Claim Missing Document
Check
Articles

SUBKLONING DAN EKSPRESI Gen fim-C S. typhimurium Ulfah Choiriyah; Muktiningsih Nurjayadi; Fera Kurnia Dewi
Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Vol 3 No 2 (2013): JRSKT - Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan, Volume 3 Nomor 2 Desember 2013
Publisher : Program Studi Kimia Universitas Negeri Jakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (3451.444 KB) | DOI: 10.21009/JRSKT.032.01

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh rekombinan pET-30a-fim-C S. typhimurium hasil subkloning dan protein rekombinan Fim-C S. typhimurium hasil ekspresi serta mengetahui karakter subklon rekombinan dan protein rekombinan yang dihasilkan. Metode yang digunakan adalah eksplorasi. Plasmid rekombinan pGEM-T-easy-fim-C S. typhimurium dari penelitian sebelumnya dipotong dengan dua enzim restriksi yaitu BamHI dan HindIII. Gen fim-C S. typhimurium tersebut diligasi pada vektor ekspresi pET-30a dan ditransformasi dengan sel inang E. coli TOP- 10F’ untuk memperoleh plasmid pET-30a-fim-C S. typhimurium. Hasil rekombinan dikarakterisasi dengan metode size screening, PCR koloni, analisis enzim restriksi dan sekuensing untuk mengetahui keberhasilan transformasi yang dilakukan. Hasil karakterisasi menunjukkan pET-30a-fim-C S. typhimurium mengandung sisipan gen fim-C S. typhimurium berukuran 0,7 kb homolog 100% dengan S. typhimurium str. Lt2 pada GeneBank. Plasmid rekombinan pET-30a-fim-C S. typhimurium ditransformasi dengan sel inang E. coli ArcticExpress (DE3) yang memiliki sistem transkripsi dan translasi sehingga diperoleh protein rekombinan. Overekspresi menghasilkan protein yang tidak larut dalam sitoplasma atau membentuk inclusion bodies. Protein rekombinan Fim-C S. typhimurium dikarakterisasi dengan SDS-PAGE sehingga diperoleh pita overekspresi protein pada ukuran diantara 25 kDa dan 35 kDa. Hasil ini diperkuat dengan analisis menggunakan program DNAStar menunjukkan ukuran protein rekombinan Fim-C S. typhimurium sebesar 31 kDa. Dari penelitian ini disimpulkan bahwa subkloning dan ekspresi gen fim-C S. typhimurium telah berhasil dilakukan yang akan digunakan pada penelitian selanjutnya. Kata kunci: Salmonella typhimurium, gen fim-C S. typhimurium 0,7 kb, subkloning gen fim-C S. typhimurium, ekspresi gen fim-C S. typhimurium, protein rekombinan Fim-C S. typhimurium 31 kDa This research aims to obtain pET-30a-fim-C S. typhimurium recombinant from subcloning results and Fim-C S. typhimurium recombinant protein from expression results and to know characters recombinant subclone and recombinant protein produced. This research is exploration.Steps of this research are pGEM-T-easy-fim-C S. typhimurium recombinant plasmid from previous research is cut with two restriction enzymes, BamHI dan HindIII. fim-C S. typhimurium gene is ligated to the expression vector pET-30a and transformed with E. coli TOP-10F’ as host cell to obtain pET-30afim-C S. typhimurium plasmid. The recombinant results is characterized by size screening, PCR colony, restriction enzymes analysis and sequencing method to know the successful transformation performed. Characterization shows that pET-30a-fim-C S. typhimurium contain fim-C 0,7 kb of S. typhimurium gene insert have 100% homology with S. typhimurium str. Lt2 in GeneBank. pET-30a-fim-C S. typhimurium recombinant plasmid is transformed to E. coli ArcticExpress (DE3) as host cell which has transcription and translation system so that obtained recombinant protein. Overexpression produces insoluble protein in the cytoplasm or forming inclusion bodies. Fim-C S. typhimurium recombinant protein is characterized by SDS-PAGE so that obtained overexpression protein band size between 25 kDa and 35 kDa. These results were confirmed by analysis using DNASTAR’s program that shows the size of Fim-C S. typhimurium recombinant protein is 31 kDa. From this research, we can concluded that subcloning and expression fim-C S. typhimurium gene has been successfully and this protein can be used in further research. Keyword: Salmonella typhimurium, fim-C 0,7 kb of S. typhimurium gene, subcloning fim-C S. typhimurium gene, expression fim-C S. typhimurium gene, Fim-C 31 kDa of S. typhimurium recombinant protein
KLONING GEN FIM-C SALMONELLA TYPHIMURIUM DENGAN VEKTOR pGEM-T easy UNTUK PENGEMBANGAN VAKSIN REKOMBINAN PENYAKIT TYPHUS PADA MANUSIA Muktiningsih Nurjayadi; Giri Alviyanto; Fera Kurnia Dewi; Irma Ratna Kartika; Fernita Puspasari; Dessy Natalia
Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Vol 3 No 2 (2013): JRSKT - Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan, Volume 3 Nomor 2 Desember 2013
Publisher : Program Studi Kimia Universitas Negeri Jakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (2100.129 KB) | DOI: 10.21009/JRSKT.032.04

Abstract

Bakteri Salmonella typhimurium merupakan penyebab penyakit typhus pada hewan mencit. Bakteri ini sering digunakan sebagai model untuk mempelajari penyakit typhus pada manusia. Penelitian ini bertujuan mendapatkan klon rekombinan gen fim-C Salmonella typhimurium dengan ukuran 0,7 kilobasa (pGEM-TStpm-fim-C) dan mengetahui karakteristik gen fim-C Salmonella typhimurium hasil kloning tersebut. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah metode eksploratif. Tahap yang dilakukan meliputi isolasi DNA genom S. typhimurium, amplifikasi gen fim-C S. typhmurium dengan metode PCR, karakterisasi gen fim-C S. typhimurium hasil amplifikasi, purifikasi gen fim-C S. typhimurium, kloning gen fim-C S. typhimurium dengan vektor pGEM-T easy, dan karakterisasi hasil kloning. Amplifikasi gen fim-C dengan metode PCR menggunakan primer FimC-Stpm-F dan FimC-Stpm-R menghasilkan pita DNA berukuran 0,7 kilobasa sesuai ukuran gen fim-C S. typhimurium. Kesesuaian tersebut menunjukkan bahwa desain dan sintesis primer serta amplifikasi berhasil dilakukan. Hasil kloning gen fim-C S. typhimurium 0,7 kb dengan vektor kloning pGEM-T easy memberikan koloni putih dan biru dengan ukuran yang sesuai stándar. Analisis restriksi plasmid rekombinan pGEM-T-Stpmfim-C dengan enzim BamHI dan HindIII menghasilkan dua pita berukuran 3 kb dan 0,7 kb sesuai ukuran DNA vektor pGEM-T easy dan gen fim-C S. typhimurium sebagi insert. Sekuensing klon rekombinan yang dihasilkan membuktikan bahwa urutan DNA S. typhimurium yang diperoleh memiliki homologi sebesar 99% dengan S.typhimurium LT2 pada GeneBank. Berdasarkan data-data tersebut disimpulkan bahwa pada penelitian ini telah berhasil dilakukan kloning gen fim-C S. typhimurium berukuran 0,7 kb pada vektor pGEM-T easy. Kata kunci : Salmonella typhimurium, kloning gen fim-C S. typhimurium, vaksin rekombinan, penyakit typhus. Salmonella typhimurium is bacteria that causes typhus disease in mouse. Usually, Salmonella typhimurium is used as a model for typhus disease study in human. The research is aimed to obtain recombinant clone of Salmonella typhimurium fim-C gene 0.7kilobase(kb) and knowing characteristics of Salmonella typhimurium gene the cloning result. Method of this research is exploration. Step of this research are isolate DNA genome of S. typhimurium bacteria, amplifícate fim-C gene by PCR, characterize S.typhimurium fim-C the amplification product, purification of S.typhimurium fim-C gene, cloning of S.typhimurium fim-C gene with pGEM-T easy vector, characterize the cloning product. Amplification of fim-C gen by PCR used FimC-Stpm- primer and FimC-Stpm-R primer produce DNA band 0.7kilbase appropriate with size of S.typhimurium fim-C gene. This result showing design, primer synthesis, and amplification has been succesfully. The cloning result from S.typhimurium fim-C gene 0.7kb with cloning vector pGEM-T easy give white colony and blue colony. The restriction analysis of recombinant plasmid pGEM-T-Stpm-fim-C with BamHI and HindIII enzyme produces two band 3 kb and 0.7 kb which appropriate size of DNA pGEM-T-easy vector and S.typhimurium fim-C gene as insert. Sequencing of recombinant clone proving DNA S.typhimurium have 99% homolog wh S.typhimurium LT2 in GeneBank. Conclusión this research is cloning of S.typhimurium fim-C gene 0.7kb with pGEM-T easy has been succesfully. Keywords: Salmonella typhimurium, cloning of Salmonella typhimurium fim-C gene, recombinant vaccine, typhus disease.
PENGARUH EKSTRAK METANOL KULIT BUAH JENGKOL TERHADAP PENURUNAN KADAR GLUKOSA DARAH MENCIT Irma Ratna Kartika; Muktiningsih Muktiningsih; Fera Kurniadewi
Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Vol 1 No 1 (2011): JRSKT - Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan, Volume 1 Nomor 1 Juni 2011
Publisher : Program Studi Kimia Universitas Negeri Jakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (280.159 KB) | DOI: 10.21009/JRSKT.011.03

Abstract

The study aim is to investigate the phytochemical profile and the effect of methanol extract of Jengkol [Pithecellobium jiringa (Jack) Prain ex King] (Leguminoceae) on reduction of glucose blood sugar level of mice (Mus musculus L.) strain DDY. A 870 g of dried Jengkol from Cipayung was macerated with methanol in order to get dried methanol extract (12,75 g). Meanwhile, phytochemical screening of the extract gave the information that the extract contained phenolic, flavanoid, steroid and saponine compounds. A TLC chromatogram indicated that methanol extract contained five phenolic compounds, seven flavonoid compounds and six mixtures of steroid and saponine compounds. The results showed that the extract of 450 mg/kg BW was able to lower glucose blood level as much as 66,67% more effective than other extract dosages (300 mg/kg BW, 600 mg/kg BW and 750 mg/kg BW) and the control drugs (Amaryl® 0,02 mg/kg BW, Glucobay® 1 mg/kg BW and Glucophage® 10 mg/kg BW). The maximum decrease of glucose level had been reach at day 14 of observation after administration of extracts or drugs. Hyperglycemic mice by glucose induced can be identified as animal model of type 2 diabetes due to unhealthy and unbalanced eating habit. Hence based on experiment outcome above, it can be concluded that extract dosage of 450 mg/kg BW has function as oral anti diabetic drug of type 2 diabetes. Keywords: hyperglycemia, Amaryl, Glucobay, Glucophage, diabetes, methanol extract Abstrak Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil fitokimia dan pengaruh dosis ekstrak metanol kulit buah Jengkol [Pithecellobium jiringa (Jack) Prain ex King] (Leguminoceae) terhadap penurunan kadar glukosa darah mencit (Mus Musculus L.) strain DDY dengan waktu pengamatan yang berbeda.Sebanyak 870 g jengkol dari Cipayung yang sudah dikeringkan, dimaserasi dengan pelarut metanol sehingga diperoleh ekstrak metanol kering (12,75 g). Sementara, hasil uji fitokimia memberikan informasi bahwa kulit buah jengkol mengandung senyawa kimia golongan fenolik, flavonoid, steroid, dan saponin. Hasil kromatogram dari KLT menunjukkan bahwa ekstrak metanol kulit buah jengkol mengandung 5 noda yang teridentifikasi sebagai senyawa fenolik, 7 noda yang teridentifikasi sebagai senyawa flavonoid, dan 6 noda yang teridentifikasi sebagai senyawa steroid dan saponin. Hasil penelitian menyimpulkan bahwa ekstrak jengkol dosis 450 mg/kg BB mampu menurunkan kadar glukosa darah sebesar 66,67% lebih efektif dibanding ekstrak dosis lain (300 mg/kg BB, 600 mg/kg BB dan 750 mg/kg BB) dan kontrol obat (Amaryl® 0,02 mg/kg BB, Glucobay® 1 mg/kg BB dan Glucophage® 10 mg/kg BB). Penurunan kadar glukosa secara maksimum terjadi pada waktu pengamatan hari ke-14 setelah pemberian ekstrak atau obat. Mencit yang dibuat hiperglikemia dengan cara diberi glukosa berlebih setiap hari, dapat dijadikan sebagai model hewan yang mengalami diabetes tipe 2 karena pola makanan yang tidak sehat dan seimbang. Oleh karena itu berdasarkan hasil percobaan di atas dapat diambil kesimpulan bahwa dosis 450 mg/kg BB dapat berfungsi sebagai obat antidiabetes oral tipe 2. Kata Kunci: hiperglikemia, Amaryl®, Glucobay®, Glucophage®, diabetes, ekstrak metanol
DETEKSI BAKTERI PENYEBAB PENYAKIT TYPHUS PADA MANUSIA DENGAN POLYMERASE CHAIN REACTION Muktiningsih Nurjayadi; Fera Kurnia Dewi; Dahlia Dahlia; S, Restu.N S; Fitri W
Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Vol 1 No 1 (2011): JRSKT - Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan, Volume 1 Nomor 1 Juni 2011
Publisher : Program Studi Kimia Universitas Negeri Jakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (359.944 KB) | DOI: 10.21009/JRSKT.011.08

Abstract

Salmonella typhi is bacteria that cause typhoid disease in humans. In Indonesia, the morbidity number of typhoid disease tends to be increase. Thus, it has been requiring the alternative for handling or preventing that disease. Recently, the detection method commonly uses for S. typhi detection is Serological test. The weakness of this method is often producing less accurate and not specific detection. The previous research was successfully discovered S. typhi gene that codes protein which is contributed at adherents or colonization those bacteria in epithelial human cell. That result was base to develop detection on S. typhi method by Polymerase chain reaction (PCR). The aim of this research is developing a specific and accurate detection method for S. typhi bacteria by PCR. The research result is performed successfully to amplify the fimbrial-C S. typhi gene using pairs of primer FW-INT 2- REV-1A NEW which was designed and synthesized in previous step. That success showed by the finding of the DNA fragment of 0.2 kilobase (kb) proffers to size of DNA fragment which is hopefully in using S. typhi genome as a template. Specificity and sensitivity test for those primers are still conducting to reproducibility results. Base on the results can be concluded that the research have successfully conducted in developing S. typhi detection method using pairs of S. typhi fimbrial-C primer. Hopefully, the studied of developing detection methods was conducted better compare with former detection methods.Keywords: S. typhi detection method, fim-C S. typhi gene, PCRAbstrakSalmonella typhi merupakan bakteri penyebab penyakit tifus pada manusia. Di Indonesia, angka morbiditas penderita penyakit typhus cenderung meningkat, sehingga diperlukan suatu alternatif untuk penanganan atau pencegahan penyakit tersebut. Sampai saat ini metode deteksi S. typhi yang banyak digunakan adalah uji serologi. Kelemahan metode ini adalah sering menghasilkan deteksi yang kurang akurat dan tidak spesifik. Pada penelitian yang dilakukan sebelumnya, telah berhasil ditemukan gen fimbrial-C S. typhi pengkode protein yang berperan dalam penempelan S. typhi pada usus manusia, hasil ini dijadikan landasan untuk pengembangan metode deteksi menggunakan teknik PCR. Tujuan penelitian ini mengembangkan metode deteksi yang akurat dan spesifik untuk bakteri penyebab penyakit typhus pada manusia. Hasil penelitian menunjukkan bahwa telah berhasil dilakukan amplifikasi gen fimbrial-C S. typhi menggunakan pasangan primer hasil perancangan yaitu FW-INT 2- REV-1A NEW. Keberhasilan tersebut ditunjukkan dengan diperolehnya pita DNA berukuran 0.2 kilo basa (kb) sesuai dengan ukuran pita DNA yang diharapkan dengan menggunakan template DNA genom bakteri S. typhi. Uji sensitivitas dan spesifisitas terhadap primer hasil rancangan sedang di kaji lebih lanjut untuk memperoleh reprodusibiltas hasil pengujian. Berdasarkan hasil yang diperoleh dapat disimpulkan bahwa telah berhasil dilakukan pengembangan metode deteksi S. typhi menggunakan pasangan primer fimbrial-C S. typhi. Pengkajian pengembangan metode deteksi yang dihasilkan ini diharapkan dapat lebih baik dibanding beberapa metode deteksi yang sudah ada.Kata Kunci: Metode Deteksi Bakteri typhus, fim-C S. typhi, PCR
Pengaruh Adjuvant Alumina dan Protein Rekombinan Fim-C Inclusion Bodies Salmonella Typhimurium terhadap Respon Imun Mencit Balb/C Dian Larasati; Muktiningsih Nurjayadi; Kurnia Agustini
Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan Vol 7 No 1 (2017): JRSKT - Jurnal Riset Sains dan Kimia Terapan, Volume 7 Nomor 1 Juli 2017
Publisher : Program Studi Kimia Universitas Negeri Jakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (844.907 KB) | DOI: 10.21009/JRSKT.071.01

Abstract

Typhoid fever is one of the most public health problem in the world, with approximately 17 million cases of typhoid fever worldwide and 600,000 death cases each year. One method to prevent typhoid fever is vaccination. Nowadays, frequently, vaccine for typhoid fever is Ty 21a and vi polysaccharide vaccines. In other hands, it has side effect of nausea, fever, and headache. So it is still necessary to search other typhoid vaccine with minimum side effects. The purpose of this study was to obtain immunogenicity test information of recombinant protein Fim-C S. typhimurium and adjuvant alumina in Balb / C mice. The used doses were 20 μg, 40 μg, and 60 μg. Plasma was obtain then analyzed by ELISA, western immunobloting, and dot blot. Immune response of Balb / C mice from KS 1 showed significant differences antibody when dose injection 40μg / 20g BB and KS2 showed significant differences antibody when dose injection 20μg / 20g BB compared with KN. Adjuvant alumina was added to the Fim-C protein inclusion bodies Salmonella typhimurium provides a higher immune response compared to the Fim-C inclusions bodies Salmonella typhimurium protein without the addition of adjuvant alumina. The results of analysis by using western blot and dot blot showed the formation of brown color indicating the interaction between protein Fim-C inclusion bodies Salmonella typhimurium and anti-Fim-C S. typhimurium antibodies. The results of adjuvant alumina and protein Fim-C inclusion bodies of Salmonella typhimurium in Balb / C mice concluded that adjuvant alumina and Fim-C protein inclusion bodies Salmonella typhimurium provide significant increased immune response in Balb / C mice. Keyword: Salmonella typhimurium, typhoid vaccine, recombinant protein Fim-inclusion Bodies S. typhimurium, Balb/C mice
HUBUNGAN KOMITMEN DAN TANGGUNG JAWAB LINGKUNGAN TERHADAP KINERJA PENGELOLAAN HUTAN PADA PROGRAM REBOISASI Abdul Hakam Barok; Muktiningsih Muktiningsih; Diana Vivanti
Jurnal Green Growth dan Manajemen Lingkungan Vol 7 No 2 (2018): Jurnal Green Growth dan Manajemen Lingkungan
Publisher : Program Studi Manajemen Lingkungan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (207.964 KB) | DOI: 10.21009/jgg.072.01

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui hubungan komitmen dan tanggung jawab lingkungan terhadap kinerja pengelolaan hutan pada program reboisasi. Lokasi penelitian dilaksanakan di Resot Pemangku Hutan (RPH) Solokuro – Lamongan, dengan obyek penelitian adalah masyarakat desa Solokuro peserta program reboisasi. Pengumpulan data dilakukan dengan membagikan kuesioner kepada 75 responden sampel. Data yang terkumpul dianalisis dengan menggunakan statistik parametrik yaitu statistik deskriptif dan statistik inferensial. Pengujian hipotesis dilakukan melalui uji korelasional. Uji analisis dalam penelitian ini meliputi: (1) uji multiple (2) uji koefisien korelasi, dan (3) uji koefisien determinasi. Hasil penelitian ini menunjukkan, (1) komitmen yang tinggi berhubungan kinerja pengelolaan hutan yang tinggi, (2) tanggung jawab lingkungan yang tinggi berhubungan dengan kinerja pengelolaan hutan yang tinggi, (3) komitmen dan tanggung jawab lingkungan yang tinggi membuat kinerja pengelolaan hutan tinggi. Berdasarkan hasil penelitian tersebut bahwa komitmen dan tanggung jawab lingkungan baik sendiri-sendiri maupun bersamaan memiliki hubungan positif terhadap peningkatan kinerja pengelolaan hutan, sehingga model ini dapat dilanjutkan dan juga bisa diterapkan program reboisasi di lokasi yang berbeda.
Perakitan Gas Chromatography Sederhana Untuk Pembelajaran Instrumen Pemisahan Senyawa Kimia Tanto Budi Susilo; Rahmat Yunus Yunus; Azidi Irwan Irwan; Oni Soesanto Soesanto; Arief Rahmad Maulana Akbar; Rizki Fitria Fitria; Muktiningsih Muktiningsih Muktiningsih
Jurnal Pengabdian ILUNG (Inovasi Lahan Basah Unggul) Vol 2, No 4 (2023)
Publisher : Universitas Lambung Mangkurat

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20527/ilung.v2i4.7682

Abstract

AbstrakGas Chromatography (GC) merupakan suatu metode standar dalam kurikulum pendidikan sains kimia. Metode ini berupa alat yang mampu memisahkan dan menganalisis senyawa multi komponen berdasarkan data fisiknya. Biasanya ukuran alat adalah besar dengan harga yang mahal. Namun, alat ini dapat dirangkai secara sederhana dengan menggunakan bahan-bahan disekitar (https://youtu.be/w9OMFAAPV0I). Metodologi perakitan mengunakan kompresor, pipa kapiler, elemen panas dan detektor alkohol. Bahan uji berupa fermentasi buah-buahan dan dipraktekkan kepada mahasiswa semester 5 Program Studi Kimia, Universitas Lambung Mangkurat. Metode Structural Equation Modelling (SEM) digunakan untuk mengetahui persepsi mahasiswa terhadap alat GC. Sebelumnya mahasiswa menganggap alat adalah GC rumit (74.4%), mahal (51.2%), tidak bisa dirakit sendiri (39.5%), berukuran besar (51.2%). Namun, setelah terlibat dalam kegiatan perakitan alat GC, persepsi mahasiswa terhadap alat tersebut berubah yaitu rumit (23.3%), mahal (11.6%), tidak bisa dirakit sendiri (0%), berukuran besar (16.3%), simpel (44.2%), biaya terjangkau (37.2%), bisa dirakit sendiri (65.1%) serta berukuran kecil (37.2%). Sehingga alat GC sederhana ini dapat menjadi alternatif pilihan ditengah mahalnya alat GC pabrikan. Kata kunci: gas chromatography; perakitan; pemisaha
Rapid Detection of Foodborne Pathogen Bacteria Vibrio parahaemolyticus in Seafood Using Gene ToxR with Real-Time Polymerase Chain Reaction Method Ismaya Krisdawati; Muktiningsih Nurjayadi; Jefferson Lynford Declan; Gladys Indira Putri; Dandy Akbar Juliansyah; Maharani Azka Azzahra; Irvan Maulana; Irma Ratna Kartika; Vira Saamia; Dwi Ana Oktaviani; I Made Wiranatha; Hesham Ali Al-Enshashy
Microbiology Indonesia Vol. 17 No. 1 (2023): March
Publisher : Indonesian Society for microbiology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (1613.88 KB)

Abstract

Cases of food poisoning often occur due to food contamination caused by pathogenic bacteria. One of the pathogenic bacteria is Vibrio parahaemolyticus which is found in seafood. Thus, a fast, accurate and specific detection method is needed. The purpose of this study was to quickly detect Vibrio parahaemolyticus bacteria in seafood samples targeting the ToxR gene using Real Time PCR. In a previous study, gradient PCR was used to optimize ideal annealing temperature ranges from 53-62°C and revealed that 58°C produced the best outcomes for the ToxR primer with a size of 171 base pairs. Real-Time PCR was utilized to amplify, specify, and test for sensitivity under the ideal conditions from the PCR Gradient. The confirmation results show that the primer pairs could amplify ToxR of Vibrio parahaemolyticus with the amount of concentration as much as 50 ng/µL with Ct 10,69 and 10,32 and melting curve at temperature 82,18°C and 82,23°C. This primer pair can also distinguish non-target bacteria with different Ct and melting curve temperature. The sensitivity assay for this primer can amplify DNA templates at concentration 0,0032 ng/µL. Shrimp samples that are contaminated artificially can still be detected at Ct 13,02 and Ct 13,09. Based on these results, it can be concluded that Real Time PCR with ToxR primer can be applied to develop a detection kit for Vibrio parahaemolyticus in seafood.
Rapid Detection of Foodborne Pathogen Bacteria Vibrio parahaemolyticus in Seafood using Gene ToxR with Real-Time Polymerase Chain Reaction Method Ismaya Krisdawati; Muktiningsih Nurjayadi; Jefferson Lynford Decan
Microbiology Indonesia Vol. 17 No. 1 (2023): March
Publisher : Indonesian Society for microbiology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.5454/mi.17.1.15-23

Abstract

Cases of food poisoning often occur due to food contamination caused by pathogenic bacteria. One of the pathogenic bacteria is Vibrio parahaemolyticus which is found in seafood. Thus, a fast, accurate and specific detection method is needed. The purpose of this study was to quickly detect Vibrio parahaemolyticus bacteria in seafood samples targeting the ToxR gene using Real Time PCR. In a previous study, gradient PCR was used to optimize ideal annealing temperature ranges from 53-62°C and revealed that 58°C produced the best outcomes for the ToxR primer with a size of 171 base pairs. Real-Time PCR was utilized to amplify, specify, and test for sensitivity under the ideal conditions from the PCR Gradient. The confirmation results show that the primer pairs could amplify ToxR of Vibrio parahaemolyticus with the amount of concentration as much as 50 ng ?L-1 with Ct 10.69 and 10.32 and melting curve at temperature 82.18°C and 82.23°C. This primer pair can also distinguish non- target bacteria with different Ct and melting curve temperature. The sensitivity assay for this primer can amplify DNA templates at concentration 0.0032 ng ?L-1. Shrimp samples that are contaminated artificially can still be detected at Ct 13.02 and Ct 13.09. Based on these results, it can be concluded that Real Time PCR with ToxR primer can be applied to develop a detection kit for Vibrio parahaemolyticus in seafood.
PERSPEKTIF GURU SEKOLAH MENENGAH ATAS TERHADAP PROJEK PENGUATAN PROFIL PELAJAR PANCASILA PADA KURIKULUM MERDEKA Masturdin Masturdin; Ira Nur Amalia; Sindy Kania Sulastri; Muktiningsih Nurjayadi
Jurnal Cahaya Mandalika ISSN 2721-4796 (online) Vol. 3 No. 2: Jurnal Cahaya Mandalika
Publisher : Institut Penelitian Dan Pengambangan Mandalika Indonesia (IP2MI)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Pergantian kurikulum di Indonesia adalah proses yang terus berkembang seiring waktu. Kurikulum menjadi dinamis untuk disesuaikan dengan perkembangan dan tuntutan kehidupan yang terus berubah. Projek penguatan profil pelajar pancasila merupakan salah satu bagian dari struktur kurikulum merdeka sehingga guru harus memiliki perspektif yang baik terhadap pemahaman kurikulum merdeka. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui perspektif guru sekolah mengah atas terhadap projek penguatan profil pelajar pancasila. Metode penelitian yang digunakan yaitu metode kualitatif, melalui metode kualitatif dapat digambarkan secara mendalam mengenai perspektif guru terahap projek penguatan profil pelajar pancasila. Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan guru sekolah menengah atas memiliki perspektif yang baik terhadap kegiatan projek penguatan profil pelajar pancasila. Mulai dari konsep dasar, tahap persiapan, tahap pelaksanaan sampai dengan tahap asesmen dan evaluasi projek penguatan pelajaran pancasila. Hal tersebut didukung berdasarkan data hasil wawancara yang menujukan bahwa jawaban dari setiap responden sesuai dengan panduan projek penguatan pelajar pancasila yang telah di keluarkan oleh Kemendikbud, sehingga dapat di simpulkan bahwa guru sekolah menegah atas yang berada di daerah kabupaten dan kota serang provinsi Banten memiliki perspektif yang baik terhadap kegiatan projek penguatan pelajar pancasila pada kurikulum merdeka.
Co-Authors Abdul Hakam Barok Aboemolak, Bassam Abomoelak, Bassam Abumoelak, Bassam Achmad Ridwan, Achmad Ade Danova Adinda Myra Amalia Putri Adinda Myra Amalia Putri Agung Purwanto AGUS SETIAWAN Agus Setiawan Ahmad Yudianto Aina Q Marof Akbar, Dandy Alin Mardiah Aliyah, Elvira Zulfah Ananda Indah Putri Sihombing Angelina, Helzi Anggraeni, Rosita Gio Anisa Fitriyanti Annisa Auliya Annisa Maharani Annisa, Cindy Ermintia Aqilah, Amadita Shafa Arief Rahmad Maulana Akbar Arieztania Rahmadhani Arif Rahman Asri Sulfianti Athiyah Layla Atikah Nur Rahmawati Atin Supiyani Aulia Siti Pathoni Aulia Widowati Axel Mareta Ayu Berkahingrum Azidi Irwan Azizah, Puan Aqila Azzahra, Maharanianska Bassam Abomoelak Bassam Abomoelak Berkahingrum, Ayu Cahyani, Septia Dwi Chen, Shyi-Tien Dahlia Dahlia Dalia Sukmawati Dandy Akbar Juliansyah Dandy Akbar Juliansyah Dandy Akbar Juliansyah Daniel Joe Dailin Darwis, Darsef Desi Lestari Dessy Natalia Devi Aliefiyardi Dian Larasati Diana Vivanti Diat Nurhidayat Dudi Hardianto Dwi Ana Oktaviani El Enshasy, Hesham El-Enshasy, Hesham Ali Elenshasy, Hesham Ali Elsa Septiani Ely Puspita Sari Enshasy, Hesham Ali El Erdawati Ezzaty NM Razif Fahriza, Tiara Farid Agouillal Fathya Putri Fajriani Fera Kurnia Dewi Fera Kurnia Dewi Fera Kurnia Dewi Fera Kurniadewi Fera Kurniadewi Fera Kurniadewi Fernita Puspasari Fitri W Fitriyanti, Anisa Furqoni, Abdul Hadi Geta Putri Mentari Giri Alviyanto Gladys Indira Putri Gladys Indira Putri Gladys Indira Putri Grace Grace, Grace Gusti Angieta Putri Hairishah, Nazrisya Helzi Angelina Hermawati, Elvira Hesham A. El Enshasy Hesham Ali Al-Enshashy Hesham Ali El Enshasy Hesham Ali El-Enshasy I Made Wiranatha I Made Wiranatha I Nyoman Ruja IMAM SANTOSO Imanuelle Orchidea R P Ira Nur Amalia Irma Ratna Kartika Irvan Maulana Irvan Maulana Irwan Saputra Isfasona Bunga Falana Ismaya Krisdawati Ismaya Krisdawati Ismaya Krisdawati Izzatul Ilma Chairinnisa Jefferson Lynford Declan Johanes Erwin Tantaruna Juliansyah, Dandy Akbar Kartika, Irma Ratna Kinanti Istantia Chantika Krisdawati, Ismaya Kurnia Agustini Kurnia Agustini Kurniadewi, Fera Lanasari, Rossy Lilis Septyarini Lim J. R Listya Ayu Saraswati Maharani Azka Azzahra Maharanianska Azzahra Maria Paristiowati Masturdin Masturdin Maulana, Irvan Mellyna Fitriani Musie, Royna Rahma Nabilla Anisa Putrie Nasywa Fhelia Salta Nida Nur Afifah Nita Aresanti Novi Permanasari Novi Wulandari Novianti Mantasha NOVITASARI Novitasari Novitasari Oni Soesanto Soesanto Pardiana Permatasari, Nur Azmi Puan Aqila Azizah Putri Novitasari Putri, Adinda Myra Amalia Putri, Gladys Indira Putri, Gusti Angieta Raden Haryo Bimo Setiarto Rahma, Wanda Amelia Rahmat Yunus Yunus Rahmawati, Atikah Nur Ramadhan, Fitri Nur Rara Seruni Rara Seruni Retno Dwi Cahayningrum Rheva Amadea Rina Agustina Ririn Gustini Rizkahana Syehfia Rizki Fitria Roshanida A. Rahman Rosi Nurhujaimah Rosita Gio Anggraeni Royna Rahma Musie S, Restu.N S Saamia, Vira Salsabila, Nadia Sara E Gomaa Sarah Adilisa Kartini Sari, Ely Puspita Setia Budi Shangkara, Muhammad Arkent Sheila Nurul Fadillah Octaviany Shyi-Tien Chen Sihombing, Ananda Indah Putri Sindy Kania Sulastri Sintia Mardita Siti Azizah Siti Fatimah SITI FATIMAH Siti Munawaoh Siti Munawaroh Siti Namiran Hadis Sondang N. Sihombing SRI RAHAYU Sri Rahayu Sulistiyani Susilo, Ahmad Dwi Susilo, Tanto Budi Syamsul Bachri Tiara Fahriza Toton Sutono Tri Hastuti Budi Utami Tri Susanti Ucu Cahyana Ulfah Choiriyah Uswatul Nisa Vira Saamia Vira Saamia Vira Saamia Wahyuningtiyas, Kartika Putri Wiranatha, I Made Yohana Caroline Sihombing Yohannes Eka Cordias Buulolo Yuli Rahmawati Zahroni, Siti Zarani M Taher