Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
5.613
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Jurnal Penelitian dan Pengembangan Pendidikan Jurnal Pendidikan dan Pembelajaran Khatulistiwa (JPPK) Jurnal Teknologi Informasi dan Ilmu Komputer Jurnal Ilmu Sosial dan Ilmu Politik (JISIP) Media Penelitian Pendidikan : Jurnal Penelitian dalam Bidang Pendidikan dan Pengajaran SASINDO E-Dimas: Jurnal Pengabdian kepada Masyarakat Journal DaFIna - Journal Deutsch als Fremdsprache in Indonesien SASINDO Jurnal Ilmiah Universitas Batanghari Jambi Arsitektura : Jurnal Ilmiah Arsitektur dan Lingkungan Binaan Desimal: Jurnal Matematika Indonesian Journal of Artificial Intelligence and Data Mining JURNAL PENDIDIKAN TAMBUSAI Jurnal Ilmiah Mandala Education (JIME) Jurnal Kajian Ilmiah Kesehatan Dan Teknologi (JKIKT) Social, Humanities, and Educational Studies (SHEs): Conference Series Bhamada: Jurnal Ilmu dan Teknologi Kesehatan (E-Journal) Jurnal Bahasa Indonesia bagi Penutur Asing (JBIPA) Journal of Food and Culinary Academic Journal of Educational Sciences (Jurnal Akademik bidang Ilmu-Ilmu Pendidikan) Vox Populi Economicus: Jurnal Ekonomi dan Manajemen Jurnal Pustaka Mitra : Pusat Akses Kajian Mengabdi Terhadap Masyarakat International Journal on Education Insight PEDAGOGI: Jurnal Ilmiah Pendidikan International Journal of Ethno-Sciences and Education Research Ta'rim: Jurnal Pendidikan dan Anak Usia Dini eProceedings of Engineering Innovative: Journal Of Social Science Research IJESPG (International Journal of Engineering, Economic, Social Politic and Government) journal Sasindo : Jurnal Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia Kohesi: Jurnal Sains dan Teknologi Morfologi : Jurnal Ilmu Pendidikan, Bahasa, Sastra dan Budaya IIJSE VISA: Journal of Vision and Ideas Jurnal Accounting Information System (AIMS) Jurnal Riset Teknik Komputer Seroja Husada: Jurnal Kesehatan Masyarakat KALBISIANA Jurnal Sains, Bisnis dan Teknologi Epaper Bisnis: International Journal Entrepreneurship and Management Khidmat: Journal Community Service Bhamada: Jurnal Ilmu dan Teknologi Kesehatan (E-Journal) Jurnal Agrisep Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat
Larasati Larasati
Unknown Affiliation
Religion Agriculture, Biological Sciences & Forestry Arts Humanities Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Civil Engineering, Building, Construction & Architecture Computer Science & IT Control & Systems Engineering Decision Sciences, Operations Research & Management Dentistry Economics, Econometrics & Finance Education Electrical & Electronics Engineering Energy Engineering Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Industrial & Manufacturing Engineering Languange, Linguistic, Communication & Media Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Library & Information Science Mathematics Medicine & Pharmacology Nursing Physics Public Health Social Sciences Transportation Veterinary Other

Published : 56 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Jurnal Teknologi Informasi dan Ilmu Komputer

 1 
Model Prediksi Interaksi Senyawa dan Protein untuk Drug Repositioning menggunakan Deep Semi-Supervised Learning Larasati, Larasati; Kusuma, Wisnu Ananta; Annisa, Annisa
Jurnal Teknologi Informasi dan Ilmu Komputer Vol 7 No 4: Agustus 2020
Publisher : Fakultas Ilmu Komputer, Universitas Brawijaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25126/jtiik.2020742236

Abstract

Drug repositioning adalah penggunaan senyawa obat yang sudah lolos uji sebelumnya untuk mengatasi penyakit baru selain penyakit awal obat tersebut ditujukan. Drug repositioning dapat dilakukan dengan memprediksi interaksi senyawa obat dengan protein penyakit yang bereaksi positif. Salah satu tantangan dalam prediksi interaksi senyawa dan protein adalah masalah ketidakseimbangan data. Deep semi-supervised learning dapat menjadi alternatif untuk menangani model prediksi dengan data yang tidak seimbang. Proses pre-training berbasis unsupervised learning pada deep semi-supervised learning dapat merepresentasikan input dari unlabeled data (data mayoritas) dengan baik dan mengoptimasi inisialisasi bobot pada classifier. Penelitian ini mengimplementasikan Deep Belief Network (DBN) sebagai pre-training dan Deep Neural Network (DNN) sebagai classifier. Data yang digunakan pada penelitian ini adalah dataset ion channel, GPCR, dan nuclear receptor yang bersumber dari pangkalan data KEGG BRITE, BRENDA, SuperTarget, dan DrugBank. Hasil penelitian ini menunjukkan pada dataset tersebut, pre-training berupa ekstraksi fitur memberikan efek optimasi dilihat dari peningkatan performa model DNN pada akurasi (3-4.5%), AUC (4.5%), precision (5.9-6%), dan F-measure (3.8%). AbstractDrug repositioning is the reuse of an existing drug to treat a new disease other than its original medical indication. Drug repositioning can be done by predicting the interaction of drug compounds with disease proteins that react positively. One of the challenges in predicting the interaction of compounds and proteins is imbalanced data. Deep semi-supervised learning can be an alternative to handle prediction models with imbalanced data. The unsupervised learning based pre-training process in deep semi-supervised learning can represent input from unlabeled data (majority data) properly and optimize initialization of weights on the classifier. This study implements the Deep Belief Network (DBN) as a pre-training with Deep Neural Network (DNN) as a classifier. The data used in this study are ion channel, GPCR, and nuclear receptor dataset sourced from KEGG BRITE, BRENDA, SuperTarget, and DrugBank databases. The results of this study indicate that pre-training as feature extraction had an optimization effect. This can be seen from DNN performance improvement in accuracy (3-4.5%), AUC (4.5%), precision (5.9-6%), and F-measure (3.8%).
Co-Authors Afina Nurfauzia Agus Wismanto Alif Pranata ALKHUSARI Amalia, Ridha Amaniarsih, Dwi Suci Aminuyati Amrina Rosada Ana Hardiana Anesa Surya Annisa Annisa Anziila, Astrid Shalli Ari Fajar Santoso Arif Pristianto Arisul Ulumuddin Arumjati, Vernilina Oktaeighta Arumjati, Vernillina Oktaeighta asrul, nurmahyuni Aulia, Rara Ayu, Andini Sukma Batubara, Didiek Hardadi Cahyadi, Muhammad Mukhlis Cahyani, Indah Sinawang Christine Indrianny Tanod Dewi Sartika Munthe Dhata Praditya Djunaedi, Mira Kartika Dewi Dwi Santoso, Andreas Edy Purwo Saputro Eka Rahma Ningsih Elena Prida Fahlevi, Zhillan Zhalila Farid Rahman Fauzia, Nabila Atika Firdha Senja Maelaningsih Fitriani Freddy Johanis Rumambi Girly Risma Firsty Hanum, Atiqa Nur Latifa Hernawan, Alisha Deanna Hernina, Hernina Hesti Mayasari Ila Rosmilawati Indriani, Virania Intan Intan Isti Andini Jamalini Putri Tampubolon Jasmine, Safira Amalia Jaya, Indra Frana Jenny Indrastoeti Siti Poerwanti Joko Joko Kholidah Nur KUNTARI, SEPTI Kurniawan Kurniawan Kusuma, Dimas Wiradarma Laksono Trisnantoro Latif Anshori Kurniawan Laura Shafarina Madeten, Sisilya Saman Mahatma, Mahatma Maria Arina Luardini Marisi Pakpahan Maswanku, Luwemba Musa Meilani, Chelsy Mirza Fadil Monica, Vina Muchammad Hamdani Muhamad Farhan Muhammad Reza Aulia Muhlis Muhlis Mutaqin, Jenal Najwa Lubis Nanik Setyawati Ngatmini Ngatmini Nihayati, Arina Oktariana Pramiastuti Prasti Eko Yunanto Purwadhi Purwadhi Puspitasari, Devi Ambarwati Qohardita, Risa Riadoh Riadoh Rima Harsa Alquraisi Rini Kuswati Roni Kurniawan Rosmiati, Neni Rosyidah Rosyidah, Rosyidah Rotua Lenawati Tindaon Rudi Ruswandi Sachlan, Muhammad Gizwa Afdhallah Selvi Ramadani Sepiyan, Deni Septiyani, Retnosyari Setiawan, Rizki Siswanto PHM Siti Helmyati Siti Saadah Soffi Widyanesti Priwantoro, Soffi Widyanesti Subhan Widiansyah Sulaeman, Putri Amanah Suyoto Suyoto Tryana, Anjas Utami, HR. Utami, Nurul Putrie Wahyu S.J. Saputra Wibowo, Asep Wijana, Miki Wisnu Ananta Kusuma Wiyadi Wiyadi Yani Restiani Widjaja, Yani Restiani Yenda Sarfida Yuliana, Wahyu Prapti Yunika, Fisi Dwi Zainal Arifin Zeze Zakaria Hamzah