p-Index From 2021 - 2026
4.534
P-Index
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Vegetalika

Optimasi Ekstraksi RNA dan Teknik Kloning: Studi Kasus Kloning Gen Heading Date 3a pada Kelapa Sawit Polosoro, Aqwin; Enggarini, Wening; Kusumanegara, Kusumawaty; Hadiarto, Toto; Miftahudin, Miftahudin; Supena, Ence Darmo Jaya
Vegetalika Vol 13, No 2 (2024)
Publisher : Universitas Gadjah Mada

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22146/veg.92085

Abstract

Pembungaan memegang peranan penting bagi tumbuhan karena memfasilitasi rekombinasi genetik, sehingga mendukung perkembangan keragaman genetik yang penting. Keluarga protein phosphatidylethanolamine binding proteins (PEBP) memainkan peran penting dalam mengatur waktu pembungaan dan dormansi benih di beragam spesies tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk merancang vektor biner dengan membangun pCAMBIA1300 yang menggabungkan rangkaian gen EgHd3a dari kelapa sawit. Proses konstruksi gen meliputi ekstraksi RNA, sintesis cDNA, amplifikasi gen EgHd3a, kloning gen menjadi vektor kloning, subkloning ke dalam vektor biner pCAMBIA1300, dan diakhiri dengan validasi gen melalui analisis sekuens. Pada ekstraksi RNA, metode PCL-Chisam telah terbukti efektif melalui ekstraksi berulang, meningkatkan kualitas dan kuantitas total RNA. Dalam proses kloaning, metode konvensional menghadapi tantangan dalam memilih lokasi pembelahan yang tepat. Untuk mengatasi kendala ini, penggunaan enzim dengan overhang yang kompatibel diusulkan sebagai solusi potensial. Secara khusus, penggantian BamHI dari BglII telah secara efektif mengatasi tantangan ini. Konfirmasi integrasi fragmen gen ke dalam plasmid pCAMBIA1300 dicapai melalui pengurutan. Meskipun perbedaan diidentifikasi dalam rangkaian EgHd3a-2, perubahan ini tidak berdampak pada asam amino yang dikodekan, sehingga menjaga integritas rangkaian protein
Co-Authors , Triadiati AD Ambarwati ADEEL ABDUL KARIM ALTUHAISH Afifah Azkiyah Ahmad Dwi Setyawan Ahmad Tarmidi Albarokah, Nurdiansyah ALEX HARTANA ALEX HARTANA Amarullah, Mohammad Syarifuddin Ambarwati, AD Anarki, Aprillia Alling Anjar Tri Wibowo Arafah, Purnama Aris Tjahjoleksono Atang Sutandi Awik Puji Dyah Nurhayati Aziz, Alvi Bachtiar, Machdum BUDI SETIADI DARYONO Budiarto, Despiyan Dwi CHAIDIR CHAIDIR Dasumiati Dasumiati Desvian Bandarsyah Devi Media Siska Dewi Indriyani Roslim DIANA AGUSTIN CAROLINA DIBYO PRONOWO Dwi Jatmoko Dwi Suci Setyaningsih Dwinita Wikan Utami DWINITA WIKAN UTAMI Eka Setiawan Fahrurrozi Fahrurrozi Faiz, Agus Maulana Fauzobihi, Fauzobihi Fuad Fitriawan, Fuad Habizar, Habizar Hafizhni Anggia, Rafi HAJRIAL ASWIDINNOOR Hamim Hamim Hanarida, I Harisca, Rodhi Hartanti, Fajri Hartati, N Sri Haryanti, Intisari HIMMAH RUSTIAMI Himmah Rustiami, Himmah I Hanarida I PUTU GEDE P. DAMAYANTO I PUTU GEDE P. DAMAYANTO, I PUTU GEDE P. I Rosdianti Ilham Dinar Akbar Cudino Iman Rusmana Iswandi Anas Isya, Mandanu Akhta Nur Iwan, Pristanto Ria Irawan J PERRY GUSTAFSON Joko Prasetiyono JULIARNI JULIARNI Juliyani Juliyani Kamini, Kamini Khoirurrijal Khoirurrijal, Khoirurrijal Komalasari, Selly Siti Komalasari Kustiariyah, Kustiariyah Kusumanegara, Kusumawaty LA KOLAKA Latifah, Vida Rahma M Ilham Fahmi Roji MARIA BINTANG Marlina Ardiyani Maududy, Robby Meitha, Karlia Moeljopawiro, Sugiono Muchozin, Muhammad Ni'an Muhammad Akbar Velayati Muhammad Alfarabi Mukhlash Abrar Munif Ghulamahdi Muslimin Muslimin MUTTAQIN, MAFRIKHUL Nadzar Saifudin Nasir, Fahad Muhammad Nasir Nettyani, Naipospos Nugroho, Giri Nunung Fajaryani, Nunung Nurlaela Nurlaela Nurlaela Nurlaela Nurlaila, Santi Nurlaila OKKY SETYAWATI DHARMAPUTRA Pieter Agusthinus Riupassa Polosoro, Aqwin Prasetiyono, Joko Purwanti, Tira Puspita Dewi Sopyati Putri Aulia Putro, Karso Suryo Raden Mohamad Herdian Bhakti RANTJE LILLY WORANG Rasyid, Aliy Ratnasari, Seli Risa Aryantri Rizal Nursamsi, Dede RIZAL SYARIEF Rosandi Ardi Noegraha Rosdianti, I Ruwirohi, Jan Everhard S Yuriyah Sahab, Fahmi Sahab Sairun Sairun Salimah, Hafshah Aqidatun Sandra Arifin Aziz Sartika, Dian Setiawan Setiawan Setiawan, Jeffry SISWA SETYAHADI Siti Maryam Harahap Slamet, Oky Sobir Sobir Sokoy, Mercy Sopandi, Nur Irfan Sri Ernawati Srifariyati, Srifariyati Sudirman Yahya Sugeng Heri Suseno Sugiono Moeljopawiro Suharsono Suharsono Suharsono Suharsono Suharsono Suharsono Suharsono, Suharyadi Suharyadi Sulistiani, Erina Supena, Ence Darmo Jaya Sutiarso Sutiarso Suwaji Handaru Wardoyo Suwarno Suwarno Suwarno Suwarno TATIK CHIKMAWATI Tnunay, Ite Morina Yostianti Toto Hadiarto Trikoesoemaningtyas Turhadi Turhadi Utut Suharsono Utut Widyastuti Violita Violita Wardhani, Hilda Sari Wening Enggarini Windarti Wahyuningtyas Windriyana, Windriyana Yuriyah, S Yusrian, Afif Ramdhan Yusuf, Adib Fakhruddin Yuyun Rohmatul Uyuni Zurtiana, Ahmad