeru, Husain A.; Latifah, Rina G.
Kimia Padjadjaran Vol 1, No 2 (2023)
Publisher : Kimia Padjadjaran

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kontaminasi daging babi pada produk olahan daging menjadi masalah yang sering terjadi, terutama bagi konsumen yang memerhatikan keyakinan agama atau budaya mereka. Oleh karena itu, deteksi keberadaan kontaminasi daging babi dalam produk olahan daging menjadi penting untuk memastikan keaslian dan keamanan produk tersebut. Dalam beberapa penelitian sebelumnya, metode Polymerase Chain Reaction (PCR) dengan primer cytochrome b banyak digunakan untuk mendeteksi DNA babi karena memiliki kepekaan yang tinggi dalam identifikasi kontaminasi DNA babi pada bahan pangan. Penelitian ini bertujuan untuk menguji metode PCR dalam mendeteksi kontaminasi daging babi pada olahan daging. Sampel yang digunakan adalah bakso sapi dan bakso babi dengan tiga tahapan utama yaitu isolasi DNA, amplifikasi DNA dengan menggunakan PCR, dan visualisasi produk PCR dengan elektroforesis. Berdasarkan hasil yang didapatkan dalam penelitian ini menunjukkan bahwa metode PCR dengan primer cytotchrome b merupakan metode yang efektif untuk mendeteksi kontaminasi babi pada olahan daging dapat dilakukan karena metode ini sensitif, spesifik, dan relatif mudah untuk dilakukan
Analisis Kualitatif Bakteri Koliform pada Air Kemasan dengan Metode Most Probable Number Nurrusyda, Fajriana Shafira; Mawalia, Khiftul; Hasriani, Shela Amelia; Shahab, Ali Ridho; Tambunan, Clara Junita; Budiman, Mulydayana Reanifah; Harahap, Winni Suryani; Gobel, Khaeriska Rahayu; Ishmayana, Safri; Sumeru, Husain Akbar
Kimia Padjadjaran Vol 3, No 1 (2024)
Publisher : Kimia Padjadjaran

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Air merupakan sumber daya utama bagi kehidupan manusia yang digunakan untuk konsumsi, rumah tangga, dan industri. Kualitas mikrobiologis air minum perlu diawasi karena keberadaan bakteri indikator koliform mencerminkan kontaminasi fekal dan risiko penyakit. Berdasarkan Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia No. 2 Tahun 2023, air minum yang aman tidak boleh mengandung bakteri koliform dalam 100 mL sampel. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis keberadaan Escherichia coli pada air minum isi ulang menggunakan metode Most Probable Number (MPN), yaitu metode estimasi jumlah bakteri secara statistik berdasarkan jumlah tabung positif pada seri pengenceran tertentu. Uji dilakukan melalui dua tahap yaitu uji penduga untuk mendeteksi keberadaan bakteri koliform melalui pembentukan gas akibat fermentasi laktosa, dan uji konfirmasi untuk memastikan keberadaan E. coli pada media diferensial. Hasil uji penduga menunjukkan adanya gas pada satu tabung LB 2X (10 mL) dan satu tabung LB 1X (1 mL), sedangkan pada tabung LB 1X (0,1 mL) tidak terbentuk gas. Kombinasi hasil 1–1–0 menunjukkan estimasi MPN sebesar 3 bakteri/100 mL, yang termasuk kontaminasi rendah. Pada uji konfirmasi, koloni dengan warna ungu kehitaman dan kilau logam hijau pada media EMB teridentifikasi sebagai E. coli. Dengan demikian, sampel air minum isi ulang mengandung E. coli dan tidak memenuhi syarat sebagai air minum layak konsumsi.
In-house Multiplex rRT-PCR Assay for Sars-Cov2 Detection in Indonesia using a new primer design Gaffar, Shabarni; Putri, Rafika Nanda; Shabrinna, Hanif; Supriyadi, Isma Yustifania; Wiraswati, Hesti Lina; Ekawardani, Savira; Ishmayana, Safri; Hartati, Yeni Wahyuni; Faridah, Lia
Jurnal Riset Kimia Vol. 16 No. 1 (2025): March
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jrk.v16i1.781

Abstract

During the COVID-19 pandemic, we attempted to develop an in-house rRT-PCR kit, utilizing custom primers targeting NSP14 and RdRp, with the RPP30 gene as an internal control. This kit will support Indonesian independence in enhancing COVID-19 diagnostics. The primer and probe were designed by a bioinformatics tool, determining primer specificity and sensitivity, optimizing probe concentrations, establishing LoD (Limit of Detection), LoQ (Limit of Quantification), and rRT-PCR efficiency, multiplex testing of the rRT-PCR kit on clinical samples, and testing the kit's stability. The in-house rRT-PCR kit can detect NSP14, RdRp, and RPP30 genes. The optimal concentrations for the NSP14, RdRp, and RPP30 probes are 1 μM, 1.5 μM, and 1.5 μM, respectively. The LoD and LoQ for the NSP14 are 0.22 ng/μL and 0.67 ng/μL, and for the RdRp are 1.08 ng/μL and 3.28 ng/μL. The rRT-PCR efficiencies for the NSP14, RdRp, and RPP30 are 80.3%, 100.6%, and 106%, respectively. Detection of ten clinical samples, comprising seven true positive and three true negative samples, showed Ct (Cycle threshold) values of 28–31 for the RPP30 gene, Ct 21–27 for the RdRp gene, and Ct 30–34 for the NSP14 gene. Stability testing of the rRT-PCR kit demonstrated promising results, where the kit stored at -20°C for seven days showed almost no difference in Ct values. This in-house multiplex rRT-PCR will support Indonesian independence in enhancing COVID-19 diagnostics, providing a dependable method for detecting SARS-CoV-2 in clinical samples.
Co-Authors ', O. Suprijana Abubakar Sidik Abubakar Sidik Ace Tatang Hidayat Agus Safari Agus Safari Agus Safari Agus Safari Agus Safari Agus Safari Agus Safari Agus Safari Ahsanul Chaliqin Gayo Anastasya Firdausi Anggraeni, Nenden I. Anggraeni, Nenden Indrayati Anne Carolina Annisyaban Fatiha Azzahra Ari Hardianto Asep Juanda Budiman, Mulydayana Reanifah Carolina, Anne Ceppy Nasahi Danar Dono Dani Permana Desi Harneti Putri Huspa Devi, Puspitasari Rosiana Dian S Kamara Dian S. Kamara Dian S. Kamara Djajasoepena, Sadiah Djajasoepena, Sadiah DJOKO PRIJONO Ekawardani, Savira Endah Wulandari Fadhlillah, Muhammad Fadhlillah, Muhammad Fahruddin, Muhammad Fahmi Farhan Azhwin Maulana Fazl, Fazli Fazli Fazl Fitri Widiantini Frida F. Isnanisafitri Frida F. Isnanisafitri Frida F. Isnanisafitri Ghina, Sarah Fahma Ginting, Sani D. R. Br Gobel, Khaeriska Rahayu Hafiz, Ersanda Harahap, Winni Suryani Hari R. Haryadi Hasriani, Shela Amelia Herlian E. Putra Herlina Marta Hesti Lina Wiraswati Horasio, Debora Tamaris Husain Akbar Sumeru Ida Indrawati Idar Idar Idar Idar Idar Idar Idar Idar Idar, Idar Ika Wiani Iman Permana Maksum Isnanisafitri, Frida Febriani Juanda, Asep Kamara, Dian S Kamara, Dian S. Kamara, Dian S. Kindi Farabi Latifah, Rina G. Latifah, Rina Gaida Lia Faridah Linar Z Udin Linar Z Udin Linar Z. Udin M. Yusuf Awaluddin Mawalia, Khiftul Muhammad Fadhlillah Muhammad Fadhlillah Muhammad Fadhlillah Muhammad Fadhlillah Muhammad Fadhlillah Muhammad Yusuf Nabila, Najwa Nadia Maulida Nenden I. Anggraeni Nenden I. Anggraeni Neneng S Widayani Neneng Sri Widayani Nurisa Fadillah Isnaeni Nurlelasari Nurlelasari Nurrusyda, Fajriana S Nurrusyda, Fajriana Shafira Nurrusyda, Fajrina Shafira O. Suprijana O. Suprijana PUTRI, RAFIKA Putri, Rafika Nanda Putri, Tysza Ainnunnisa Maulidya R. Arif Malik Ramadhan R. Ukun M.S. Soedjanaatmadja Rachman, Saadah D Rachman, Saadah D. Rachman, Saadah D. Rachman, Saadah Diana Rani Maharani Regaputra Satria Janitra Ridya Widya Pasisca Roni Sutrisna Rudi Hartono Rusky I. Pratama Saadah D Rachman Saadah D. Rachman Saadah D. Rachman Saadah D. Rachman Saadah D. Rachman Saadah D. Rachman Saadah Diana Rachman Saadah Diana Rachman Saadah Diana Rachman Sadiah Djajasoepana Sadiah Djajasoepena Safari, Agus Sani Dwiningrum Rahayu Br Ginting Sani Dwiningrum Rahayu Br Ginting Savira Ekawardhani Septiana, Reysha A. Q. A. Shabarni Gaffar Shabrinna, Hanif Shahab, Ali Ridho Soetijoso Soemitro Soetijoso Soemitro Sofyan Multazam N Aji Sumeru, Husain A. Sumeru, Husain Akbar Suprijana, O. Supriyadi, Isma Yustifania Sutrisna, Roni Sylvi Qurrotul Aini Tambunan, Clara Junita Toto Subroto Tri Mayanti Trianing Tyas Kusuma Anggaeni Udin, Linar Z Unang Supratman Wahyu Widayat Westy Juniaty Widayani, Neneng Sri Wiliandini, Fadilla Yeni W Hartati Yeni Wahyuni Hartati Yogas Dwi Pratiwi Yusuf Hidayat Yusuf Hidayat Yusup Hidayat Yusup Hidayat Yusup Hidayat Zamzahra, Salma