Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : AL KAUNIYAH

Karakteristik Molekuler Kelelawar (Microchiroptera), berdasarkan DNA Mitokondria (Gen COI) di Gua Sukabumi dan Sentul Jawa Barat Ismayati Afifah; Dedy Duryadi Solihin; Arzyana Sunkar
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 14, No 1 (2021): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v14i1.14147

Abstract

AbstrakCytochrome Oxidase I (COI) merupakan salah satu gen mitokondria untuk membantu konstruksi dari pohon filogeni yang dapat bertindak sebagai gen marker. Gen COI memiliki keakuratan dalam mengidentifikasi spesies dan umumnya digunakan sebagai “DNA Barcoding”. Informasi mengenai karakteristik genetik berdasarkan DNA mitokondria pada kelelawar di Sukabumi dan Sentul belum banyak dilaporkan. Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui keragaman genetik kelelawar berdasarkan DNA mitokondria dengan penanda Cytochrome Oxidase I (COI) sebagai DNA barcoding. Isolasi DNA total dilakukan menggunakan Kit Dneasy® Blood and Tissue Kit cat no 69504 (50) berdasarkan prosedur Spin-Column Protocol dengan modifikasi. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa gen COI telah berhasil mengidentifikasi karakteristik spesies. Dua haplotipe didapatkan dari masing-masing populasi. Berdasarkan barcode DNA menunjukkan populasi Sukabumi merupakan spesies Chaerephon plicatus dengan nilai identitas genetik sebesar 97,08%, sedangkan populasi Sentul menunjukkan perbedaan secara genetik dengan spesies Hipposideros larvatus dengan nilai identitas genetik sebesar 94,85%. Identifikasi secara genetik dengan menggunakan gen COI menunjukkan bahwa kelelawar yang berasal Sukabumi adalah spesies Chaerephon plicatus dengan jarak genetik sebesar 3,1%. Kelelawar yang berasal dari Sentul memiliki kedekatan dengan spesies Hipposideros larvatus namun memiliki jarak genetik sebesar 5,2%. AbstractCytochrome Oxidase I (COI) is one of the mitochondrial genes to help the construction of phylogeny trees that can act as marker genes. The COI gene has accuracy in identifying species and is commonly used as "DNA Barcoding". Information about genetic characteristics based on mitochondrial DNA in bats in Sukabumi and Sentul has not been widely reported. The purpose of this study was to determine the genetic diversity of bats based on Mitochondrial DNA with Cytochrome Oxidase I (COI) markers as DNA barcoding. Total DNA isolation was carried out using the Dneasy® Blood and Tissue Kit paint no. 69504 (50) based on the Spin-Column Protocol procedure with modifications. The results of this study indicate that the COI gene has successfully identified species characteristics. Two haplotypes were obtained from each population. Based on DNA barcodes, the population of Sukabumi is a species of Chaerephon plicatus with a genetic identity value of 97.08%, while the Sentul population shows genetic differences with the Hipposideros larvatus species with a genetic identity value of 94.85%. Genetic identification using the COI gene shows that the bats originating from Sukabumi is a spesies Chaerephon plicatus with a genetic distance of 3.1%. The bats originating from Sentul are closely related to the species Hipposideros larvatus but have a genetic distance of 5.2%.
Co-Authors Abdul Rahman Singkam Abdul Rahman Singkam Achmad - Taher ACHMAD FARAJALLAH Achmad Machmud Achmad Machmud Thohari Achmad Taher Achmad Taher Achmad, Taher Agus Nuryanto Agus Wahyana Anggara Agus Wahyana Anggara Agus Wahyana Anggara, Agus Wahyana Alam Putra Persada Ani Mardiastuti Ani Suryani Antonius Suwanto Any Aryani Ardi Kapahang Arief Boediono Arlyza1, Irma Shita Arzyana Sunkar Bahiyah Bahiyah Bambang Purwantara Cece Sumantri CECILIA ANNA SEUMAHU CECILIA ANNA SEUMAHU CHRISTIAN HANSJOACHIM SCHULZE D.D. Sastraatmadja DAMAYANTI BUCHORI Daniel Happy Putra Dedi . Soedharma DEDI SOEDHARMA Dedi Soedharma DEWI APRI ASTUTI Dewi Elfidasari Dewi Malia Prawiradilaga Dewi Malia Prawiradilaga, Dewi Malia Diah Iskandriati DIAH ISKANDRIATI DIETMAR BLOHM Dodi Nandika Dondin Sajuthi Dwi ASTUTI Dwi Astuti Dwi Sendi Priyono DYAH PERWITASARI -FARAJALLAH Epa Paujiah, Epa Evy Ayu Arida EVY AYU ARIDA Fahma Wijayanti Fahri Fahrudin, Fahri Faisal Mustafa Findra, Muhammad Nur FUNGKEY HOETAMA Gita Kusuma Rahayu Hadi Allikodra Hadi S Alikodra HAJRIAL ASWIDINNOOR Handayani , Handayani Handayani Handayani Hari Prayogo Harini Nurcahya Mariandayani Heddy Julistiono HEDDY JULISTIONO Hermanu Triwidodo I Gusti Agung Arta Putra I WAYAN SUANA Ibnu Maryanto Iman Rusmana Indah Fajarwati, Indah Irma Shita Arlyza Irzaman, Irzaman Isdradjad Setyobudiandi Ismayati Afifah Jakaria Jakaria Jamhari Jamhari Jarulis Jarulis Jarulis Jarulis Jarulis Jarulis Jito Jito Jito Sugardjito Jusmaldi Jusmaldi Kadarwan Soewardi Khustina, Yenny Chusna Khustina, Yenny Chusna Kunio Watanabe Lia Aseptin Murdini Lilik Budi Lilik Budi Prasetyo LILIK BUDIPRASETYO Lucia Johana Lambey M F Rahardjo M. F. Rahardjo M. Zairin Junior Mahmud, Rois MARIA BINTANG MF Rahardjo Mustafa Sabri Nastiti Kusumorini NEVIATY PUTRI ZAMANI Niken Subekti Niken TM Pratiwi Nurlisa Alias Butet Pamungkas, Joko Prasetyo Prasetyo Priyono, Siti N. Puji Rianti Retno Damayanti Soejoedono RICHARD F GRANT RIDWAN AFFANDI Rini Widayanti Robba Fahrisy Darus Roedhy Poerwanto Roedy Poerwanto Roedy Poerwanto Roni Koneri Ronny Rachman Noor Roza Elvyra Rudhy Gustiano Rudhy Gustiano Rudhy Gustiano Rudhy Gustiano Rudi Afnan Rudi Tarumingkeng Rudy C Tarumingkeng Safrida Safrida Safrida Safrida Saroyo Saroyo SATA YOSHIDA SRIE RAHAYU SATRIYAS ILYAS SELA SEPTIMA MARIYA SILMI MARIYA Siti N. Priyono SJAFRIDA MANUWOTO Soaloon Sinaga Soaloon Sinaga Sobir Sobir Sobir Sobir Sobir Sobir Solihin Solihin Sri Catur Setyawatiningsih Sri Catur Setyawatiningsih sri murtini . SRI NINGSIH Sri Sulandari Sri Supraptini Mansjoer Subyakto Subyakto Sugardjito Sugardjito Suharsono Suharsono SULISTIYANI SULISTIYANI SULISTIYANI SULISTIYANI Sulistiyani Sulistiyani Sulistiyani, Sulistiyani Surjono Surjokusumo Syaiful Anwar Syamsul Bachry Taher, Achmad Tedjo Sukmono Thohari Thohari Tike Sartika Tri Haryoko Tri Haryoko, Tri Tutik Wresdiyati UUS SAEPULOH UUS SAEPULOH Wasmen Manalu Yuli Wahyu Tri Mulyani YULIN LESTARI Yuni Cahya Endrawati Yus Rusila Noor Yus Rusila Noor Yusnarti Yus