Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Jurnal Biosense

OPTIMASI SUHU ANNEALING MARKA MOLEKULER SIMPLE SEQUENCE REPEAT (SSR) UNTUK STUDI KERAGAMAN GENETIK Aglaonema pictum (Roxb.) Kunth Maharani, Fira Shabrina Bintang; Hariri, Muhammad Rifqi; Turhadi, Turhadi
JURNAL BIOSENSE Vol 8 No 4 (2025): Edisi Oktober 2025
Publisher : Program Studi Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas PGRI Banyuwangi, Jalan Ikan Tongkol No 01, Telp (0333) 421593, 428592 Banyuwangi 68416

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36526/biosense.v8i4.5695

Abstract

Aglaonema pictum (Roxb.) Kunth merupakan tanaman hias populer di dunia karena memiliki variasi corak warna daun. Studi tentang keragaman genetik A. pictum masih jarang dilakukan, sehingga upaya ini perlu dilakukan. Salah satu penanda molekuler yang dapat digunakan untuk mengetahui keragaman genetik yaitu Simple Sequence Repeats (SSR). Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi kondisi optimum pada primer SSR untuk studi keragaman genetik A. pictum. Metode yang digunakan adalah pengumpulan sampel, ekstraksi DNA menggunakan cetyltrimethylammonium bromide (CTAB), amplifikasi DNA menggunakan primer SSR (OSR13, RM10, RM6470, OSR14, MRG2172_RT2172, MRG2153_RGP2153, RM249, RM100, MRG2881_RT2881, dan RM7240) dengan menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) pada kisaran suhu 52-54℃, 55-59℃, 47.2-50.9℃, dan 47.6-50.4℃, elektroforesis dan dokumentasi gel agarosa, serta analisis data. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dua dari sembilan primer SSR (RM249 dan RM7240) dapat diamplifikasi dengan baik pada suhu 49,3 ˚C dan 52,6 ˚C. Kedua suhu tersebut mengindikasikan suhu optimum yang dapat mengamplifikasi DNA sampel A. pictum. Sementara itu, primer OSR13, RM10, RM6470, OSR14, MRG2172_RT2172, MRG2153_RGP2153, RM100, MRG2881_RT2881 tidak berhasil teramplifikasi dengan baik dan spesifik pada rentang suhu annealing yang digunakan dalam penelitian ini.
Co-Authors A Husaini, Iin Pertiwi Achmad, Fariz Ade Ayu Oksari Afif Bintoro Afri Irawan Almaidah, Elsa Nadia Althoriq, Luthfi Amy Tenzer Angio, Melisnawati H Aprilianingsih, Risqi Arfa, Bella Saskia Arie Setyawati Arifin Surya Dwipa Irsyam Arifin Surya Dwipa Irsyam Arnia Sari Mukaromah Asih Perwita Dewi ASIH PERWITA DEWI ASIH PERWITA DEWI, ASIH PERWITA Asri Febriana, Asri Atria, Mega Baharuddin, Muh. Fikry Baidlowi, Muhammad Hisyam Baiq Farhatul Wahidah Balqis Balqis Budianti, Noviana Canita, Anggun Chika, Syifara Damayanti, Frisca Damayanti, Inggar Danang Wahyu Purnomo Dewi Wahyuni K. Baderan DIAN LATIFAH, DIAN Dian Rosleine, Dian Effendi, Surianto eko purnomo Endewip, Lidya N. Fitri Fatma Wardani Handayani, Windri Helmanto, Hendra Husaini, Iin P.A Husaini, Iin Pertiwi A Hutabarat, Prima Wahyu Kusuma Indresputra, Faozan Irsyam, Arifin Surya Dwipa Irvan Fadli Wanda Irwanto, Rina Ratnasih Kusnadi Maharani, Fira Shabrina Bintang MARTIANSYAH, Irfan Meilina, Tiara Dwi Melisnawati H Angio Mountara, Arieh Mujahidin Mujahidin Muliyah, Evi Mulyani, Melza Mustaqim, Wendy Achmad Nugrahaningsih Nugrahaningsih Peniwidiyanti Peniwidiyanti Peniwidiyanti, Peniwidiyanti Pratiwi, Widya Ayu Primananda, Enggal Putri, Dwinda Mariska RACHMADIYANTO, ARIEF NOOR Rahmaningtiyas, Lutfi Ria Windi Lestari Rina Ratnasih Irwanto Rinandio, Dipta Sumeru Ristiawan, Hani Rita Rizky Rahmawati Rizki Wulan Anjani Safarinanugraha, Dina Salamah, Hatipah Santoso, Trio Saripudin Saripudin Setiawan, Ashari Bagus Setyanti, Dwi Solihah, Fifi Mar’atun Suhatman, Agus Suhaya, Yoyo Sukirman Rahim Sulistyawati, Endah Syamsidah Rahmawati, Syamsidah Thobib Hasan Al Yamini Tianara, Alexander Turhadi Turhadi Vertiana, Erlin Via Widjaya, Aulia Hasan Wulandhari Yuhaeni, Eni Yuliyanto, Ponco Yusniati, Euis Zahro, Shofiyyatuz Zakaria Al Anshori zulkarnaen, rizmoon Zulkarnaen, Rizmoon Nurul