Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : Sainstek

MODELING STRUKTUR PROTEIN VAKSIN H5N1 HA BTB MENGGUNAKAN I-TASSER Amelia, Fitri
Sainstek VOL 07, NO 01, 2013
Publisher : Jurnal Sainstek

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (139.941 KB)

Abstract

Modeling protein Hemagglutinin virus Influenza A (H5N1 2/2005) telah dilakukan menggunakan server I-TASSER. Model yang didapatkan adalah 5 rancangan struktur tersier protein menggunakan template 2wr0 dan 2wr1. Kualitas struktur protein diukur berdasarkan geometri antar residu dengan residu lainnya dan geometry total struktur. Hasil analisis statistika Ramachandran didapatkan bahwa protein Model 2 merupakan model terbaik karena memiliki 86,2% residu yang berada pada most favored region, 11, 2% pada additional allowed region, 1,8% pada generously allowed region, dan 0,8% pada disallowed region.
PERANCANGAN VAKSIN PROTEIN CVLP POLI INDUKSI AVIAN INFLUENZA H5N1 SUBCLADE 2.1 Amelia, Fitri; UNP, Iryani
Sainstek Vol 6, No 1, 2011
Publisher : Sainstek

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (7.771 KB)

Abstract

Tingkat virulensi akibat infeksi virus influenza H5N1 sangat tinggi sehingga adanya vaksin sangat diperlukan. Telah dilakukan penelitian Research and Development (RnD) tentang perancangan vaksin protein cVLP Avian Influenza (AI) H5N1 Subclade 2.1. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan perancangan sekuen vaksin cVLP AI H5N1 secara in silico. Penelitian dilakukan secara in silico (per-modelan/komputasi). Sekuen yang digunakan pada penelitian ini adalah sekuen protein HA dan NA H5N1 subclade 2.1. Sekuen subclade 2.1 yang didapatkan adalah 9 Sekuen protein HA dan 9 Sekuen protein NA. Sekuen yang digunakan sebagai backbone sekuen 2/2005 sebagai. Sekuen epitope B Cell protein HA adalah KSSWSDHEASS dan CNTKCQTPMGA, serta sekuen epitope B Cell protein NA adalah GDNPRPNDGTGSCG dan SDTVSWSWPDGA. Sekuen epitope T cell protein HA yang dapat digunakan adalah EKIVLLLAIVSL dan epitope T cell protein NA adalah IRPCFWVEL. Dari hasil penelitian, didapatkan 6 rancangan sekuen protein vaksin cVLP, yaitu vaksin cVLP AI H5N1 NA TBB, NA BBT, NA BTB, HA TBB, HA BBT, HA BTB. Ke-enam vaksin tersebut memiliki folding akhir yang sama dengan protein HA dan NA AI H5N1 dan bersifat immunogenic karena persen (%) identity ke-enam sekuen vaksin yang dirancang besar dari 25%. Keyword: vaksin, cVLP, Avian Influenza, H5N1
Co-Authors Abdul Aziz Hunaifi Adzam, Muhammad Afreni Hamidah Aini, Syamsi Al-latifatuzzahra, Siti Safira Allya Roosallyn Assyoffa Alvionita, Elvira Amelia, Fazila Aprilia Susilo, Resti Aprilianti, Cindy Ardian Ayu Fitriana, Ardian Ayu Ardita, Negi Asrizal, A Bahrun, Muhammad Farhan Bakhiet, Bakri Muhammad Cyntia Citra Maharani Della Rosalynna Stiadi Desy Kurniawati Devi, Diana Dewi Chamidah Edi Nasra Era Nopera Rauzi Erna Irawan, Erna Eva Sulastri Sagita Fahmi Tsani Irsyadi, Fahmi Tsani Friyatmi Friyatmi Heditama, Muhammad Raffi Herlan Sutisna, Herlan Hidayat, Basultan Honni Honni, Honni Ifan Rivaldo Indra Fajar Alamsyah Irma, Tri Wahyuni Iryani Iryani Iryani UNP Iswendi iswendi Khoiriawati, Novi Khusnul Fikriyah Kiki Amelia, Kiki Latunreng, Wahyuddin Lubaba, Abu Lubis, Yulia Haliza Maida, Margarita Claudya Mairizwan, M Marlini, Rahmida Meri Maryati Mustakim Sagita Muswita Muswita Nahrin, Sari Nuralita Nanny Harmani Nasution, Ismail Effendi Nizar, Umar Kalmar Noliea Nugroho, Rama Puji Okatiranti O Parbuntari, Hesty Permatasari, Dian Anggraheni Pernadi, Niza Lian Putra, Ananda Putri, Salsa Yosrika Qomari, Nur Qurata’aini, Faizah Rahmadani, Welni Rahmasari, Alfina Ika Rahmat Ilham Perdana Rahmayani, Sherly Ramadhani, Andini Novita Rani, Rada Ranny Rachmawati Rd. Dian Herdiana Utama, Rd. Dian Herdiana Rifai Lubis, Rahmat Rinata, Taufik Maulana Rizki, Suci Yulia Rusnel, Azizah Risani Sari, Lisa Permata Sheanny Ocmi Sakti Shofil Fikri Sidiq, Aqil Marsya Soemadi, Rr Anggraini Suryani, Fajar Suryani, Okta Syafari, Nofiana Tiana Pustaka, Tiana Utami, Suci Reski Wulandari, elysa Yerimadesi Yerimadesi Yohandri, Y Yuliana Seputraningrum, Yuliana Yusmaita, Eka Zulfarazi Zunaidah, Farida Nurlaila