Claim Missing Document
Check
Articles

An In Silico Evaluation of the Anti-Wrinkling Potential of Certain Peptides in Relation to the Catalytic Domain of Matrix Metalloproteinase-1 Rahmadani, Agung; Sukemi, Sukemi; Tasya, Indriana; Olii, Nova Yunita Putri; Ridwansyah, Muhammad; Turista, Dora Dayu Rahma; Arifian, Hanggara
Jurnal Sains dan Kesehatan Vol. 7 No. 1 (2025): J. Sains Kes.
Publisher : Fakultas Farmasi, Universitas Mulawarman, Samarinda, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25026/jsk.v7i1.2518

Abstract

Skin wrinkles are caused by the cleavage of collagen fibers by the major collagenase enzyme matrix metalloproteinase-1 (MMP-1). Peptide-based matrix metalloproteinase-1 inhibitors present a potential new therapeutic strategy to prevent MMP-1-mediated collagenolysis, which is induced by UV-induced MMP-1 overexpression. This in silico study investigated the MMP-1 inhibitory capacity of carefully selected and well-designed hexapeptides. A molecular docking method was employed to screen 14 hexapeptides. The target ligands were observed to interact non-covalently. The LYYYGP peptide sequence was found to form three hydrogen bonds (H-bonds) with amino acid (AA) residues in the catalytic domain of MMP-1. Additionally, hydrophobic interactions between these peptides and the protein were observed at certain sites. The maximum binding affinity was observed for the LYYYGP sequence (binding free energy, ?G = -9.00 kcal/mol). These sequences exhibited binding energies comparable to those of the LSYYGP sequence (-8.48 kcal/mol) and YSGYYP sequence (-8.27 kcal/mol). The YSGYGY sequence demonstrated a lower binding affinity for the target receptor, with ?G = -5.59 kcal/mol. This study indicates that specific peptide sequence components are crucial for forming hydrogen bonds that link proteins to peptides. Further investigation, encompassing chemical synthesis and laboratory experimentation, is requisite to substantiate the efficacy of the two hexapeptides.
Accuracy of neural networks in brain wave diagnosis of schizophrenia Sukemi, Sukemi; Cahyadi, Gabriel Ekoputra Hartono; Samsuryadi, Samsuryadi; Akbar, Muhammad Agung
IAES International Journal of Artificial Intelligence (IJ-AI) Vol 14, No 2: April 2025
Publisher : Institute of Advanced Engineering and Science

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.11591/ijai.v14.i2.pp1311-1325

Abstract

This research explores the application of a modified deep learning model for electroencephalography (EEG) signal classification in the context of schizophrenia diagnosis. This study aims to utilize the temporal and spatial characteristics of EEG data to improve classification accuracy. Four popular convolutional neural network (CNN) architectures, namely LeNet-5, AlexNet, VGG16, and ResNet-18, are adapted to handle 1D EEG signals. In addition, a hybrid architecture of CNN-gated recurrent unit (GRU) and CNN-long short-term memory (LSTM) is proposed to capture spatial and temporal dynamics. The model was evaluated on a dataset consisting of EEG recordings from 14 patients with paranoid schizophrenia and 14 healthy controls. The results show high accuracy and F1 scores for all modified models, with CNN-LSTM and CNN-GRU achieving the highest performance with scores of 0.96 and 0.97, respectively. Receiver operating characteristic (ROC) curves demonstrate the model's ability to distinguish between healthy controls and schizophrenia patients. The proposed model offers a promising approach for automated schizophrenia diagnosis based on EEG signals, potentially assisting clinicians in early detection and intervention. Future work will focus on larger data sets and explore transfer learning techniques to improve the generalization ability of the model.
Penentuan kondisi optimum penjerapan ekstrak etanol bunga dadap merah (Erythrina cristagalli L.) oleh kertas saring Agustina, Reny; Sukemi, Sukemi
Bivalen: Chemical Studies Journal Vol. 6 No. 1 (2023)
Publisher : Bachelor Degree Program of Chemical Education - Mulawarman University | Program Studi S-1 Pendidikan Kimia - Universitas Mulawarman

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30872/bcsj.v6i1.952

Abstract

Bunga dadap merah (Erythrina cristagalli L.) berpotensi untuk dijadikan indikator asam basa alami. Penelitian ini dirancang untuk mengetahui kondisi optimum penjerapan ekstrak etanol bunga dadap merah oleh kertas saring. Ekstrak etanol bunga dadap merah diperoleh dengan metode maserasi menggunakan pelarut etanol 95% selama 24 jam. Larutan indikator kemudian diuji perubahan warnanya pada larutan pH 1-14. Larutan indikator selanjutnya digunakan untuk menentukan kondisi optimum (waktu kontak, MLR, suhu dan konsentrasi) penjerapan ekstrak oleh kertas saring. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penjerapan ekstrak etanol bunga dadap merah oleh kertas saring meningkat seiring meningkatnya waktu kontak, material to liquor ratio (MLR), suhu dan konsentrasi. Waktu kontak dan suhu optimum pada penelitian ini adalah 60 menit dan 78°C, sementara MLR dan konsentrasi maksimum diperoleh pada 1:150 dan pemekatan 6×.
Persepsi siswa SMA tentang pembelajaran kimia menggunakan Google classroom Sukemi, Sukemi; Rindoi, Muhammad; Kusumawardani, Ratna; Watulingas, Maasje C.
Bivalen: Chemical Studies Journal Vol. 5 No. 1 (2022)
Publisher : Bachelor Degree Program of Chemical Education - Mulawarman University | Program Studi S-1 Pendidikan Kimia - Universitas Mulawarman

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui persepsi siswa tentang pembelajaran kimia secara daring menggunakan Google classroom. Populasi dalam penelitian ini adalah 216 siswa kelas X IPA SMA N 2 Samarinda tahun ajaran 2020/2021. Sampel penelitian adalah 68 siswayang terdiri atas 20 laki-laki dan 48 perempuan yang dipilih secara acak. Penelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dengan teknik pengumpulan data menggunakan angket. Persepsi siswa yang diukur adalah kemudahan akses, manfaat, komunikasi dan interaksi, pengiriman instuksi, dan kepuasan siswa. Hasil penelitian menunjukkan bahwa siswa memiliki persepsi positif tentang pembelajaran kimia secara daring menggunakan Google classroom. Penelitian ini mengindikasikan bahwa Google classroom merupakan solusi bagi guru, khususnya guru kimia, dalam melaksanakan pembelajaran daring.
Kondisi optimum pewarnaan serat daun doyo menggunakan pewarna alami dari ekstrak kulit akar Rhizopora stylosa Sukemi, Sukemi; Adha, Syahida; Suprianto, Edy; Fadjri, Luthfi Talitha Fairuzy; Ishmah, Rismananda; Gunawan, Rony; Kusumattaqiin, Fataa
Bivalen: Chemical Studies Journal Vol. 5 No. 2 (2022)
Publisher : Bachelor Degree Program of Chemical Education - Mulawarman University | Program Studi S-1 Pendidikan Kimia - Universitas Mulawarman

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30872/bcsj.v5i2.1796

Abstract

Kain tenun (ulap) doyo merupakan produk tekstil suku Dayak Benuaq, Provinsi Kalimantan Timur, Indonesia. Kain ini dibuat dari serat daun doyo yang memiliki warna dasar putih-krem dan pewarna alami digunakan untuk mewarnainya. Bakau mengandung tanin yang dapat dijadikan pewarna alami. Pada proses pewarnaan benang atau serat dari daun doyo terjadi proses penyerapan warna oleh serat. Penelitian ini dirancang untuk menentukan kondisi optimum pewarnaan serat daun doyo menggunakan ekstrak kulit akar bakau (EKAB) spesies Rhizopora stylosa. Pembuatan zat warna dilakukan dengan perebusan kulit akar bakau kering menggunakan aquades. Pewarnaan serat doyo menggunakan teknik pencelupan. Uji beda warna (DI) serat yang diwarnai dianalisis menggunakan applikasi ImageJ. Hasil penelitian menunjukan pewarna alami dari EKAB berwarna cokelat tua. Kondisi optimum pewarnaan serat daun doyo menggunakan pewarna alami EKAB adalah: pH larutan pewarna 3, suhu pewarnaan 92°C, waktu pencelupan/pewarnaan 130 menit, material to liquor ratio (MLR) 1:100 (b/v), dan konsentrasi larutan pewarna pada tiga kali pemekatan. Hasil pewarnaan serat daun doyo menggunakan ekstrak kulit akar bakau adalah cokelat. Hasil ini menunjukkan bahwa kulit akar bakau dapat diaplikasikan sebagai sumber zat warna pada pewarnaan serat daun doyo.
Karakteristik trayek pH indikator alami dan aplikasinya pada titrasi asam dan basa Agustina, Reny; Rahma, Sitti; Arni, Arni; Sandhira, Aura Chrismania; Sukemi, Sukemi
Bivalen: Chemical Studies Journal Vol. 5 No. 2 (2022)
Publisher : Bachelor Degree Program of Chemical Education - Mulawarman University | Program Studi S-1 Pendidikan Kimia - Universitas Mulawarman

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Indikator asam basa merupakan senyawa kompleks yang mampu bereaksi dengan asam atau basa yang disertai dengan perubahan warna. Indikator asam basa memiliki trayek pH yang ditunjukkan oleh perubahan warnanya pada kondisi asam dan basa. Penggunaan indikator asam basa sintesis membutuhkan biaya dan dapat mencemari lingkungan sehingga dibutuhkan suatu indikator pengganti yang lebih murah dan ramah lingkungan. Indikator sintesis dapat diganti dengan indikator alami yang dapat dibuat dengan mengekstrak bagian dari tanaman, seperti batang, daun, bunga dan buah. Beberapa jenis dan bagian tanaman seperti buah karamunting, bunga dadap merah, bunga kembang merak, bunga kembang sepatu, bunga rosella, bunga telang, bunga waru, daun adam hawa, kayu secang, ketan hitam, kubis ungu, kulit buah naga, pucuk daun pucuk merah, dan ubi jalar ungu berpotensi sebagai indikator asam basa. Hal ini dapat dilihat dari trayek pHnya, perubahan warnanya, dan aplikasinya pada titrasi asam basa. Indikator asam-basa alami dapat dijadikan laternatif sebagai pengganti indikator asam basa sisntesis.
Aktivitas antioxidan ekstrak metanol bunga Gmelina elliptica dari Kalimantan Timur Usman, Usman; Sukemi, Sukemi; Mardian, Yessi Maulida; Herliani, Herliani; Sari, Eadvin Rosrinda Awang; Arung, Enos Tangke
Bivalen: Chemical Studies Journal Vol. 5 No. 2 (2022)
Publisher : Bachelor Degree Program of Chemical Education - Mulawarman University | Program Studi S-1 Pendidikan Kimia - Universitas Mulawarman

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Gmelina elliptica digunakan penduduk di desa Talisayan, Kalimantan Timur, untuk mengobati otorrhea. Penelitian tentang aktifitas biologi dan antioksidan dari G. elliptica telah banyak dilakukan. Walaupun demikian penelitian aktivitas antioksidan bunga G. elliptica dari Kalimantan Timur belum dilakukan. Penelitian ini dilakukan untuk menganalisa aktivitas antioksidan ekstrak kasar metanol bunga G. elliptica dari desa Talisayan. Aktivitas antioksidan menggunakan uji penangkapan radikal 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH). Aktivitas penangkapan radikal DPPH dari ekstrak mencapai 89,77% pada konsentrasi 0,0050 mg/ml. Jadi bunga G. elliptica dari Kalimantan Timur berpotensi sebagai sumber antioksidan.
LITERATURE REVIEW: INOVASI PEMBELAJARAN KIMIA BERWAWASAN LINGKUNGAN MELALUI PENDEKATAN GREEN CHEMISTRY Aliah, Nur; Wati, Della Syaras; Nurfitriani, Ditalia; Olii, Nova Yunita Putri; Sukemi, Sukemi
CHEDS: Journal of Chemistry, Education, and Science Vol 8, No 2 (2024)
Publisher : Universitas Islam Sumatera Utara

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30743/cheds.v8i2.10170

Abstract

Green Chemistry merupakan sebuah konsep yang mengangkat permasalahan terkait dampak lingkungan untuk mengurangi penggunaan bahan berbahaya dengan menggunakan bahan yang lebih ramah lingkungan. Pendidikan mempunyai peranan penting sebagai sarana dan prasarana penyaluran green chemistry untuk meningkatkan sikap peduli lingkungan. Metode penelitian yang digunakan adalah Narrative Literature Review (NLR) dengan mencari artikel jurnal melalui database Google Scholar selama 10 tahun terakhir. Hasil studi literatur menunjukkan bahwa pendekatan green chemistry sebagai inovasi bidang pendidikan mempunyai pengaruh besar terhadap peningkatan pengalaman belajar, penguasaan konsep, motivasi dan hasil belajar siswa serta peningkatan kepedulian terhadap lingkungan. Misalnya saja penggunaan bahan alami terbarukan dibandingkan bahan kimia sintetik di laboratorium. Berbagai fasilitas atau bahan ajar digunakan seperti buku atau e-book, e-modul, dan lembar kerja siswa yang menarik.
Electrospun nylon-6 nanofibers and their characteristics Sriyanti, Ida; Agustini, Meily P; Jauhari, Jaidan; Sukemi, Sukemi; Nawawi, Zainuddin
Jurnal Ilmiah Pendidikan Fisika Al-Biruni Vol 9 No 1 (2020): Jurnal Ilmiah Pendidikan Fisika Al-Biruni
Publisher : Universitas Islam Negeri Raden Intan Lampung, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24042/jipfalbiruni.v9i1.5747

Abstract

The purposes of this research were to investigate the synthesized Nylon-6 nanofibers using electrospinning technique and their characteristics. The method used in this study was an experimental method with a quantitative approach. Nylon-6 nanofibers have been produced using the electrospinning method. This fiber was made with different concentrations, i.e. 20% w/w (FN1), 25% w/w (FN2), and 30% w/w (FN3). The SEM results show that the morphology of all nylon-6 nanofibers) forms perfect fibers without bead fiber. Increasing fiber concentration from 20% w/w to 30% w/w results in bigger morphology and fiber diameter. The dimensions of the FN1, FN2, and FN3 fibers are 1890 nm, 2350 nm, and 2420 nm, respectively. The results of FTIR analysis showed that the increase in the concentration of nylon-6 (b) and the electrospinning process caused a peak shift in the amide II group (CH2 bond), the carbonyl group and the CH2 stretching of the amide III group from small wave numbers to larger ones. The results of XRD characterization showed that the electrospinning process affected the changes in the XRD pattern of nylon-6 nanofiber (FN1, FN2, and FN3) in the state of semi crystal. Nylon-6 nanofibers can be used for applications in medicine, air filters, and electrode for capacitors
Video pembelajaran kimia: media untuk meningkatkan pemahaman konsep dan hasil belajar peserta didik: Chemistry learning videos: media to enhance concept understanding and student learning outcomes Nadia, Nadia; Hikmatul Rabiah, Nasya; Nuraini, Indah; Dwi Saputri, Rindiani; Sukemi, Sukemi; Khoirunnisa, Fitriah
Bivalen: Chemical Studies Journal Vol. 8 No. 1 (2025)
Publisher : Bachelor Degree Program of Chemical Education - Mulawarman University | Program Studi S-1 Pendidikan Kimia - Universitas Mulawarman

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.30872/bcsj.v8i1.4909

Abstract

Pembelajaran kimia di sekolah sering kali dianggap sangat sulit dikarenakan materinya yang abstrak jika dijelaskan dengan monoton dan lisan saja. Pendidik memerlukan bantuan media yang tepat agar peserta didik dapat memahami materi menjadi lebih mudah. Literatur review ini bertujuan untuk melihat dan menganalisis berbagai literature review mengenai penggunaan video pembelajaran dalam pendidikan kimia yang sering dianggap rumit dan abstrak oleh banyak peserta didik. Melalui metode narrative literature review, artikel ini mengkaji berbagai literatur yang menunjukkan bagaimana video pembelajaran dapat mempermudah pemahaman konsep kimia yang kompleks. Video pembelajaran sebagai media audiovisual, tidak hanya berfungsi sebagai alat bantu, tetapi juga meningkatkan motivasi dan keterlibatan peserta didik. Ditemukan bahwa penerapan video pembelajaran dapat meningkatkan keterampilan berpikir kritis dan hasil belajar peserta didik. Dengan visualisasi yang menarik dan penyajian yang interaktif, video pembelajaran mampu menjembatani kesenjangan antara konsep abstrak kimia dan pemahaman konkret peserta didik. Berdasarkan literatur review yang dilakukan, dapat disimpulkan bahwa video pembelajaran berperan positif dalam meningkatkan pemahaman konsep dan hasil belajar peserta didik pada mata pelajaran kimia.
Co-Authors Abunoya, Juleha Ilfri Ade Iriani Sapitri Ade Iriani Sapitri Adha, Syahida Agustina, Reny Agustini, Meily P Ahmad Fali Oklilas Aidil Putrasyah Akbar, M. Agung Alexander Edo Tondas Aming, Aming Andari Andari, Andari Andre Hardoni Anggraeni, Egi Syahrah Anggun Islami Angraini, Zihan Nur Apriansyah Putra Aprilisa, Shinta Arif, Ainun Rezkiva Arifian, Hanggara Arni Arni Awaliyah, Nabilah Nailah Ayu Meida Bambang Tutuko Bengawan Alfaresi Cahyadi, Gabriel Ekoputra Hartono Carunisa, Chofifah Darmawahyuni, Annisa Defi Telly Krisnawaty Palingu, Defi Telly Krisnawaty Deviyantoro, Deviyantoro Dewi Puspasari Dian Oktavian Dian Palupi Dian Palupi Rini Dian Palupi Rini Dian Palupi Rini Dian Palupi Rini Dwi Saputri, Rindiani Elza Fitriana Saraswita Endy Suherman Enos Tangke Arung, Enos Tangke Ermatita - Erwin, Erwin Evi Purnamasari Fadhilah Dirayati Fadhilah Dirayati Fadhilah Dirayati Fadjri, Luthfi Talitha Fairuzy Faisal Fajri Faisal Fajri Fajri, Faisal Farah Erika Farah, Harra Ismi Fatimah, Neni Hasnah Febriani, Sarah Ferlian Seftianto Firdaus Firdaus Fitriah Khoirunnisa Gabriel Ekoputra H.C Gizcha Putri Destriana Gunawan, Rony Hadipurnama Satria Hamid Rahman Hardiman Hardiman Hartandi, Dimas Hatta Efrizal Herliani Herliani Hikmatul Rabiah, Nasya Huda Ubaya Ida Sriyanti Iis Intan Widiyowati Indah Nuraini, Indah Irfan, Ade Iriyanti, Novia Dwi Irmawati Irmawati Ishmah, Rismananda Ismali, Dicky Taopik Ismali Jaidan Jauhari Johannes Petrus Joko Purnomo Joko Purnomo Jordan Marcelino Kadir, Nurdianah Abdul Kusumattaqiin, Fataa Laode Rijai Larasati, Herlin Alfiana Lestari, Wahyu Yunita Lia Andiani Lia Andiani M. Fachrurrozi . M. Naufal Rachmatullah Mahmudah, Sofia Maqom Al Mardian, Yessi Maulida Marlina Sylvia Megah Mulya Meily P Agustini Muhammad Azrell Samudra Muhammad Naufal Rachmatullah Muhammad Ridwansyah Muhammad Wahyu Fadli Nadia Nadia Norbaiti, Norbaiti Nur Aliah, Nur Nurfitriani, Ditalia Nursilawati, Nursilawati Octaria, Orissa Olii, Nova Yunita Putri Pakaenoni, Frederich Pandito Dewa Putra Parwito Prasiwi, Dinar Pratama, Yogi Tiara Purwita, Rahmadina Putri, Noni Khaisha Rahmadani, Agung Rahmatullah, Agung Nugraha Ratna Kusumawardani, Ratna Rendy Isdwanta Rifkie Primartha Rifkie Primartha Rindoi, Muhamad Rindoi, Muhammad Riyanto Riyanto RR. Ella Evrita Hestiandari Salam, Supriatno Samsuryadi Samsuryadi Samsyuryadi Samsyuryadi Samsyuryadi Samsyuryadi Sandhira, Aura Chrismania Santi Riana Dewi, Santi Riana Saputri, Deveronica Karning Saputri, Mitha Sari, Eadvin Rosrinda Awang Siti Mariah, Siti Siti Nurmaini Sitti Rahma, Sitti Sobirin Sobirin Suniyati, Suniyati Syamsiar, Syamsiar Tasya, Indriana Turista, Dora Dayu Rahma Usman Usman Wati, Della Syaras Watulingas, Maasje C. Wirhanuddin, Wirhanuddin Yogi Tiara Pratama Yogi Tiara Pratama Yudha Pratomo Yulianti, Evi Yusa Virginiawan Guntara Zainuddin Nawawi