p-Index From 2021 - 2026
6.767
P-Index
This Author published in this journals
All Journal International Journal of Evaluation and Research in Education (IJERE) Jurnal Dedikasi Jurnal Gamma Jurnal Pangan dan Gizi AL KAUNIYAH Jurnal Pemikiran dan Pengembangan Sekolah Dasar (JP2SD) JINOP (Jurnal Inovasi Pembelajaran) Jurnal Pendidikan Biologi Indonesia Jurnal Inovasi Pendidikan IPA Jurnal CARE Jurnal Edukasi Matematika dan Sains Journal of Tropical Biodiversity and Biotechnology JOIV : International Journal on Informatics Visualization BIOLINK (Jurnal Biologi Lingkungan, Industri, Kesehatan) Jurnal Pendidikan Biologi BIOEDUKASI As-Salam: Jurnal Studi Hukum Islam & Pendidikan AL-ATHFAAL : JURNAL ILMIAH PENDIDIKAN ANAK USIA DINI EnviroScienteae JAST : Jurnal Aplikasi Sains dan Teknologi Journal of Education Technology Jurnal Penelitian dan Pengkajian Ilmu Pendidikan: e-Saintika Jurnal Pembelajaran dan Biologi Nukleus JSMARTech : Journal of Smart Bioprospecting and Technology Jurnal Pengabdian UNDIKMA Jurnal Kependidikan: Jurnal Hasil Penelitian dan Kajian Kepustakaan di Bidang Pendidikan, Pengajaran dan Pembelajaran Bioscientist : Jurnal Ilmiah Biologi Lumbung Inovasi: Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat Azzahra : Jurnal Pendidikan Anak Usia Dini Proceeding Biology Education Conference Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) Research and Development in Education (RaDEn) Biocaster : Jurnal Kajian Biologi Nuras : Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat Jurnal Peduli : Jurnal Pengabdian Kepada Masyarakat Jurnal Informatika Polinema (JIP) Biosaintifika: Journal of Biology & Biology Education JPPG LinguaScopes: International Journal of Language Education Sasambo: Jurnal Abdimas (Journal of Community Service) Jurnal Kesehatan Masyarakat Indonesian Journal of Education and Youth Development
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search
Journal : AL KAUNIYAH

Desain Primer PCR Spesifik Secara In Silico Untuk Amplifikasi Gen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) DNA Mitokondria Pada Aedes aegypti Moh. Mirza Nuryady; Elly Purwanti; Siti Nur Aldina; Sri Wahyuni; Tutut Indria Permana; Zakiyatul Khoiriyah; Kiky Martha Ariesaka
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol 18, No 1 (2025): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v1i1.33726

Abstract

AbstrakGen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) merupakan salah satu marker molekuler untuk identifikasi spesies berdasarkan DNA mitokondria. Tujuan dilakukannya penelitian ini, yaitu untuk mendapatkan primer gen COX-1 yang spesifik terhadap nyamuk A. aegypti. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif observasional yaitu dengan melakukan desain primer secara in silico dan konfirmasi secara in vitro ditandai dengan pita DNA hasil PCR. Langkah pertama dari metode ini, yaitu dengan mengunduh urutan DNA COX-1 Aedes aegypti dari Gene Bank (NCBI) dengan nomor aksesi DQ397892.1. Hasil dari Primer3web diperoleh dua primer yang spesifik, yaitu primer pertama memiliki sekuen F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA dan R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT dan pada primer kedua F¢ AGTCCAGCCCTTCTATGATCA dan R¢ TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Optimasi primer pada tahap konfirmasi dilakukan dengan kisaran suhu annealing 46, 48, dan 52 °C didapatkan hasil visualisasi elektroforesis yang menunjukkan adanya pita DNA dengan ukuran +600 bp pada ketiga kondisi suhu. Kesimpulan pada penelitian ini adalah didapatkan dua primer yang spesifik terhadap gen COX-1 Aedes egypti. AbstractThe COX-1 gene (Cytochrome Oxidase Subunit I) is one of the molecular marker for species identification based on mitochondrial DNA. The purpose of this study was to obtain specific COX-1 gene primers for A. aegypti mosquitoes. This research was an observational descriptive study, namely by carrying out the primary design in silico and in vitro confirmation marked by DNA bands from PCR results. The first step of this method is to download the COX-1 Aedes aegypti DNA sequence from the Gene Bank (NCBI) with accession number DQ397892.1. The results from Primer3web obtained two specific primers, namely, the first primer had the sequences F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT and the second primer had F¢AGTCCAGCCCTTCTATGATCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Primer optimization at the confirmation stage was carried out with annealing temperature ranges of 46, 48, and 52 °C. The results of electrophoretic visualization showed the presence of DNA bands with a size of +600 bp at all three temperature conditions. The conclusion of this study was that there were two specific primers  for the COX-1 gene of A. aegypti.
Desain Primer PCR Spesifik Secara In Silico Untuk Amplifikasi Gen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) DNA Mitokondria Pada Aedes aegypti Nuryady, Moh. Mirza; Purwanti, Elly; Aldina, Siti Nur; Wahyuni, Sri; Permana, Tutut Indria; Khoiriyah, Zakiyatul; Ariesaka, Kiky Martha
Al-Kauniyah: Jurnal Biologi Vol. 18 No. 1 (2025): AL-KAUNIYAH JURNAL BIOLOGI
Publisher : Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Syarif Hidayatullah State Islami

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.15408/kauniyah.v1i1.33726

Abstract

AbstrakGen COX-1 (Cytochrome Oxidase Subunit I) merupakan salah satu marker molekuler untuk identifikasi spesies berdasarkan DNA mitokondria. Tujuan dilakukannya penelitian ini, yaitu untuk mendapatkan primer gen COX-1 yang spesifik terhadap nyamuk A. aegypti. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif observasional yaitu dengan melakukan desain primer secara in silico dan konfirmasi secara in vitro ditandai dengan pita DNA hasil PCR. Langkah pertama dari metode ini, yaitu dengan mengunduh urutan DNA COX-1 Aedes aegypti dari Gene Bank (NCBI) dengan nomor aksesi DQ397892.1. Hasil dari Primer3web diperoleh dua primer yang spesifik, yaitu primer pertama memiliki sekuen F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA dan R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT dan pada primer kedua F¢ AGTCCAGCCCTTCTATGATCA dan R¢ TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Optimasi primer pada tahap konfirmasi dilakukan dengan kisaran suhu annealing 46, 48, dan 52 °C didapatkan hasil visualisasi elektroforesis yang menunjukkan adanya pita DNA dengan ukuran +600 bp pada ketiga kondisi suhu. Kesimpulan pada penelitian ini adalah didapatkan dua primer yang spesifik terhadap gen COX-1 Aedes egypti. AbstractThe COX-1 gene (Cytochrome Oxidase Subunit I) is one of the molecular marker for species identification based on mitochondrial DNA. The purpose of this study was to obtain specific COX-1 gene primers for A. aegypti mosquitoes. This research was an observational descriptive study, namely by carrying out the primary design in silico and in vitro confirmation marked by DNA bands from PCR results. The first step of this method is to download the COX-1 Aedes aegypti DNA sequence from the Gene Bank (NCBI) with accession number DQ397892.1. The results from Primer3web obtained two specific primers, namely, the first primer had the sequences F¢AGCAACTTTACACGGAACTCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT and the second primer had F¢AGTCCAGCCCTTCTATGATCA and R¢TGTTCTGCAGGAGGAAGTGT. Primer optimization at the confirmation stage was carried out with annealing temperature ranges of 46, 48, and 52 °C. The results of electrophoretic visualization showed the presence of DNA bands with a size of +600 bp at all three temperature conditions. The conclusion of this study was that there were two specific primers  for the COX-1 gene of A. aegypti.
Co-Authors Ach. Muhib Zainuri Ach. Muhib Zainuri Ahmad Ardiyansyah Ahmad Fauzi Akhmad Sukri Aldina, Siti Nur Alhummaira, Satwika Amaliyah Dina Anggraeni Asmah Hidayati Astika Dwi Lorosae Atok Miftachul Hudha Atok Miftachul Hudha Dian Trinsiska Anggraini Diani Fatmawati Drs. Sukarsono, M.Si.,, Drs. Sukarsono, Eddy Satriyanto Eko Cahyono, Eko Endrik Nurrohman Faqih Asshiddiqie Farida Rachmawati, Farida Fauzi Ahmad Muda Fendy Hardian Permana Fendy Hardian Permana Feni Tin Faizah Firman Arifin, Firman FITRIYAH Fitriyah Fitriyah Fitriyah Fitriyah Fuad Jaya Miharja Hadi Gunawan Sakti Hasan, Aso Hameed Hermanto, Feri Eko Hidajah Rachmawati Husamah Husamah I Gusti Ngurah Agung Wiwekananda Iis Maisaroh Ilham Budi Setyawan Ilham Budi Setyawan, Ilham Irwansyah, Arif Isti Pujiati Kawurian, Hesti Asri Khoiriyah, Zakiyatul Khoiro, Aisha Azaria Nisa’ul Khomsiyati , Siti Khomsiyati, Siti Kiky Martha Ariesaka kin, shodikin Laila Nursafitri Laila Nursafitri, Laila Lestari, Novi Puji Liliek Triani Lud Waluyo Marheny Lukitasari Mashudah Masliyah, Anis Mauridhi Hery Purnomo Moch Agus Krisno Budiyanto Moh Mirza Nuryady, Moh Mirza Moh. Mirza Nuryady Mohamad Amin Muizzudin Muizzudin Mukhammad Aris Muzzudin Muzzudin Nafi’ah, Elisa Rohimatun Najichah, Amalia Fajriyyatin Nikmah, Hurrun In Ningrum, Retno Novan Ardy Wiyani Novan Ardy Wiyani Novita Herawati Nur Islakhun Nisa’ Nurwidodo, Nurwidodo Nuryady, Mohamad Mirza Panji Ratih Suci, Panji Ratih Patma, Tundung Subali Pujiati, Isti Putri, Ambarwati Rizkia Qoriatul Wahida Rahmat Hidayat Retno Ningrum Rima Kholifatul Janah Riyanto . Rizka, Muhammad Arief Rizki, Sarita Ronny Susetyoko safitri, cikra ikhda Nur Hamidah Sari, Selvy Ratna Sefriyanti SEFRIYANTI, SEFRIYANTI Sely Tunjung Manik Septiani Selly Susanti SITI FATIMAH Siti Khomsiyati Siti Mufidah Siti Nur Aldina Siti Zaenab sitikhomsiyati Sri Wahyuni Sri Wahyuni Sri Wahyuni Sukarsono Sukarsono Syamsiar, Syamsiar Tutut Indria Permana Uminar, Ajeng Ninda Wahyu Prihanta Wahyu Prihanta Wahyu Prihanta Wahyu Prihanta Wahyu Prihanta Wangiyana, I Gde Adi Suryawan Warkoyo, W. Wijaya, Candra Kusuma Wiratmoko Yuwono Yasmine Salsabila Muninda Yuliani, Rifky Luvia Yuni Pantiwati Yuni Pantiwati Zakiyatul Khoiriyah