Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
3.207
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Sainteks Omni-Akuatika Jurnal Perikanan Universitas Gadjah Mada Jurnal Akuakultur Sungai dan Danau Indonesian Aquaculture Journal Jurnal Riset Akuakultur Aquacultura Indonesiana Jurnal Ruaya : Jurnal Penelitian dan Kajian Ilmu Perikanan dan Kelautan Jurnal Perikanan Pantura Arwana: Jurnal Ilmiah Program Studi Perairan Proceedings Series on Physical & Formal Sciences Jurnal Ruaya : Jurnal Penelitian dan Kajian Ilmu Perikanan dan Kelautan Jurnal MAIYAH Molekul: Jurnal Ilmiah Kimia
Syakuri, Hamdan
Unknown Affiliation
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Civil Engineering, Building, Construction & Architecture Computer Science & IT Decision Sciences, Operations Research & Management Earth & Planetary Sciences Economics, Econometrics & Finance Electrical & Electronics Engineering Energy Engineering Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Materials Science & Nanotechnology Mechanical Engineering Medicine & Pharmacology Social Sciences Veterinary Other

Published : 23 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 23 Documents
Search

 1   2   3 
ISOLASI, IDENTIFIKASI, DAN ANALISIS EKSPRESI GEN PENGKODE GROWTH HORMONE PADA IKAN SIDAT (Anguilla bicolor) Syakuri, Hamdan; Wibowo, Satrio Haryu; Ekasanti, Anandita; Soedibya, Petrus Hary Tjahja; Marnani, Sri; Listiowati, Emyliana; Nugrayani, Dewi; Sukardi, Purnama
Jurnal Riset Akuakultur Vol 19, No 1 (2024): (Maret 2024)
Publisher : Politeknik Kelautan dan Perikanan Jembrana

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15578/jra.19.1.2024.69-83

Abstract

Gen hormon pertumbuhan (growth hormone, GH) perlu dipelajari untuk mendukung domestikasi ikan sidat Anguilla bicolor di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi gen pengkode GH serta menganalisis ekspresinya pada sampel ikan sidat A. bicolor. Primer untuk amplifikasi gen GH ikan sidat A. bicolor didesain berdasarkan sekuen gen GH dari beberapa spesies ikan sidat lain yang tersedia di GenBank. Sampel cDNA hipofisa dan otak ikan sidat digunakan untuk amplifikasi gen GH. Hasil amplifikasi disekuensing dan hasilnya dianalisis menggunakan analisis BLAST, multiple sequences alignment, hormon signature, dan filogenetik. Analisis ekspresi gen GH dilakukan menggunakan teknik realtime PCR dengan metode delta-delta CT pada 14 sampel ikan sidat (23,1 ± 19,6 g; 24,5 ± 4,2 cm). Fragmen DNA sepanjang 486 bp berhasil diamplifikasi dan disekuensing. Sekuen gen GH A. bicolor memiliki similaritas nukleotida sebesar 98,49-99,14% jika dibandingkan dengan gen GH ikan sidat A. anguilla, A. australis, dan A. japonica. Sekuen parsial tersebut secara in silico diketahui mengkode bagian dari protein GH sepanjang 155 asam amino (aa). Sekuen asam amino protein GH A. bicolor sangat mirip dengan sekuen spesies ikan sidat lain dengan hanya tiga perbedaan asam amino dan membentuk satu percabangan pada pohon filogenetik. Tingkat ekspresi gen GH pada sampel ikan sidat memiliki variasi yang tinggi. Hasil penelitian ini dapat menjadi dasar untuk studi selanjutnya khususnya berkaitan dengan peran gen GH dalam pertumbuhan ikan sidat A. bicolor.The growth hormone (GH) gene needs to be studied to support the domestication of the Anguilla bicolor eel in Indonesia. This study aimed to isolate and identify the GH coding gene and analyze its expression in samples of the eel A. bicolor. Primers for amplification of the GH gene of A. bicolor eels were designed based on GH gene sequences from several other eel species available in GenBank. Pituitary and brain cDNA samples of eel were used for GH gene amplification. The amplification results were sequenced and the results were analyzed using BLAST analysis, multiple sequence alignment, hormone signature, and phylogenetic analysis. The GH gene expression analysis was carried out using the real-time PCR technique with the delta-delta CT method on 14 eel samples (23.1 ± 19.6 g; 24.5 ± 4.2 cm). The 486 bp DNA fragment was successfully amplified and sequenced. The GH gene sequence of A. bicolor has a nucleotide similarity of 98.49-99.14% when compared with the GH gene of other eel species A. anguilla, A. australis, and A. japonica. This partial sequence was found in silico to code 155 amino acids (aa) GH protein. The amino acid sequence of the A. bicolor GH protein is very similar to that of other eel species with only three amino acid differences and forms one branch on the phylogenetic tree. The expression level of the GH gene in eel samples had high variations. The results of this study could be a basis for further studies, especially regarding the role of the GH gene in the growth of the eel A. bicolor. 
PENAPISAN BAKTERI SELULOLITIK PADA SALURAN PENCERNAAN IKAN KERAPU CANTANG YANG DIBUDIDAYAKAN DI DESA BABAKAN, KECAMATAN PANGANDARAN, KABUPATEN PANGANDARAN Syukri, Ningam; ., Kasprijo; Tjahja, P.Hary; Syakuri, Hamdan; Listiowati, Emyliana
Jurnal Ruaya : Jurnal Penelitian dan Kajian Ilmu Perikanan dan Kelautan Vol 9 No 2 (2021): Jurnal Ruaya : Jurnal Penelitian dan Kajian Ilmu Perikanan dan Kelautan
Publisher : UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PONTIANAK

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (528.946 KB) | DOI: 10.29406/jr.v9i2.3000

Abstract

Ikan Kerapu Cantang merupakan hasil pesilangan dari ikan Kerapu Macan betina dan ikan Kerapu Kertang jantan. Ikan Kerapu Cantang merupakan salah satu komoditas perikanan budidaya yang memiliki nilai ekonomis tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keberadaan bakteri selulolitik serta aktivitas bakteri selulolitik pada saluran pencernaan ikan Kerapu Cantang. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah metode observasi dengan pengambilan sampel secara purpose random sampling. Variabel utama yang diamati pada penelitian ini yaitu mengamati proporsi bakteri selulolitik dan aktivitas bakteri selulolitik pada saluran pencernaan ikan Kerapu Cantang. Untuk variabel pendukung pada penilitian ini yaitu kelimpahan bakteri, uji gram KOH, proporsi Bacillus Serta pewarnaan gram. Keberadaan bakteri Selulolitik pada saluran pencernaan ikan Kerapu Cantang pada penelitian ini ditunjukkan dengan adanya zona bening di sekeliling koloni bakteri yang ditumbuhkan pada media spesifik ( CMC 1%). Hasil penelitian ini untuk proporsi keberadaan bakteri selulolitik pada bagian anterior 49,33% middle 38,66% dan posterior 28%. Aktivitas bakteri selulolitik dari penelitian ini menunjukan hasil dengan indeks hidrolisis pada bagian anterior sebesar 0,14 – 1,4, midddle 0,1 – 3,3 dan posterior 0,2 – 1,6.
Modulation of Gut Microbiota, Nutrient Transport Gene Expression, and Growth of Red Hybrid Tilapia (Oreochromis sp.) Fed with Black Soldier Fly (Hermetia illucens) by Oral Probiotics Latifah, Ma'rufa Nurul; Murti, Fauziah Arelia Usmiara; Helmiati, Senny; Ismail, Norshida; Syakuri, Hamdan; Istiqomah, Indah; Murwantoko, Murwantoko; Isnansetyo, Alim
Jurnal Perikanan Universitas Gadjah Mada Vol 26, No 2 (2024)
Publisher : Universitas Gadjah Mada

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22146/jfs.95268

Abstract

Maggot Black Soldier Fly (BSF) is a nutritionally rich alternative food for fish. The slow digestibility requires the combination with other technologies to produce fish with excellent growth. This study aims to investigate the impact of probiotic application on the growth, microbiome, and gene expression in the intestines of tilapia-fed black soldier fly (BSF) larvae. Tilapia intestines were examined after two months of rearing with three replications and two treatments: A) 30% maggots and 70% commercial pellets with probiotics, and B) 30% maggots and 70% commercial pellets without probiotics. We discovered that probiotics have a significant impact on the gut microbiomes of fish and their absolute growth. The amplicon sequence variant in the probiotic treatment (A) was 25, with dominance by Cetobacterium, Acinetobacter, Enhydrobacter, and Gemmobacter, while the non-probiotic treatment (B) was 8, with dominance by Cetobacterium and Turicibacter. The probiotic treatment increased the expression of Ghrelin, Muc-2, IL-1β, and I-FABP genes, but not the CD36 gene. These findings suggest oral probiotics can help boost tilapia production when fed maggot black soldier fly (Hermetia illucens).
Co-Authors A. Ekasanti Ade Rusman Agung Cahyo Setyawan Agung Cahyo Setyawan Agus Nuryanto Ahmad Hanif Pranoto Utomo ALIM ISNANSETYO Alvin Maulana Astuti - D. Nugrayani D. Wisudyanti Dewi Fitrya Nugraheny Dewi Nugrayani Dewi Nugrayani Dewi Nugrayani Dewi Nugrayani Dewi Wisudyanti Dyahruri Sanjayasari Ekasanti, Anandita Emyliana Listiowati Emyliana Listiowati Emyliana Listiowati Emyliana Listiowati, Emyliana Endang Hilmi Endang Hilmi Faizah, Farkhah Nur Hary Tjahja Soedibya Hendro Pramono Ikhsan Pratama Imlami, Ainulyakin Hasan INDAH ISTIQOMAH Ismail, Norshida K. H. Nitimulyo Kasprijo, Kasprijo Kusuma, Baruna Kusuma, Rima Oktavia Latifah, Ma'rufa Nurul Marhaendro Santoso Mas Yedi Sumaryadi Mohammad Nurhafid Muh. Sulaiman Dadiono Muhammad Nurhafid Muhammad Nurhafid Nurhafid Murti, Fauziah Arelia Usmiara Murwantoko . Muslih Muslih Ningam Syukri Norman Arie Prayogo Norman Arie Prayogo, Norman Arie Nugrayani, Dewi Nuning Vita Hidayati Nur Wijayanti Oedjijono Oedjijono P.Hary Tjahja Palupi, Mustika Philipus Uli Basa Hutabarat Purnama Sukardi Purnama Sukardi Purnama Sukardi Purwandaru Widyasunu R. Oktavia Rosita, Rita Eka Rusman, Ade Senny Helmiati Setyawan, Agung Cahyo Slamet Budi Prayitno Soedibya, Petrus Hary Tjahja Sofi Khoerun Nisa Sri Marnani Sri Marnani Steinhagen, Dieter Syukri, Ningam Taufik Budhi Pramono Taufik Budhi Pramono Taufik Budhi Pramono Teuku Junaidi Tjahja, P.Hary Triyanto Triyanto Undiono Undiono Vaediyasari, Dahniar Wibowo, Satrio Haryu Wijaya, Rudy Yohanes Evander