Claim Missing Document
Check
Articles

Beberapa Faktor Determinan dalam Penyusunan Peta Genetik , Jamsari
Zuriat Vol 18, No 1 (2007)
Publisher : Breeding Science Society of Indonesia (BSSI) / PERIPI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24198/zuriat.v18i1.6742

Abstract

Peta genetik merupakan faktor penting dalam isolasi gen berdasar kloning. Beberapa faktor, seperti sistem skoring, nilai REC dan nilai LOD memberikan pengaruh nyata dalam penyusunan peta genetik. Skoring kodominan (LOD bernilai 0−25) terbukti memberikan informasi yang lebih banyak dibandingkan dengan system scoring dominan (LOD bernilai 0−10). Disamping sistem skoring nilai parameter LOD yang digunakan juga terbukti mempengaruhi kestabilan peta genetic yang dihasilkan. Sistem scoring kodominan memberikan peluang penggunaan interval nilai LOD yang lebih luas dibandingkan dengan system scoring dominant.
RESPON DIFERENSIAL FISIOLOGIS TANAMAN TEBU (Saccharum officinarum) PADA KONDISI CEKAMAN KEKURANGAN AIR Jamsari Jamsari; Rhenly Danis; Ishak Manti; Renfiyeni Renfiyeni
Jurnal Agrista Vol 23, No 2 (2019): Volume 23 Nomor 2 Agustus 2019
Publisher : Fakultas Pertanian, Universitas Syiah Kuala

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (972.528 KB)

Abstract

Abstrak, Tebu adalah pabrik penghasil gula utama di dunia dan juga memainkan peran penting sebagai bahan baku untuk produksi bioetanol. Peningkatan produktivitas tanaman terkena tekanan lingkungan yaitu: kekurangan air yang saat ini merupakan masalah serius yang terkait dengan fenomena perubahan iklim global. Memahami respons tanaman terhadap tekanan lingkungan adalah salah satu kunci untuk dapat menyelesaikan masalah tersebut. Dalam hal ini, studi mendasar terkait dengan respons tanaman tebu terhadap tekanan air sangat penting. Penelitian ini terdiri dari kombinasi dua faktor, yaitu jenis klon yang terdiri dari PS.864, PSJT.941, dan VMC.76-16, 851 sebagai klon kelompok toleran, PS.862, PS.882 dan PS.851 sebagai non. kelompok klon toleran dan kurangnya penanganan tekanan air selama 5 hari. Data dianalisis lebih lanjut menggunakan DNMRT pada tingkat signifikansi 5%. Pengamatan menunjukkan bahwa klon toleran serta klon non-toleran PS.862 menunjukkan respons resistensi yang lebih baik daripada kelompok yang tidak toleran. Indikasinya ditunjukkan oleh nilai Relative Water Content (RWC), area daun spesifik (SLA) dan Nilai Defisit Air (WDV). Total protein profil tebu yang tumbuh di bawah defisit air dan mitranya dibedakan secara berbeda oleh penekanan ekspresi protein sekitar 35 kDa di semua klon. Sementara dalam kondisi defisit air ekspresi protein dengan ukuran 25 kDa sangat luar biasa diekspresikan. Physiological Differential Response of Sugarcane on Under Stress Conditions Lacking WaterAbstract, Sugarcane is the main sugar-producing plant in the world and also plays an important role as a raw material for bioethanol production. Productivity improvement of the plant is exposed to environmental stress ie: water shortage which is currently a serious problem associated with the global climate change phenomenon. Understanding of plant responses to environmental stress is one of the keys to be able to resolve the issue. In this regard, the fundamental studies related to the sugarcane plant responses to water stress is very important. This study consists of a combination of two factors, namely the type of clones consisting of PS.864, PSJT.941, and VMC.76-16, 851 as tolerant group clones, PS.862, PS.882 and PS.851as non tolerant clones group and lack of water stress treatment for 5 days. The data were analyzed further using DNMRT at 5% significance level. Observations showed that tolerant clones as well as non-tolerant clones PS.862 showed better resistance response than non tolerant groups. The indication was shown by the value of the Relative Water Content (RWC), Specific leaf area (SLA) and Water Deficit Value (WDV). Total protein profiling of sugarcane grown under water deficit and its counterpart differentially distinguished by suppression of protein expression of about 35 kDa in all clones. While in the water deficit condition expression of a protein with a size of 25 kDa is remarkable expressed.
Keragaman Baru pada Daerah Ujung Gen Hormon Pertumbuhan Sapi Pesisir Ternak Lokal Sumatera Barat Yurnalis Yurnalis; Arnim Arnim; Sarbaini Sarbaini; Jamsari Jamsari
Jurnal Peternakan Indonesia (Indonesian Journal of Animal Science) Vol 19, No 3 (2017): Jurnal Peternakan Indonesia
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jpi.19.3.103-109.2017

Abstract

Dari 210 sampel sapi pesisisir umur 1,5 tahun, dipilih 60 sample berdasarkan berat badan yaitu 30 sampel dengan berat tinggi (125±9,02 kg) dan 30 sampel dengan berat badan rendah (65±6,09 kg). Sampel darah 60 ekor sapi diisolasi dan produk PCR dari fragmen gen GH (455 bp)  disekuensing forward dan reserve.  Dua dilesi ditemukan pada posisi 2731 dan 2732 dengan fekuensi allel 0.06, dan 0.19. Delapan mutasi ditemukan pada posisi  2537, 2567, 2639, 2647, 2706, 2713, 2732, dan 2813 dengan genotipe  G → T,  G → T, C → G, T → C, A → G, C → T, C → T, C → A dengan frekuensi allel berturut-turut 0,66; 0,97; 1,00; 0,54; 0,37; 0,62; 0,77 dan 1,00. Hasil penelitian ini menunjukkan gen GH pada sapi pesisir mempunyai keragaman yang tinggi, sehingga perlu dilakukan penelitian lanjut untuk mengetahui apakah keragaman ini berhubungan dengaan sifat-sifat produksi.
Isolasi Bakteri Asam Laktat (BAL) Penghasil Asam Glutamat dari Ikan Budu sebagai Feed Suplemen Ayam Broiler V. Maslami; Y. Marlida; Mirnawati Mirnawati; Jamsari Jamsari; Y. S. Nur
Jurnal Peternakan Indonesia (Indonesian Journal of Animal Science) Vol 20, No 1 (2018): Jurnal Peternakan Indonesia
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jpi.20.1.29-36.2018

Abstract

POTENSI BAKTERI ASAM LAKTAT DALAM MENGHASILKAN BAKTERIOSIN SEBAGAI ANTIMIKROBA DAN PENGUKURAN BERAT MOLEKULNYA DENGAN SDS-PAGE DARI ISOLAT FERMENTASI KAKAO Urnemi -; Sumaryati Syukur; Endang Purwati; Sanusi Ibrahim; Jamsari -
Jurnal Riset Kimia Vol. 4 No. 2 (2011): March
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jrk.v4i2.141

Abstract

 ABSTRACTLactic acid bacteria (LAB) were isolated from cocoa beans fermentation Forestero variety from West Sumatera, that were eleven isolates. The isolates were tested to antimicrobial activity against pathogenic bacteria E.coli NBRC 14237, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Bacillus subtilis BTCCB 612, listeria m. dan S. Typhii.Results the research showed that, isolates had inhibition zone to pathogenic bacteria, that were 7 mm till 12 mm at 48 hours observation. R2.4 isolate was most potential to inhibition zones growth pathogenic bacteria, That was 11mm till 12 mm to five pathogens. R2.4 isolates was the highest to against pathogenic bacteria (Bacillus subtilis BTCCB, Listeria monocytogenesis and Staphylococcus aureus NBRC) had inhibition zones, that was 12. mm till 48 hours. Listeria monocytogenesis had been known as pest bacterium of food born, so that R2.4 isolate can be used as food biopreservative. Crude of R2.4 isolate molecular weight was 10 kDa by SDS-PAGE.  Key words: Lactic acid bacteria, antimicrobial activity, SDS-PAGE, cocoa fermentation  and food biopreservative    
POTENSI BAKTERI ASAM LAKTAT DALAM MENGHASILKAN BAKTERIOSIN SEBAGAI ANTIMIKROBA DAN PENGUKURAN BERAT MOLEKULNYA DENGAN SDS-PAGE DARI ISOLAT FERMENTASI KAKAO Urnemi -; Sumaryati Syukur; Endang Purwati; Sanusi Ibrahim; Jamsari -
Jurnal Riset Kimia Vol. 1 No. 2 (2008): March
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jrk.v1i2.149

Abstract

ABSTRACT Lactic acid bacteria (LAB) were isolated from of cocoa beans fermentation Forestero variety from West Sumatera, that were eleven isolates. The isolates were tested to antimicrobial activity against pathogenic bacteria E.coli NBRC 14237, Staphylococcus aureus NBRC 13276, Bacillus subtilis BTCCB 612, listeria m. dan S. Typhii. Results the research showed that, isolates had inhibition zone to pathogenic bacteria, that were 7 mm till 12 mm at 48 hours observation. R2.4 isolate was most potential to inhibition zones growth pathogenic bacteria, that was 11mm till 12 mm to five pathogens. R2.4 isolates was the highest to against pathogenic bacteria (Bacillus subtilis BTCCB, Listeria monocytogenesis and Staphylococcus aureus NBRC) had inhibition zones, that was 12.00 mm till 48 hours. Listeria monocytogenesis had been known as pest bacterium of food born, so that R2.4 isolate can be used as food biopreservative. Crude of R2.4 isolate molecular weight was 10 kDa by SDS-PAGE.  Key words: Lactic acid bacteria, Antimicrobial activity, SDS-PAGE, Cocoa fermentation and food biopreservative                                                      
OPTIMASI NUTRISI MEDIA PERTUMBUHAN BAKTERI TERMOFIL PENGHASIL SELULASE DARI SUMBER AIR PANAS RIMBO PANTI Armaini -; Abdi Dharma; Sumaryati Syukur; Jamsari -
Jurnal Riset Kimia Vol. 5 No. 1 (2011): September
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jrk.v5i1.165

Abstract

 Optimization have been done on the media for the growth of the isolated thermophiles bacteria from hot springs Rimbo Panti, the nutrients comprising variety of carbon sources such as CMC (carboxymethyl cellulose), avicell (micro crystalline cellulose), and cellobiose, with a variety of sources organic nitrogen, peptone, extracts yeast, tryptone, and urea, as well as variations consist of inorganic nitrogen sources, KNO3, NaNO3, (NH4)2SO4, and (NH4)NO3. Determination of cellulase activity performed using DNS reagent (3,5-dinitro salicylic acid). Maximum cellulase production with high activity based on the results of this research, the best of carbon source is CMC with optimum concentration 0.125%, inorganic nitrogen source is peptone with the optimum concentration of 0.3 to 0.4% and the inorganic nitrogen source is (NH4)2SO4 with optimum concentration of 0.2 - 0.25%. Optimization of size of inoculums obtained the optimum amount of inoculums 2%. Keywords: Optimization, thermophiles bacteria, cellulose, carbon sources, nitrogen sources
SKRINING DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENDEGRADASI INULIN DARI SUMBER AIR PANAS PADANG BALIMBIANG DI SOLOK Minda Azhar; Sumaryati Syukur; Dessy Natalia; Vovien -; Jamsari -
Jurnal Riset Kimia Vol. 5 No. 1 (2011): September
Publisher : Universitas Andalas

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.25077/jrk.v5i1.175

Abstract

 ABSTRACT Thermophilic bacteria and thermotolerant bacteria are potential sources of thermostable of inulin degradating enzyme, an enzyme which converts inulin into fructose and FOS prebiotics. Isolation and identification of 16S rDNA gene inulin degradation bacteria from hot springs of Padang Balimbiang in Solok have been undertaken. Screening of inulin degradation bacteria was done using direct and undirect methods on medium with inulin or inulin-RBB as a sole carbon source. One inulin degradation bacteria have been obtained from 21 isolates. The isolate was designated as UBCT-030. The isolate is able to grow at temperature 23 °C to 60 °C. According to 16S rDNA gene analysis, phisiology and morphology bacteria on UBCT-030 isolate was identified as Bacillus subtilis.  Keywords: inulinase bacteria, hot springs, Bacillus subtilis, inulin, 16S rDNA gene
Asupan Lemak dan Ekspresi Gen eNOS3 Alel Glu298Asp pada Penderita Hipertensi Etnik Minangkabau Delmi Sulastri; Lipoeto NI; Nasrul Zubir; Jamsari Jamsari
MEDIA MEDIKA INDONESIANA 2011:MMI Volume 45 Issue 1 Year 2011
Publisher : MEDIA MEDIKA INDONESIANA

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (364.07 KB)

Abstract

ABSTRACTIntake of fat and Gen eNOS3 Alel Glu298Asp expression in hypertensive Minangkabau personsBackground: eNOS 3 gene is one of the important genes which is related to the high prevalence of hypertension essensial. This gene expresses the nitric oxide synthase (NOS) enzyme which regulates the synthesis of nitric oxide (NO) in human body.Methods: A research has been done on hypertensive and normotensive patients aged 30-65 years old. The main purpose of this research was to evaluate the association of fat intake on eNOS3 gene Glu298Asp allel expression in hypertension subjects in Minangkabau ethnicity. One hundred thirty subjects had been interview about their eating habits, and measured their omega-3, eNOS3 gene and NO plasma level. The data were analysed with t-tes and chi-square.Results: The hypertensive’s plasma NO concentration was 26.91±15.40 μM/L and normotensive’s was 25.79±15.04 μM/L. 52.5% of the hypertensive subjects and 47.5% of the normotensive has eNOS3 gene heterozygotes GT allele. Mean rates for total fat, SFA, MUFA and PUFA consumption of hypertensive subjects are 28.05±6.57%, 12.31±4.21%, 4.21±1.79%, 3.77±1.97% and normotensive are 30.14±13.98%, 12.58±4.22%, 4.40±2.22%, 4.00±1.96%. Mean rate for plasma omega-3 concentration of hypertensive subjects is 14.45±0.10μg/dL and normotensive is 14.49±1.00 μg/dL. There is significant relationship between omega-3 with NO plasma level on hypertension with GT heterozygote alleles.Conclusion: In hypertensive patients with GT heterozygote alleles, only omega-3 plasma is associated with NO2 plasma.Keywords: Essensial hipertension, eNOS3 gene, NO plasma levelABSTRAKLatar belakang: Gen eNOS3 alel Glu298Asp merupakan salah satu gen yang berhubungan dengan kejadian hipertensi esensial. Kemampuan Gen eNOS3 alel ini untuk mensintesis enzim nitric oxide synthase (NOS) berkurang sehingga sintesis nitric oxide (NO) menurun.Metode: Penelitian pada subyek hipertensi dan normotensi berusia 30-65 tahun bertujuan untuk melihat hubungan asupan lemak dengan ekspresi gen eNOS3 alel Glu298Asp. Seratus tiga puluh subyek, diwawancara pola makannya lalu dilakukan pemeriksaan kadar omega-3 dan omega-6 plasma, gen eNOS3, serta kadar NO plasma. Data yang diperoleh dianalisis menggunakan uji T dan chi-square.Hasil: Kadar NO plasma subyek hipertensi adalah 26,91±15,40 μM/L dan normotensi 25,79±15,04 μM/L. 52,5% subyek hipertensi dan 47,5% normotensi mempunyai polimorfisme gen eNOS3 alel heterozigot GT. Rerata persentase asupan lemak total, ALJ, ALTJT, ALTJG pada subyek hipertensi adalah 28,05±6,57%, 12,31±4,21%, 4,21±1,79%, 3,77±1,97% dan pada subyek normotensi adalah 30,14±13,98%, 12,58±4,22%, 4,40±2,22%, 4,00±1,96%. Rerata kadar omega-3 plasma subyek hipertensi adalah 14,45±0,10 μg/dL dan normotensi 14,49±1,00 μg/dL. Terdapat hubungan kadar omega-3 dengan NO plasma pada penderita hipertensi dengan alel heterozigot GT.Simpulan: Pada penderita hipertensi dengan alel heterozigot GT, hanya omega-3 plasma yang berhubungan dengan kadar NO2 plasma.
Detection and Sequence Diversity of Begomovirus Associated with Yellow Leaf Curl Disease of Pepper (Capsicum annuum) in West Sumatra, Indonesia JUMSU TRISNO; SRI HENDRASTUTI HIDAYAT; TRIMURTI HABAZAR; ISHAK MANTI; . JAMSARI
Microbiology Indonesia Vol. 3 No. 2 (2009): August 2009
Publisher : Indonesian Society for microbiology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (195.352 KB) | DOI: 10.5454/mi.3.2.2

Abstract

Yellow leaf curl disease of pepper has become an emerging important disease in West Sumatra since early 2000. Several attempts have been made, including disease survey and detection, in order to identify the causal agent of the disease. Pepper (Capsicum annuum) plants showing yellow leaf curl from West Sumatra were analyzed for presence of Begomovirus employing Polymerase Chain Reaction (PCR) with degenerate primers pAL1v 1978 and pARc 715. A DNA fragment of 1.6 kb was successfully amplified and subjected to direct sequencing. A stem loop region was found in the nucleotide sequence obtained, which contains the conserved nucleotide signature sequence TAATATTAC present in begomoviruses. Based on the stem loop region comparisons and phylogenetic analysis, the virus isolates from West Sumatra showed the closest relationship to Pepper yellow leaf curl Indonesia virus (PYLVIV) and Tomato yellow leaf curl Indonesia virus (TYLCIV). The sequence was different from other Asia Begomoviruses reported earlier. These isolates were divided into three groups which were tentatively called Pepper yellow leaf curl Indonesia virus-West Sumatra-[group 1], -[group 2] and -[group 3] {PYLCIV-WS-[group1], -[group2], and -[group3]}.
Co-Authors -, Urnemi -, Vovien . Dachryanus Abdi Dharma Achmad Noerkhaerin Putra Adrial Adrial, Adrial Afriwardi Afriwardi Agustian Agustian Ahmad Denian Ali Rahmad Ali Rahmat Aliya, Lisana Shidiqqin Alvarino Ananda, Abi Awfa Rahman Andani Eka Putra Andika Ade Saputra Arif Sardi Armaini - Arni Amir Arnim Arnim Asman Manaf Azhar, Minda Azmi Dhalimi Buana, Gherriandi R. Cuandra, Kevin N. Dachryanus, Dachryanus Delmi Sulastri DESSY NATALIA Djong Hon Tjong E. Y. Rahman E. Y. Rahman Efrida Efrida ekawati, fitri elara resigia Elly Syafriani Elmatris , Elmatris Elvi Zuriyani ELVI ZURIYANI Endang Purwati RN Endrinaldi , Endrinaldi Eryati Darwin Eryka Okta Juanty Eryka Okta Juanty FA Febria Fatchiyah Fatchiyah Febria, FA Femy Riwany Firjatullah, Muhammad F. Friska Eka Fitria Gumilar, Erry Gusmawartati Gusmawartati Hamda Fauza Hanifah, Wafiq Hardisman Hasbi Al Huda Hasibuan, Imron Martua Hazmi, Auliya A. Herviyanti Herviyanti Ida Parwati Ifan Aulia Candra Irawati Chaniago Irfan Suliansyah ISHAK Ishak Manti ISHAK MANTI Ishak Manti Istino Ferita Jeanne Venora Jumsu Trisno Karmia, Hudila Rifa Lidya Sari Utami Lily Syukriani Lipoeto NI Liza Aulia Yusfi Maharani, Annisa D. Maulana, Rafi Meisilva Erona Meisilva Erona S Minda Azhar Mirnawati Mirnawati ML Edy Parwanto Mochammad Imron Awalludin Muhamad Irsyad Murdaningsih H. Karmana N Nasir N Nurhidayat N Nurhidayat, N Nasril Nasir Nasril Nasir Nasrul Zubir Natalia, Dessy Nefilinda Nefilinda Nefilinda Nefilinda Nelson, Nelvianti Netty Suharti Ningsih, Azma Risilvia Noraziyah Abd Aziz Shamsudin Nur Afrainin Syah Nurainas Nurainas Nursyafi, Fauzan Syarif Obel Obel Obel, Obel Prayogi, Norbertus M. Putra, Andika Chandra Rachmad Hersi Martinsyah Rahmad, Ali Rahman, Awalil RK. Rahmi Handayani Rahmi Kamelia Ramadhan, Nugraha Renfiyeni Reni Koja Respati, Aditya Nugraha Retno Ariza Soeprihatini Soemarwoto Rhenly Danis Rika Despica Rika Despica Rosadi, Firsta Ninda Roza Yunita Rusfidra rusfidra Sahrul Utama Saipul Sihotang, Saipul Salma Salma Salma Salma Sanusi Ibrahim Sarbaini Sarbaini Sartika, Diza Selvia Dewi Pohan Seswita, Seswita Silvia Permata sari Slamet Rianto SRI HENDRASTUTI HIDAYAT Sumaryati Syukur Sumaryati Syukur Suswita, Rini Syamsurizal Syamsurizal Syazili Mustofa Tika Runifah Trimuri Habazar TRIMURTI HABAZAR Tristan, Christopher D. Urnemi - Urnemi Urnemi V. Maslami Vovien - Wahyudi, Dhyani P. Wardi, Epi Supri Wawan Abdullah Setiawan Winda Purnama Sari Winda Purnama Sari Y Heryandi Y. Marlida Y. S. Nur Yahono, Angela S. Yanwirasti Yanwirasti Yanwirasti Yenny, Satya W. Yuniar Lestari Yurnalis Yurnalis Yusrawati Yusrawati Yustini Alioes ZK Abdurahman Baizal Zulkarnain Chaidir