Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
1.325
P-Index
This Author published in this journals
All Journal VALENSI Journal of Mathematical and Fundamental Sciences Jurnal Kimia Riset Indonesian Journal of Chemistry PHARMACY: Jurnal Farmasi Indonesia (Pharmaceutical Journal of Indonesia) MOSIRAHA : Jurnal Pengabdian Farmasi
Arba, Muhammad
Department Of Pharmacy, Faculty Of Pharmacy, Universitas Halu Oleo, Kendari 93231, Indonesia
Humanities Astronomy Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Earth & Planetary Sciences Health Professions Materials Science & Nanotechnology Mathematics Physics Public Health

Published : 9 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 9 Documents
Search

 1 
Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (HKSA) dan Penambatan Molekul Senyawa Turunan Benzamida sebagai Inhibitor Alosterik Mitogen Enhanced Kinase (MEK) Muhammad Arba; Ruslin Ruslin; Nursan Nursan; Maulidiyah Maulidiyah; Daryono Hadi Tjahjono
Jurnal Kimia Valensi Jurnal Kimia VALENSI Volume 4, No. 1, Mei 2018
Publisher : Syarif Hidayatullah State Islamic University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (744.19 KB) | DOI: 10.15408/jkv.v4i1.7454

Abstract

Jalur sinyal protein kinase Ras-Raf-MEK-ERK adalah salah satu target penting dalam penemuan obat antikanker. Senyawa turunan benzamida diketahui berpotensi sebagai inhibitor alosterik Mitogen Enhanced Kinase (MEK). Pada penelitian ini dilakukan studi hubungan kuantitatif stuktur dan aktivitas (HKSA) dan penambatan molekul pada 30 senyawa turunan benzamida sebagai inhibitor alosterik MEK untuk mendapatkan senyawa baru turunan benzamida yang lebih poten sebagai inhibitor alosterik MEK. Perhitungan 13 deskriptor molekul yang mewakili parameter sterik, hidrofobik dan elektronik dilakukan dengan perangkat lunak MOE 2009.10, sedangkan analisis regresi multi linear dengan SPSS 19.0 digunakan untuk mencari hubungan antara variabel bebas (deksriptor molekul) dengan variabel terikat (aktivitas penghambatan senyawa pada MEK). Model HKSA terbaik yang diperoleh adalah pIC50 = 14.229 – 0.00001(AM1_E) + 0.043(ASA_H) + 33.609(Glob) – 0.648(Log S) – 0.047(Vol) dengan kriteria statistik R=0.965; R2=0.931; Fhitung/ Ftabel= 17.693, dan q2 = 0.8897. Desain senyawa baru dilakukan menggunakan model HKSA tervalidasi dan diperoleh 2 senyawa baru turunan benzamida, C1, dan C2, yang memiliki aktivitas lebih baik dari senyawa induk. Studi penambatan molekul menunjukkan bahwa kedua senyawa baru tersebut mampu berinteraksi pada sisi alosterik protein MEK melalui ikatan hidrogen dan ikatan van der Waals dengan residu-residu asam amino krusial protein MEK. Penelitian ini mengindikasikan bahwa kedua senyawa baru yang didesain dapat ditindaklanjuti pada studi penemuan obat yang menargetkan MEK pada sisi alosterik.DOI:http://dx.doi.org/10.15408/jkv.v4i1.7454
STUDI HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR AKTIVITAS SENYAWA TURUNAN MEISOINDIGO SEBAGAI INHIBITOR CDK4 Muhammad Arba; Riki Andriansyah; Messi Leonita
Jurnal Kimia Riset Vol. 1 No. 2 (2016): Desember
Publisher : Universitas Airlangga

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (232.283 KB) | DOI: 10.20473/jkr.v1i2.3090

Abstract

ABSTRAKTelah dilakukan analisis Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas (HKSA) senyawa turunan meisoindigo sebagai inhibitor Cyclin Dependent Kinase-4 (CDK4) menggunakan regresi multi linear untuk pemilihan variabel. Hasil penelitian menyatakan bahwa aktivitas penghambatan CDK4 dari senyawa turunan mesoindigo bergantung pada beberapa parameter, yaitu momen dipol, energi total, energi elektronik, panas pembentukan, dan kelarutan. Akurasi model HKSA yang diusulkan divalidasi baik dengan teknik validasi silang maupun dengan validasi eksternal. Hasil penelitian ini dapat digunakan untuk desain senyawa inhibitor CDK4 yang lebih baik dari turunan meisoindigo. Kata kunci: HKSA, meisoindigo, kanker, CDK4 ABSTRACTCyclin-dependent kinase 4 (CDK4) is an important target in the treatment of cancer. Exploring of compounds that can inhibit the activity of CDK4 is actively performed worldwide. This research was conducted to do Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) analysis of meisoindigo derivative compounds as inhibitor for CDK4 in order to get QSAR equation, then it was further used to design new inhibitor based meisoindigo which has more potent and selective for CDK4. Data compound is divided into training set to build QSAR models and the test set to validate the model. Calculation was done by MOE2009.10 descriptor and multilinear regression analysis, SPSS19.0. The results showed that the inhibitory activity of mesoindigo derived compounds toward CDK4 was depended on several dipole moment, total energy, electronic energy, heat of formation, and solubility. The accuracy of QSAR models proposed validated by cross validation techniques and with external validation. The results of this study can be used to design a new CDK4 inhibitor compound better than meisoindigo derivative Keywords: QSAR, meisoindigo, cancer, CDK4
Molecular modeling on the identification of potential Janus Kinase 3 (JAK3) inhibitor based on the Indonesian Medicinal Plant Database Muhammad Arba; Sanang Nur Safitri; Andry Nur Hidayat; Arry Yanuar; Muhammad Sulaiman Zubair; Asmiyenti Djaliasrin Djalil; Daryono Hadi Tjahjono
Journal of Mathematical and Fundamental Sciences Vol. 52 No. 3 (2020)
Publisher : Institute for Research and Community Services (LPPM) ITB

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.5614/j.math.fund.sci.2020.52.3.2

Abstract

The Janus tyrosine kinases (JAKs) have shown great promise as therapeutic protein targets in the treatment of cancer and inflammation diseases. This study used pharmacophore modeling to identify potential inhibitors of Janus kinase 3 (JAK3). A pharmacophore model was developed based on a known JAK3 inhibitor (1NX) and was employed to search for potential JAK3 inhibitors against Indonesian herbal compounds. Among 28 hit molecules that were identified and subjected to a molecular docking protocol against JAK3, the three compounds that had the highest affinities toward JAK3 were camelliaside B, 3-O-galloylepicatechin-(4beta-6)-epicatechin-3-O-gallate, and mesuaferrone B. These were then each subjected to a 50-ns molecular dynamics (MD) simulation. Analysis of RMSD and RMSF values indicated that the three compounds reached stability during the MD simulation. Interestingly, all three compounds had lower binding energies than 1NX against JAK3, as predicted by the MM-PBSA binding energy calculation.
In Vitro and In Silico Studies of Quercetin and Daidzin as Selective Anticancer Agents Muhammad Sulaiman Zubair; Syariful Anam; Saipul Maulana; Muhammad Arba
Indonesian Journal of Chemistry Vol 21, No 2 (2021)
Publisher : Universitas Gadjah Mada

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22146/ijc.53552

Abstract

Quercetin and daidzin are flavonoid and flavonoid glycoside type compounds that have been found in many plants and nutraceuticals. This study aims to examine the in vitro cytotoxic and selectivity properties of quercetin and daidzin on breast and cervical cancers and to study their molecular interaction and stability on epidermal growth factor receptor tyrosine kinase (EGFR-TK) by applying molecular docking and molecular dynamics (MD) simulations. In vitro anticancer activity was performed by 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT) method on breast cancer cell (T47D), cervical cancer cells (HeLa), and Vero normal cells, while molecular docking and MD simulation were done by using AutoDock Vina and Amber18 package software, respectively. Quercetin and daidzin showed potent cytotoxic and high selectivity on both cell lines. Daidzin was found to has a higher IC50 and selectivity index than quercetin. Docking and MD results showed that both compounds prefer to interact with epidermal growth factor receptor tyrosine kinase (EGFR-TK). Daidzin showed better interaction than quercetin with a docking score of -9.6 kcal/mol. Also, daidzin was found more stable than quercetin with low RMSD and RMSF values.
Virtual Screening of the Indonesian Medicinal Plant and Zinc Databases for Potential Inhibitors of the RNA-Dependent RNA Polymerase (RdRp) of 2019 Novel Coronavirus Muhammad Arba; Andry Nur-Hidayat; Ida Usman; Arry Yanuar; Setyanto Tri Wahyudi; Gilbert Fleischer; Dylan James Brunt; Chun Wu
Indonesian Journal of Chemistry Vol 20, No 6 (2020)
Publisher : Universitas Gadjah Mada

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22146/ijc.56120

Abstract

The novel coronavirus disease 19 (Covid-19) which is caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has been a pandemic across the world, which necessitate the need for the antiviral drug discovery. One of the potential protein targets for coronavirus treatment is RNA-dependent RNA polymerase. It is the key enzyme in the viral replication machinery, and it does not exist in human beings, therefore its targeting has been considered as a strategic approach. Here we describe the identification of potential hits from Indonesian Herbal and ZINC databases. The pharmacophore modeling was employed followed by molecular docking and dynamics simulation for 40 ns. 151 and 14480 hit molecules were retrieved from Indonesian herbal and ZINC databases, respectively. Three hits that were selected based on the structural analysis were stable during 40 ns, while binding energy prediction further implied that ZINC1529045114, ZINC169730811, and 9-Ribosyl-trans-zeatin had tighter binding affinities compared to Remdesivir. The ZINC169730811 had the strongest affinity toward RdRp compared to the other two hits including Remdesivir and its binding was corroborated by electrostatic, van der Waals, and nonpolar contribution for solvation energies. The present study offers three hits showing tighter binding to RdRp based on MM-PBSA binding energy prediction for further experimental verification.
Insight on Estrogen Receptor Alpha Modulator from Indonesian Herbal Database: An in-silico analysis Muhammad Arba; Nadhifatul Aslikah; Arfan Arfan; Ruslin Ruslin; Arry Yanuar
PHARMACY: Jurnal Farmasi Indonesia (Pharmaceutical Journal of Indonesia) Jurnal Pharmacy, Vol. 17 No. 02 Desember 2020
Publisher : Pharmacy Faculty, Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30595/pharmacy.v17i2.7592

Abstract

Estrogen receptor α (ERα) is liable for regulating transcription factors which are an important part of hormonal signaling in breast cancer. This study intends to find hit compounds that are considered capable of inhibiting ERα by utilizing structure-based pharmacophores and molecular docking. Pharmacophore of the original ERα ligand (E4D600) has one hydrogen bond acceptor and three hydrogen bond donors which are used to select compounds from the Indonesian herbal database. This pharmacophore model had an Area under Curve of the Receiver Operating Characteristics (AUC-ROC) value is 0.80 and the Goodness of Hits (GH) value is 0.81. The selection process generated 330 compounds which proceed to the molecular docking stage to analyze their binding energy and interactions to ERα. The results indicated potential hit compounds seen from their binding energies in the range -5.42 to -10.01 kcal/mol. four of the best compounds including Lig57/(-)-Bidwillon A, Lig47/Quercetin 3-(6''-galloylgalactoside), Lig197/Multifloroside and Lig83/Erythrabyssin II provide promising information for their detailed analysis as ERα inhibitors.
SOSIALISASI DAN EDUKASI TENTANG KOSMETIK YANG AMAN PADA MASYARAKAT PESISIR DI DESA LEPPE, KECAMATAN SOROPIA, KABUPATEN KONAWE Muhammad Arba; Wa Ode Sitti Zubaydah; Rifa'atul Mahmudah; Irvan Anwar; Alvin Mahendra Salim; Cici Pulcerima; Fitri Syahriani Djalil; Friesca Dwi Cahyani; Nur Islami Irwan; Riski; Rita; Sri Astuti Handayani
Mosiraha: Jurnal Pengabdian Farmasi Vol. 1 No. 1 (2023): Edisi April 2023
Publisher : Fakultas Farmasi Universitas Halu Oleo

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kosmetika merupakan salah satu produk farmasi yang digunakan setiap hari oleh wanita dan pria mulai dari bayi sampai orang dewasa. Tujuan dari kegiatan ini adalah untuk memberikan sosialisasi kepada masyarakat desa pesisir mengenai pemilihan kosmetika yang aman. Metode yang digunakan adalah dengan pembagian leaflet dan pemberian materi melalui presentase dan dilanjutkan dengan sesi tanya jawab. Luaran kegiatan berupa warga desa Leppe mengetahui cara pemilihan kosmetik yang aman sesuai yang disyaratkan oleh BPOM. Kesimpulan masyarakat desa leppe masih minim tentang pemilihan kosmetik yang aman, sehingga dengan adanya sosialisasi ini diharapkan dapat menambah pengetahuan masyarakat dalam mengetahui dan memilih kosmetik yang aman.
PENINGKATAN PEMAHAMAN TENTANG BAHAYA PENYALAHGUNAAN NARKOBA DAN OBAT KERAS PADA REMAJA DI SMA NEGERI 1 SOROPIA Muhammad Arba; Rahmat Muliadi; Arfan Arfan; Rifa'atul Mahmudah
Mosiraha: Jurnal Pengabdian Farmasi Vol. 1 No. 2 (2023): Edisi Agustus 2023
Publisher : Fakultas Farmasi Universitas Halu Oleo

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.33772/mosiraha.v1i2.14

Abstract

Penyalahgunaan narkoba dan obat keras telah menjadi permasalahan serius yang merugikan individu, keluarga, dan masyarakat. Untuk mengatasi masalah ini, dilakukan sebuah pengabdian masyarakat di desa pesisir, khususnya di SMAN 1 Soropia, dengan fokus pada sosialisasi mengenai bahaya penyalahgunaan narkotika dan obat keras. Pengabdian ini bertujuan untuk meningkatkan kesadaran masyarakat, terutama siswa-siswi SMAN 1 Soropia, tentang risiko dan konsekuensi negatif dari penyalahgunaan narkoba dan obat keras. Selain itu, pengabdian ini juga bertujuan untuk mempromosikan gaya hidup sehat sebagai upaya preventif dalam mengatasi penyalahgunaan. Pengabdian dilakukan dengan metode penyuluhan, pembagian leaflet, dan kegiatan interaktif melalui pemberian materi dan diskusi. Penyuluhan memberikan informasi yang komprehensif tentang jenis narkoba, dampaknya pada kesehatan fisik dan mental, serta implikasi hukumnya. Hasil dari pengabdian ini menunjukkan peningkatan kesadaran masyarakat di desa pesisir, khususnya siswa-siswi SMAN 1 Soropia, tentang risiko penyalahgunaan narkoba dan obat keras. Masyarakat menjadi lebih responsif dan proaktif dalam upaya pencegahan, dengan mengambil langkah-langkah preventif untuk menghindari penyalahgunaan obat keras. Pengabdian masyarakat ini berhasil meningkatkan kesadaran masyarakat tentang bahaya penyalahgunaan narkoba dan obat keras. Kolaborasi antara pihak sekolah, masyarakat, dan instansi terkait menjadi kunci dalam menciptakan lingkungan yang lebih aman dan sehat di desa pesisir. Melalui upaya pencegahan ini, diharapkan perubahan perilaku yang lebih positif dapat terus berkembang, sehingga kualitas hidup masyarakat di daerah pesisir dapat meningkat.
SOSIALISASI KESEHATAN REPRODUKSI DI SEKOLAH MENENGAH ATAS NEGERI 8 KENDARI Muhammad Arba; Loly Subhiaty Idrus; Vica Aspadiah; rahmat Muliadi; Fadhliyah Malik; Nasrudin
Mosiraha: Jurnal Pengabdian Farmasi Vol. 2 No. 1 (2024): Edisi April 2024
Publisher : Fakultas Farmasi Universitas Halu Oleo

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.33772/mosiraha.v2i1.44

Abstract

Kesehatan reproduksi tidak hanya mencakup tentang pengetahuan remaja mengenai cara menjaga kesehatan alat reproduksinya. Akan tetapi, juga mencakup tentang pengetahuan remaja mengenai kodrat yang perlu diemban dan perilaku yang tidak boleh dilakukan setelah mengalami perkembangan seks sekunder. Tujuan dari kegiatan ini dimaksudkan untuk memberikan edukasi dan pengetahuan mengenai kesehatan reproduksi remaja serta hal-hal yang dapat membahayakan diri jika tidak menjaga kesehatan reproduksi pada siswa(i) SMA Negeri 8. Metode yang diberikan berupa informasi melalui sosialisasi, leaflet yang diberikan, jurnal pengabdian dan melalui media berita online. Hasil dari kegiatan pengabdian yang telah dilakukan yaitu bertambahnya pengetahuan siswa(i) SMA Negeri 8 Kendari tentang kesehatan reproduksi remaja dan mendapatkan informasi yang jelas mengenai kesehatan reproduksi remaja.
Co-Authors Alvin Mahendra Salim Andry Nur Hidayat Andry Nur-Hidayat Arfan Arfan Arry Yanuar Asmiyenti Djaliasrin Djalil Chun Wu Cici Pulcerima Daryono Hadi Tjahjono Dylan James Brunt Fadhliyah Malik Fitri Syahriani Djalil Friesca Dwi Cahyani Gilbert Fleischer Ida Usman Irvan Anwar Loly Subhiaty Idrus Maulidiyah Maulidiyah Messi Leonita Muhammad Sulaiman Zubair Nadhifatul Aslikah NASRUDIN Nur Islami Irwan Nursan Nursan Rahmat Muliadi Rifa'atul Mahmudah Rifa'atul Mahmudah Riki Andriansyah Riski RITA Ruslin Ruslin Ruslin Ruslin Saipul Maulana Sanang Nur Safitri Setyanto Tri Wahyudi Sri Astuti Handayani Syariful Anam Vica Aspadiah Wa Ode Sitti Zubaydah