Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
8.205
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Jurnal Biologi Udayana Bioscience Bioeducation Journal Jurnal Ilmu Dasar AL KAUNIYAH Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Althea Medical Journal Biota Biomedika BIO-SITE |BIOLOGI Sains Terapan Jurnal Penelitian dan Pembelajaran IPA Scientiae Educatia: Jurnal Pendidikan Sains Jurnal Penelitian Pendidikan IPA (JPPIPA) Jurnal Biologi Tropis EKSAKTA : Jurnal Penelitian dan Pembelajaran MIPA Indonesian Food Science and TechnologyJournal Jurnal Agrotek Tropika Bio-Lectura Eksakta : Berkala Ilmiah Bidang MIPA Jurnal Ilmu Kefarmasian Indonesia AL-ULUM: JURNAL SAINS DAN TEKNOLOGI Atrium Pendidikan Biologi Serambi Biologi Majalah Kesehatan Pharmamedika Pelita Eksakta Abdi: Jurnal Pengabdian dan Pemberdayaan Masyarakat Sainstek : Jurnal Sains dan Teknologi Jurnal Biogenerasi IJECA (International Journal of Education and Curriculum Application) Suluah Bendang: Jurnal Ilmiah Pengabdian Kepada Masyarakat Jurnal Biosense Halal Research Journal TROPICAL GENETICS MASALIQ: Jurnal Pendidikan dan Sains Tropical Genetics Jurnal Serambi Biologi Berita Biologi
Dwi Hilda Putri
Universitas Negeri Padang
Religion Agriculture, Biological Sciences & Forestry Humanities Astronomy Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Civil Engineering, Building, Construction & Architecture Computer Science & IT Control & Systems Engineering Decision Sciences, Operations Research & Management Education Energy Engineering Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Languange, Linguistic, Communication & Media Materials Science & Nanotechnology Mathematics Mechanical Engineering Medicine & Pharmacology Physics Public Health Social Sciences Veterinary Other

Published : 100 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 3 Documents
Search
Journal : TROPICAL GENETICS

 1 
Primer design, in silico PCR and optimum annealing temperature for Escherichia coli detection in refillable drinking water samples Afifatul Achyar; Annisa Irna Putri; Dwi Hilda Putri; Yuni Ahda
Tropical Genetics Vol. 1 No. 2 (2021)
Publisher : Genetikawan Muda Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (1092.036 KB)

Abstract

Refill Drinking Water Depots (DAMIU) in the community are easy to find at affordable prices, which is a concern in the feasibility of refill drinking water quality. E.coli is one of the pathogenic bacteria present in drinking water that has poor quality. When it enters the body it can cause symptoms of diarrhea, fever, vomiting and others. The purpose of this study was to create a specific primer for E.coli that can be used to detect E.coli and determine the optimum temperature of primer annealing. Researchers do a new primer design because the existing design does not necessarily produce the same results due to various factors of different experimental conditions. The primer design was carried out on an in silico-based and had to meet the criteria for a good primer because it would be used in vitro. E.coli gene sequences was aligned with Shigella sp. using Pairwise Alignment. Primer candidates were analyzed using NCBI's Primer3 and Geneious Prime tools. The result is that the first primer pair is forward 5'–ATGCAGTGGTTCCTTATCTCACA-3' reverse 5'- ATCCTTAATGGCACTGCGCT-3', amplifying the amplicons along 417 bp in the yraJ gene. The second primer pair, forward 5'-CAGAACGTTTTTCATTCAGCAGG-3' reverse 5'-GCCACTACCAGATCGAGTCA-3' amplifies the 573 bp amplicon in the rne gene. The optimum annealing temperature for both pairs of primers was 59.5oC.
Optimization of Specific PCR Conditions for Cows (Bos taurus) in Rendang Samples for Molecular-Based Halal Tests Nurfadillatun Nisa Wijaya; Sisca Alicia Farma; Dwi Hilda Putri; Afifatul Achyar
Tropical Genetics Vol. 2 No. 1 (2022):
Publisher : Genetikawan Muda Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Rendang is one of the popular foods in Indonesia made from beef as the main ingredient, which has great potential in tourism development. As a country that has a Muslim majority population, this is very influential for the halal tourism industry. Halal tourism is the parent of tourism in accordance with Islamic principles. The issue of halal food is a sensitive issue for the community. The rise of mixing of non-halal ingredients such as pork in processed food products has worried the public, especially for adherents of the Islamic religion. However, this can be detected molecularly using the Polymerase Chain Reaction (PCR) technique which will amplify the DNA of the target gene of the species to be identified. Each gene has a primer with a different concentration and annealing temperature, so that prior to PCR with research samples, it is necessary to optimize the primer concentration and annealing temperature in order to obtain the appropriate PCR composition and conditions so as to obtain optimal PCR results. In this study, optimization of bovine-specific BOS primers that amplify the ND5 gene in mitochondrial DNA was carried out, namely ND5 (NADH dehydrogenase subunit 5). The results showed that the optimum annealing temperature was 48.2ºC, the optimum primary concentration was 0.5 μM.
Genotyping Of Sumatera Local Variety Of Citrus Using Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD) Technique Rinti Mutiara Sari; Afifatul A Achyar; Yuni Ahda; Dwi Hilda Putri
Tropical Genetics Vol. 2 No. 2 (2022):
Publisher : Genetikawan Muda Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24036/tg.v2i2.29

Abstract

Indonesia memiliki varietas jeruk lokal yang tidak kalah dengan jeruk impor, terutama dalam hal kesegaran buah. Namun, masyarakat lebih tertarik dengan warna kulit jeruk sehingga masyarakat lebih memilih jeruk impor ketimbang jeruk lokal, khususnya di Sumatera. Oleh karena itu, perlu dilakukan upaya pelestarian dan peningkatan karakteristik jeruk ini untuk meningkatkan kualitasnya melalui pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimalkan metode isolasi DNA sampel buah jeruk dengan Chelex-TE dan untuk mengetahui profil genetik jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan genotipe RAPD. Sampel yang digunakan adalah beberapa jeruk lokal di Sumatera (Citrus Siam Gunung Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu dan Citrus Pasaman) dan Citrus impor (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot dan Citrus Wokam). DNA diisolasi menggunakan metode Chelex-TE 10% yang dioptimalkan untuk beberapa parameter seperti ukuran butir, kulit buah dan daun. RAPD dilakukan dengan menggunakan 10 primer RAPD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode isolasi Chelex Chelex-TE 10% yang optimal adalah ukuran sampel 1 butir. Amplifikasi jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan 10 primer tunggal menghasilkan pita polimorfik. Nilai kesamaan jaccard menunjukkan bahwa kelima sampel jeruk tersebut merupakan varietas lokal Sumatera yang diamati memiliki variasi genetik yang tinggi dibandingkan dengan keempat jeruk impor tersebut. Indonesia memiliki varietas jeruk lokal yang tidak kalah dengan jeruk impor, terutama dalam hal kesegaran buah. Namun, masyarakat lebih tertarik dengan warna kulit jeruk sehingga masyarakat lebih memilih jeruk impor ketimbang jeruk lokal, khususnya di Sumatera. Oleh karena itu, perlu dilakukan upaya pelestarian dan peningkatan karakteristik jeruk ini untuk meningkatkan kualitasnya melalui pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimalkan metode isolasi DNA sampel buah jeruk dengan Chelex-TE dan untuk mengetahui profil genetik jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan genotipe RAPD. Sampel yang digunakan adalah beberapa jeruk lokal di Sumatera (Citrus Siam Gunung Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu dan Citrus Pasaman) dan Citrus impor (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot dan Citrus Wokam). DNA diisolasi menggunakan metode Chelex-TE 10% yang dioptimalkan untuk beberapa parameter seperti ukuran butir, kulit buah dan daun. RAPD dilakukan dengan menggunakan 10 primer RAPD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode isolasi Chelex Chelex-TE 10% yang optimal adalah ukuran sampel 1 butir. Amplifikasi jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan 10 primer tunggal menghasilkan pita polimorfik. Nilai kesamaan jaccard menunjukkan bahwa kelima sampel jeruk tersebut merupakan varietas lokal Sumatera yang diamati memiliki variasi genetik yang tinggi dibandingkan dengan keempat jeruk impor tersebut.
Co-Authors Abdul Razak Abdul Razak Abdul Razak Abdul Razak Achyar, Afifatul AERMA HASTUTY Afionita, Santi Ahmad Wibisana, Ahmad Albar, Rahmat Alfatimah Azzahra, Balkis Amanda, Nifsa Riski Andri Damayanti, Ndaru Annisa Irna Putri Annisa Khaira Arlina, Sistika Armen Armen Atifah, Yusni Aulia Yunita Aulia, Ony Nattasha Aura Iga Maharani Az-Zahra, Fauziah Azwir Anhar Berlinda Paradisa, Yashanti Cania Dewi, Rahmawitra Chatri, Moralita Chatri Cindy Pramila Darussyamsu, Rahmawati Des M Dezi Handayani Dezi Handayani Dina Sukma dina vaniana Dinda Sahara Djoelvinanda, Habibullah Edwin Edwin Efliani Efliani Eka Vidya Putra Elsa Alfiyanti Elsa Badriyya Elsa Yuniarti Fahra Fahra Fahra, Fahra Fatma Rahmadhani Febri Doni Febrina Anggiastanti Feby Yeriska Fevria, Resti Fira Safitri Fransisco, Sandi Fronica, Imelda Ghiffari, Muhammad Gustina Indriati Hartati Hartati Heffi Alberida Helsa Rahmatika Hengki Saputra Herman, Reni Herman, Reni Husnul Khatimah Intan Febriani IRDAWATI Irdawati Irdawati Irdawati Irdawati Irdawati Irdawati Irma Lailani Eka Putri Irma Leilani Eka Putri Irma Leilani Eka Putri Irvan Faizal Jamhari Jamhari Jannah Koftiah Jihan Rezi Okanti Kardiman, Reki Karlini Oktarina Kiki Amelia, Kiki Larasati Arum Utami Linda Advinda Lufri Lufri Mades Fifendy Mahjani Mahjani Maiyusri Eka Putri Mantoviana, Tiffany Marissa Angelina Miftahul Jannah Miftahul Rahmi Moca Faulina putri Monhartini, Monhartini Moralita Chatri Muhyiatul Fadilah Muhyiatul Fadilah Mukhlis Mukhlis Mukhtar Mukhtar Mulia Mulia Mulia Mutia Anika mutia anika N. Sri Hartati, N. Sri Nabilah, Rezi Nada Nafion Nadia Nisa Afifah Novitasari, Yuliana Diyah Nur Ayu Ramadanti Nur Helmi Nur Shofiatun Nisa Nur Vaizi Nurfadillatun Nisa Wijaya Nurfatihah Z, Zahara Nurhelmi Nurhelmi Nurul Pratiwi Nurul Rahmi Pratama, Chelsylia Dara Pratama, Sandi Fransisco Prima, Rika Putri Rachma Auliya Putri, Aulia Devani Putri, Cici Adelia Putri, Irma Leilani Putri, Irma Leilani Eka Putri, Isna Aryunita Putri Putri, Rani Dwi Suci Putri, Santi Diana Quratul Akyuni Rachmayati, Rike Rahmadhani Fitri Rahmat Afif Rahmatul Huda Asra Rahmawati Darussyamsu Rahmawita Rahmawita Rahmawita Rahmawita Rahmi Holinesti Rahmi, Elva Ramadanti, Nur Ayu Ramadhan Sumarmin Ramadhan Sumarmin Ramadhan Sumarmin Rani Dwi Suci Hd Putri Ratih Rahayu Relsas Yogica, Relsas Resti Desmayanti Rezi Nabilah Rhavy Ferdyan Rhini Febrianti Rinti Mutiara Sari Riri Apriyanti Riri Apriyanti S. Syamsurizal safitri, fira Salmi Halen Salsabilla, Vishtari Samsuriani Siregar Santosa, Tomi Apra Sari, Rinti Mutiara Satria, Rijal Selaras, Ganda Hijrah Shinta Sari Maria Silviana Okwisan Sirwati, Fadila Sisca Alicia Farma Sisri Yandila Siti Aisyah Siti Helmyati Sity Sarroh SOLICHATUN SOLICHATUN Sri Okta Handayani Suhaimi . Sulistiani Sulistiani, Sulistiani Syakirah binti Samsudin Syifa Kamila Namidya Tomi Apra Santosa Tomi Apra Santosa Santosa Valofi, Nagra Aulia Vauzia, Vauzia Vestimarta, Aldi Wahyuda Violita Violita Violita Violita Violita Viona, Alda Wahyuni Wahyuni wahyuni wahyuni Wahyuni, Resma Widya Ruchi Wilna Sari Wirda Taufik Y Yusrizal Yatnita Parama Cita Yolanda Ruhul Azomi Yosi Laila Rahmi Yulita, Nelfi Yuni Ahda Yuni Ahda Yuni Ahda Yuni Ahda Yusrizal Yusrizal Yusrizal Yusrizal Yusrizal Yusrizal Zakri, Dwika Febriana Zuhratul Mardiyah Amir Amir Zulyusri Zulyusri Zulzusri, Zulzusri